MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum F8 draft genome

Total Repeats: 38496

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_021008	GCG	2	6	157556	157561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135026
2502	NC_021008	CGGT	2	8	157674	157681	0 %	25 %	50 %	25 %	479135027
2503	NC_021008	GAA	2	6	157694	157699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479135027
2504	NC_021008	TCG	2	6	157701	157706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135027
2505	NC_021008	CGG	2	6	157756	157761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135027
2506	NC_021008	GC	3	6	157766	157771	0 %	0 %	50 %	50 %	479135027
2507	NC_021008	ATC	2	6	157797	157802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135027
2508	NC_021008	TCG	2	6	157881	157886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135027
2509	NC_021008	GC	3	6	157915	157920	0 %	0 %	50 %	50 %	479135027
2510	NC_021008	TGC	2	6	157938	157943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135027
2511	NC_021008	GCC	2	6	157946	157951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135027
2512	NC_021008	CTTC	2	8	158029	158036	0 %	50 %	0 %	50 %	479135027
2513	NC_021008	TGA	2	6	158056	158061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135027
2514	NC_021008	TTG	2	6	158091	158096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479135027
2515	NC_021008	ACC	2	6	158271	158276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479135027
2516	NC_021008	TGT	2	6	158426	158431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479135027
2517	NC_021008	CG	4	8	158438	158445	0 %	0 %	50 %	50 %	479135027
2518	NC_021008	CTG	2	6	158452	158457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135027
2519	NC_021008	CTG	2	6	158705	158710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135028
2520	NC_021008	TGC	2	6	158742	158747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135028
2521	NC_021008	TGGC	2	8	158771	158778	0 %	25 %	50 %	25 %	479135028
2522	NC_021008	TG	3	6	158792	158797	0 %	50 %	50 %	0 %	479135028
2523	NC_021008	CAA	2	6	159072	159077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479135029
2524	NC_021008	CTG	2	6	159136	159141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135029
2525	NC_021008	GCG	2	6	159200	159205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135029
2526	NC_021008	GAG	2	6	159258	159263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479135029
2527	NC_021008	TGCA	2	8	159352	159359	25 %	25 %	25 %	25 %	479135029
2528	NC_021008	GTG	2	6	159412	159417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479135029
2529	NC_021008	TCA	2	6	159431	159436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135029
2530	NC_021008	GGC	2	6	159516	159521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135029
2531	NC_021008	TACACC	2	12	159640	159651	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	479135029
2532	NC_021008	ATG	2	6	159692	159697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135029
2533	NC_021008	ATC	2	6	159701	159706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135029
2534	NC_021008	AAC	2	6	159818	159823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479135029
2535	NC_021008	GC	3	6	159925	159930	0 %	0 %	50 %	50 %	479135029
2536	NC_021008	AGG	2	6	159943	159948	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479135029
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2538	NC_021008	CGA	2	6	163785	163790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135030
2539	NC_021008	CGC	2	6	163923	163928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135030
2540	NC_021008	AAG	2	6	163936	163941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479135030
2541	NC_021008	CGG	2	6	163946	163951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135030
2542	NC_021008	CG	3	6	163958	163963	0 %	0 %	50 %	50 %	479135030
2543	NC_021008	GCC	2	6	163966	163971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135030
2544	NC_021008	GCC	3	9	163975	163983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135030
2545	NC_021008	CCG	2	6	163985	163990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135030
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2547	NC_021008	CGT	2	6	164137	164142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135030
2548	NC_021008	CTG	2	6	164170	164175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135030
2549	NC_021008	CGA	2	6	164217	164222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135030
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2551	NC_021008	AGCC	2	8	164255	164262	25 %	0 %	25 %	50 %	479135030
2552	NC_021008	GAG	2	6	164299	164304	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479135030
2553	NC_021008	AAG	2	6	164326	164331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479135030
2554	NC_021008	GCC	2	6	164356	164361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135030
2555	NC_021008	ACA	2	6	164432	164437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479135030
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2560	NC_021008	ACC	2	6	164566	164571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479135030
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2565	NC_021008	GAC	2	6	164761	164766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135030
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2591	NC_021008	TGAGGA	2	12	168569	168580	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	479135032
