MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia thailandensis MSMB121 chromosome 1

Total Repeats: 107860

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_021173	TCG	2	6	42010	42015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488602627
1003	NC_021173	TAG	2	6	42016	42021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488602627
1004	NC_021173	TTG	2	6	42117	42122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488602627
1005	NC_021173	TGCA	2	8	42165	42172	25 %	25 %	25 %	25 %	488602627
1006	NC_021173	CG	3	6	42186	42191	0 %	0 %	50 %	50 %	488602627
1007	NC_021173	TCG	2	6	42205	42210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488602627
1008	NC_021173	TC	3	6	42245	42250	0 %	50 %	0 %	50 %	488602627
1009	NC_021173	TGA	2	6	42258	42263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488602627
1010	NC_021173	CAG	2	6	42267	42272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488602627
1011	NC_021173	CAA	2	6	42465	42470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488602627
1012	NC_021173	CCG	2	6	42493	42498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488602627
1013	NC_021173	ATCC	2	8	42536	42543	25 %	25 %	0 %	50 %	488602627
1014	NC_021173	CAA	2	6	42560	42565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488602627
1015	NC_021173	CGC	2	6	42586	42591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488602627
1016	NC_021173	TGC	2	6	42618	42623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488602627
1017	NC_021173	CG	3	6	42636	42641	0 %	0 %	50 %	50 %	488602627
1018	NC_021173	ACG	2	6	42682	42687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488602627
1019	NC_021173	CCG	2	6	42701	42706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488602627
1020	NC_021173	CGC	2	6	42854	42859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488602968
1021	NC_021173	GATCGT	2	12	42879	42890	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	488602968
1022	NC_021173	AAC	2	6	42896	42901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488602968
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1025	NC_021173	TGC	2	6	43049	43054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488602968
1026	NC_021173	TCGT	2	8	43066	43073	0 %	50 %	25 %	25 %	488602968
1027	NC_021173	CAATG	2	10	43116	43125	40 %	20 %	20 %	20 %	488602968
1028	NC_021173	TGAT	2	8	43154	43161	25 %	50 %	25 %	0 %	488602968
1029	NC_021173	GAT	2	6	43186	43191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488602968
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1032	NC_021173	GAT	2	6	43336	43341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488602968
1033	NC_021173	TGGC	2	8	43350	43357	0 %	25 %	50 %	25 %	488602968
1034	NC_021173	GCT	2	6	43506	43511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488602968
1035	NC_021173	CGG	2	6	43529	43534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488602968
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1037	NC_021173	GCG	2	6	43669	43674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488602968
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1039	NC_021173	GCCGCG	2	12	43976	43987	0 %	0 %	50 %	50 %	488602968
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1041	NC_021173	TCG	2	6	44045	44050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488602968
1042	NC_021173	GTA	2	6	44131	44136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488602968
1043	NC_021173	TCG	3	9	44186	44194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488602968
1044	NC_021173	TCG	2	6	44282	44287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488602968
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1054	NC_021173	GCA	2	6	44757	44762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488602968
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1056	NC_021173	TCG	2	6	44873	44878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488602968
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1058	NC_021173	CGGA	2	8	44922	44929	25 %	0 %	50 %	25 %	488602968
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1110	NC_021173	CAA	2	6	47445	47450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488602052
1111	NC_021173	CG	3	6	47505	47510	0 %	0 %	50 %	50 %	488602052
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1125	NC_021173	GC	3	6	48194	48199	0 %	0 %	50 %	50 %	488602052
1126	NC_021173	ATG	2	6	48257	48262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488602052
1127	NC_021173	CCG	2	6	48263	48268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488602052
1128	NC_021173	ATC	2	6	48271	48276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488602052
