MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum F8 draft genome

Total Repeats: 38496

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_021008	CACG	2	8	217545	217552	25 %	0 %	25 %	50 %	479135069
3502	NC_021008	AAC	2	6	217645	217650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479135069
3503	NC_021008	CA	3	6	217661	217666	50 %	0 %	0 %	50 %	479135069
3504	NC_021008	ATT	2	6	218200	218205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479135070
3505	NC_021008	AGC	2	6	218264	218269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135070
3506	NC_021008	TTA	2	6	218325	218330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479135070
3507	NC_021008	CAT	2	6	218386	218391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135070
3508	NC_021008	T	6	6	218395	218400	0 %	100 %	0 %	0 %	479135070
3509	NC_021008	CAC	2	6	218403	218408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479135070
3510	NC_021008	GAAT	2	8	218452	218459	50 %	25 %	25 %	0 %	479135070
3511	NC_021008	GCAT	2	8	218470	218477	25 %	25 %	25 %	25 %	479135070
3512	NC_021008	TCT	2	6	218562	218567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479135070
3513	NC_021008	GTT	2	6	218630	218635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479135070
3514	NC_021008	CA	3	6	218802	218807	50 %	0 %	0 %	50 %	479135070
3515	NC_021008	AAT	2	6	218817	218822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479135070
3516	NC_021008	TTG	2	6	218834	218839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479135070
3517	NC_021008	GATC	2	8	218841	218848	25 %	25 %	25 %	25 %	479135070
3518	NC_021008	TCA	2	6	218852	218857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135070
3519	NC_021008	CTTTG	2	10	218880	218889	0 %	60 %	20 %	20 %	479135070
3520	NC_021008	GCA	2	6	218973	218978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135070
3521	NC_021008	TTC	2	6	219366	219371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479135071
3522	NC_021008	TCT	2	6	219439	219444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479135071
3523	NC_021008	TCT	2	6	219462	219467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479135071
3524	NC_021008	CGT	2	6	219533	219538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135071
3525	NC_021008	CG	4	8	219667	219674	0 %	0 %	50 %	50 %	479135071
3526	NC_021008	AAC	2	6	219681	219686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479135071
3527	NC_021008	CTT	2	6	219701	219706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479135071
3528	NC_021008	TGA	2	6	219715	219720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135071
3529	NC_021008	GAT	2	6	219773	219778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135071
3530	NC_021008	GTT	2	6	219827	219832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479135071
3531	NC_021008	CTGG	2	8	219836	219843	0 %	25 %	50 %	25 %	479135071
3532	NC_021008	CCATGC	2	12	219865	219876	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	479135071
3533	NC_021008	TGG	2	6	219894	219899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479135071
3534	NC_021008	CGT	2	6	219964	219969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135071
3535	NC_021008	TTTC	2	8	219977	219984	0 %	75 %	0 %	25 %	479135071
3536	NC_021008	GAA	2	6	220058	220063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479135071
3537	NC_021008	GCC	2	6	220226	220231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135071
3538	NC_021008	ACG	2	6	220296	220301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135071
3539	NC_021008	GT	3	6	220309	220314	0 %	50 %	50 %	0 %	479135071
3540	NC_021008	TTC	2	6	220482	220487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479135071
3541	NC_021008	TTG	2	6	220506	220511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479135071
3542	NC_021008	TCG	2	6	220539	220544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135071
3543	NC_021008	GAA	2	6	220613	220618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479135071
3544	NC_021008	TCG	2	6	220638	220643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135071
3545	NC_021008	TCC	2	6	220647	220652	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479135071
3546	NC_021008	CTCC	2	8	220663	220670	0 %	25 %	0 %	75 %	479135071
3547	NC_021008	ACG	2	6	220737	220742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135071
3548	NC_021008	CGG	2	6	220819	220824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135071
3549	NC_021008	CTT	3	9	220832	220840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479135071
3550	NC_021008	GCA	2	6	220967	220972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135072
3551	NC_021008	CGC	2	6	220987	220992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135072
3552	NC_021008	CTT	2	6	221013	221018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479135072
3553	NC_021008	CGCAT	2	10	221044	221053	20 %	20 %	20 %	40 %	479135072
3554	NC_021008	CGT	2	6	221129	221134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135072
3555	NC_021008	TCG	2	6	221149	221154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135072
3556	NC_021008	CGT	2	6	221174	221179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135072
3557	NC_021008	TGA	2	6	221342	221347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135072
3558	NC_021008	TTC	2	6	221374	221379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479135072
3559	NC_021008	CCT	2	6	221396	221401	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479135072
3560	NC_021008	GGA	2	6	221402	221407	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479135072
3561	NC_021008	CTG	2	6	221481	221486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135072
3562	NC_021008	TTG	2	6	221506	221511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479135072
3563	NC_021008	CCG	2	6	221539	221544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135072
3564	NC_021008	GCC	2	6	221596	221601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135072
3565	NC_021008	AGC	2	6	221710	221715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135072
3566	NC_021008	CTG	2	6	221755	221760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135072
3567	NC_021008	GC	3	6	221915	221920	0 %	0 %	50 %	50 %	479135072
3568	NC_021008	CCTTGC	2	12	221957	221968	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	479135072
3569	NC_021008	TGG	2	6	222035	222040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479135072
3570	NC_021008	ACG	2	6	222079	222084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135072
3571	NC_021008	GAATCG	2	12	222100	222111	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	479135072
3572	NC_021008	CTT	2	6	222135	222140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479135072
3573	NC_021008	GTG	2	6	222145	222150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479135072
3574	NC_021008	CCG	2	6	222151	222156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135072
3575	NC_021008	TCC	2	6	222172	222177	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479135072
3576	NC_021008	TCA	2	6	222197	222202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135072
