MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia sp. RPE64 plasmid p2 DNA

Total Repeats: 1532

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021295	CGA	2	6	57013	57018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507527128
1002	NC_021295	CG	3	6	57116	57121	0 %	0 %	50 %	50 %	507527128
1003	NC_021295	ACTC	2	8	57139	57146	25 %	25 %	0 %	50 %	507527128
1004	NC_021295	TGC	2	6	57223	57228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507527128
1005	NC_021295	TCG	2	6	57237	57242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507527128
1006	NC_021295	TGGCG	2	10	57253	57262	0 %	20 %	60 %	20 %	507527128
1007	NC_021295	CGA	2	6	57270	57275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507527128
1008	NC_021295	GAA	2	6	57314	57319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507527128
1009	NC_021295	GGGCC	2	10	57347	57356	0 %	0 %	60 %	40 %	507527128
1010	NC_021295	CATT	2	8	57377	57384	25 %	50 %	0 %	25 %	507527128
1011	NC_021295	GCC	2	6	57597	57602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507527129
1012	NC_021295	TCT	3	9	57632	57640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	507527129
1013	NC_021295	CCG	2	6	57718	57723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507527129
1014	NC_021295	TCGAA	2	10	57745	57754	40 %	20 %	20 %	20 %	507527129
1015	NC_021295	GCT	2	6	57780	57785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507527129
1016	NC_021295	TCG	2	6	57817	57822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507527129
1017	NC_021295	GCCCAT	2	12	57870	57881	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	507527129
1018	NC_021295	CGCC	2	8	57896	57903	0 %	0 %	25 %	75 %	507527129
1019	NC_021295	CCG	2	6	57905	57910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507527129
1020	NC_021295	GC	3	6	57948	57953	0 %	0 %	50 %	50 %	507527129
1021	NC_021295	GCG	3	9	57979	57987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507527129
1022	NC_021295	GCG	2	6	57998	58003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507527129
1023	NC_021295	TGCC	2	8	58010	58017	0 %	25 %	25 %	50 %	507527129
1024	NC_021295	CGT	2	6	58094	58099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507527129
1025	NC_021295	CGT	2	6	58115	58120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507527129
1026	NC_021295	CAC	2	6	58125	58130	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	507527129
1027	NC_021295	GCAGCC	2	12	58168	58179	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	507527129
1028	NC_021295	TG	3	6	58184	58189	0 %	50 %	50 %	0 %	507527129
1029	NC_021295	GTT	2	6	58255	58260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	507527129
1030	NC_021295	TCG	2	6	58265	58270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507527129
1031	NC_021295	GAT	2	6	58383	58388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507527129
1032	NC_021295	CTG	2	6	58421	58426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507527129
1033	NC_021295	CGA	2	6	58446	58451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507527129
1034	NC_021295	TCG	2	6	58469	58474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507527129
1035	NC_021295	CGG	2	6	58478	58483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507527129
1036	NC_021295	GGCC	2	8	58496	58503	0 %	0 %	50 %	50 %	507527129
1037	NC_021295	AGG	2	6	58504	58509	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	507527129
1038	NC_021295	GCG	2	6	58510	58515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507527129
1039	NC_021295	CGA	2	6	58577	58582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507527129
1040	NC_021295	CAG	2	6	58608	58613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507527129
1041	NC_021295	CGG	2	6	58628	58633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507527129
1042	NC_021295	GTC	2	6	58638	58643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507527129
1043	NC_021295	GC	3	6	58661	58666	0 %	0 %	50 %	50 %	507527129
1044	NC_021295	TGA	2	6	59013	59018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507527130
1045	NC_021295	GCC	2	6	59053	59058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507527130
1046	NC_021295	CAT	2	6	59094	59099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507527130
1047	NC_021295	GCA	2	6	59103	59108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507527130
1048	NC_021295	CGC	2	6	59142	59147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507527130
1049	NC_021295	GTT	2	6	59259	59264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	507527130