1129	NC_021173	TGA	2	6	48287	48292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488602052
1130	NC_021173	GTCC	2	8	48299	48306	0 %	25 %	25 %	50 %	488602052
1131	NC_021173	CTG	2	6	48346	48351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488602052
1132	NC_021173	ACCT	2	8	48382	48389	25 %	25 %	0 %	50 %	488602052
1133	NC_021173	TAC	2	6	48412	48417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488602052
1134	NC_021173	GGCC	2	8	48528	48535	0 %	0 %	50 %	50 %	488602052
1135	NC_021173	GGC	2	6	48565	48570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488602052
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1138	NC_021173	GC	3	6	48679	48684	0 %	0 %	50 %	50 %	488602052
1139	NC_021173	GATG	2	8	48733	48740	25 %	25 %	50 %	0 %	488602052
1140	NC_021173	CCA	3	9	48753	48761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488602052
1141	NC_021173	CAA	2	6	48781	48786	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488602052
1142	NC_021173	CAAT	2	8	48836	48843	50 %	25 %	0 %	25 %	488602052
1143	NC_021173	ACC	2	6	48857	48862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488602052
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1146	NC_021173	TG	4	8	49002	49009	0 %	50 %	50 %	0 %	488602052
1147	NC_021173	CAT	2	6	49050	49055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488602052
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1149	NC_021173	GC	3	6	49110	49115	0 %	0 %	50 %	50 %	488602052
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1155	NC_021173	CAA	2	6	49547	49552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488604004
1156	NC_021173	TGAT	2	8	49600	49607	25 %	50 %	25 %	0 %	488604004
1157	NC_021173	ACC	2	6	49633	49638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488604004
1158	NC_021173	CGA	2	6	49640	49645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488604004
1159	NC_021173	GGA	2	6	49720	49725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488604004
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1161	NC_021173	GCG	2	6	49904	49909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488604004
1162	NC_021173	GCG	2	6	49925	49930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488604004
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1164	NC_021173	CG	3	6	49973	49978	0 %	0 %	50 %	50 %	488604004
1165	NC_021173	GCA	2	6	49991	49996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488604004
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1171	NC_021173	CGT	2	6	50324	50329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488604004
1172	NC_021173	CAA	2	6	50423	50428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488604004
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1241	NC_021173	GC	3	6	55332	55337	0 %	0 %	50 %	50 %	488603312
1242	NC_021173	CG	3	6	55385	55390	0 %	0 %	50 %	50 %	488603312
1243	NC_021173	CCG	2	6	55410	55415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488603312
1244	NC_021173	TCGA	2	8	55439	55446	25 %	25 %	25 %	25 %	488603312
1245	NC_021173	GCC	2	6	55524	55529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488603312
1246	NC_021173	GCC	2	6	55556	55561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488603312
1247	NC_021173	CAT	2	6	55659	55664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488603312
1248	NC_021173	A	6	6	55670	55675	100 %	0 %	0 %	0 %	488603312
1249	NC_021173	TCG	2	6	55931	55936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488603312
1250	NC_021173	GTC	2	6	56011	56016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488603312
1251	NC_021173	ATCG	2	8	56017	56024	25 %	25 %	25 %	25 %	488603312
1252	NC_021173	ATG	2	6	56107	56112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488603312
1253	NC_021173	GCCAT	2	10	56160	56169	20 %	20 %	20 %	40 %	488603312
1254	NC_021173	GA	4	8	56202	56209	50 %	0 %	50 %	0 %	488603312
1255	NC_021173	GTT	2	6	56224	56229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488603312
1256	NC_021173	ACT	2	6	56324	56329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488603312
1257	NC_021173	CAC	2	6	56352	56357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488603312
1258	NC_021173	GAC	2	6	56398	56403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488603312
1259	NC_021173	GAT	2	6	56433	56438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488603312
1260	NC_021173	CA	3	6	56451	56456	50 %	0 %	0 %	50 %	488603312
1261	NC_021173	ACC	2	6	56462	56467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488603312
1262	NC_021173	CG	3	6	56494	56499	0 %	0 %	50 %	50 %	488603312
