MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia sp. RPE64 plasmid p1 DNA

Total Repeats: 31438

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_021289	ATGCCG	2	12	158203	158214	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	507518456
4002	NC_021289	CGG	3	9	158245	158253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518456
4003	NC_021289	CG	3	6	158257	158262	0 %	0 %	50 %	50 %	507518456
4004	NC_021289	TCA	2	6	158272	158277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507518456
4005	NC_021289	GCT	2	6	158345	158350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518456
4006	NC_021289	CGTGCG	2	12	158366	158377	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	507518456
4007	NC_021289	TGC	2	6	158401	158406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518456
4008	NC_021289	CGG	2	6	158443	158448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518456
4009	NC_021289	ACCGTC	2	12	158463	158474	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	507518456
4010	NC_021289	CGA	2	6	158480	158485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518456
4011	NC_021289	AGCG	2	8	158517	158524	25 %	0 %	50 %	25 %	507518456
4012	NC_021289	CGGCT	2	10	158562	158571	0 %	20 %	40 %	40 %	507518456
4013	NC_021289	CCGG	2	8	158573	158580	0 %	0 %	50 %	50 %	507518456
4014	NC_021289	GC	3	6	158603	158608	0 %	0 %	50 %	50 %	507518456
4015	NC_021289	TGA	2	6	158641	158646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507518456
4016	NC_021289	CGA	2	6	158663	158668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518456
4017	NC_021289	CGA	2	6	158690	158695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518456
4018	NC_021289	GCC	2	6	158703	158708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518456
4019	NC_021289	CGCT	2	8	158730	158737	0 %	25 %	25 %	50 %	507518456
4020	NC_021289	CGG	3	9	158746	158754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518456
4021	NC_021289	CG	4	8	158767	158774	0 %	0 %	50 %	50 %	507518456
4022	NC_021289	GC	3	6	158830	158835	0 %	0 %	50 %	50 %	507518456
4023	NC_021289	GC	3	6	158858	158863	0 %	0 %	50 %	50 %	507518456
4024	NC_021289	CAT	2	6	158885	158890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507518456
4025	NC_021289	CGG	2	6	158908	158913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518456
4026	NC_021289	CGG	2	6	158944	158949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518456
4027	NC_021289	GC	3	6	158951	158956	0 %	0 %	50 %	50 %	507518456
4028	NC_021289	TGCG	2	8	158975	158982	0 %	25 %	50 %	25 %	507518456
4029	NC_021289	TCG	2	6	159055	159060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518456
4030	NC_021289	TCGGC	2	10	159118	159127	0 %	20 %	40 %	40 %	507518456
4031	NC_021289	CCGG	2	8	159174	159181	0 %	0 %	50 %	50 %	507518456
4032	NC_021289	GCT	2	6	159197	159202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518456
4033	NC_021289	GCGA	2	8	159249	159256	25 %	0 %	50 %	25 %	507518456
4034	NC_021289	GCTTC	2	10	159282	159291	0 %	40 %	20 %	40 %	507518457
4035	NC_021289	GGC	2	6	159299	159304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518457
4036	NC_021289	GCG	2	6	159328	159333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518457
4037	NC_021289	CGA	2	6	159340	159345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518457
4038	NC_021289	TTG	2	6	159357	159362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	507518457
4039	NC_021289	ACG	2	6	159363	159368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518457
4040	NC_021289	CG	4	8	159458	159465	0 %	0 %	50 %	50 %	507518457
4041	NC_021289	GC	3	6	159499	159504	0 %	0 %	50 %	50 %	507518457
4042	NC_021289	GTC	2	6	159537	159542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518457
4043	NC_021289	GCG	2	6	159598	159603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518457
4044	NC_021289	TTC	2	6	159690	159695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	507518457
4045	NC_021289	GAT	2	6	159725	159730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507518457
4046	NC_021289	GGT	2	6	159887	159892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	507518457
4047	NC_021289	GCC	3	9	159989	159997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518457
4048	NC_021289	GCAG	2	8	160001	160008	25 %	0 %	50 %	25 %	507518457
4049	NC_021289	AGC	2	6	160026	160031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518457
4050	NC_021289	GTTC	2	8	160464	160471	0 %	50 %	25 %	25 %	507518458
