MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum F8 draft genome

Total Repeats: 38496

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_021008	TCG	2	6	188649	188654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135048
3002	NC_021008	GAT	2	6	188819	188824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135048
3003	NC_021008	GAC	2	6	188845	188850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135048
3004	NC_021008	GCA	2	6	188857	188862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135048
3005	NC_021008	GCC	2	6	188864	188869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135048
3006	NC_021008	GTGG	2	8	188872	188879	0 %	25 %	75 %	0 %	479135048
3007	NC_021008	TGG	2	6	188886	188891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479135048
3008	NC_021008	ATG	2	6	188905	188910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135048
3009	NC_021008	TGGCA	2	10	188912	188921	20 %	20 %	40 %	20 %	479135049
3010	NC_021008	CGCC	2	8	188988	188995	0 %	0 %	25 %	75 %	479135049
3011	NC_021008	CGC	2	6	189000	189005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135049
3012	NC_021008	CGA	2	6	189006	189011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135049
3013	NC_021008	GAC	2	6	189031	189036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135049
3014	NC_021008	GC	3	6	189078	189083	0 %	0 %	50 %	50 %	479135049
3015	NC_021008	GCGCTG	2	12	189118	189129	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	479135049
3016	NC_021008	TGG	2	6	189140	189145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479135049
3017	NC_021008	CACG	2	8	189323	189330	25 %	0 %	25 %	50 %	479135049
3018	NC_021008	CGA	2	6	189345	189350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135049
3019	NC_021008	CCT	2	6	189497	189502	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479135049
3020	NC_021008	GTG	2	6	189517	189522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479135049
3021	NC_021008	GCG	2	6	189529	189534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135049
3022	NC_021008	CATC	2	8	189596	189603	25 %	25 %	0 %	50 %	479135049
3023	NC_021008	CGT	2	6	189621	189626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135049
3024	NC_021008	CAG	2	6	189673	189678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135049
3025	NC_021008	TGG	2	6	189878	189883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479135049
3026	NC_021008	CGG	2	6	190001	190006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135050
3027	NC_021008	CTG	2	6	190008	190013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135050
3028	NC_021008	ATT	2	6	190052	190057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479135050
3029	NC_021008	TCG	2	6	190061	190066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135050
3030	NC_021008	ACG	2	6	190103	190108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135050
3031	NC_021008	TGC	2	6	190117	190122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135050
3032	NC_021008	TCG	2	6	190126	190131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135050
3033	NC_021008	ACC	2	6	190167	190172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479135050
3034	NC_021008	ACC	2	6	190215	190220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479135050
3035	NC_021008	ATG	2	6	190300	190305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135050
3036	NC_021008	CCG	2	6	190309	190314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135050
3037	NC_021008	CGG	2	6	190444	190449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135050
3038	NC_021008	CGAT	2	8	190468	190475	25 %	25 %	25 %	25 %	479135050
3039	NC_021008	TGC	2	6	190480	190485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135050
3040	NC_021008	GAT	2	6	190518	190523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135050
3041	NC_021008	TCA	2	6	190540	190545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135050
3042	NC_021008	CGT	2	6	190575	190580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135050
3043	NC_021008	ATG	2	6	190609	190614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135050
3044	NC_021008	GGC	2	6	190644	190649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135050
3045	NC_021008	GGT	2	6	190709	190714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479135050
3046	NC_021008	GATG	2	8	190748	190755	25 %	25 %	50 %	0 %	479135050
3047	NC_021008	AGA	2	6	190756	190761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479135050
3048	NC_021008	CGA	2	6	190778	190783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135050
3049	NC_021008	GTC	2	6	190847	190852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135050
3050	NC_021008	ACC	2	6	190869	190874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479135050
3051	NC_021008	ACGCAC	2	12	190886	190897	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	479135050
3052	NC_021008	GGT	2	6	190904	190909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479135050
3053	NC_021008	TTGC	2	8	190938	190945	0 %	50 %	25 %	25 %	479135050
3054	NC_021008	CTG	2	6	190983	190988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135050
3055	NC_021008	AT	3	6	191856	191861	50 %	50 %	0 %	0 %	479135051
3056	NC_021008	CGG	2	6	191901	191906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135051
3057	NC_021008	CTTGCC	2	12	191945	191956	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	479135051
3058	NC_021008	GCG	2	6	191959	191964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135051
3059	NC_021008	GTCC	2	8	191988	191995	0 %	25 %	25 %	50 %	479135051
3060	NC_021008	CGG	2	6	192029	192034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135051
3061	NC_021008	GCC	2	6	192076	192081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135051
