MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Burkholderia sp. RPE64 plasmid p2 DNA

Total Repeats: 1532

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021295	CT	3	6	47	52	0 %	50 %	0 %	50 %	507527062
2	NC_021295	CCG	2	6	184	189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507527062
3	NC_021295	TCGA	2	8	193	200	25 %	25 %	25 %	25 %	507527062
4	NC_021295	TGCGT	2	10	231	240	0 %	40 %	40 %	20 %	507527062
5	NC_021295	GAC	2	6	275	280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507527062
6	NC_021295	GCG	2	6	306	311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507527062
7	NC_021295	GC	4	8	319	326	0 %	0 %	50 %	50 %	507527062
8	NC_021295	CCT	2	6	382	387	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	507527062
9	NC_021295	GAA	2	6	449	454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507527062
10	NC_021295	CTG	2	6	515	520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507527062
11	NC_021295	TCG	2	6	528	533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507527062
12	NC_021295	TC	3	6	541	546	0 %	50 %	0 %	50 %	507527062
13	NC_021295	GCGA	2	8	683	690	25 %	0 %	50 %	25 %	507527062
14	NC_021295	GCA	2	6	886	891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507527062
15	NC_021295	CCGA	2	8	1037	1044	25 %	0 %	25 %	50 %	507527062
16	NC_021295	CGG	2	6	1090	1095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507527062
17	NC_021295	CT	3	6	1111	1116	0 %	50 %	0 %	50 %	507527062
18	NC_021295	GTT	2	6	1148	1153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	507527062
19	NC_021295	TCC	2	6	1221	1226	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	507527062
20	NC_021295	GTC	2	6	1258	1263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507527062
21	NC_021295	CGA	2	6	1282	1287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507527062
22	NC_021295	ACGA	2	8	2295	2302	50 %	0 %	25 %	25 %	507527063
23	NC_021295	AAG	2	6	2419	2424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507527063
24	NC_021295	GCC	2	6	2435	2440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507527063
25	NC_021295	CGCT	2	8	2489	2496	0 %	25 %	25 %	50 %	507527063
26	NC_021295	CAG	2	6	2505	2510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507527063
27	NC_021295	GAC	3	9	2606	2614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507527063
28	NC_021295	TGA	2	6	2662	2667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507527063
29	NC_021295	TG	3	6	2701	2706	0 %	50 %	50 %	0 %	507527063
30	NC_021295	GGA	2	6	2735	2740	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	507527063
31	NC_021295	GGC	2	6	2778	2783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507527063
32	NC_021295	AGA	2	6	2881	2886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507527063
33	NC_021295	CG	3	6	2940	2945	0 %	0 %	50 %	50 %	507527063
34	NC_021295	CAT	2	6	2957	2962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507527063
35	NC_021295	GGC	2	6	3011	3016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507527063
36	NC_021295	ATTTC	2	10	3055	3064	20 %	60 %	0 %	20 %	507527063
37	NC_021295	TTC	2	6	3151	3156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	507527063
38	NC_021295	GC	3	6	3277	3282	0 %	0 %	50 %	50 %	507527063
39	NC_021295	CG	3	6	3338	3343	0 %	0 %	50 %	50 %	507527063
40	NC_021295	TGG	2	6	3358	3363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	507527063
41	NC_021295	TGA	2	6	3380	3385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507527063
42	NC_021295	GAT	2	6	3436	3441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507527064
43	NC_021295	GCG	2	6	3464	3469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507527064
44	NC_021295	GCA	2	6	3490	3495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507527064
45	NC_021295	GGCG	2	8	3532	3539	0 %	0 %	75 %	25 %	507527064
46	NC_021295	ATC	2	6	3710	3715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507527064
47	NC_021295	GCG	2	6	3718	3723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507527064
48	NC_021295	GC	3	6	3766	3771	0 %	0 %	50 %	50 %	507527064
49	NC_021295	GAT	2	6	3778	3783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507527064
50	NC_021295	CGA	2	6	3792	3797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507527064
51	NC_021295	TCG	2	6	3807	3812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507527064
52	NC_021295	GAA	2	6	3827	3832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507527064
53	NC_021295	CG	3	6	3862	3867	0 %	0 %	50 %	50 %	507527064
