MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum F8 draft genome

Total Repeats: 38496

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_021008	GC	3	6	130635	130640	0 %	0 %	50 %	50 %	479135007
2002	NC_021008	CAC	2	6	130643	130648	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479135007
2003	NC_021008	CAT	2	6	130665	130670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135007
2004	NC_021008	GTA	2	6	130795	130800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135007
2005	NC_021008	GCC	2	6	130812	130817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135007
2006	NC_021008	ACGA	2	8	130830	130837	50 %	0 %	25 %	25 %	479135007
2007	NC_021008	GCT	2	6	130880	130885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135007
2008	NC_021008	ATT	2	6	130917	130922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479135007
2009	NC_021008	CG	4	8	130994	131001	0 %	0 %	50 %	50 %	479135007
2010	NC_021008	TGT	2	6	131059	131064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479135007
2011	NC_021008	ACTG	2	8	131069	131076	25 %	25 %	25 %	25 %	479135007
2012	NC_021008	CCG	2	6	131083	131088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135007
2013	NC_021008	GCA	2	6	131089	131094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135007
2014	NC_021008	GCAA	2	8	131167	131174	50 %	0 %	25 %	25 %	479135007
2015	NC_021008	GCA	2	6	131210	131215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135007
2016	NC_021008	CTG	2	6	131328	131333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135007
2017	NC_021008	CGG	2	6	131375	131380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135007
2018	NC_021008	CAA	2	6	131382	131387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479135007
2019	NC_021008	TCA	2	6	131434	131439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135007
2020	NC_021008	AAG	2	6	131475	131480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479135007
2021	NC_021008	TCA	3	9	131530	131538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135007
2022	NC_021008	GAG	2	6	131550	131555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479135007
2023	NC_021008	GCC	2	6	131595	131600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135007
2024	NC_021008	CGG	2	6	131609	131614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135007
2025	NC_021008	GCCG	2	8	131639	131646	0 %	0 %	50 %	50 %	479135007
2026	NC_021008	TCC	2	6	131649	131654	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479135007
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2029	NC_021008	GCC	2	6	131718	131723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135007
2030	NC_021008	CGG	2	6	131797	131802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135007
2031	NC_021008	CTG	2	6	131853	131858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135007
2032	NC_021008	GGT	2	6	131906	131911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479135007
2033	NC_021008	ACC	2	6	132015	132020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479135007
2034	NC_021008	ATTC	2	8	132125	132132	25 %	50 %	0 %	25 %	479135007
2035	NC_021008	CGA	2	6	132143	132148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135007
2036	NC_021008	TCG	2	6	132160	132165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135007
2037	NC_021008	CG	3	6	132176	132181	0 %	0 %	50 %	50 %	479135007
2038	NC_021008	GCT	2	6	132304	132309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135007
2039	NC_021008	GAG	2	6	132312	132317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479135007
2040	NC_021008	CCG	2	6	132323	132328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135007
2041	NC_021008	CGC	2	6	132353	132358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135007
2042	NC_021008	CGC	2	6	132374	132379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135007
2043	NC_021008	TCA	2	6	132385	132390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135007
2044	NC_021008	CAT	2	6	132404	132409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135007
2045	NC_021008	AAG	2	6	132503	132508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479135008
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2047	NC_021008	GC	3	6	132523	132528	0 %	0 %	50 %	50 %	479135008
2048	NC_021008	TCA	2	6	132627	132632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135008
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2052	NC_021008	CGA	2	6	132760	132765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135008
2053	NC_021008	CGA	2	6	132915	132920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135009
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2055	NC_021008	ACC	2	6	132960	132965	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479135009
2056	NC_021008	GCCA	2	8	133007	133014	25 %	0 %	25 %	50 %	479135009
2057	NC_021008	GA	3	6	133063	133068	50 %	0 %	50 %	0 %	479135009
2058	NC_021008	TTGA	2	8	133109	133116	25 %	50 %	25 %	0 %	479135009
2059	NC_021008	CGG	3	9	133212	133220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135009
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2061	NC_021008	CAG	2	6	133469	133474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135010
2062	NC_021008	CGC	2	6	133501	133506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135010
2063	NC_021008	CGC	2	6	133519	133524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135010
2064	NC_021008	CAG	2	6	133538	133543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135010
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2092	NC_021008	TGA	2	6	135528	135533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135012
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2098	NC_021008	GACCA	2	10	135801	135810	40 %	0 %	20 %	40 %	479135012
2099	NC_021008	CGC	2	6	135814	135819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135012
2100	NC_021008	TCG	2	6	135828	135833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135012
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2103	NC_021008	GGCA	2	8	135900	135907	25 %	0 %	50 %	25 %	479135012
