MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Butyrate-producing bacterium SSC/2

Total Repeats: 56653

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_021016	TCT	2	6	272247	272252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479159113
5002	NC_021016	AGAT	2	8	272353	272360	50 %	25 %	25 %	0 %	479159113
5003	NC_021016	ACC	2	6	272395	272400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479159113
5004	NC_021016	A	7	7	272437	272443	100 %	0 %	0 %	0 %	479159113
5005	NC_021016	TCCT	2	8	272495	272502	0 %	50 %	0 %	50 %	479159113
5006	NC_021016	TCA	2	6	272562	272567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479159113
5007	NC_021016	TA	3	6	272595	272600	50 %	50 %	0 %	0 %	479159113
5008	NC_021016	TGT	2	6	272657	272662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479159113
5009	NC_021016	CTT	2	6	272664	272669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479159113
5010	NC_021016	TCT	2	6	272684	272689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479159113
5011	NC_021016	TCA	2	6	272708	272713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479159113
5012	NC_021016	ATCA	2	8	272728	272735	50 %	25 %	0 %	25 %	479159113
5013	NC_021016	CTT	2	6	272776	272781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479159113
5014	NC_021016	TCT	2	6	272795	272800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479159113
5015	NC_021016	TCT	2	6	272916	272921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479159113
5016	NC_021016	AT	3	6	273042	273047	50 %	50 %	0 %	0 %	479159113
5017	NC_021016	TCT	2	6	273098	273103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479159113
5018	NC_021016	TG	3	6	273137	273142	0 %	50 %	50 %	0 %	479159113
5019	NC_021016	TGT	2	6	273256	273261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479159114
5020	NC_021016	TTC	2	6	273271	273276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479159114
5021	NC_021016	TCT	2	6	273287	273292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479159114
5022	NC_021016	TTTC	2	8	273306	273313	0 %	75 %	0 %	25 %	479159114
5023	NC_021016	TTCT	2	8	273336	273343	0 %	75 %	0 %	25 %	479159114
5024	NC_021016	TCT	2	6	273359	273364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479159114
5025	NC_021016	TCA	2	6	273374	273379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479159114
5026	NC_021016	GATA	2	8	273418	273425	50 %	25 %	25 %	0 %	479159114
5027	NC_021016	GTT	2	6	273548	273553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479159114
5028	NC_021016	GCT	2	6	273554	273559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479159114
5029	NC_021016	T	6	6	273583	273588	0 %	100 %	0 %	0 %	479159114
5030	NC_021016	CAT	2	6	273697	273702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479159115
5031	NC_021016	TTA	2	6	273703	273708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479159115
5032	NC_021016	CTGT	2	8	273739	273746	0 %	50 %	25 %	25 %	479159115
5033	NC_021016	ACA	2	6	273747	273752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479159115
5034	NC_021016	TTG	2	6	273762	273767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479159115
5035	NC_021016	AT	3	6	273780	273785	50 %	50 %	0 %	0 %	479159115
5036	NC_021016	TTC	2	6	273794	273799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479159115
5037	NC_021016	CTTT	2	8	273802	273809	0 %	75 %	0 %	25 %	479159115
5038	NC_021016	CCTG	2	8	273816	273823	0 %	25 %	25 %	50 %	479159115
5039	NC_021016	AAC	2	6	273882	273887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479159115
5040	NC_021016	TCCA	2	8	273893	273900	25 %	25 %	0 %	50 %	479159115
5041	NC_021016	ATC	2	6	273957	273962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479159115
5042	NC_021016	AT	3	6	273969	273974	50 %	50 %	0 %	0 %	479159115
5043	NC_021016	CTT	3	9	273982	273990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479159115
5044	NC_021016	T	7	7	274031	274037	0 %	100 %	0 %	0 %	479159115
5045	NC_021016	CTT	2	6	274075	274080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479159115
5046	NC_021016	CT	3	6	274084	274089	0 %	50 %	0 %	50 %	479159115
5047	NC_021016	GTT	2	6	274220	274225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479159116
5048	NC_021016	CAG	2	6	274297	274302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479159116
5049	NC_021016	TAA	2	6	274355	274360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479159116
5050	NC_021016	TCT	2	6	274425	274430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479159116
5051	NC_021016	TGA	2	6	274432	274437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479159116
5052	NC_021016	TTTCA	2	10	274535	274544	20 %	60 %	0 %	20 %	479159116
5053	NC_021016	CTA	2	6	274588	274593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479159116