54	NC_021295	GCG	2	6	4058	4063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507527064
55	NC_021295	GTT	2	6	4070	4075	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	507527064
56	NC_021295	CAA	2	6	4087	4092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	507527064
57	NC_021295	GCG	2	6	4100	4105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507527064
58	NC_021295	GGAGC	2	10	4225	4234	20 %	0 %	60 %	20 %	507527064
59	NC_021295	ACA	2	6	4325	4330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	507527064
60	NC_021295	TGA	2	6	6181	6186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507527065
61	NC_021295	TCG	2	6	6230	6235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507527065
62	NC_021295	TCGT	2	8	6246	6253	0 %	50 %	25 %	25 %	507527065
63	NC_021295	A	6	6	6257	6262	100 %	0 %	0 %	0 %	507527065
64	NC_021295	ATG	2	6	6450	6455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507527066
65	NC_021295	CAC	2	6	6458	6463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	507527066
66	NC_021295	GTT	2	6	6555	6560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	507527066
67	NC_021295	TCG	2	6	6594	6599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507527066
68	NC_021295	AGC	2	6	6708	6713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507527066
69	NC_021295	CGA	2	6	6756	6761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507527066
70	NC_021295	G	6	6	6985	6990	0 %	0 %	100 %	0 %	507527067
71	NC_021295	AC	3	6	7000	7005	50 %	0 %	0 %	50 %	507527067
72	NC_021295	GTTC	2	8	7012	7019	0 %	50 %	25 %	25 %	507527067
73	NC_021295	ATC	2	6	7031	7036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507527067
74	NC_021295	ACG	2	6	7040	7045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507527067
75	NC_021295	CGC	2	6	7092	7097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507527067
76	NC_021295	TCAA	2	8	7139	7146	50 %	25 %	0 %	25 %	507527067
77	NC_021295	TGA	2	6	7181	7186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507527068
78	NC_021295	CAACG	2	10	7244	7253	40 %	0 %	20 %	40 %	507527068
79	NC_021295	ATCA	2	8	7258	7265	50 %	25 %	0 %	25 %	507527068
80	NC_021295	AAGCC	2	10	7266	7275	40 %	0 %	20 %	40 %	507527068
81	NC_021295	GCC	2	6	7280	7285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507527068
82	NC_021295	CG	3	6	7304	7309	0 %	0 %	50 %	50 %	507527068
83	NC_021295	GCCG	2	8	7364	7371	0 %	0 %	50 %	50 %	507527069
84	NC_021295	CGC	2	6	7463	7468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507527070
85	NC_021295	GCA	2	6	7488	7493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507527070
86	NC_021295	CGT	2	6	7528	7533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507527070
87	NC_021295	CCA	2	6	7564	7569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	507527070
88	NC_021295	TTC	2	6	7584	7589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	507527070
89	NC_021295	GCGTG	2	10	7669	7678	0 %	20 %	60 %	20 %	507527070
90	NC_021295	TGA	2	6	7689	7694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507527070
91	NC_021295	TCT	2	6	7704	7709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	507527070
92	NC_021295	TCG	2	6	7710	7715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507527070
93	NC_021295	CCA	2	6	7750	7755	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	507527070
94	NC_021295	GCG	2	6	7760	7765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507527070
95	NC_021295	GCG	2	6	7800	7805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507527070
96	NC_021295	GCGA	2	8	7854	7861	25 %	0 %	50 %	25 %	507527070
97	NC_021295	GTCT	2	8	7862	7869	0 %	50 %	25 %	25 %	507527070
98	NC_021295	CGC	2	6	7930	7935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507527070
99	NC_021295	AAC	2	6	7991	7996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	507527070
100	NC_021295	CG	3	6	7997	8002	0 %	0 %	50 %	50 %	507527070
101	NC_021295	A	7	7	8484	8490	100 %	0 %	0 %	0 %	507527071
102	NC_021295	GGC	2	6	8506	8511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507527071
103	NC_021295	GGC	2	6	8532	8537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507527071
104	NC_021295	CCG	2	6	8573	8578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507527071
105	NC_021295	GGCG	2	8	8682	8689	0 %	0 %	75 %	25 %	507527071
106	NC_021295	TCG	2	6	8714	8719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507527071
107	NC_021295	GGT	2	6	8734	8739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	507527071
108	NC_021295	CCG	2	6	8741	8746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507527071