3062	NC_021008	CGCAC	2	10	192106	192115	20 %	0 %	20 %	60 %	479135051
3063	NC_021008	ACC	2	6	192148	192153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479135051
3064	NC_021008	GTC	2	6	192171	192176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135051
3065	NC_021008	GAGC	2	8	192179	192186	25 %	0 %	50 %	25 %	479135051
3066	NC_021008	CGC	2	6	194640	194645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135052
3067	NC_021008	CGC	2	6	194655	194660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135052
3068	NC_021008	AC	3	6	194709	194714	50 %	0 %	0 %	50 %	479135052
3069	NC_021008	AGA	2	6	195069	195074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479135052
3070	NC_021008	CGC	2	6	195078	195083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135052
3071	NC_021008	ACCG	2	8	195103	195110	25 %	0 %	25 %	50 %	479135052
3072	NC_021008	TGG	2	6	195174	195179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479135052
3073	NC_021008	TCG	2	6	195398	195403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135053
3074	NC_021008	GTCGAA	2	12	195445	195456	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	479135053
3075	NC_021008	GAT	2	6	195459	195464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135053
3076	NC_021008	TCT	2	6	195465	195470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479135053
3077	NC_021008	GGCAAC	2	12	195487	195498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135053
3078	NC_021008	GC	3	6	195552	195557	0 %	0 %	50 %	50 %	479135053
3079	NC_021008	AGC	2	6	195590	195595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135053
3080	NC_021008	CGC	2	6	195597	195602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135053
3081	NC_021008	CACC	2	8	195615	195622	25 %	0 %	0 %	75 %	479135053
3082	NC_021008	TAC	2	6	195643	195648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135053
3083	NC_021008	GAT	2	6	195652	195657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135053
3084	NC_021008	ACG	2	6	195695	195700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135053
3085	NC_021008	CAA	2	6	195744	195749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479135053
3086	NC_021008	CAT	2	6	195813	195818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135053
3087	NC_021008	ACC	2	6	195821	195826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479135053
3088	NC_021008	GCT	2	6	195861	195866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135053
3089	NC_021008	CT	4	8	195865	195872	0 %	50 %	0 %	50 %	479135053
3090	NC_021008	CGTCTA	2	12	195921	195932	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	479135053
3091	NC_021008	CAT	2	6	196167	196172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135053
3092	NC_021008	TCC	2	6	196252	196257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479135053
3093	NC_021008	GCT	2	6	196319	196324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135053
3094	NC_021008	GCT	2	6	196326	196331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135053
3095	NC_021008	TGG	2	6	196352	196357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479135053
3096	NC_021008	ACC	2	6	196390	196395	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479135053
3097	NC_021008	TCCA	2	8	196465	196472	25 %	25 %	0 %	50 %	479135053
3098	NC_021008	GC	3	6	196548	196553	0 %	0 %	50 %	50 %	479135053
3099	NC_021008	CAA	2	6	196629	196634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479135053
3100	NC_021008	CAG	2	6	196660	196665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135053
3101	NC_021008	CCG	2	6	196682	196687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135053
3102	NC_021008	GCCA	2	8	196729	196736	25 %	0 %	25 %	50 %	479135053
3103	NC_021008	TCG	2	6	196739	196744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135053
3104	NC_021008	ACT	2	6	196893	196898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135054
3105	NC_021008	CCT	2	6	196942	196947	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479135054
3106	NC_021008	ACCG	2	8	196953	196960	25 %	0 %	25 %	50 %	479135054
3107	NC_021008	CGGAC	2	10	197006	197015	20 %	0 %	40 %	40 %	479135054
3108	NC_021008	CGA	2	6	197027	197032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135054
3109	NC_021008	CGA	2	6	197057	197062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135054
3110	NC_021008	CGC	2	6	197073	197078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135054
3111	NC_021008	CG	3	6	197080	197085	0 %	0 %	50 %	50 %	479135054
3112	NC_021008	GCC	2	6	197127	197132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135054
3113	NC_021008	GGC	2	6	197160	197165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135054
3114	NC_021008	CG	3	6	197170	197175	0 %	0 %	50 %	50 %	479135054
3115	NC_021008	CA	3	6	197191	197196	50 %	0 %	0 %	50 %	479135054
3116	NC_021008	TCA	2	6	197209	197214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135054
3117	NC_021008	CCA	2	6	197257	197262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479135054
3118	NC_021008	ATC	2	6	197274	197279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135054
3119	NC_021008	GCTC	2	8	197282	197289	0 %	25 %	25 %	50 %	479135054
3120	NC_021008	CAG	2	6	197384	197389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135054
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3242	NC_021008	CTT	2	6	202569	202574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479135058
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3354	NC_021008	GAG	2	6	206900	206905	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479135062
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3356	NC_021008	TGCGC	2	10	206956	206965	0 %	20 %	40 %	40 %	479135062
