MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum F8 draft genome

Total Repeats: 3935

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021008	ATCA	2	8	6242	6249	50 %	25 %	0 %	25 %	479134918
2	NC_021008	GCCG	2	8	6842	6849	0 %	0 %	50 %	50 %	479134919
3	NC_021008	GTCG	2	8	6932	6939	0 %	25 %	50 %	25 %	479134919
4	NC_021008	ATGC	2	8	8305	8312	25 %	25 %	25 %	25 %	479134919
5	NC_021008	CGGC	2	8	8326	8333	0 %	0 %	50 %	50 %	479134919
6	NC_021008	CTGC	2	8	8772	8779	0 %	25 %	25 %	50 %	479134920
7	NC_021008	CGAT	2	8	8836	8843	25 %	25 %	25 %	25 %	479134920
8	NC_021008	TGGA	2	8	9497	9504	25 %	25 %	50 %	0 %	479134921
9	NC_021008	CGGT	2	8	10675	10682	0 %	25 %	50 %	25 %	479134921
10	NC_021008	CATG	2	8	12516	12523	25 %	25 %	25 %	25 %	479134921
11	NC_021008	ACCG	2	8	12541	12548	25 %	0 %	25 %	50 %	479134921
12	NC_021008	AGAT	2	8	14235	14242	50 %	25 %	25 %	0 %	479134925
13	NC_021008	ATTT	2	8	14725	14732	25 %	75 %	0 %	0 %	479134925
14	NC_021008	CCAG	2	8	17083	17090	25 %	0 %	25 %	50 %	479134926
15	NC_021008	GGAA	2	8	17099	17106	50 %	0 %	50 %	0 %	479134926
16	NC_021008	GACG	2	8	17692	17699	25 %	0 %	50 %	25 %	479134927
17	NC_021008	GCCA	2	8	17855	17862	25 %	0 %	25 %	50 %	479134927
18	NC_021008	AGCG	2	8	18837	18844	25 %	0 %	50 %	25 %	479134929
19	NC_021008	ATGT	2	8	19644	19651	25 %	50 %	25 %	0 %	479134930
20	NC_021008	CTTG	2	8	19724	19731	0 %	50 %	25 %	25 %	479134930
21	NC_021008	TCAA	2	8	20236	20243	50 %	25 %	0 %	25 %	479134931
22	NC_021008	CAGC	2	8	20648	20655	25 %	0 %	25 %	50 %	479134931
23	NC_021008	CCGT	2	8	20800	20807	0 %	25 %	25 %	50 %	479134931
24	NC_021008	TCAT	2	8	20812	20819	25 %	50 %	0 %	25 %	479134931
25	NC_021008	CACG	2	8	20923	20930	25 %	0 %	25 %	50 %	479134931
26	NC_021008	AATC	2	8	21233	21240	50 %	25 %	0 %	25 %	479134931
27	NC_021008	CAAC	2	8	21284	21291	50 %	0 %	0 %	50 %	479134931
28	NC_021008	CAAG	2	8	21590	21597	50 %	0 %	25 %	25 %	479134931
29	NC_021008	CAGA	2	8	21686	21693	50 %	0 %	25 %	25 %	479134931
30	NC_021008	GCAA	2	8	21754	21761	50 %	0 %	25 %	25 %	479134931
31	NC_021008	AGCC	2	8	21835	21842	25 %	0 %	25 %	50 %	479134931
32	NC_021008	CAAC	2	8	21905	21912	50 %	0 %	0 %	50 %	479134931
33	NC_021008	GCTT	2	8	22288	22295	0 %	50 %	25 %	25 %	479134931
34	NC_021008	CGAT	2	8	22401	22408	25 %	25 %	25 %	25 %	479134931
35	NC_021008	GAAT	2	8	22559	22566	50 %	25 %	25 %	0 %	479134931
36	NC_021008	CAAT	2	8	22754	22761	50 %	25 %	0 %	25 %	479134931
37	NC_021008	GGAT	2	8	23810	23817	25 %	25 %	50 %	0 %	479134931
38	NC_021008	GATT	2	8	27920	27927	25 %	50 %	25 %	0 %	479134932
39	NC_021008	TCCA	2	8	28189	28196	25 %	25 %	0 %	50 %	479134932
40	NC_021008	CCAT	2	8	29231	29238	25 %	25 %	0 %	50 %	479134932
41	NC_021008	ACGA	2	8	30622	30629	50 %	0 %	25 %	25 %	479134933
42	NC_021008	CTAG	2	8	31187	31194	25 %	25 %	25 %	25 %	479134933
43	NC_021008	AGAT	2	8	34161	34168	50 %	25 %	25 %	0 %	479134934
44	NC_021008	GAAA	2	8	34286	34293	75 %	0 %	25 %	0 %	479134934
45	NC_021008	GGCG	2	8	34693	34700	0 %	0 %	75 %	25 %	479134935