109	NC_021295	GC	3	6	8783	8788	0 %	0 %	50 %	50 %	507527071
110	NC_021295	CCG	2	6	8813	8818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507527071
111	NC_021295	ATC	2	6	8878	8883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507527071
112	NC_021295	GCG	2	6	8897	8902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507527071
113	NC_021295	CCA	2	6	8954	8959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	507527071
114	NC_021295	TCG	2	6	8984	8989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507527071
115	NC_021295	CG	3	6	9020	9025	0 %	0 %	50 %	50 %	507527071
116	NC_021295	GCA	2	6	9066	9071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507527071
117	NC_021295	CGA	2	6	9078	9083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507527071
118	NC_021295	CGG	2	6	9096	9101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507527071
119	NC_021295	GGT	2	6	9108	9113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	507527071
120	NC_021295	ACG	2	6	9128	9133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507527071
121	NC_021295	CCA	2	6	9188	9193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	507527071
122	NC_021295	TGA	2	6	9233	9238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507527071
123	NC_021295	GCGG	2	8	9373	9380	0 %	0 %	75 %	25 %	507527071
124	NC_021295	CG	3	6	9515	9520	0 %	0 %	50 %	50 %	507527071
125	NC_021295	GAC	2	6	9543	9548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507527071
126	NC_021295	CGC	2	6	9557	9562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507527071
127	NC_021295	CTG	2	6	9601	9606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507527071
128	NC_021295	GTCG	2	8	9618	9625	0 %	25 %	50 %	25 %	507527071
129	NC_021295	ACG	2	6	9632	9637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507527071
130	NC_021295	GCAG	2	8	9699	9706	25 %	0 %	50 %	25 %	507527071
131	NC_021295	TCG	3	9	9877	9885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507527072
132	NC_021295	CAT	2	6	9899	9904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507527072
133	NC_021295	ATG	2	6	9957	9962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507527072
134	NC_021295	CTTC	2	8	9985	9992	0 %	50 %	0 %	50 %	507527072
135	NC_021295	CGT	2	6	10031	10036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507527072
136	NC_021295	GGCC	2	8	10045	10052	0 %	0 %	50 %	50 %	507527072
137	NC_021295	CGC	2	6	10063	10068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507527072
138	NC_021295	TGG	2	6	10072	10077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	507527072
139	NC_021295	T	6	6	10104	10109	0 %	100 %	0 %	0 %	507527072
140	NC_021295	CAT	2	6	10122	10127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507527072
141	NC_021295	TCTT	2	8	10163	10170	0 %	75 %	0 %	25 %	507527072
142	NC_021295	CTT	2	6	10196	10201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	507527072
143	NC_021295	CAT	2	6	10301	10306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507527072
144	NC_021295	CTG	2	6	10335	10340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507527072
145	NC_021295	ACGCGT	2	12	10344	10355	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	507527072
146	NC_021295	TCG	2	6	10363	10368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507527072
147	NC_021295	GC	3	6	10402	10407	0 %	0 %	50 %	50 %	507527072
148	NC_021295	TTTGGC	2	12	10443	10454	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	507527072
149	NC_021295	CTGG	2	8	10470	10477	0 %	25 %	50 %	25 %	507527072
150	NC_021295	GTG	2	6	10545	10550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	507527072
151	NC_021295	GTC	2	6	10551	10556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507527072
152	NC_021295	GGGC	2	8	10559	10566	0 %	0 %	75 %	25 %	507527072
153	NC_021295	CCT	2	6	10594	10599	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	507527072
154	NC_021295	GTG	2	6	10611	10616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	507527072
155	NC_021295	CCT	2	6	10655	10660	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	507527072
156	NC_021295	TCG	2	6	10666	10671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507527072
157	NC_021295	CGG	2	6	10697	10702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507527072
158	NC_021295	GCT	2	6	10703	10708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507527072
159	NC_021295	CGA	2	6	10735	10740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507527072
