MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum F8 draft genome

Total Repeats: 38496

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_021008	GC	3	6	248950	248955	0 %	0 %	50 %	50 %	479135088
4002	NC_021008	TCC	2	6	248992	248997	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479135089
4003	NC_021008	CAC	2	6	249039	249044	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479135089
4004	NC_021008	GC	3	6	249085	249090	0 %	0 %	50 %	50 %	479135089
4005	NC_021008	CGCA	2	8	249099	249106	25 %	0 %	25 %	50 %	479135089
4006	NC_021008	TGCG	2	8	249107	249114	0 %	25 %	50 %	25 %	479135089
4007	NC_021008	TC	3	6	249137	249142	0 %	50 %	0 %	50 %	479135089
4008	NC_021008	GCC	2	6	249153	249158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135089
4009	NC_021008	CGA	2	6	249203	249208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135089
4010	NC_021008	GC	3	6	249246	249251	0 %	0 %	50 %	50 %	479135089
4011	NC_021008	CTT	2	6	249285	249290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479135089
4012	NC_021008	ATG	2	6	249394	249399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135089
4013	NC_021008	GCC	2	6	249411	249416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135089
4014	NC_021008	GGT	2	6	249417	249422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479135089
4015	NC_021008	CG	3	6	249480	249485	0 %	0 %	50 %	50 %	479135089
4016	NC_021008	TCT	2	6	249781	249786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479135090
4017	NC_021008	GCC	2	6	249788	249793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135090
4018	NC_021008	CAG	2	6	249800	249805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135090
4019	NC_021008	CAT	2	6	249848	249853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135090
4020	NC_021008	CGG	3	9	249892	249900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135090
4021	NC_021008	CGG	2	6	249904	249909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135090
4022	NC_021008	CG	3	6	250106	250111	0 %	0 %	50 %	50 %	479135090
4023	NC_021008	TCG	2	6	250113	250118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135090
4024	NC_021008	CGGG	2	8	250190	250197	0 %	0 %	75 %	25 %	479135090
4025	NC_021008	CGG	2	6	250240	250245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135090
4026	NC_021008	GGC	3	9	250307	250315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135090
4027	NC_021008	GTA	2	6	250391	250396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135090
4028	NC_021008	CGA	2	6	250405	250410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135090
4029	NC_021008	GCC	2	6	250553	250558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135090
4030	NC_021008	GAC	2	6	250622	250627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135090
4031	NC_021008	CACGAC	2	12	250643	250654	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	479135090
4032	NC_021008	CGG	2	6	250666	250671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135090
4033	NC_021008	TGG	2	6	250912	250917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479135090
4034	NC_021008	GAG	2	6	250929	250934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479135090
4035	NC_021008	CCG	2	6	250935	250940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135090
4036	NC_021008	TCT	2	6	250984	250989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479135090
4037	NC_021008	CGGA	2	8	250999	251006	25 %	0 %	50 %	25 %	479135090
4038	NC_021008	TCG	2	6	251043	251048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135090
4039	NC_021008	GAT	2	6	251201	251206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135090
4040	NC_021008	GTC	2	6	251237	251242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135090
4041	NC_021008	CGG	2	6	251252	251257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135090
4042	NC_021008	GTGA	2	8	251954	251961	25 %	25 %	50 %	0 %	479135091
4043	NC_021008	CGG	2	6	252058	252063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135091
4044	NC_021008	GGC	2	6	252089	252094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135091
4045	NC_021008	CCA	2	6	252156	252161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479135091
4046	NC_021008	ACC	2	6	252180	252185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479135091
4047	NC_021008	CAC	2	6	252210	252215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479135091
4048	NC_021008	GC	3	6	252239	252244	0 %	0 %	50 %	50 %	479135091
4049	NC_021008	CGG	2	6	252249	252254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135091
4050	NC_021008	GCG	2	6	252257	252262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135091
4051	NC_021008	GGT	2	6	252478	252483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479135091
4052	NC_021008	GCCT	2	8	252558	252565	0 %	25 %	25 %	50 %	479135091
4053	NC_021008	CAC	2	6	252716	252721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479135091
4054	NC_021008	GCC	2	6	252731	252736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135091
4055	NC_021008	CGC	2	6	253024	253029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135091
4056	NC_021008	GGC	2	6	253031	253036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135091
4057	NC_021008	TTCG	2	8	253099	253106	0 %	50 %	25 %	25 %	479135091
4058	NC_021008	GC	3	6	253117	253122	0 %	0 %	50 %	50 %	479135091
4059	NC_021008	AGCG	2	8	253166	253173	25 %	0 %	50 %	25 %	479135092
4060	NC_021008	GAT	2	6	253218	253223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135092
4061	NC_021008	TTC	2	6	253248	253253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479135092
4062	NC_021008	GCA	2	6	253286	253291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135092
4063	NC_021008	CAG	2	6	253395	253400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135092
4064	NC_021008	CCAA	2	8	253416	253423	50 %	0 %	0 %	50 %	479135092
4065	NC_021008	AAT	2	6	253449	253454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479135092
4066	NC_021008	GAA	2	6	253586	253591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479135093
4067	NC_021008	TGA	2	6	253608	253613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135093
4068	NC_021008	CG	3	6	253780	253785	0 %	0 %	50 %	50 %	479135093
4069	NC_021008	GTG	2	6	254282	254287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479135094