5054	NC_021016	ACC	2	6	274628	274633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479159116
5055	NC_021016	TCTGTT	3	18	274662	274679	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	479159116
5056	NC_021016	CCA	2	6	274713	274718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479159116
5057	NC_021016	CTA	2	6	274780	274785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479159116
5058	NC_021016	CCTG	2	8	274803	274810	0 %	25 %	25 %	50 %	479159116
5059	NC_021016	CTT	2	6	274818	274823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479159116
5060	NC_021016	CTTT	2	8	274956	274963	0 %	75 %	0 %	25 %	479159116
5061	NC_021016	ATG	2	6	275001	275006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479159116
5062	NC_021016	AGC	2	6	275021	275026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479159116
5063	NC_021016	TTC	2	6	275057	275062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479159116
5064	NC_021016	CT	3	6	275065	275070	0 %	50 %	0 %	50 %	479159116
5065	NC_021016	CTTC	2	8	275082	275089	0 %	50 %	0 %	50 %	479159116
5066	NC_021016	GAT	2	6	275099	275104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479159116
5067	NC_021016	TTAAG	2	10	275125	275134	40 %	40 %	20 %	0 %	479159116
5068	NC_021016	ATA	2	6	275166	275171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479159116
5069	NC_021016	TCT	2	6	275208	275213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479159116
5070	NC_021016	ATA	2	6	275216	275221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479159116
5071	NC_021016	TCA	2	6	275286	275291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479159117
5072	NC_021016	AT	3	6	275294	275299	50 %	50 %	0 %	0 %	479159117
5073	NC_021016	TCT	2	6	275308	275313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479159117
5074	NC_021016	ATC	2	6	275419	275424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479159117
5075	NC_021016	CCT	2	6	275483	275488	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479159117
5076	NC_021016	ATCAT	2	10	275617	275626	40 %	40 %	0 %	20 %	479159117
5077	NC_021016	CTT	2	6	275707	275712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479159117
5078	NC_021016	TAAA	2	8	275714	275721	75 %	25 %	0 %	0 %	479159117
5079	NC_021016	CTA	2	6	275756	275761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479159117
5080	NC_021016	AGAA	2	8	275766	275773	75 %	0 %	25 %	0 %	479159117
5081	NC_021016	TTC	3	9	275952	275960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479159118
5082	NC_021016	CGC	2	6	275991	275996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479159118
5083	NC_021016	ATG	2	6	276009	276014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479159118
5084	NC_021016	TGGT	2	8	276020	276027	0 %	50 %	50 %	0 %	479159118
5085	NC_021016	TTC	2	6	276075	276080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479159118
5086	NC_021016	GCT	3	9	276123	276131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479159118
5087	NC_021016	TGT	2	6	276132	276137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479159118
5088	NC_021016	CTG	2	6	276150	276155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479159118
5089	NC_021016	GCT	2	6	276159	276164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479159118
5090	NC_021016	ATG	2	6	276185	276190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479159118
5091	NC_021016	ACT	2	6	276192	276197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479159118
5092	NC_021016	TTG	2	6	276200	276205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479159118
5093	NC_021016	GAT	3	9	276211	276219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479159118
5094	NC_021016	AGA	2	6	276246	276251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479159118
5095	NC_021016	TCC	2	6	276255	276260	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479159118
5096	NC_021016	AAT	2	6	276305	276310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479159118
5097	NC_021016	GCT	2	6	276316	276321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479159118
5098	NC_021016	TTA	2	6	276322	276327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479159118
5099	NC_021016	GTC	2	6	276421	276426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479159118
5100	NC_021016	AAC	2	6	276435	276440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479159118
5101	NC_021016	TTG	2	6	276524	276529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479159118
5102	NC_021016	CTG	2	6	276534	276539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479159118
5103	NC_021016	TGC	2	6	276555	276560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479159118
5104	NC_021016	GAC	2	6	276578	276583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479159118
5105	NC_021016	TTC	2	6	276587	276592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479159118
