MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia sp. RPE64 plasmid p1 DNA

Total Repeats: 31438

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_021289	GGC	2	6	119083	119088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518415
3002	NC_021289	CAG	2	6	119098	119103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518415
3003	NC_021289	CGC	2	6	119111	119116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518415
3004	NC_021289	CGT	2	6	119155	119160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518415
3005	NC_021289	TGT	2	6	119162	119167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	507518415
3006	NC_021289	TGA	2	6	119213	119218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507518415
3007	NC_021289	CGG	2	6	119274	119279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518415
3008	NC_021289	CGG	2	6	119340	119345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518415
3009	NC_021289	CGGC	2	8	119369	119376	0 %	0 %	50 %	50 %	507518415
3010	NC_021289	ACG	3	9	119378	119386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518415
3011	NC_021289	TCA	2	6	119396	119401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507518415
3012	NC_021289	CCG	2	6	119402	119407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518415
3013	NC_021289	CGG	2	6	119540	119545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518415
3014	NC_021289	CG	3	6	119568	119573	0 %	0 %	50 %	50 %	507518415
3015	NC_021289	ACG	2	6	119585	119590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518415
3016	NC_021289	GCGG	2	8	119611	119618	0 %	0 %	75 %	25 %	507518415
3017	NC_021289	CCG	2	6	119681	119686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518415
3018	NC_021289	ACG	2	6	119779	119784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518415
3019	NC_021289	CGA	2	6	119786	119791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518415
3020	NC_021289	CGG	2	6	119852	119857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518415
3021	NC_021289	GAA	2	6	119919	119924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507518415
3022	NC_021289	CGA	2	6	119933	119938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518415
3023	NC_021289	CGAC	2	8	119945	119952	25 %	0 %	25 %	50 %	507518415
3024	NC_021289	CG	4	8	120033	120040	0 %	0 %	50 %	50 %	507518415
3025	NC_021289	CGG	2	6	120137	120142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518415
3026	NC_021289	ATC	2	6	120146	120151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507518415
3027	NC_021289	GAGC	2	8	120159	120166	25 %	0 %	50 %	25 %	507518415
3028	NC_021289	CGG	2	6	120230	120235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518415
3029	NC_021289	GCATCG	2	12	120241	120252	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	507518415
3030	NC_021289	GCG	3	9	120275	120283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518415
3031	NC_021289	GC	3	6	120290	120295	0 %	0 %	50 %	50 %	507518415
3032	NC_021289	AAC	2	6	120341	120346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	507518415
3033	NC_021289	AAG	2	6	120412	120417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507518415
3034	NC_021289	GGCG	2	8	120444	120451	0 %	0 %	75 %	25 %	507518415
3035	NC_021289	GGC	2	6	120468	120473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518415
3036	NC_021289	GGGC	2	8	120480	120487	0 %	0 %	75 %	25 %	507518415
3037	NC_021289	GACGC	2	10	120523	120532	20 %	0 %	40 %	40 %	507518415
3038	NC_021289	TCGG	2	8	120553	120560	0 %	25 %	50 %	25 %	507518415
3039	NC_021289	GGCG	2	8	120603	120610	0 %	0 %	75 %	25 %	507518415
3040	NC_021289	GCT	2	6	120630	120635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518415
3041	NC_021289	GCTGAC	2	12	120654	120665	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	507518415
3042	NC_021289	CGG	2	6	120690	120695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518415
3043	NC_021289	CGG	2	6	120716	120721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518415
3044	NC_021289	ACCG	2	8	120745	120752	25 %	0 %	25 %	50 %	507518415
3045	NC_021289	ACGA	2	8	120766	120773	50 %	0 %	25 %	25 %	507518415
3046	NC_021289	TTC	2	6	120775	120780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	507518415
3047	NC_021289	TTC	2	6	120819	120824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	507518415
3048	NC_021289	GATCT	2	10	120892	120901	20 %	40 %	20 %	20 %	507518415
3049	NC_021289	TGC	2	6	120917	120922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518415
