MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia sp. RPE64 plasmid p1 DNA

Total Repeats: 31438

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021289	GTGC	2	8	20099	20106	0 %	25 %	50 %	25 %	507518313
502	NC_021289	GCC	2	6	20154	20159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518313
503	NC_021289	TCA	2	6	20215	20220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507518313
504	NC_021289	CG	4	8	20237	20244	0 %	0 %	50 %	50 %	507518313
505	NC_021289	GGC	2	6	20270	20275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518313
506	NC_021289	TCG	2	6	20284	20289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518313
507	NC_021289	ACG	2	6	20292	20297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518313
508	NC_021289	TCG	2	6	20299	20304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518313
509	NC_021289	GC	3	6	20323	20328	0 %	0 %	50 %	50 %	507518313
510	NC_021289	GC	3	6	20344	20349	0 %	0 %	50 %	50 %	507518313
511	NC_021289	CGG	2	6	20353	20358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518313
512	NC_021289	CAT	2	6	20381	20386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507518313
513	NC_021289	CGTG	2	8	20387	20394	0 %	25 %	50 %	25 %	507518313
514	NC_021289	TGCGC	2	10	20419	20428	0 %	20 %	40 %	40 %	507518313
515	NC_021289	CG	3	6	20430	20435	0 %	0 %	50 %	50 %	507518313
516	NC_021289	CTGG	2	8	20456	20463	0 %	25 %	50 %	25 %	507518313
517	NC_021289	GCTC	2	8	20495	20502	0 %	25 %	25 %	50 %	507518313
518	NC_021289	CG	3	6	20529	20534	0 %	0 %	50 %	50 %	507518313
519	NC_021289	CGA	2	6	20627	20632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518313
520	NC_021289	GGC	2	6	20673	20678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518314
521	NC_021289	GGC	2	6	20682	20687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518314
522	NC_021289	CGG	3	9	20693	20701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518314
523	NC_021289	AGG	2	6	20702	20707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	507518314
524	NC_021289	TGC	2	6	20739	20744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518314
525	NC_021289	GCC	2	6	20759	20764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518314
526	NC_021289	TGC	2	6	20826	20831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518314
527	NC_021289	GCGCC	2	10	20851	20860	0 %	0 %	40 %	60 %	507518314
528	NC_021289	CCCGCG	2	12	20889	20900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518314
529	NC_021289	GCC	3	9	20918	20926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518314
530	NC_021289	CGC	2	6	20930	20935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518314
531	NC_021289	CGC	3	9	20939	20947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518314
532	NC_021289	GCG	2	6	20994	20999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518314
533	NC_021289	CGC	2	6	21013	21018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518314
534	NC_021289	CGT	2	6	21052	21057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518314
535	NC_021289	TGCCGG	2	12	21082	21093	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	507518314
536	NC_021289	AGT	2	6	21175	21180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507518314
537	NC_021289	TGGTG	2	10	21184	21193	0 %	40 %	60 %	0 %	507518314
538	NC_021289	GGC	3	9	21244	21252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518315
539	NC_021289	CGG	2	6	21275	21280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518315
540	NC_021289	ACGC	2	8	21305	21312	25 %	0 %	25 %	50 %	507518315
541	NC_021289	GCG	2	6	21401	21406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518315
542	NC_021289	CGA	2	6	21407	21412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518315
543	NC_021289	GCG	3	9	21419	21427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518315
544	NC_021289	TAG	3	9	21430	21438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507518315
545	NC_021289	GCG	2	6	21446	21451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518315
546	NC_021289	TAA	2	6	21466	21471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	507518315
547	NC_021289	CCG	2	6	21478	21483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518315
548	NC_021289	GGC	2	6	21519	21524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518315
549	NC_021289	ACG	2	6	21577	21582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518315
550	NC_021289	A	6	6	21591	21596	100 %	0 %	0 %	0 %	507518315
551	NC_021289	AACC	2	8	21627	21634	50 %	0 %	0 %	50 %	507518315
552	NC_021289	A	6	6	21736	21741	100 %	0 %	0 %	0 %	507518316
553	NC_021289	GTCG	2	8	21819	21826	0 %	25 %	50 %	25 %	507518317
554	NC_021289	CGA	2	6	21833	21838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518317
555	NC_021289	GCC	2	6	21861	21866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518317
556	NC_021289	ACGCCG	2	12	21875	21886	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	507518317
557	NC_021289	CGC	2	6	21897	21902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518317
558	NC_021289	CCG	2	6	21923	21928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518317
559	NC_021289	CG	3	6	21927	21932	0 %	0 %	50 %	50 %	507518317
560	NC_021289	GCC	2	6	21934	21939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518317
561	NC_021289	GGT	2	6	21975	21980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	507518317
