MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Butyrate-producing bacterium SSC/2

Total Repeats: 1214

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021016	GGACAA	2	12	542	553	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	479158861
2	NC_021016	TAAAGT	2	12	1329	1340	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	479158862
3	NC_021016	GAGAAA	2	12	2091	2102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479158865
4	NC_021016	AAAAAT	2	12	2372	2383	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	479158866
5	NC_021016	TCAGGA	2	12	5872	5883	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	479158872
6	NC_021016	TTAGAT	2	12	6112	6123	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	479158873
7	NC_021016	GATGCA	2	12	6620	6631	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	479158874
8	NC_021016	ATTCGT	2	12	15996	16007	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	479158886
9	NC_021016	CTTCCA	2	12	25156	25167	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	479158890
10	NC_021016	GATGAA	2	12	25177	25188	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	479158890
11	NC_021016	AGTAAG	2	12	30556	30567	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	479158896
12	NC_021016	ATCTGA	2	12	35334	35345	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	479158899
13	NC_021016	CAATGT	2	12	35383	35394	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	479158899
14	NC_021016	AATATT	2	12	35659	35670	50 %	50 %	0 %	0 %	479158900
15	NC_021016	TTTGGA	2	12	37719	37730	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	479158901
16	NC_021016	GTCTAA	2	12	37992	38003	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	479158901
17	NC_021016	GACTTT	2	12	38067	38078	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	479158901
18	NC_021016	TCAGAA	2	12	40355	40366	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	479158903
19	NC_021016	ATCTTG	2	12	51551	51562	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	479158910
20	NC_021016	ATGATT	2	12	51872	51883	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	479158910
21	NC_021016	TGATAT	2	12	52317	52328	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	479158912
22	NC_021016	GCACAG	2	12	55003	55014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479158915
23	NC_021016	TGCTCC	2	12	61376	61387	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	479158923
24	NC_021016	TTTTCC	2	12	61451	61462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479158923
25	NC_021016	ATTTTT	2	12	62822	62833	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	479158925
26	NC_021016	AATAGA	2	12	62958	62969	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	479158925
27	NC_021016	TGCCTG	2	12	64029	64040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479158925
28	NC_021016	TTCGCA	2	12	64357	64368	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	479158925
29	NC_021016	CACCAT	2	12	64961	64972	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	479158925
30	NC_021016	TTGTTA	2	12	65547	65558	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	479158926
31	NC_021016	AATCAA	2	12	66697	66708	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	479158926
32	NC_021016	TTTAAT	2	12	68804	68815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479158929
33	NC_021016	ATCGGT	2	12	73157	73168	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	479158933
34	NC_021016	ATATTA	2	12	77353	77364	50 %	50 %	0 %	0 %	479158936
35	NC_021016	CGGATA	2	12	78214	78225	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	479158937
36	NC_021016	CATTTT	2	12	78876	78887	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	479158938
37	NC_021016	GGAAAA	2	12	79457	79468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479158939
38	NC_021016	AATGAA	2	12	82260	82271	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	479158941
39	NC_021016	TGGAAT	2	12	86178	86189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479158945
40	NC_021016	CCTTCA	2	12	87454	87465	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	479158947
41	NC_021016	AATGCA	2	12	93296	93307	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	479158953
42	NC_021016	AAATGC	2	12	94230	94241	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	479158954
43	NC_021016	TCTACA	2	12	98811	98822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479158958
44	NC_021016	ACAAAA	2	12	101286	101297	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	479158961
45	NC_021016	AAAATC	2	12	110673	110684	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	479158969
46	NC_021016	TGGAAT	2	12	111213	111224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479158970
47	NC_021016	GGAACT	2	12	117446	117457	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	479158975
48	NC_021016	CTTTTT	2	12	119323	119334	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	479158976
49	NC_021016	ATTTTT	2	12	120882	120893	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	479158977
50	NC_021016	AGTGCG	2	12	121000	121011	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	479158977
51	NC_021016	TCAGCG	2	12	121765	121776	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	479158977
52	NC_021016	GTTCAT	2	12	127868	127879	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	479158981