4051	NC_021289	CTG	3	9	160531	160539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518458
4052	NC_021289	CGG	2	6	160548	160553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518458
4053	NC_021289	GGC	2	6	160569	160574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518458
4054	NC_021289	CTG	2	6	160630	160635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518458
4055	NC_021289	GGA	2	6	160650	160655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	507518458
4056	NC_021289	ATC	2	6	160672	160677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507518458
4057	NC_021289	GCG	2	6	160769	160774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518458
4058	NC_021289	GCT	2	6	160797	160802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518458
4059	NC_021289	CGG	3	9	160806	160814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518458
4060	NC_021289	CGG	2	6	160832	160837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518458
4061	NC_021289	CCG	2	6	160883	160888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518458
4062	NC_021289	CGC	2	6	160905	160910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518458
4063	NC_021289	TCA	2	6	160943	160948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507518458
4064	NC_021289	CGA	2	6	160956	160961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518458
4065	NC_021289	TGA	2	6	160991	160996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507518458
4066	NC_021289	GCAAG	2	10	161061	161070	40 %	0 %	40 %	20 %	507518458
4067	NC_021289	ACG	2	6	161123	161128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518458
4068	NC_021289	CG	4	8	161127	161134	0 %	0 %	50 %	50 %	507518458
4069	NC_021289	GCG	2	6	161150	161155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518458
4070	NC_021289	GCCG	2	8	161181	161188	0 %	0 %	50 %	50 %	507518458
4071	NC_021289	GGC	2	6	161194	161199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518458
4072	NC_021289	GGC	2	6	161256	161261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518458
4073	NC_021289	GC	3	6	161260	161265	0 %	0 %	50 %	50 %	507518458
4074	NC_021289	CGG	2	6	161370	161375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518459
4075	NC_021289	GCC	2	6	161395	161400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518459
4076	NC_021289	TCCG	2	8	161516	161523	0 %	25 %	25 %	50 %	507518459
4077	NC_021289	GCT	3	9	161588	161596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518459
4078	NC_021289	GCC	2	6	161608	161613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518459
4079	NC_021289	GCTTCG	2	12	161692	161703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518459
4080	NC_021289	CGC	2	6	161749	161754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518459
4081	NC_021289	CCG	2	6	161768	161773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518459
4082	NC_021289	TA	3	6	161795	161800	50 %	50 %	0 %	0 %	507518459
4083	NC_021289	GCGCC	2	10	161814	161823	0 %	0 %	40 %	60 %	507518459
4084	NC_021289	TCC	2	6	161827	161832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	507518459
4085	NC_021289	GCC	2	6	161903	161908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518459
4086	NC_021289	GCG	2	6	162002	162007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518459
4087	NC_021289	GCCC	2	8	162046	162053	0 %	0 %	25 %	75 %	507518459
4088	NC_021289	GCG	2	6	162128	162133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518459
4089	NC_021289	GCG	3	9	162143	162151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518459
4090	NC_021289	TCA	2	6	162173	162178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507518459
4091	NC_021289	GCG	2	6	162187	162192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518459
4092	NC_021289	TGGCC	2	10	162194	162203	0 %	20 %	40 %	40 %	507518459
4093	NC_021289	GCG	2	6	162206	162211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518459
4094	NC_021289	TCG	2	6	162223	162228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518459
4095	NC_021289	ACG	2	6	162247	162252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518459
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4097	NC_021289	TCGC	2	8	162283	162290	0 %	25 %	25 %	50 %	507518459
4098	NC_021289	GC	3	6	162289	162294	0 %	0 %	50 %	50 %	507518459
4099	NC_021289	CAG	2	6	162300	162305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518459
4100	NC_021289	CG	3	6	162306	162311	0 %	0 %	50 %	50 %	507518459
4101	NC_021289	GC	3	6	162362	162367	0 %	0 %	50 %	50 %	507518459