562	NC_021289	CGG	3	9	22055	22063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518317
563	NC_021289	GCC	2	6	22098	22103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518317
564	NC_021289	ACG	2	6	22111	22116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518317
565	NC_021289	CGAC	2	8	22118	22125	25 %	0 %	25 %	50 %	507518317
566	NC_021289	CG	3	6	22176	22181	0 %	0 %	50 %	50 %	507518317
567	NC_021289	AGC	2	6	22207	22212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518317
568	NC_021289	GTG	2	6	22219	22224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	507518317
569	NC_021289	CGA	2	6	22232	22237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518317
570	NC_021289	GC	3	6	22270	22275	0 %	0 %	50 %	50 %	507518317
571	NC_021289	CG	3	6	22276	22281	0 %	0 %	50 %	50 %	507518317
572	NC_021289	GC	3	6	22317	22322	0 %	0 %	50 %	50 %	507518317
573	NC_021289	GCAG	2	8	22345	22352	25 %	0 %	50 %	25 %	507518317
574	NC_021289	CGG	2	6	22385	22390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518317
575	NC_021289	CGC	2	6	22408	22413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518317
576	NC_021289	GC	4	8	22437	22444	0 %	0 %	50 %	50 %	507518317
577	NC_021289	CCGCGT	2	12	22610	22621	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	507518318
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579	NC_021289	GTAC	2	8	22652	22659	25 %	25 %	25 %	25 %	507518318
580	NC_021289	CGA	2	6	22744	22749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518318
581	NC_021289	TTC	2	6	22750	22755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	507518318
582	NC_021289	ACG	2	6	22825	22830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518318
583	NC_021289	CGG	2	6	22850	22855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518318
584	NC_021289	CG	3	6	22890	22895	0 %	0 %	50 %	50 %	507518318
585	NC_021289	GCA	2	6	22925	22930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518318
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588	NC_021289	GCG	2	6	23110	23115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518318
589	NC_021289	CGC	2	6	23153	23158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518318
590	NC_021289	CG	4	8	23268	23275	0 %	0 %	50 %	50 %	507518319
591	NC_021289	AGC	2	6	23276	23281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518319
592	NC_021289	ACG	2	6	23306	23311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518319
593	NC_021289	GCA	2	6	23358	23363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518319
594	NC_021289	GCT	2	6	23374	23379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518319
595	NC_021289	GC	3	6	23394	23399	0 %	0 %	50 %	50 %	507518319
596	NC_021289	CG	3	6	23418	23423	0 %	0 %	50 %	50 %	507518319
597	NC_021289	ACG	2	6	23471	23476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518319
598	NC_021289	CG	4	8	23485	23492	0 %	0 %	50 %	50 %	507518319
599	NC_021289	TCG	2	6	23570	23575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518319
600	NC_021289	CG	3	6	23600	23605	0 %	0 %	50 %	50 %	507518319
601	NC_021289	CG	3	6	23635	23640	0 %	0 %	50 %	50 %	507518319
602	NC_021289	AGC	2	6	23651	23656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518319
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605	NC_021289	CTT	2	6	23682	23687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	507518319
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607	NC_021289	GCGAG	2	10	23781	23790	20 %	0 %	60 %	20 %	507518319
608	NC_021289	TCG	2	6	23795	23800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518319
609	NC_021289	CAG	2	6	23806	23811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518319
610	NC_021289	CTGC	2	8	23919	23926	0 %	25 %	25 %	50 %	507518319
611	NC_021289	CGC	2	6	23939	23944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518319
612	NC_021289	CGGC	2	8	23946	23953	0 %	0 %	50 %	50 %	507518319
613	NC_021289	TTC	2	6	23981	23986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	507518319
614	NC_021289	A	7	7	24056	24062	100 %	0 %	0 %	0 %	507518319
615	NC_021289	GCG	2	6	24064	24069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518319
616	NC_021289	GAC	2	6	24097	24102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518319
617	NC_021289	CCGT	2	8	24106	24113	0 %	25 %	25 %	50 %	507518319
618	NC_021289	CG	3	6	24114	24119	0 %	0 %	50 %	50 %	507518319
619	NC_021289	CG	3	6	24122	24127	0 %	0 %	50 %	50 %	507518319
620	NC_021289	GCA	2	6	24144	24149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518319
621	NC_021289	GCCGGA	2	12	24160	24171	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	507518319
622	NC_021289	CGC	2	6	24192	24197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518319
623	NC_021289	GCC	2	6	24232	24237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518319
624	NC_021289	CGA	2	6	24243	24248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518319
625	NC_021289	GCGCTG	2	12	24269	24280	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	507518319
626	NC_021289	GC	4	8	24285	24292	0 %	0 %	50 %	50 %	507518319
627	NC_021289	CGG	2	6	24345	24350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518320
628	NC_021289	AGC	2	6	24357	24362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518320
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755	NC_021289	GGA	2	6	29378	29383	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	507518325
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