2592	NC_021008	CTT	2	6	168630	168635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479135032
2593	NC_021008	TGG	2	6	168701	168706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479135032
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2595	NC_021008	CAGA	2	8	168746	168753	50 %	0 %	25 %	25 %	479135032
2596	NC_021008	AGGT	2	8	168763	168770	25 %	25 %	50 %	0 %	479135032
2597	NC_021008	TGA	2	6	168818	168823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135032
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2601	NC_021008	CAG	2	6	169008	169013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135032
2602	NC_021008	TCA	2	6	169067	169072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135032
2603	NC_021008	GCA	2	6	169226	169231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135032
2604	NC_021008	GAA	2	6	169232	169237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479135032
2605	NC_021008	GC	3	6	169247	169252	0 %	0 %	50 %	50 %	479135032
2606	NC_021008	GGCA	2	8	169276	169283	25 %	0 %	50 %	25 %	479135032
2607	NC_021008	GCA	2	6	169427	169432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135032
2608	NC_021008	GAA	2	6	169458	169463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479135032
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2611	NC_021008	AGGA	2	8	169531	169538	50 %	0 %	50 %	0 %	479135032
2612	NC_021008	ATT	2	6	169820	169825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479135033
2613	NC_021008	GGC	2	6	169860	169865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135033
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2616	NC_021008	CAA	2	6	170028	170033	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479135033
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2619	NC_021008	CGA	2	6	170108	170113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135033
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2621	NC_021008	CAC	2	6	170238	170243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479135033
2622	NC_021008	TA	3	6	170245	170250	50 %	50 %	0 %	0 %	479135033
2623	NC_021008	GGT	2	6	170322	170327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479135033
2624	NC_021008	TTC	2	6	170388	170393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479135033
2625	NC_021008	TCG	2	6	170408	170413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135033
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2634	NC_021008	CAC	2	6	171045	171050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479135033
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2650	NC_021008	CGA	2	6	171802	171807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135034
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2653	NC_021008	AAGA	2	8	171836	171843	75 %	0 %	25 %	0 %	479135034
2654	NC_021008	TGC	2	6	171846	171851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135034
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2661	NC_021008	GGC	2	6	172067	172072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135034
2662	NC_021008	AGTTG	2	10	172126	172135	20 %	40 %	40 %	0 %	479135034
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2739	NC_021008	CGGT	2	8	175553	175560	0 %	25 %	50 %	25 %	479135035
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2862	NC_021008	GTC	2	6	180944	180949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135040
2863	NC_021008	GCA	2	6	181030	181035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135040
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2865	NC_021008	CAG	2	6	181145	181150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135040
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2981	NC_021008	CGA	2	6	186966	186971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135047
2982	NC_021008	CGC	2	6	187000	187005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135047
2983	NC_021008	T	6	6	187068	187073	0 %	100 %	0 %	0 %	479135047
2984	NC_021008	GGC	2	6	187080	187085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135047
2985	NC_021008	CGC	2	6	187087	187092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135047
2986	NC_021008	CGC	2	6	187205	187210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135047
2987	NC_021008	GC	3	6	187209	187214	0 %	0 %	50 %	50 %	479135047
2988	NC_021008	TGC	2	6	187310	187315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135047
2989	NC_021008	TAT	2	6	187323	187328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479135047
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2991	NC_021008	TCG	2	6	187385	187390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135047
2992	NC_021008	ATG	2	6	188354	188359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135048
2993	NC_021008	CAT	2	6	188374	188379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135048
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2995	NC_021008	TCG	2	6	188454	188459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135048
2996	NC_021008	ATC	2	6	188495	188500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135048
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2998	NC_021008	CG	4	8	188540	188547	0 %	0 %	50 %	50 %	479135048
2999	NC_021008	CGA	2	6	188596	188601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135048
3000	NC_021008	TGG	2	6	188604	188609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479135048

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