1050	NC_021295	ATC	3	9	59293	59301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507527130
1051	NC_021295	GCGAT	2	10	59330	59339	20 %	20 %	40 %	20 %	507527130
1052	NC_021295	AAC	2	6	59363	59368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	507527130
1053	NC_021295	GTT	2	6	59400	59405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	507527130
1054	NC_021295	GGAA	2	8	59448	59455	50 %	0 %	50 %	0 %	507527130
1055	NC_021295	ATC	2	6	59533	59538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507527130
1056	NC_021295	CGG	2	6	59539	59544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507527130
1057	NC_021295	TTGA	2	8	59551	59558	25 %	50 %	25 %	0 %	507527130
1058	NC_021295	TGG	2	6	59579	59584	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	507527130
1059	NC_021295	CCG	2	6	59591	59596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507527130
1060	NC_021295	GCT	2	6	59622	59627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507527130
1061	NC_021295	GC	3	6	59662	59667	0 %	0 %	50 %	50 %	507527130
1062	NC_021295	CTG	2	6	59689	59694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507527130
1063	NC_021295	GC	3	6	59757	59762	0 %	0 %	50 %	50 %	507527130
1064	NC_021295	CGA	2	6	59811	59816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507527130
1065	NC_021295	ACG	2	6	59828	59833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507527130
1066	NC_021295	GGC	2	6	59865	59870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507527130
1067	NC_021295	GCC	2	6	59881	59886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507527130
1068	NC_021295	TAG	2	6	59916	59921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507527130
1069	NC_021295	GGCA	2	8	59933	59940	25 %	0 %	50 %	25 %	507527130
1070	NC_021295	TCT	2	6	60212	60217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	507527130
1071	NC_021295	CGT	3	9	60261	60269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507527130
1072	NC_021295	GGC	2	6	60277	60282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507527130
1073	NC_021295	CGG	2	6	60287	60292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507527130
1074	NC_021295	CGT	2	6	60300	60305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507527130
1075	NC_021295	CTG	2	6	60337	60342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507527130
1076	NC_021295	TCGG	2	8	60345	60352	0 %	25 %	50 %	25 %	507527130
1077	NC_021295	CGG	2	6	60447	60452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507527130
1078	NC_021295	GGTTG	2	10	60459	60468	0 %	40 %	60 %	0 %	507527130
1079	NC_021295	TGTTCA	2	12	60524	60535	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	507527130
1080	NC_021295	GCG	2	6	60572	60577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507527130
1081	NC_021295	CG	3	6	60616	60621	0 %	0 %	50 %	50 %	507527130
1082	NC_021295	GCC	2	6	60718	60723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507527130
1083	NC_021295	GTC	2	6	60745	60750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507527130
1084	NC_021295	CAG	2	6	60781	60786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507527130
1085	NC_021295	GTCGG	2	10	60823	60832	0 %	20 %	60 %	20 %	507527130
1086	NC_021295	GAT	2	6	60833	60838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507527130
1087	NC_021295	CCG	2	6	60982	60987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507527131
1088	NC_021295	GTCGA	2	10	61039	61048	20 %	20 %	40 %	20 %	507527131
1089	NC_021295	CGA	2	6	61075	61080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507527131
1090	NC_021295	TGC	2	6	61217	61222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507527131
1091	NC_021295	AGCG	2	8	61223	61230	25 %	0 %	50 %	25 %	507527131
1092	NC_021295	TTC	2	6	61267	61272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	507527131
1093	NC_021295	TCG	2	6	61576	61581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507527132
1094	NC_021295	GCC	2	6	61647	61652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507527132
1095	NC_021295	TCG	2	6	61738	61743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507527132
1096	NC_021295	CG	3	6	61774	61779	0 %	0 %	50 %	50 %	507527132
1097	NC_021295	ATG	2	6	61986	61991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507527132
1098	NC_021295	CAT	2	6	61997	62002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507527132
1099	NC_021295	GTC	2	6	62055	62060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507527132
1100	NC_021295	GTT	2	6	62064	62069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	507527132