53	NC_021016	TTAATA	2	12	130439	130450	50 %	50 %	0 %	0 %	479158984
54	NC_021016	TCATTT	2	12	139665	139676	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	479158997
55	NC_021016	CTTTTG	2	12	140221	140232	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	479158997
56	NC_021016	TAAATG	2	12	141122	141133	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	479158998
57	NC_021016	GTCATA	2	12	141149	141160	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	479158998
58	NC_021016	TACATA	2	12	142003	142014	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	479158999
59	NC_021016	ACGTAA	2	12	144418	144429	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	479159002
60	NC_021016	AGGATT	2	12	144730	144741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479159003
61	NC_021016	ATGAAG	2	12	146555	146566	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	479159004
62	NC_021016	GATATG	2	12	147455	147466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479159005
63	NC_021016	GATGGA	2	12	148631	148642	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	479159006
64	NC_021016	CAACGA	2	12	148823	148834	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	479159007
65	NC_021016	ATCATT	2	12	149074	149085	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	479159007
66	NC_021016	TATTTT	2	12	153345	153356	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	479159010
67	NC_021016	GGAAGA	2	12	156683	156694	50 %	0 %	50 %	0 %	479159013
68	NC_021016	ATTTTC	2	12	161943	161954	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	479159017
69	NC_021016	AAAGAA	2	12	162110	162121	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	479159017
70	NC_021016	ATAACA	2	12	162688	162699	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	479159018
71	NC_021016	AGCGGC	2	12	163040	163051	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	479159018
72	NC_021016	CGTAAA	2	12	166630	166641	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	479159021
73	NC_021016	GATCGA	2	12	167419	167430	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	479159022
74	NC_021016	ATAAAA	2	12	169757	169768	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	479159024
75	NC_021016	AGATTG	2	12	172402	172413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479159028
76	NC_021016	GTATGA	2	12	177633	177644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479159032
77	NC_021016	TGGATG	2	12	177673	177684	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	479159034
78	NC_021016	GGAATG	2	12	179738	179749	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	479159036
79	NC_021016	TACTTT	2	12	179961	179972	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	479159036
80	NC_021016	TTAAAA	2	12	181266	181277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479159036
81	NC_021016	AAAAGT	2	12	182338	182349	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	479159038
82	NC_021016	AGCACA	2	12	193438	193449	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	479159047
83	NC_021016	TTGTGC	2	12	196643	196654	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	479159052
84	NC_021016	GTTTCA	2	12	197422	197433	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	479159052
85	NC_021016	TTGCTG	2	12	201490	201501	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	479159053
86	NC_021016	TCAAAG	2	12	203566	203577	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	479159054
87	NC_021016	TGGAAA	2	12	220316	220327	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	479159065
88	NC_021016	TGATTG	2	12	222244	222255	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	479159066
89	NC_021016	GCAGAA	2	12	222732	222743	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	479159067
90	NC_021016	AAATTT	2	12	228501	228512	50 %	50 %	0 %	0 %	479159075
91	NC_021016	TCGCAA	2	12	228607	228618	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	479159075
92	NC_021016	CGGAGA	2	12	230614	230625	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	479159077
93	NC_021016	TGAAGA	2	12	230797	230808	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	479159077
94	NC_021016	AGCAGG	2	12	233421	233432	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	479159079
95	NC_021016	TGCCAT	2	12	234275	234286	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	479159080
96	NC_021016	ATCGGA	2	12	234330	234341	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	479159080
97	NC_021016	GGGAAT	2	12	237190	237201	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	479159082
98	NC_021016	TCCAGA	2	12	237397	237408	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	479159082
99	NC_021016	CAAATG	2	12	238643	238654	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	479159083
100	NC_021016	CATTTG	2	12	238883	238894	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	479159083
101	NC_021016	AGTGGA	2	12	240699	240710	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	479159084
102	NC_021016	CAGGCT	2	12	242200	242211	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	479159085
103	NC_021016	CTAAAA	2	12	243313	243324	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	479159088
104	NC_021016	GAATTG	2	12	246696	246707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479159092