5106	NC_021016	AAC	2	6	276621	276626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479159118
5107	NC_021016	TCT	2	6	276701	276706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479159118
5108	NC_021016	TGT	2	6	276720	276725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479159118
5109	NC_021016	CTT	2	6	276740	276745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479159118
5110	NC_021016	TTC	2	6	276747	276752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479159118
5111	NC_021016	CAA	2	6	276809	276814	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479159118
5112	NC_021016	TAA	2	6	276864	276869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479159118
5113	NC_021016	ACC	2	6	276876	276881	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479159118
5114	NC_021016	ATGTCC	2	12	276909	276920	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	479159118
5115	NC_021016	ACAT	2	8	276931	276938	50 %	25 %	0 %	25 %	479159118
5116	NC_021016	TC	3	6	276940	276945	0 %	50 %	0 %	50 %	479159118
5117	NC_021016	AAG	2	6	276950	276955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479159118
5118	NC_021016	ATA	2	6	276997	277002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479159118
5119	NC_021016	TAA	2	6	277053	277058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479159118
5120	NC_021016	TAA	2	6	277064	277069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479159118
5121	NC_021016	TTA	2	6	277075	277080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479159118
5122	NC_021016	ATC	2	6	277092	277097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479159118
5123	NC_021016	TTA	2	6	277129	277134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479159118
5124	NC_021016	CTG	2	6	277139	277144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479159118
5125	NC_021016	CAT	2	6	277157	277162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479159118
5126	NC_021016	GCA	2	6	277183	277188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479159118
5127	NC_021016	CTT	2	6	277227	277232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479159118
5128	NC_021016	CCAT	2	8	277370	277377	25 %	25 %	0 %	50 %	479159119
5129	NC_021016	T	6	6	277386	277391	0 %	100 %	0 %	0 %	479159119
5130	NC_021016	TTC	2	6	277397	277402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479159119
5131	NC_021016	AT	3	6	277458	277463	50 %	50 %	0 %	0 %	479159119
5132	NC_021016	TCG	2	6	277490	277495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479159119
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5134	NC_021016	TGT	2	6	277594	277599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479159119
5135	NC_021016	ATGCCA	2	12	277614	277625	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	479159119
5136	NC_021016	ATC	2	6	277669	277674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479159119
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5142	NC_021016	CAT	2	6	277976	277981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479159119
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5144	NC_021016	TTC	2	6	278055	278060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479159119
5145	NC_021016	T	6	6	278061	278066	0 %	100 %	0 %	0 %	479159119
5146	NC_021016	ATG	2	6	278070	278075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479159119
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5148	NC_021016	AAT	2	6	278142	278147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479159119
5149	NC_021016	TGCAA	2	10	278167	278176	40 %	20 %	20 %	20 %	479159119
5150	NC_021016	ATCT	2	8	278265	278272	25 %	50 %	0 %	25 %	479159120
5151	NC_021016	TTCTTT	2	12	278330	278341	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	479159120
5152	NC_021016	TGC	2	6	278366	278371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479159120
5153	NC_021016	ATC	2	6	278396	278401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479159120
5154	NC_021016	CTT	3	9	278438	278446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479159120
5155	NC_021016	T	6	6	278445	278450	0 %	100 %	0 %	0 %	479159120
5156	NC_021016	CTT	2	6	278485	278490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479159120
5157	NC_021016	ACT	2	6	278502	278507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479159120
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5159	NC_021016	TGC	2	6	278594	278599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479159120
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5161	NC_021016	TCCA	2	8	278612	278619	25 %	25 %	0 %	50 %	479159120
5162	NC_021016	TGA	2	6	278657	278662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479159120