1101	NC_021295	GC	3	6	62142	62147	0 %	0 %	50 %	50 %	507527132
1102	NC_021295	ATG	2	6	62276	62281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507527133
1103	NC_021295	CGC	2	6	62299	62304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507527133
1104	NC_021295	GC	3	6	62321	62326	0 %	0 %	50 %	50 %	507527133
1105	NC_021295	GAT	2	6	62334	62339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507527133
1106	NC_021295	CCA	3	9	62340	62348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	507527133
1107	NC_021295	GCC	2	6	62411	62416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507527133
1108	NC_021295	TGT	2	6	62426	62431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	507527133
1109	NC_021295	ACGATC	2	12	62504	62515	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	507527133
1110	NC_021295	GC	3	6	62610	62615	0 %	0 %	50 %	50 %	507527133
1111	NC_021295	CAG	3	9	62656	62664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507527133
1112	NC_021295	GAT	2	6	62755	62760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507527133
1113	NC_021295	AGAT	2	8	62765	62772	50 %	25 %	25 %	0 %	507527133
1114	NC_021295	TTC	2	6	62781	62786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	507527133
1115	NC_021295	CGA	2	6	62802	62807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507527133
1116	NC_021295	AAC	2	6	62855	62860	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	507527133
1117	NC_021295	GAAG	2	8	62865	62872	50 %	0 %	50 %	0 %	507527133
1118	NC_021295	CAA	2	6	62895	62900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	507527133
1119	NC_021295	CGA	2	6	62926	62931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507527133
1120	NC_021295	CCG	2	6	63062	63067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507527133
1121	NC_021295	TGC	2	6	63091	63096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507527133
1122	NC_021295	GCC	3	9	63119	63127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507527133
1123	NC_021295	ACC	2	6	63131	63136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	507527133
1124	NC_021295	CGA	3	9	63144	63152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507527133
1125	NC_021295	GAA	2	6	63168	63173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507527133
1126	NC_021295	CGA	2	6	63179	63184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507527133
1127	NC_021295	AG	3	6	63199	63204	50 %	0 %	50 %	0 %	507527133
1128	NC_021295	TGC	2	6	63235	63240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507527133
1129	NC_021295	CCG	2	6	63261	63266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507527133
1130	NC_021295	GCA	2	6	63303	63308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507527133
1131	NC_021295	GGA	2	6	63318	63323	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	507527133
1132	NC_021295	CCG	2	6	63600	63605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507527134
1133	NC_021295	GTC	2	6	63677	63682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507527134
1134	NC_021295	CGGA	2	8	63700	63707	25 %	0 %	50 %	25 %	507527134
1135	NC_021295	ATC	2	6	63708	63713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507527134
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1137	NC_021295	CGC	2	6	63736	63741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507527134
1138	NC_021295	CG	3	6	63799	63804	0 %	0 %	50 %	50 %	507527134
1139	NC_021295	ACG	2	6	63835	63840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507527134
1140	NC_021295	CAGGC	2	10	63872	63881	20 %	0 %	40 %	40 %	507527134
1141	NC_021295	TTG	2	6	63891	63896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	507527134
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1145	NC_021295	GCC	2	6	64076	64081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507527134
1146	NC_021295	GC	3	6	64204	64209	0 %	0 %	50 %	50 %	507527134
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1153	NC_021295	GAT	2	6	64541	64546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507527135
1154	NC_021295	TGA	2	6	64630	64635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507527135
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1239	NC_021295	ATCCG	2	10	71549	71558	20 %	20 %	20 %	40 %	507527143
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1243	NC_021295	GAGT	2	8	71786	71793	25 %	25 %	50 %	0 %	507527143
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1497	NC_021295	CG	3	6	85712	85717	0 %	0 %	50 %	50 %	507527155
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