1263	NC_021173	TCC	2	6	56535	56540	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488603312
1264	NC_021173	TTG	2	6	56542	56547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488603312
1265	NC_021173	ATG	2	6	56671	56676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488603312
1266	NC_021173	TATG	2	8	56731	56738	25 %	50 %	25 %	0 %	488603312
1267	NC_021173	GAT	2	6	56779	56784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488603312
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1269	NC_021173	GGA	2	6	56874	56879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488603312
1270	NC_021173	ACG	2	6	56900	56905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488603312
1271	NC_021173	GAA	2	6	56916	56921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488603312
1272	NC_021173	GTG	2	6	56939	56944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488603312
1273	NC_021173	ACATC	2	10	56957	56966	40 %	20 %	0 %	40 %	488603312
1274	NC_021173	CAA	2	6	57004	57009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488603312
1275	NC_021173	TCG	2	6	57034	57039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488603312
1276	NC_021173	ATTGTC	2	12	57485	57496	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	488601788
1277	NC_021173	ATC	2	6	57507	57512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488601788
1278	NC_021173	TCGA	2	8	57516	57523	25 %	25 %	25 %	25 %	488601788
1279	NC_021173	ACC	2	6	57545	57550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488601788
1280	NC_021173	TCG	2	6	57570	57575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488601788
1281	NC_021173	GCA	2	6	57615	57620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488601788
1282	NC_021173	GCCGAA	2	12	57701	57712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488601788
1283	NC_021173	GA	3	6	57754	57759	50 %	0 %	50 %	0 %	488601788
1284	NC_021173	ACC	2	6	57896	57901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488601788
1285	NC_021173	CAA	2	6	57979	57984	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488601788
1286	NC_021173	CGA	2	6	58003	58008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488601788
1287	NC_021173	GCCA	2	8	58057	58064	25 %	0 %	25 %	50 %	488602823
1288	NC_021173	CAA	2	6	58268	58273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488602823
1289	NC_021173	GAT	2	6	58377	58382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488602823
1290	NC_021173	TGA	2	6	58396	58401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488602823
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1292	NC_021173	TCG	2	6	58537	58542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488602823
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1294	NC_021173	GAAA	2	8	58686	58693	75 %	0 %	25 %	0 %	488602823
1295	NC_021173	CGAAC	2	10	58706	58715	40 %	0 %	20 %	40 %	488602823
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1306	NC_021173	CGCA	2	8	59353	59360	25 %	0 %	25 %	50 %	488602823
1307	NC_021173	TCC	2	6	59458	59463	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488602823
1308	NC_021173	AAG	2	6	59503	59508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488602823
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1323	NC_021173	TCGT	2	8	60532	60539	0 %	50 %	25 %	25 %	488604808
1324	NC_021173	CTG	2	6	60551	60556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488604808
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1348	NC_021173	ATGGG	2	10	63778	63787	20 %	20 %	60 %	0 %	488605226
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1357	NC_021173	T	6	6	64443	64448	0 %	100 %	0 %	0 %	488602188
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1359	NC_021173	A	7	7	64522	64528	100 %	0 %	0 %	0 %	488602188
1360	NC_021173	AT	3	6	64538	64543	50 %	50 %	0 %	0 %	488602188
1361	NC_021173	CGA	2	6	64554	64559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488602188
1362	NC_021173	CACT	2	8	64579	64586	25 %	25 %	0 %	50 %	488602188
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1366	NC_021173	GCAA	2	8	64668	64675	50 %	0 %	25 %	25 %	488602188
1367	NC_021173	CTA	2	6	64705	64710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488602188
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1371	NC_021173	TGA	2	6	64830	64835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488602188
1372	NC_021173	ACAA	2	8	64885	64892	75 %	0 %	0 %	25 %	488602188
1373	NC_021173	AAT	2	6	64995	65000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488602188
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1375	NC_021173	A	6	6	65038	65043	100 %	0 %	0 %	0 %	488602188
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