3577	NC_021008	GTA	2	6	222249	222254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135072
3578	NC_021008	CGGC	2	8	222270	222277	0 %	0 %	50 %	50 %	479135072
3579	NC_021008	GCCA	2	8	222300	222307	25 %	0 %	25 %	50 %	479135072
3580	NC_021008	GTT	2	6	222321	222326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479135072
3581	NC_021008	GCC	2	6	222396	222401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135072
3582	NC_021008	TCG	2	6	222433	222438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135072
3583	NC_021008	GTA	2	6	222522	222527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135072
3584	NC_021008	TGG	2	6	222536	222541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479135072
3585	NC_021008	CCGA	2	8	222691	222698	25 %	0 %	25 %	50 %	479135072
3586	NC_021008	CCA	2	6	222758	222763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479135072
3587	NC_021008	CAC	2	6	222765	222770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479135072
3588	NC_021008	TCG	2	6	222796	222801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135072
3589	NC_021008	GAT	2	6	222831	222836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135072
3590	NC_021008	GTC	2	6	222948	222953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135072
3591	NC_021008	CGGT	2	8	222964	222971	0 %	25 %	50 %	25 %	479135072
3592	NC_021008	GCA	2	6	223007	223012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135072
3593	NC_021008	GAA	2	6	223020	223025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479135072
3594	NC_021008	TGG	2	6	223138	223143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479135072
3595	NC_021008	GCG	2	6	223147	223152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135072
3596	NC_021008	GGA	2	6	223173	223178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479135072
3597	NC_021008	GAT	2	6	223203	223208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135072
3598	NC_021008	AGC	2	6	223213	223218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135072
3599	NC_021008	CCG	2	6	223289	223294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135072
3600	NC_021008	TCG	2	6	223318	223323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135072
3601	NC_021008	TCA	2	6	223361	223366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135072
3602	NC_021008	CGTC	2	8	223442	223449	0 %	25 %	25 %	50 %	479135072
3603	NC_021008	CT	3	6	223452	223457	0 %	50 %	0 %	50 %	479135072
3604	NC_021008	AAC	2	6	223477	223482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479135072
3605	NC_021008	ATG	2	6	223507	223512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135072
3606	NC_021008	GTT	2	6	223572	223577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479135072
3607	NC_021008	TCG	2	6	223585	223590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135072
3608	NC_021008	AGC	2	6	223597	223602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135072
3609	NC_021008	TCA	2	6	223612	223617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135072
3610	NC_021008	AAG	2	6	223636	223641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479135072
3611	NC_021008	GCT	2	6	223688	223693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135072
3612	NC_021008	CCT	2	6	223733	223738	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479135072
3613	NC_021008	GCT	2	6	223744	223749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135072
3614	NC_021008	TCG	2	6	223770	223775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135072
3615	NC_021008	AGGA	2	8	223797	223804	50 %	0 %	50 %	0 %	479135072
3616	NC_021008	GTC	2	6	223821	223826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135072
3617	NC_021008	GCG	2	6	223830	223835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135072
3618	NC_021008	CGA	2	6	223886	223891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135072
3619	NC_021008	TGT	2	6	223937	223942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479135072
3620	NC_021008	GGCAT	2	10	229525	229534	20 %	20 %	40 %	20 %	479135073
3621	NC_021008	CAT	2	6	229667	229672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135073
3622	NC_021008	CGA	2	6	229715	229720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135073
3623	NC_021008	CAT	2	6	229733	229738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135073
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3730	NC_021008	ATGCTC	2	12	235673	235684	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	479135077
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3861	NC_021008	CCAG	2	8	242405	242412	25 %	0 %	25 %	50 %	479135085
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3864	NC_021008	CGA	2	6	242465	242470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135085
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3977	NC_021008	GTCA	2	8	247924	247931	25 %	25 %	25 %	25 %	479135088
3978	NC_021008	TCC	2	6	247961	247966	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479135088
3979	NC_021008	GCA	2	6	247968	247973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135088
3980	NC_021008	AAT	2	6	248005	248010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479135088
3981	NC_021008	CAT	3	9	248035	248043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135088
3982	NC_021008	GGT	2	6	248092	248097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479135088
3983	NC_021008	CGG	2	6	248106	248111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135088
3984	NC_021008	GTT	2	6	248113	248118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479135088
3985	NC_021008	CGA	2	6	248127	248132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135088
3986	NC_021008	CTG	2	6	248134	248139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135088
3987	NC_021008	CCAT	2	8	248145	248152	25 %	25 %	0 %	50 %	479135088
3988	NC_021008	ATC	2	6	248162	248167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135088
3989	NC_021008	ATC	3	9	248183	248191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135088
3990	NC_021008	ATG	2	6	248210	248215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135088
3991	NC_021008	TCG	2	6	248327	248332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135088
3992	NC_021008	GTT	2	6	248338	248343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479135088
3993	NC_021008	ACC	2	6	248492	248497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479135088
3994	NC_021008	GCAC	2	8	248507	248514	25 %	0 %	25 %	50 %	479135088
3995	NC_021008	ATC	2	6	248528	248533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135088
3996	NC_021008	GGT	2	6	248563	248568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479135088
3997	NC_021008	TGAAGC	2	12	248613	248624	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	479135088
3998	NC_021008	CAG	2	6	248737	248742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135088
3999	NC_021008	TGC	2	6	248772	248777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135088
4000	NC_021008	ATG	2	6	248810	248815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135088

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