4102	NC_021289	TGA	2	6	162373	162378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507518459
4103	NC_021289	CAGCCG	2	12	162494	162505	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	507518459
4104	NC_021289	CGC	2	6	162536	162541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518459
4105	NC_021289	GC	3	6	162540	162545	0 %	0 %	50 %	50 %	507518459
4106	NC_021289	GCC	2	6	162571	162576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518459
4107	NC_021289	GCC	2	6	162595	162600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518459
4108	NC_021289	GA	3	6	162711	162716	50 %	0 %	50 %	0 %	507518459
4109	NC_021289	CGGC	2	8	162729	162736	0 %	0 %	50 %	50 %	507518459
4110	NC_021289	TGC	2	6	162828	162833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518460
4111	NC_021289	GCCGT	2	10	162869	162878	0 %	20 %	40 %	40 %	507518460
4112	NC_021289	GACG	2	8	162883	162890	25 %	0 %	50 %	25 %	507518460
4113	NC_021289	GACC	2	8	162906	162913	25 %	0 %	25 %	50 %	507518460
4114	NC_021289	CGA	3	9	162981	162989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518460
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4116	NC_021289	CGG	2	6	163029	163034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518460
4117	NC_021289	CGG	2	6	163080	163085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518460
4118	NC_021289	TCT	2	6	163092	163097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	507518460
4119	NC_021289	CTT	2	6	163098	163103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	507518460
4120	NC_021289	GAT	2	6	163258	163263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507518460
4121	NC_021289	CGT	2	6	163273	163278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518460
4122	NC_021289	GCG	2	6	163299	163304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518460
4123	NC_021289	CGA	2	6	163305	163310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518460
4124	NC_021289	CAT	2	6	163312	163317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507518460
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4135	NC_021289	CTG	2	6	163675	163680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518460
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4154	NC_021289	CG	3	6	164197	164202	0 %	0 %	50 %	50 %	507518461
4155	NC_021289	GCA	2	6	164210	164215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518461
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4243	NC_021289	CGT	2	6	167402	167407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518464
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4245	NC_021289	CGA	2	6	167438	167443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518464
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4366	NC_021289	GGC	2	6	172252	172257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518468
4367	NC_021289	GGC	2	6	172284	172289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518468
4368	NC_021289	GAT	2	6	172296	172301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507518468
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4486	NC_021289	GCG	2	6	176482	176487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518472
4487	NC_021289	GC	3	6	176509	176514	0 %	0 %	50 %	50 %	507518472
4488	NC_021289	ACT	2	6	176520	176525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507518472
4489	NC_021289	ACCGCG	2	12	176535	176546	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	507518472
4490	NC_021289	GGCGT	2	10	176571	176580	0 %	20 %	60 %	20 %	507518472
4491	NC_021289	GCT	2	6	176609	176614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518472
4492	NC_021289	GC	3	6	176620	176625	0 %	0 %	50 %	50 %	507518472
4493	NC_021289	CAG	2	6	176646	176651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518472
4494	NC_021289	TCA	2	6	176671	176676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507518472
4495	NC_021289	GCC	2	6	176685	176690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518472
4496	NC_021289	TGAT	2	8	176713	176720	25 %	50 %	25 %	0 %	507518472
4497	NC_021289	TCG	2	6	176728	176733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518472
4498	NC_021289	TCGCG	2	10	176741	176750	0 %	20 %	40 %	40 %	507518472
4499	NC_021289	CAA	2	6	176768	176773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	507518472
4500	NC_021289	CGC	2	6	176798	176803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518472

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