3050	NC_021289	TCG	2	6	120980	120985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518415
3051	NC_021289	TGA	2	6	121001	121006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507518415
3052	NC_021289	GAA	2	6	121026	121031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507518415
3053	NC_021289	GGC	2	6	121035	121040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518415
3054	NC_021289	TCGT	2	8	121157	121164	0 %	50 %	25 %	25 %	507518416
3055	NC_021289	GACAT	2	10	121177	121186	40 %	20 %	20 %	20 %	507518416
3056	NC_021289	CGC	2	6	121211	121216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518416
3057	NC_021289	CG	3	6	121221	121226	0 %	0 %	50 %	50 %	507518416
3058	NC_021289	CG	3	6	121277	121282	0 %	0 %	50 %	50 %	507518416
3059	NC_021289	ACC	2	6	121317	121322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	507518416
3060	NC_021289	CG	3	6	121369	121374	0 %	0 %	50 %	50 %	507518416
3061	NC_021289	GCTC	2	8	121382	121389	0 %	25 %	25 %	50 %	507518416
3062	NC_021289	TCG	2	6	121402	121407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518416
3063	NC_021289	TCGA	2	8	121518	121525	25 %	25 %	25 %	25 %	507518416
3064	NC_021289	CGA	2	6	121538	121543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518416
3065	NC_021289	GCCGC	2	10	121545	121554	0 %	0 %	40 %	60 %	507518416
3066	NC_021289	CG	3	6	121592	121597	0 %	0 %	50 %	50 %	507518416
3067	NC_021289	GC	3	6	121598	121603	0 %	0 %	50 %	50 %	507518416
3068	NC_021289	GCG	3	9	121615	121623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518416
3069	NC_021289	TCG	2	6	121633	121638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518416
3070	NC_021289	CG	3	6	121641	121646	0 %	0 %	50 %	50 %	507518416
3071	NC_021289	TTC	2	6	121653	121658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	507518416
3072	NC_021289	CGA	2	6	121676	121681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518416
3073	NC_021289	CG	3	6	121688	121693	0 %	0 %	50 %	50 %	507518416
3074	NC_021289	CTGT	2	8	121724	121731	0 %	50 %	25 %	25 %	507518416
3075	NC_021289	CG	3	6	121750	121755	0 %	0 %	50 %	50 %	507518416
3076	NC_021289	CTG	2	6	121803	121808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518416
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3079	NC_021289	CGG	2	6	121874	121879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518416
3080	NC_021289	GC	3	6	121887	121892	0 %	0 %	50 %	50 %	507518416
3081	NC_021289	GGC	2	6	121902	121907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518416
3082	NC_021289	GC	3	6	121913	121918	0 %	0 %	50 %	50 %	507518416
3083	NC_021289	TCG	2	6	121930	121935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518416
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3087	NC_021289	GCG	2	6	122244	122249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518417
3088	NC_021289	CGTC	2	8	122293	122300	0 %	25 %	25 %	50 %	507518417
3089	NC_021289	GC	3	6	122331	122336	0 %	0 %	50 %	50 %	507518417
3090	NC_021289	TTC	2	6	122337	122342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	507518417
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3092	NC_021289	GC	3	6	122358	122363	0 %	0 %	50 %	50 %	507518417
3093	NC_021289	GGC	2	6	122391	122396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518417
3094	NC_021289	CGG	2	6	122422	122427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518417
3095	NC_021289	CGC	2	6	122554	122559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518418
3096	NC_021289	GC	3	6	122575	122580	0 %	0 %	50 %	50 %	507518418
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3098	NC_021289	GCG	2	6	122691	122696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518418
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3101	NC_021289	TGC	2	6	122742	122747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518418
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3103	NC_021289	CGA	2	6	122784	122789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518418
3104	NC_021289	GCCT	2	8	122803	122810	0 %	25 %	25 %	50 %	507518418
3105	NC_021289	CGGCG	2	10	122823	122832	0 %	0 %	60 %	40 %	507518418
3106	NC_021289	GC	3	6	122860	122865	0 %	0 %	50 %	50 %	507518418
3107	NC_021289	CGA	2	6	122877	122882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518418
3108	NC_021289	CGG	2	6	122957	122962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518418
3109	NC_021289	CGG	2	6	123015	123020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518418
3110	NC_021289	CGCC	2	8	123021	123028	0 %	0 %	25 %	75 %	507518418