105	NC_021016	GAAATT	2	12	247948	247959	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	479159093
106	NC_021016	GATTTG	2	12	251211	251222	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	479159097
107	NC_021016	CTTACA	2	12	253819	253830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479159101
108	NC_021016	CATAAA	2	12	254099	254110	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	479159101
109	NC_021016	TGCCTT	2	12	255135	255146	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	479159102
110	NC_021016	CTTTTC	2	12	256253	256264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479159102
111	NC_021016	TCTTTT	2	12	257485	257496	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	479159102
112	NC_021016	CTGTTG	2	12	257528	257539	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	479159102
113	NC_021016	GATCAA	2	12	263159	263170	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	479159105
114	NC_021016	GATCTG	2	12	263553	263564	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	479159106
115	NC_021016	TGCTGT	2	12	265025	265036	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	479159108
116	NC_021016	ATATTT	2	12	271557	271568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479159112
117	NC_021016	CTCAAT	2	12	271583	271594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479159112
118	NC_021016	TCTGTT	3	18	274662	274679	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	479159116
119	NC_021016	ATGTCC	2	12	276909	276920	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	479159118
120	NC_021016	ATGCCA	2	12	277614	277625	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	479159119
121	NC_021016	TTCTTT	2	12	278330	278341	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	479159120
122	NC_021016	TTAATT	2	12	279799	279810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479159120
123	NC_021016	TCGTCT	2	12	281434	281445	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	479159121
124	NC_021016	TCTTTT	2	12	281529	281540	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	479159121
125	NC_021016	CGTATC	2	12	285443	285454	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	479159125
126	NC_021016	TACTTT	2	12	291621	291632	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	479159128
127	NC_021016	CTTGAT	2	12	292570	292581	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	479159129
128	NC_021016	CCTTGA	2	12	292628	292639	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	479159129
129	NC_021016	TCCAGA	2	12	294643	294654	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	479159130
130	NC_021016	GCCATT	2	12	295067	295078	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	479159131
131	NC_021016	GCTTTT	2	12	296974	296985	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	479159133
132	NC_021016	TCCTTT	2	12	298066	298077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479159134
133	NC_021016	TCTTAT	2	12	299288	299299	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	479159135
134	NC_021016	TTATAA	2	12	305715	305726	50 %	50 %	0 %	0 %	479159144
135	NC_021016	TAAATA	2	12	307076	307087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479159144
136	NC_021016	TGAATA	2	12	307530	307541	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	479159145
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139	NC_021016	TTTCTC	2	12	317497	317508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479159156
140	NC_021016	CATGAA	2	12	338524	338535	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	479159175
141	NC_021016	TTTGCT	2	12	340000	340011	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	479159176
142	NC_021016	ATTTCT	2	12	340271	340282	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	479159177
143	NC_021016	TGTTCT	2	12	340970	340981	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	479159177
144	NC_021016	TTTCTT	2	12	341109	341120	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	479159177
145	NC_021016	GAATAT	2	12	350534	350545	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	479159186
146	NC_021016	TTTAAA	2	12	354141	354152	50 %	50 %	0 %	0 %	479159189
147	NC_021016	CGATCC	2	12	357366	357377	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	479159190
148	NC_021016	ATTTTT	2	12	357882	357893	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	479159190
149	NC_021016	TATTGA	2	12	361045	361056	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	479159193
150	NC_021016	TTGTCT	2	12	361324	361335	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	479159193
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152	NC_021016	TCTACT	2	12	364964	364975	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	479159197
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170	NC_021016	TCATTA	2	12	429357	429368	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	479159255
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179	NC_021016	ATGATC	2	12	453583	453594	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	479159277
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181	NC_021016	TCTGTA	2	12	454559	454570	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	479159278
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230	NC_021016	TGAAGT	2	12	557479	557490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479159368
