MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum F8 draft genome

Total Repeats: 1127

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021008	TCGGA	2	10	7255	7264	20 %	20 %	40 %	20 %	479134919
2	NC_021008	CCATG	2	10	8622	8631	20 %	20 %	20 %	40 %	479134920
3	NC_021008	TTCGG	2	10	8788	8797	0 %	40 %	40 %	20 %	479134920
4	NC_021008	GCCTT	2	10	8848	8857	0 %	40 %	20 %	40 %	479134920
5	NC_021008	AAGTT	2	10	9731	9740	40 %	40 %	20 %	0 %	479134921
6	NC_021008	GTCTT	2	10	10208	10217	0 %	60 %	20 %	20 %	479134921
7	NC_021008	CGGCC	2	10	11528	11537	0 %	0 %	40 %	60 %	479134921
8	NC_021008	CCGTG	2	10	13124	13133	0 %	20 %	40 %	40 %	479134923
9	NC_021008	CCAAG	2	10	13197	13206	40 %	0 %	20 %	40 %	479134923
10	NC_021008	TGCTT	2	10	13845	13854	0 %	60 %	20 %	20 %	479134924
11	NC_021008	TGAAA	2	10	14479	14488	60 %	20 %	20 %	0 %	479134925
12	NC_021008	AAAGT	2	10	14879	14888	60 %	20 %	20 %	0 %	479134925
13	NC_021008	CGGAA	2	10	16807	16816	40 %	0 %	40 %	20 %	479134926
14	NC_021008	ATTGT	2	10	18774	18783	20 %	60 %	20 %	0 %	479134929
15	NC_021008	GAATC	2	10	20850	20859	40 %	20 %	20 %	20 %	479134931
16	NC_021008	GCCGA	2	10	22297	22306	20 %	0 %	40 %	40 %	479134931
17	NC_021008	TGCTT	2	10	22502	22511	0 %	60 %	20 %	20 %	479134931
18	NC_021008	TGCCT	2	10	23996	24005	0 %	40 %	20 %	40 %	479134931
19	NC_021008	CCGTT	2	10	28717	28726	0 %	40 %	20 %	40 %	479134932
20	NC_021008	GCTCG	2	10	35318	35327	0 %	20 %	40 %	40 %	479134935
21	NC_021008	CAAGG	2	10	39149	39158	40 %	0 %	40 %	20 %	479134937
22	NC_021008	GCCGA	2	10	44102	44111	20 %	0 %	40 %	40 %	479134938
23	NC_021008	AGCTG	2	10	44361	44370	20 %	20 %	40 %	20 %	479134938
24	NC_021008	ATCAC	2	10	44856	44865	40 %	20 %	0 %	40 %	479134938
25	NC_021008	CATCG	2	10	47833	47842	20 %	20 %	20 %	40 %	479134942
26	NC_021008	GCTGT	2	10	48103	48112	0 %	40 %	40 %	20 %	479134942
27	NC_021008	ATTGG	2	10	49803	49812	20 %	40 %	40 %	0 %	479134944
28	NC_021008	ACCGC	2	10	50388	50397	20 %	0 %	20 %	60 %	479134945
29	NC_021008	CGGTG	2	10	51526	51535	0 %	20 %	60 %	20 %	479134945
30	NC_021008	CGGCC	2	10	56129	56138	0 %	0 %	40 %	60 %	479134949
31	NC_021008	CGGCC	2	10	56705	56714	0 %	0 %	40 %	60 %	479134949
32	NC_021008	TTGCG	2	10	59213	59222	0 %	40 %	40 %	20 %	479134952
33	NC_021008	ACACC	2	10	61024	61033	40 %	0 %	0 %	60 %	479134954
34	NC_021008	CATCT	2	10	61052	61061	20 %	40 %	0 %	40 %	479134954
35	NC_021008	GACCG	2	10	73962	73971	20 %	0 %	40 %	40 %	479134961
36	NC_021008	TTGGC	2	10	75859	75868	0 %	40 %	40 %	20 %	479134964
37	NC_021008	ATTCG	2	10	77574	77583	20 %	40 %	20 %	20 %	479134966
38	NC_021008	TCGAT	2	10	77964	77973	20 %	40 %	20 %	20 %	479134966
39	NC_021008	TGGCC	2	10	79625	79634	0 %	20 %	40 %	40 %	479134968
40	NC_021008	CACGG	2	10	81939	81948	20 %	0 %	40 %	40 %	479134972
41	NC_021008	CTTCG	2	10	84574	84583	0 %	40 %	20 %	40 %	479134974
42	NC_021008	CAGAC	2	10	86742	86751	40 %	0 %	20 %	40 %	479134977
43	NC_021008	GCACG	2	10	87618	87627	20 %	0 %	40 %	40 %	479134978
44	NC_021008	CCATT	2	10	87657	87666	20 %	40 %	0 %	40 %	479134978
45	NC_021008	CATGG	2	10	87896	87905	20 %	20 %	40 %	20 %	479134979
46	NC_021008	GCCGA	2	10	89359	89368	20 %	0 %	40 %	40 %	479134979
47	NC_021008	CGGTA	2	10	89921	89930	20 %	20 %	40 %	20 %	479134979