3111	NC_021289	GCC	2	6	123067	123072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518418
3112	NC_021289	ATC	2	6	123095	123100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507518418
3113	NC_021289	GCC	2	6	123112	123117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518418
3114	NC_021289	CGCGA	2	10	123127	123136	20 %	0 %	40 %	40 %	507518418
3115	NC_021289	GC	3	6	123295	123300	0 %	0 %	50 %	50 %	507518418
3116	NC_021289	GCTT	2	8	123324	123331	0 %	50 %	25 %	25 %	507518418
3117	NC_021289	CGA	2	6	123392	123397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518419
3118	NC_021289	CGAG	2	8	123442	123449	25 %	0 %	50 %	25 %	507518419
3119	NC_021289	ACG	2	6	123495	123500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518419
3120	NC_021289	GC	3	6	123502	123507	0 %	0 %	50 %	50 %	507518419
3121	NC_021289	GAT	2	6	123509	123514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507518419
3122	NC_021289	ACA	2	6	123520	123525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	507518419
3123	NC_021289	CGC	2	6	123535	123540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518419
3124	NC_021289	CCG	2	6	123541	123546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518419
3125	NC_021289	ACG	3	9	123555	123563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518419
3126	NC_021289	GCG	2	6	123568	123573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518419
3127	NC_021289	CG	3	6	123617	123622	0 %	0 %	50 %	50 %	507518419
3128	NC_021289	AGC	2	6	123714	123719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518419
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3132	NC_021289	GC	3	6	123838	123843	0 %	0 %	50 %	50 %	507518419
3133	NC_021289	CCG	2	6	123852	123857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518419
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3143	NC_021289	CGA	2	6	124088	124093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518419
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3156	NC_021289	ACG	2	6	124371	124376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518419
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3232	NC_021289	CG	4	8	127860	127867	0 %	0 %	50 %	50 %	507518423
3233	NC_021289	CGC	2	6	127898	127903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518423
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3240	NC_021289	TCT	2	6	128180	128185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	507518423
3241	NC_021289	GTG	2	6	128194	128199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	507518423
3242	NC_021289	CTG	2	6	128257	128262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518423
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3244	NC_021289	GC	3	6	128291	128296	0 %	0 %	50 %	50 %	507518423
3245	NC_021289	GGCG	2	8	128298	128305	0 %	0 %	75 %	25 %	507518423
3246	NC_021289	GAC	2	6	128327	128332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518423
3247	NC_021289	TGC	2	6	128420	128425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518423
3248	NC_021289	CTT	2	6	128436	128441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	507518423
3249	NC_021289	CGA	2	6	128501	128506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518423
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3251	NC_021289	GTG	2	6	128623	128628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	507518423
3252	NC_021289	CGT	2	6	128637	128642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518423
3253	NC_021289	TCGC	2	8	128656	128663	0 %	25 %	25 %	50 %	507518423
3254	NC_021289	CCG	3	9	128717	128725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518423
3255	NC_021289	ACG	3	9	128864	128872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518424
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3263	NC_021289	GC	3	6	129199	129204	0 %	0 %	50 %	50 %	507518424
3264	NC_021289	TGC	2	6	129216	129221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518424
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3267	NC_021289	CGA	2	6	129309	129314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518425
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3269	NC_021289	CGT	2	6	129405	129410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518425
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3273	NC_021289	CGT	3	9	129552	129560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518425
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3275	NC_021289	GCCGTC	2	12	129583	129594	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	507518425