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5180	NC_021016	T	6	6	279561	279566	0 %	100 %	0 %	0 %	479159120
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5188	NC_021016	TTC	2	6	279905	279910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479159120
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5190	NC_021016	AT	3	6	279933	279938	50 %	50 %	0 %	0 %	479159120
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5202	NC_021016	TA	3	6	280542	280547	50 %	50 %	0 %	0 %	479159121
5203	NC_021016	GGT	2	6	280593	280598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479159121
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5206	NC_021016	TC	3	6	280720	280725	0 %	50 %	0 %	50 %	479159121
5207	NC_021016	GTAAA	2	10	280744	280753	60 %	20 %	20 %	0 %	479159121
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5213	NC_021016	ATC	2	6	281040	281045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479159121
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5217	NC_021016	TTC	2	6	281381	281386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479159121
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5219	NC_021016	TCGTCT	2	12	281434	281445	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	479159121
5220	NC_021016	TCTTTT	2	12	281529	281540	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	479159121
5221	NC_021016	TC	3	6	281551	281556	0 %	50 %	0 %	50 %	479159121
5222	NC_021016	TTA	2	6	281634	281639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479159121
5223	NC_021016	ATCA	2	8	281705	281712	50 %	25 %	0 %	25 %	479159121
5224	NC_021016	TGT	2	6	281807	281812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479159121
5225	NC_021016	TTC	2	6	281813	281818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479159121
5226	NC_021016	TTCA	2	8	281828	281835	25 %	50 %	0 %	25 %	479159121
5227	NC_021016	TGC	2	6	281897	281902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479159121
5228	NC_021016	CTG	2	6	282026	282031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479159121
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5230	NC_021016	AAC	2	6	282086	282091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479159121
5231	NC_021016	TCC	2	6	282113	282118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479159121
5232	NC_021016	TCC	2	6	282131	282136	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479159121
5233	NC_021016	CCT	2	6	282150	282155	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479159121
5234	NC_021016	TTTA	2	8	282260	282267	25 %	75 %	0 %	0 %	479159121
5235	NC_021016	TCA	2	6	282282	282287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479159121
5236	NC_021016	CTA	2	6	282322	282327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479159121
5237	NC_021016	AT	3	6	282332	282337	50 %	50 %	0 %	0 %	479159121
5238	NC_021016	CAT	2	6	282433	282438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479159121
5239	NC_021016	TGA	2	6	282719	282724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479159122
5240	NC_021016	TGATC	2	10	282743	282752	20 %	40 %	20 %	20 %	479159122
5241	NC_021016	ACA	2	6	282765	282770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479159122
5242	NC_021016	TGA	2	6	282791	282796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479159122
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5244	NC_021016	CAG	2	6	282920	282925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479159122
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5253	NC_021016	CAT	2	6	283356	283361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479159123
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5362	NC_021016	GA	3	6	292187	292192	50 %	0 %	50 %	0 %	479159129
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5490	NC_021016	CGGT	2	8	297513	297520	0 %	25 %	50 %	25 %	479159134
5491	NC_021016	ATG	2	6	297529	297534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479159134
5492	NC_021016	GAT	2	6	297601	297606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479159134
5493	NC_021016	TGA	2	6	297635	297640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479159134
5494	NC_021016	CAA	2	6	297657	297662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479159134
5495	NC_021016	TCCAA	2	10	297674	297683	40 %	20 %	0 %	40 %	479159134
5496	NC_021016	CAT	2	6	297711	297716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479159134
5497	NC_021016	TGT	2	6	297815	297820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479159134
5498	NC_021016	CAA	2	6	297909	297914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479159134
5499	NC_021016	TCT	2	6	297915	297920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479159134
5500	NC_021016	TCTT	2	8	297923	297930	0 %	75 %	0 %	25 %	479159134

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