48	NC_021008	TGGCT	2	10	91699	91708	0 %	40 %	40 %	20 %	479134981
49	NC_021008	AAGCG	2	10	94845	94854	40 %	0 %	40 %	20 %	479134982
50	NC_021008	TCGTC	2	10	99978	99987	0 %	40 %	20 %	40 %	479134985
51	NC_021008	GCTGC	2	10	100881	100890	0 %	20 %	40 %	40 %	479134986
52	NC_021008	GCCCG	2	10	102495	102504	0 %	0 %	40 %	60 %	479134988
53	NC_021008	GCCAT	2	10	105026	105035	20 %	20 %	20 %	40 %	479134990
54	NC_021008	GTATC	2	10	106220	106229	20 %	40 %	20 %	20 %	479134990
55	NC_021008	ACCAC	2	10	106973	106982	40 %	0 %	0 %	60 %	479134992
56	NC_021008	GCGCG	2	10	107077	107086	0 %	0 %	60 %	40 %	479134992
57	NC_021008	CGGCG	2	10	109900	109909	0 %	0 %	60 %	40 %	479134993
58	NC_021008	CTGCG	2	10	109952	109961	0 %	20 %	40 %	40 %	479134993
59	NC_021008	CGCGT	2	10	111217	111226	0 %	20 %	40 %	40 %	479134995
60	NC_021008	CGCGC	2	10	113315	113324	0 %	0 %	40 %	60 %	479134997
61	NC_021008	GCGCG	2	10	114641	114650	0 %	0 %	60 %	40 %	479134997
62	NC_021008	TCGAT	2	10	116762	116771	20 %	40 %	20 %	20 %	479134998
63	NC_021008	CGGGT	2	10	117490	117499	0 %	20 %	60 %	20 %	479134998
64	NC_021008	GCGCG	2	10	120081	120090	0 %	0 %	60 %	40 %	479134999
65	NC_021008	GGTTC	2	10	121158	121167	0 %	40 %	40 %	20 %	479134999
66	NC_021008	GCCAC	2	10	121378	121387	20 %	0 %	20 %	60 %	479134999
67	NC_021008	GGACC	2	10	121821	121830	20 %	0 %	40 %	40 %	479134999
68	NC_021008	ATCCG	2	10	123064	123073	20 %	20 %	20 %	40 %	479135000
69	NC_021008	CGAGC	2	10	123220	123229	20 %	0 %	40 %	40 %	479135000
70	NC_021008	GTCTG	2	10	124922	124931	0 %	40 %	40 %	20 %	479135002
71	NC_021008	GAGAA	2	10	125858	125867	60 %	0 %	40 %	0 %	479135002
72	NC_021008	GACCA	2	10	126467	126476	40 %	0 %	20 %	40 %	479135003
73	NC_021008	GAATC	2	10	128849	128858	40 %	20 %	20 %	20 %	479135005
74	NC_021008	CTTCA	2	10	128937	128946	20 %	40 %	0 %	40 %	479135005
75	NC_021008	CCGAC	2	10	130480	130489	20 %	0 %	20 %	60 %	479135007
76	NC_021008	GACCA	2	10	135801	135810	40 %	0 %	20 %	40 %	479135012
77	NC_021008	GTGGC	2	10	136915	136924	0 %	20 %	60 %	20 %	479135013
78	NC_021008	CAGGT	2	10	139947	139956	20 %	20 %	40 %	20 %	479135014
79	NC_021008	AGGTC	2	10	142471	142480	20 %	20 %	40 %	20 %	479135016
80	NC_021008	GCCAA	2	10	143453	143462	40 %	0 %	20 %	40 %	479135017
81	NC_021008	ACCGC	2	10	143646	143655	20 %	0 %	20 %	60 %	479135017
82	NC_021008	CACCT	2	10	144868	144877	20 %	20 %	0 %	60 %	479135018
83	NC_021008	GTCGA	2	10	152573	152582	20 %	20 %	40 %	20 %	479135023
84	NC_021008	TCCGG	2	10	153492	153501	0 %	20 %	40 %	40 %	479135024
85	NC_021008	AGGCC	2	10	156999	157008	20 %	0 %	40 %	40 %	479135026
86	NC_021008	CAGGC	2	10	157459	157468	20 %	0 %	40 %	40 %	479135026
87	NC_021008	GATCA	2	10	164830	164839	40 %	20 %	20 %	20 %	479135030
88	NC_021008	TGCGT	2	10	170672	170681	0 %	40 %	40 %	20 %	479135033
89	NC_021008	CGTGC	2	10	171120	171129	0 %	20 %	40 %	40 %	479135033
90	NC_021008	CGGTG	2	10	171727	171736	0 %	20 %	60 %	20 %	479135034
91	NC_021008	AGTTG	2	10	172126	172135	20 %	40 %	40 %	0 %	479135034
92	NC_021008	GGCGG	2	10	174308	174317	0 %	0 %	80 %	20 %	479135035
93	NC_021008	AGCCG	2	10	174670	174679	20 %	0 %	40 %	40 %	479135035
94	NC_021008	GCGCC	2	10	176450	176459	0 %	0 %	40 %	60 %	479135036