3276	NC_021289	CAG	2	6	129616	129621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518425
3277	NC_021289	TCG	2	6	129656	129661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518425
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3281	NC_021289	CGAT	2	8	129786	129793	25 %	25 %	25 %	25 %	507518425
3282	NC_021289	TCGC	2	8	129814	129821	0 %	25 %	25 %	50 %	507518425
3283	NC_021289	ACG	2	6	129822	129827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518425
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3291	NC_021289	ACG	2	6	130110	130115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518425
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3310	NC_021289	GTC	2	6	130666	130671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518425
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3352	NC_021289	ACGA	2	8	132434	132441	50 %	0 %	25 %	25 %	507518426
3353	NC_021289	GCA	2	6	132504	132509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518427
3354	NC_021289	CTTC	2	8	132588	132595	0 %	50 %	0 %	50 %	507518427
3355	NC_021289	CGG	2	6	132609	132614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518427
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3359	NC_021289	CGCAGG	2	12	132767	132778	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	507518427
3360	NC_021289	GC	3	6	132781	132786	0 %	0 %	50 %	50 %	507518427
3361	NC_021289	GTA	2	6	132865	132870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507518427
3362	NC_021289	GCG	2	6	132882	132887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518427
3363	NC_021289	CGG	2	6	132903	132908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518427
3364	NC_021289	AGC	2	6	132923	132928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518427
3365	NC_021289	GAT	2	6	133152	133157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507518428
3366	NC_021289	GC	3	6	133214	133219	0 %	0 %	50 %	50 %	507518428
3367	NC_021289	CGA	2	6	133242	133247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518428
3368	NC_021289	ATCT	2	8	133264	133271	25 %	50 %	0 %	25 %	507518428
3369	NC_021289	GC	3	6	133277	133282	0 %	0 %	50 %	50 %	507518428
3370	NC_021289	CG	3	6	133326	133331	0 %	0 %	50 %	50 %	507518428
3371	NC_021289	GGC	2	6	133334	133339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518428
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3374	NC_021289	ATC	2	6	133411	133416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507518428
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3397	NC_021289	TCGAC	2	10	134164	134173	20 %	20 %	20 %	40 %	507518429
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3473	NC_021289	CGA	4	12	137266	137277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518432
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3478	NC_021289	CGG	2	6	137343	137348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518432
3479	NC_021289	TGCA	2	8	137383	137390	25 %	25 %	25 %	25 %	507518432
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3484	NC_021289	GGC	2	6	137525	137530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518432
3485	NC_021289	CCG	2	6	137565	137570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518432
3486	NC_021289	GC	3	6	137638	137643	0 %	0 %	50 %	50 %	507518433
3487	NC_021289	GCG	2	6	137654	137659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518433
3488	NC_021289	CGG	2	6	137660	137665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518433
3489	NC_021289	TCA	2	6	137675	137680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507518433
3490	NC_021289	TCGT	2	8	137728	137735	0 %	50 %	25 %	25 %	507518433
3491	NC_021289	GC	3	6	137781	137786	0 %	0 %	50 %	50 %	507518434
3492	NC_021289	CG	4	8	137787	137794	0 %	0 %	50 %	50 %	507518434
3493	NC_021289	CGC	2	6	137871	137876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518434
3494	NC_021289	TGC	2	6	137913	137918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518434
3495	NC_021289	TCGTC	2	10	137919	137928	0 %	40 %	20 %	40 %	507518434
3496	NC_021289	CAC	2	6	137953	137958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	507518434
3497	NC_021289	TGC	2	6	137973	137978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518434
3498	NC_021289	TCG	2	6	137985	137990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518434
3499	NC_021289	TC	3	6	137998	138003	0 %	50 %	0 %	50 %	507518434
3500	NC_021289	GCG	2	6	138024	138029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518434

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