4070	NC_021008	GAG	2	6	254309	254314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479135094
4071	NC_021008	CGA	2	6	254346	254351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135094
4072	NC_021008	CGGT	2	8	254462	254469	0 %	25 %	50 %	25 %	479135094
4073	NC_021008	AGG	2	6	254478	254483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479135094
4074	NC_021008	GC	3	6	254525	254530	0 %	0 %	50 %	50 %	479135094
4075	NC_021008	TTGC	2	8	254597	254604	0 %	50 %	25 %	25 %	479135094
4076	NC_021008	GCC	2	6	254605	254610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135094
4077	NC_021008	CGT	2	6	254638	254643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135094
4078	NC_021008	CGAACG	2	12	254661	254672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135094
4079	NC_021008	GTA	2	6	254728	254733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135094
4080	NC_021008	ATT	2	6	254804	254809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479135094
4081	NC_021008	CCG	2	6	254825	254830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135094
4082	NC_021008	GCCGGT	2	12	254863	254874	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	479135094
4083	NC_021008	TGA	2	6	254952	254957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135094
4084	NC_021008	CG	3	6	254985	254990	0 %	0 %	50 %	50 %	479135094
4085	NC_021008	CGG	2	6	254994	254999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135094
4086	NC_021008	GGCG	2	8	255114	255121	0 %	0 %	75 %	25 %	479135094
4087	NC_021008	TCG	2	6	255134	255139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135094
4088	NC_021008	TCGA	2	8	255148	255155	25 %	25 %	25 %	25 %	479135094
4089	NC_021008	CGG	3	9	255156	255164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135094
4090	NC_021008	CGCGC	2	10	255241	255250	0 %	0 %	40 %	60 %	479135094
4091	NC_021008	TCG	2	6	255269	255274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135094
4092	NC_021008	GGT	2	6	255304	255309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479135094
4093	NC_021008	CGT	2	6	255390	255395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135094
4094	NC_021008	GCG	2	6	255437	255442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135094
4095	NC_021008	CGT	2	6	255456	255461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135094
4096	NC_021008	GCA	2	6	255465	255470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135094
4097	NC_021008	CTG	2	6	255505	255510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135094
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4100	NC_021008	GGT	2	6	255685	255690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479135094
4101	NC_021008	GCG	2	6	255728	255733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135094
4102	NC_021008	CAG	2	6	255841	255846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135094
4103	NC_021008	TTG	2	6	255851	255856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479135094
4104	NC_021008	CCTT	2	8	255911	255918	0 %	50 %	0 %	50 %	479135094
4105	NC_021008	CGG	2	6	255934	255939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135094
4106	NC_021008	GCC	2	6	255994	255999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135094
4107	NC_021008	TTC	2	6	256049	256054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479135094
4108	NC_021008	GCC	2	6	256078	256083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135094
4109	NC_021008	CCT	2	6	256227	256232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479135094
4110	NC_021008	CGG	2	6	256233	256238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135094
4111	NC_021008	CGGC	2	8	256244	256251	0 %	0 %	50 %	50 %	479135094
4112	NC_021008	TCT	2	6	256380	256385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479135094
4113	NC_021008	GGC	2	6	256399	256404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135094
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4117	NC_021008	CAG	2	6	256596	256601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135094
4118	NC_021008	GGCC	2	8	256900	256907	0 %	0 %	50 %	50 %	479135095
4119	NC_021008	ACC	2	6	256914	256919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479135095
4120	NC_021008	CCAT	2	8	256931	256938	25 %	25 %	0 %	50 %	479135095
4121	NC_021008	CGA	2	6	257042	257047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135095
4122	NC_021008	ATC	2	6	257179	257184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135095
4123	NC_021008	CAGG	2	8	257196	257203	25 %	0 %	50 %	25 %	479135095
4124	NC_021008	ACCG	2	8	257317	257324	25 %	0 %	25 %	50 %	479135095
4125	NC_021008	CGG	2	6	257382	257387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135095
4126	NC_021008	TGC	2	6	257438	257443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135095
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4230	NC_021008	TGA	2	6	262348	262353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135097
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4232	NC_021008	CCTT	2	8	262419	262426	0 %	50 %	0 %	50 %	479135097
4233	NC_021008	GAG	2	6	262443	262448	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479135097
4234	NC_021008	GAAC	2	8	262559	262566	50 %	0 %	25 %	25 %	479135097
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4242	NC_021008	GTC	2	6	262898	262903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135097
4243	NC_021008	TGG	3	9	262924	262932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479135097
4244	NC_021008	GC	3	6	262966	262971	0 %	0 %	50 %	50 %	479135097
4245	NC_021008	GATGTG	2	12	262985	262996	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	479135097
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4247	NC_021008	TTG	2	6	263013	263018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479135097
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4253	NC_021008	TCG	2	6	263148	263153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135097
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4262	NC_021008	CAT	2	6	263401	263406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135097
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4265	NC_021008	CGG	2	6	263500	263505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135097