231	NC_021016	CGTATC	2	12	560033	560044	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	479159369
232	NC_021016	GGAATG	2	12	566337	566348	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	479159373
233	NC_021016	AGGAAA	2	12	570286	570297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479159378
234	NC_021016	TATTTA	2	12	576249	576260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479159383
235	NC_021016	AATCCA	2	12	577492	577503	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	479159384
236	NC_021016	ACAAGT	2	12	577741	577752	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	479159384
237	NC_021016	CAAAGA	2	12	580592	580603	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	479159388
238	NC_021016	ACGTAA	2	12	581381	581392	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	479159389
239	NC_021016	AGATCG	2	12	582486	582497	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	479159392
240	NC_021016	GTAAAG	2	12	583229	583240	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	479159393
241	NC_021016	AAAGGT	2	12	586364	586375	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	479159397
242	NC_021016	TAGTGC	2	12	587949	587960	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	479159401
243	NC_021016	TTGAAG	2	12	590915	590926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479159405
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245	NC_021016	AAGCAA	2	12	594262	594273	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	479159410
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248	NC_021016	GCAATG	2	12	597193	597204	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	479159413
249	NC_021016	TGGAAA	2	12	598279	598290	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	479159415
250	NC_021016	ACAGAA	2	12	601753	601764	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	479159420
251	NC_021016	TGAAAA	2	12	602972	602983	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	479159421
252	NC_021016	TGGAAA	2	12	603222	603233	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	479159421
253	NC_021016	GGTCAA	2	12	606771	606782	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	479159424
254	NC_021016	GTACAG	2	12	610008	610019	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	479159426
255	NC_021016	GGAGAA	2	12	612615	612626	50 %	0 %	50 %	0 %	479159428
256	NC_021016	AAAGAT	2	12	613911	613922	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	479159429
257	NC_021016	TCAAGT	2	12	619575	619586	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	479159435
258	NC_021016	TCTTCC	2	12	621298	621309	0 %	50 %	0 %	50 %	479159437
259	NC_021016	AGTCAT	2	12	621509	621520	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	479159437
260	NC_021016	TTCCTG	2	12	621543	621554	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	479159437
261	NC_021016	GTTTCA	2	12	624297	624308	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	479159440
262	NC_021016	TTGCTG	2	12	628232	628243	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	479159441
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284	NC_021016	CTTCTG	2	12	690347	690358	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	479159488
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341	NC_021016	TGTCCG	2	12	787316	787327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479159568
342	NC_021016	ATCTTC	2	12	792426	792437	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	479159575
343	NC_021016	ATGATT	2	12	798891	798902	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	479159579
344	NC_021016	TGTTCT	2	12	799871	799882	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	479159581
345	NC_021016	TCGGTT	2	12	805971	805982	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	479159585
346	NC_021016	TCTAAT	2	12	807291	807302	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	479159586
347	NC_021016	TGCTCC	2	12	808682	808693	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	479159587
348	NC_021016	ATGAAC	2	12	809366	809377	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	479159587
349	NC_021016	GTTTTG	2	12	809650	809661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479159587
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352	NC_021016	ACTTAC	2	12	840135	840146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479159611
353	NC_021016	GATCGT	2	12	840218	840229	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	479159611
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370	NC_021016	CGATCA	2	12	866283	866294	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	479159632
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381	NC_021016	CTATGA	2	12	899477	899488	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	479159663
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447	NC_021016	GTAGCA	2	12	1048848	1048859	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	479159776
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453	NC_021016	TTACTG	2	12	1070659	1070670	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	479159794
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455	NC_021016	GTGATC	2	12	1071624	1071635	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	479159796
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