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3358	NC_021008	GGC	2	6	207130	207135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135062
3359	NC_021008	TTGAGG	2	12	207171	207182	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	479135062
3360	NC_021008	GAT	2	6	207322	207327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135062
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3362	NC_021008	GCCAA	2	10	207359	207368	40 %	0 %	20 %	40 %	479135062
3363	NC_021008	CGC	2	6	207379	207384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135062
3364	NC_021008	ACG	2	6	209887	209892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135063
3365	NC_021008	AGA	2	6	210016	210021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479135063
3366	NC_021008	CGA	2	6	210026	210031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135063
3367	NC_021008	CGG	2	6	210083	210088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135063
3368	NC_021008	CGA	2	6	210098	210103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135063
3369	NC_021008	GCCATC	2	12	210105	210116	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	479135063
3370	NC_021008	ACT	2	6	210157	210162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135063
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3373	NC_021008	CGA	2	6	210431	210436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135063
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3383	NC_021008	GGGC	2	8	210957	210964	0 %	0 %	75 %	25 %	479135064
3384	NC_021008	ACC	2	6	210971	210976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479135064
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3390	NC_021008	GAGGCC	2	12	211229	211240	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	479135064
3391	NC_021008	GCCG	2	8	211327	211334	0 %	0 %	50 %	50 %	479135064
3392	NC_021008	CGC	2	6	211360	211365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135064
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3394	NC_021008	GCA	2	6	211458	211463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135064
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3398	NC_021008	GC	4	8	211533	211540	0 %	0 %	50 %	50 %	479135064
3399	NC_021008	CGC	2	6	211549	211554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135064
3400	NC_021008	TGCG	2	8	211556	211563	0 %	25 %	50 %	25 %	479135064
3401	NC_021008	TTG	2	6	211677	211682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479135065
3402	NC_021008	GGC	2	6	211730	211735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135065
3403	NC_021008	CGA	2	6	211806	211811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135065
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3406	NC_021008	TCGATA	2	12	211860	211871	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	479135065
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3465	NC_021008	ACGATA	2	12	214847	214858	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	479135067
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3467	NC_021008	TGA	2	6	214965	214970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135067
3468	NC_021008	GTTC	2	8	215027	215034	0 %	50 %	25 %	25 %	479135067
3469	NC_021008	CGG	2	6	215048	215053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135067
3470	NC_021008	ATC	2	6	215080	215085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135067
3471	NC_021008	CAT	2	6	215110	215115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135067
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3473	NC_021008	GCC	2	6	215203	215208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135067
3474	NC_021008	CGC	3	9	215322	215330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135067
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3476	NC_021008	CAT	2	6	215364	215369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135067
3477	NC_021008	CGA	2	6	215370	215375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135067
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3479	NC_021008	CAA	2	6	215463	215468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479135067
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3481	NC_021008	GC	3	6	215495	215500	0 %	0 %	50 %	50 %	479135067
3482	NC_021008	GCCA	2	8	215842	215849	25 %	0 %	25 %	50 %	479135068
3483	NC_021008	GCG	2	6	215858	215863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135068
3484	NC_021008	CCG	2	6	215869	215874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135068
3485	NC_021008	TCCG	2	8	215999	216006	0 %	25 %	25 %	50 %	479135068
3486	NC_021008	ATT	2	6	216015	216020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479135068
3487	NC_021008	GAA	2	6	216077	216082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479135068
3488	NC_021008	CTGT	2	8	216110	216117	0 %	50 %	25 %	25 %	479135068
3489	NC_021008	AT	3	6	216141	216146	50 %	50 %	0 %	0 %	479135068
3490	NC_021008	TTC	2	6	216177	216182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479135068
3491	NC_021008	CAT	2	6	216732	216737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135069
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3493	NC_021008	CTG	2	6	216853	216858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135069
3494	NC_021008	GCT	2	6	216890	216895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135069
3495	NC_021008	GAAC	2	8	217011	217018	50 %	0 %	25 %	25 %	479135069
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3498	NC_021008	CGA	2	6	217167	217172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135069
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3500	NC_021008	CCG	2	6	217530	217535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135069

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