95	NC_021008	TGGCT	2	10	177298	177307	0 %	40 %	40 %	20 %	479135037
96	NC_021008	AGATC	2	10	177990	177999	40 %	20 %	20 %	20 %	479135038
97	NC_021008	CACGG	2	10	179714	179723	20 %	0 %	40 %	40 %	479135039
98	NC_021008	CGATA	2	10	179990	179999	40 %	20 %	20 %	20 %	479135039
99	NC_021008	TCTTG	2	10	180931	180940	0 %	60 %	20 %	20 %	479135040
100	NC_021008	AGCGG	2	10	182585	182594	20 %	0 %	60 %	20 %	479135043
101	NC_021008	GCCAC	2	10	182850	182859	20 %	0 %	20 %	60 %	479135043
102	NC_021008	ACCAC	2	10	184919	184928	40 %	0 %	0 %	60 %	479135045
103	NC_021008	GTGCA	2	10	186634	186643	20 %	20 %	40 %	20 %	479135047
104	NC_021008	ATCTG	2	10	186660	186669	20 %	40 %	20 %	20 %	479135047
105	NC_021008	TGGCA	2	10	188912	188921	20 %	20 %	40 %	20 %	479135049
106	NC_021008	CGCAC	2	10	192106	192115	20 %	0 %	20 %	60 %	479135051
107	NC_021008	CGGAC	2	10	197006	197015	20 %	0 %	40 %	40 %	479135054
108	NC_021008	TCCGG	2	10	198255	198264	0 %	20 %	40 %	40 %	479135054
109	NC_021008	TCCCC	2	10	198406	198415	0 %	20 %	0 %	80 %	479135054
110	NC_021008	GCACA	2	10	200699	200708	40 %	0 %	20 %	40 %	479135056
111	NC_021008	GCCGA	2	10	206158	206167	20 %	0 %	40 %	40 %	479135061
112	NC_021008	GATGC	2	10	206355	206364	20 %	20 %	40 %	20 %	479135061
113	NC_021008	TGCGC	2	10	206956	206965	0 %	20 %	40 %	40 %	479135062
114	NC_021008	GCCAA	2	10	207359	207368	40 %	0 %	20 %	40 %	479135062
115	NC_021008	GTGGC	2	10	210922	210931	0 %	20 %	60 %	20 %	479135064
116	NC_021008	GCACG	2	10	212585	212594	20 %	0 %	40 %	40 %	479135065
117	NC_021008	TCGCC	2	10	214755	214764	0 %	20 %	20 %	60 %	479135067
118	NC_021008	CTTTG	2	10	218880	218889	0 %	60 %	20 %	20 %	479135070
119	NC_021008	CGCAT	2	10	221044	221053	20 %	20 %	20 %	40 %	479135072
120	NC_021008	GGCAT	2	10	229525	229534	20 %	20 %	40 %	20 %	479135073
121	NC_021008	ATACG	2	10	232248	232257	40 %	20 %	20 %	20 %	479135074
122	NC_021008	GTAGC	2	10	232268	232277	20 %	20 %	40 %	20 %	479135074
123	NC_021008	CCGGA	2	10	232682	232691	20 %	0 %	40 %	40 %	479135075
124	NC_021008	TGGCC	2	10	233810	233819	0 %	20 %	40 %	40 %	479135075
125	NC_021008	GCGCC	2	10	234101	234110	0 %	0 %	40 %	60 %	479135076
126	NC_021008	CCGTC	2	10	234757	234766	0 %	20 %	20 %	60 %	479135076
127	NC_021008	AACGG	2	10	235237	235246	40 %	0 %	40 %	20 %	479135077
128	NC_021008	ATGCC	2	10	236357	236366	20 %	20 %	20 %	40 %	479135078
129	NC_021008	CGTCA	2	10	237583	237592	20 %	20 %	20 %	40 %	479135079
130	NC_021008	TGCGG	2	10	237701	237710	0 %	20 %	60 %	20 %	479135079
131	NC_021008	CGCCA	2	10	237766	237775	20 %	0 %	20 %	60 %	479135079
132	NC_021008	GCACG	2	10	239121	239130	20 %	0 %	40 %	40 %	479135081
133	NC_021008	TTCCT	2	10	239654	239663	0 %	60 %	0 %	40 %	479135082
134	NC_021008	ATGAC	2	10	241499	241508	40 %	20 %	20 %	20 %	479135084
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260	NC_021008	TGGCC	2	10	492112	492121	0 %	20 %	40 %	40 %	479135276
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387	NC_021008	CTCGG	2	10	773841	773850	0 %	20 %	40 %	40 %	479135446
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389	NC_021008	ACGTG	2	10	778640	778649	20 %	20 %	40 %	20 %	479135450
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