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4272	NC_021008	CTT	2	6	263792	263797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479135097
4273	NC_021008	GGCC	2	8	263815	263822	0 %	0 %	50 %	50 %	479135097
4274	NC_021008	GCAC	2	8	263829	263836	25 %	0 %	25 %	50 %	479135097
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4344	NC_021008	TCA	2	6	269084	269089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135100
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4347	NC_021008	GGT	2	6	269228	269233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479135100
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4353	NC_021008	GC	3	6	269497	269502	0 %	0 %	50 %	50 %	479135101
4354	NC_021008	CGG	2	6	269538	269543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135101
4355	NC_021008	GC	3	6	269598	269603	0 %	0 %	50 %	50 %	479135101
4356	NC_021008	ACG	2	6	269618	269623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135101
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4359	NC_021008	CGCC	2	8	269883	269890	0 %	0 %	25 %	75 %	479135102
4360	NC_021008	GAC	2	6	269920	269925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135102
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4362	NC_021008	CGA	2	6	269937	269942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135102
4363	NC_021008	GCT	2	6	269991	269996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135102
4364	NC_021008	CTC	2	6	270042	270047	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479135102
4365	NC_021008	TCA	2	6	270080	270085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135102
4366	NC_021008	CCG	2	6	270086	270091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135102
4367	NC_021008	TGG	2	6	270140	270145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479135102
4368	NC_021008	CAC	2	6	270147	270152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479135102
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4370	NC_021008	GGA	2	6	270204	270209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479135102
4371	NC_021008	GCT	2	6	270210	270215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135102
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4377	NC_021008	GGC	2	6	270658	270663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135103
4378	NC_021008	TTG	2	6	270758	270763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479135103
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4384	NC_021008	CAGC	2	8	270976	270983	25 %	0 %	25 %	50 %	479135103
4385	NC_021008	CTG	2	6	270994	270999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135103
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4389	NC_021008	CA	4	8	271141	271148	50 %	0 %	0 %	50 %	479135103
4390	NC_021008	ATGCCG	2	12	271193	271204	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	479135103
4391	NC_021008	GAA	2	6	271207	271212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479135103
4392	NC_021008	GCC	2	6	271240	271245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135103
4393	NC_021008	TCT	2	6	271287	271292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479135103
4394	NC_021008	ACC	2	6	271298	271303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479135103
4395	NC_021008	GCT	2	6	271344	271349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135103
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4401	NC_021008	CGGCA	2	10	271471	271480	20 %	0 %	40 %	40 %	479135103
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4443	NC_021008	CTGC	2	8	274591	274598	0 %	25 %	25 %	50 %	479135107
4444	NC_021008	GCTTG	2	10	274659	274668	0 %	40 %	40 %	20 %	479135107
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4451	NC_021008	ACC	2	6	274945	274950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479135107
4452	NC_021008	A	6	6	274963	274968	100 %	0 %	0 %	0 %	479135107
4453	NC_021008	GCCAC	2	10	275053	275062	20 %	0 %	20 %	60 %	479135107
4454	NC_021008	CCGA	2	8	275071	275078	25 %	0 %	25 %	50 %	479135107
4455	NC_021008	TCAT	2	8	275101	275108	25 %	50 %	0 %	25 %	479135107
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4463	NC_021008	TTG	2	6	275485	275490	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479135107
4464	NC_021008	TG	3	6	275505	275510	0 %	50 %	50 %	0 %	479135107
4465	NC_021008	TCG	2	6	275639	275644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135108
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4470	NC_021008	CACCG	2	10	275803	275812	20 %	0 %	20 %	60 %	479135108
4471	NC_021008	AGCG	2	8	275825	275832	25 %	0 %	50 %	25 %	479135108
4472	NC_021008	TCG	2	6	275939	275944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135108
4473	NC_021008	GTG	2	6	275975	275980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479135108
4474	NC_021008	TCG	2	6	276026	276031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135108
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4476	NC_021008	CCAGCA	2	12	276069	276080	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	479135108
4477	NC_021008	CGGC	2	8	276083	276090	0 %	0 %	50 %	50 %	479135108
4478	NC_021008	CGG	2	6	276107	276112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135108
4479	NC_021008	TTG	2	6	276200	276205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479135108
4480	NC_021008	CAG	2	6	276244	276249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135108
4481	NC_021008	CTT	2	6	276322	276327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479135108
4482	NC_021008	CGT	2	6	276336	276341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135108
4483	NC_021008	TCA	2	6	276354	276359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135108
4484	NC_021008	GCG	2	6	276410	276415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135108
4485	NC_021008	CGA	2	6	276417	276422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135108
4486	NC_021008	CGA	2	6	276684	276689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135109
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4488	NC_021008	CCG	2	6	276762	276767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135109
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4490	NC_021008	GCG	2	6	276943	276948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135109
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