160	NC_021295	TGC	2	6	10756	10761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507527072
161	NC_021295	CGTC	3	12	10772	10783	0 %	25 %	25 %	50 %	507527072
162	NC_021295	TGC	2	6	10872	10877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507527073
163	NC_021295	GCT	2	6	10888	10893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507527073
164	NC_021295	CAGGC	2	10	10953	10962	20 %	0 %	40 %	40 %	507527073
165	NC_021295	CGC	2	6	10984	10989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507527073
166	NC_021295	GGT	2	6	11110	11115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	507527073
167	NC_021295	CTG	2	6	11180	11185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507527073
168	NC_021295	CTCG	2	8	11188	11195	0 %	25 %	25 %	50 %	507527073
169	NC_021295	CAC	2	6	11196	11201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	507527073
170	NC_021295	CGG	2	6	11218	11223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507527073
171	NC_021295	CGA	2	6	11238	11243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507527073
172	NC_021295	CTA	2	6	11290	11295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507527073
173	NC_021295	TCACGC	2	12	11343	11354	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	507527073
174	NC_021295	CCGG	2	8	11358	11365	0 %	0 %	50 %	50 %	507527073
175	NC_021295	CGA	2	6	11454	11459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507527073
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186	NC_021295	CGG	2	6	11896	11901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507527073
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189	NC_021295	GCC	2	6	12318	12323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507527074
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194	NC_021295	CGAT	2	8	12519	12526	25 %	25 %	25 %	25 %	507527074
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247	NC_021295	GC	3	6	14498	14503	0 %	0 %	50 %	50 %	507527077
248	NC_021295	GGGC	2	8	14518	14525	0 %	0 %	75 %	25 %	507527077
249	NC_021295	GCT	2	6	14537	14542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507527077
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253	NC_021295	TCG	2	6	14674	14679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507527077
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255	NC_021295	TGC	2	6	14809	14814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507527077
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257	NC_021295	GCG	3	9	14929	14937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507527077
258	NC_021295	CGC	2	6	15056	15061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507527077
259	NC_021295	CTT	2	6	15083	15088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	507527077
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388	NC_021295	TCG	2	6	20814	20819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507527083
389	NC_021295	CAT	2	6	20821	20826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507527083
390	NC_021295	CGC	2	6	20853	20858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507527083
391	NC_021295	GCC	3	9	20873	20881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507527083
392	NC_021295	TCA	2	6	20943	20948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507527083
393	NC_021295	GTC	2	6	20984	20989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507527083
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396	NC_021295	CGG	2	6	21103	21108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507527083
397	NC_021295	GC	3	6	21142	21147	0 %	0 %	50 %	50 %	507527083
398	NC_021295	CGG	2	6	21170	21175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507527083
399	NC_021295	CGG	2	6	21193	21198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507527083
400	NC_021295	TCG	2	6	21266	21271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507527083
401	NC_021295	GCC	2	6	21305	21310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507527083
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414	NC_021295	CGG	2	6	22036	22041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507527084
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498	NC_021295	GCTGAA	2	12	27183	27194	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	507527093
499	NC_021295	CA	3	6	27454	27459	50 %	0 %	0 %	50 %	507527094
500	NC_021295	CGC	2	6	27505	27510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507527094

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