46	NC_021008	CTTC	2	8	34879	34886	0 %	50 %	0 %	50 %	479134935
47	NC_021008	CTGG	2	8	35159	35166	0 %	25 %	50 %	25 %	479134935
48	NC_021008	CCTT	2	8	35925	35932	0 %	50 %	0 %	50 %	479134935
49	NC_021008	GTCA	2	8	36552	36559	25 %	25 %	25 %	25 %	479134936
50	NC_021008	CACG	2	8	36666	36673	25 %	0 %	25 %	50 %	479134936
51	NC_021008	GGAT	2	8	36806	36813	25 %	25 %	50 %	0 %	479134936
52	NC_021008	GTGG	2	8	38419	38426	0 %	25 %	75 %	0 %	479134937
53	NC_021008	ACGC	2	8	38476	38483	25 %	0 %	25 %	50 %	479134937
54	NC_021008	CGGC	2	8	38794	38801	0 %	0 %	50 %	50 %	479134937
55	NC_021008	GAAG	2	8	43777	43784	50 %	0 %	50 %	0 %	479134938
56	NC_021008	CGCC	2	8	43972	43979	0 %	0 %	25 %	75 %	479134938
57	NC_021008	CTCG	2	8	45520	45527	0 %	25 %	25 %	50 %	479134939
58	NC_021008	GCGT	2	8	46112	46119	0 %	25 %	50 %	25 %	479134940
59	NC_021008	CTGC	2	8	48516	48523	0 %	25 %	25 %	50 %	479134942
60	NC_021008	GTCT	2	8	49995	50002	0 %	50 %	25 %	25 %	479134944
61	NC_021008	GAGC	2	8	50173	50180	25 %	0 %	50 %	25 %	479134945
62	NC_021008	CGGC	2	8	50292	50299	0 %	0 %	50 %	50 %	479134945
63	NC_021008	GAAC	2	8	50524	50531	50 %	0 %	25 %	25 %	479134945
64	NC_021008	CAGG	2	8	51784	51791	25 %	0 %	50 %	25 %	479134946
65	NC_021008	CGGA	2	8	52321	52328	25 %	0 %	50 %	25 %	479134946
66	NC_021008	TCCT	2	8	52898	52905	0 %	50 %	0 %	50 %	479134947
67	NC_021008	TCTG	2	8	53228	53235	0 %	50 %	25 %	25 %	479134947
68	NC_021008	GAAG	2	8	53465	53472	50 %	0 %	50 %	0 %	479134947
69	NC_021008	CTGC	2	8	53882	53889	0 %	25 %	25 %	50 %	479134947
70	NC_021008	TGAC	2	8	54215	54222	25 %	25 %	25 %	25 %	479134948
71	NC_021008	CGAC	2	8	54725	54732	25 %	0 %	25 %	50 %	479134948
72	NC_021008	ATGG	2	8	55339	55346	25 %	25 %	50 %	0 %	479134948
73	NC_021008	GTGG	2	8	56042	56049	0 %	25 %	75 %	0 %	479134949
74	NC_021008	ATTC	2	8	56605	56612	25 %	50 %	0 %	25 %	479134949
75	NC_021008	AGCG	2	8	56688	56695	25 %	0 %	50 %	25 %	479134949
76	NC_021008	ACCA	2	8	57166	57173	50 %	0 %	0 %	50 %	479134950
77	NC_021008	GCGG	2	8	59066	59073	0 %	0 %	75 %	25 %	479134952
78	NC_021008	CGAA	2	8	60356	60363	50 %	0 %	25 %	25 %	479134954
79	NC_021008	CAAC	2	8	60397	60404	50 %	0 %	0 %	50 %	479134954
80	NC_021008	AGCG	2	8	60855	60862	25 %	0 %	50 %	25 %	479134954
81	NC_021008	TAAA	2	8	61107	61114	75 %	25 %	0 %	0 %	479134955
82	NC_021008	CGGA	2	8	61272	61279	25 %	0 %	50 %	25 %	479134955
83	NC_021008	GATG	2	8	61634	61641	25 %	25 %	50 %	0 %	479134955
84	NC_021008	GATT	2	8	61727	61734	25 %	50 %	25 %	0 %	479134955
85	NC_021008	CGCA	2	8	61943	61950	25 %	0 %	25 %	50 %	479134955
86	NC_021008	TTCG	2	8	62108	62115	0 %	50 %	25 %	25 %	479134955
87	NC_021008	GCCG	2	8	62405	62412	0 %	0 %	50 %	50 %	479134955
88	NC_021008	CGGC	2	8	63349	63356	0 %	0 %	50 %	50 %	479134956
89	NC_021008	CAGG	2	8	63419	63426	25 %	0 %	50 %	25 %	479134956
90	NC_021008	GGCC	2	8	63451	63458	0 %	0 %	50 %	50 %	479134956
91	NC_021008	CTTC	2	8	63592	63599	0 %	50 %	0 %	50 %	479134956
92	NC_021008	CGGC	2	8	66188	66195	0 %	0 %	50 %	50 %	479134957
93	NC_021008	CGGC	2	8	68159	68166	0 %	0 %	50 %	50 %	479134959
94	NC_021008	TGGG	2	8	68753	68760	0 %	25 %	75 %	0 %	479134959
95	NC_021008	TGAG	2	8	69483	69490	25 %	25 %	50 %	0 %	479134960
96	NC_021008	CGGC	2	8	69801	69808	0 %	0 %	50 %	50 %	479134960
97	NC_021008	CGGC	2	8	69948	69955	0 %	0 %	50 %	50 %	479134960
98	NC_021008	CGGC	2	8	70026	70033	0 %	0 %	50 %	50 %	479134960
99	NC_021008	TCCT	2	8	70175	70182	0 %	50 %	0 %	50 %	479134960
100	NC_021008	CGCC	2	8	70204	70211	0 %	0 %	25 %	75 %	479134960
101	NC_021008	ACGC	2	8	70266	70273	25 %	0 %	25 %	50 %	479134960
102	NC_021008	AAGG	2	8	72861	72868	50 %	0 %	50 %	0 %	479134961
103	NC_021008	GCCT	2	8	73189	73196	0 %	25 %	25 %	50 %	479134961
104	NC_021008	TTCG	2	8	73246	73253	0 %	50 %	25 %	25 %	479134961
105	NC_021008	ATTC	2	8	73613	73620	25 %	50 %	0 %	25 %	479134961
106	NC_021008	CGAC	2	8	74152	74159	25 %	0 %	25 %	50 %	479134961
107	NC_021008	GGCC	2	8	75218	75225	0 %	0 %	50 %	50 %	479134963
108	NC_021008	TGCG	2	8	75314	75321	0 %	25 %	50 %	25 %	479134963
109	NC_021008	GCCG	2	8	76421	76428	0 %	0 %	50 %	50 %	479134964
110	NC_021008	CGTT	2	8	76734	76741	0 %	50 %	25 %	25 %	479134965
111	NC_021008	ATCC	2	8	77185	77192	25 %	25 %	0 %	50 %	479134965
112	NC_021008	GCCG	2	8	77628	77635	0 %	0 %	50 %	50 %	479134966
113	NC_021008	TCCG	2	8	78294	78301	0 %	25 %	25 %	50 %	479134966
114	NC_021008	TCAT	2	8	78609	78616	25 %	50 %	0 %	25 %	479134967
115	NC_021008	AGCG	2	8	79498	79505	25 %	0 %	50 %	25 %	479134968
116	NC_021008	CCGG	2	8	79954	79961	0 %	0 %	50 %	50 %	479134968
117	NC_021008	CCGC	2	8	80572	80579	0 %	0 %	25 %	75 %	479134969
118	NC_021008	CAGC	2	8	81824	81831	25 %	0 %	25 %	50 %	479134972
119	NC_021008	CGAT	2	8	82372	82379	25 %	25 %	25 %	25 %	479134973
120	NC_021008	AAGC	2	8	82979	82986	50 %	0 %	25 %	25 %	479134973
121	NC_021008	GGCA	2	8	83124	83131	25 %	0 %	50 %	25 %	479134973
122	NC_021008	GGTG	2	8	83979	83986	0 %	25 %	75 %	0 %	479134974
123	NC_021008	CTGA	2	8	84193	84200	25 %	25 %	25 %	25 %	479134974
124	NC_021008	TGCC	2	8	84591	84598	0 %	25 %	25 %	50 %	479134974
125	NC_021008	AGTC	2	8	86477	86484	25 %	25 %	25 %	25 %	479134977
126	NC_021008	GCAA	2	8	86763	86770	50 %	0 %	25 %	25 %	479134977
127	NC_021008	ACGA	2	8	86838	86845	50 %	0 %	25 %	25 %	479134977
128	NC_021008	TGGC	2	8	87484	87491	0 %	25 %	50 %	25 %	479134978
129	NC_021008	ATTC	2	8	87714	87721	25 %	50 %	0 %	25 %	479134978
130	NC_021008	CGTG	2	8	87944	87951	0 %	25 %	50 %	25 %	479134979
131	NC_021008	CATC	2	8	87962	87969	25 %	25 %	0 %	50 %	479134979
132	NC_021008	GGCC	2	8	88189	88196	0 %	0 %	50 %	50 %	479134979
133	NC_021008	GCCA	2	8	88293	88300	25 %	0 %	25 %	50 %	479134979
134	NC_021008	GCCG	2	8	88902	88909	0 %	0 %	50 %	50 %	479134979
135	NC_021008	GGCA	2	8	89046	89053	25 %	0 %	50 %	25 %	479134979
136	NC_021008	CAAC	2	8	89813	89820	50 %	0 %	0 %	50 %	479134979
137	NC_021008	TGCC	2	8	89981	89988	0 %	25 %	25 %	50 %	479134979
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139	NC_021008	AACG	2	8	92112	92119	50 %	0 %	25 %	25 %	479134981
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