2104	NC_021008	AGC	2	6	136249	136254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135013
2105	NC_021008	TGA	2	6	136345	136350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135013
2106	NC_021008	TCG	2	6	136540	136545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135013
2107	NC_021008	GCT	2	6	136559	136564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135013
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2110	NC_021008	CAT	2	6	136625	136630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135013
2111	NC_021008	CGG	2	6	136721	136726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135013
2112	NC_021008	GC	3	6	136751	136756	0 %	0 %	50 %	50 %	479135013
2113	NC_021008	GCA	2	6	136791	136796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135013
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2115	NC_021008	ACCG	2	8	136829	136836	25 %	0 %	25 %	50 %	479135013
2116	NC_021008	TTG	2	6	136873	136878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479135013
2117	NC_021008	GGTC	2	8	136886	136893	0 %	25 %	50 %	25 %	479135013
2118	NC_021008	GTGGC	2	10	136915	136924	0 %	20 %	60 %	20 %	479135013
2119	NC_021008	GCG	2	6	136932	136937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135013
2120	NC_021008	TTG	2	6	137004	137009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479135013
2121	NC_021008	GCT	2	6	137048	137053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135013
2122	NC_021008	CCG	2	6	137077	137082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135013
2123	NC_021008	CTG	3	9	137106	137114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135013
2124	NC_021008	CGGCTA	2	12	137129	137140	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	479135013
2125	NC_021008	TCA	2	6	137143	137148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135013
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2127	NC_021008	CAC	2	6	137174	137179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479135013
2128	NC_021008	CT	3	6	137195	137200	0 %	50 %	0 %	50 %	479135013
2129	NC_021008	TGC	2	6	137203	137208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135013
2130	NC_021008	CTGT	2	8	137227	137234	0 %	50 %	25 %	25 %	479135013
2131	NC_021008	GGC	2	6	137244	137249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135013
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2139	NC_021008	TGT	2	6	138939	138944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479135014
2140	NC_021008	TGC	2	6	138947	138952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135014
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2142	NC_021008	ATCACA	2	12	139038	139049	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	479135014
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2150	NC_021008	GAC	2	6	139190	139195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135014
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2162	NC_021008	CGG	2	6	139768	139773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135014
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2230	NC_021008	TCTGCT	2	12	142435	142446	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	479135016
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2237	NC_021008	TTC	2	6	142674	142679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479135016
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2239	NC_021008	AGG	2	6	143225	143230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479135017
2240	NC_021008	TGG	2	6	143233	143238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479135017
2241	NC_021008	CACT	2	8	143293	143300	25 %	25 %	0 %	50 %	479135017
2242	NC_021008	GC	3	6	143345	143350	0 %	0 %	50 %	50 %	479135017
2243	NC_021008	TCA	3	9	143359	143367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135017
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2475	NC_021008	ATG	3	9	156561	156569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135025
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2477	NC_021008	TCA	2	6	156763	156768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135025
2478	NC_021008	CCT	2	6	156771	156776	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479135026
2479	NC_021008	GTT	2	6	156892	156897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479135026
2480	NC_021008	TGG	2	6	156903	156908	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479135026
2481	NC_021008	CTT	2	6	156925	156930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479135026
2482	NC_021008	GTA	2	6	156943	156948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135026
2483	NC_021008	ACC	2	6	156971	156976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479135026
2484	NC_021008	CG	3	6	156987	156992	0 %	0 %	50 %	50 %	479135026
2485	NC_021008	AGGCC	2	10	156999	157008	20 %	0 %	40 %	40 %	479135026
2486	NC_021008	GAT	2	6	157015	157020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135026
2487	NC_021008	GTC	2	6	157021	157026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135026
2488	NC_021008	GGT	2	6	157027	157032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479135026
2489	NC_021008	GGC	2	6	157132	157137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135026
2490	NC_021008	GTC	2	6	157204	157209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135026
2491	NC_021008	CTT	2	6	157267	157272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479135026
2492	NC_021008	TCG	2	6	157277	157282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135026
2493	NC_021008	GCT	2	6	157341	157346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135026
2494	NC_021008	CTTC	2	8	157356	157363	0 %	50 %	0 %	50 %	479135026
2495	NC_021008	GAT	2	6	157366	157371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135026
2496	NC_021008	CCACGT	2	12	157413	157424	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	479135026
2497	NC_021008	CTT	2	6	157447	157452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479135026
2498	NC_021008	CAGGC	2	10	157459	157468	20 %	0 %	40 %	40 %	479135026
2499	NC_021008	CGC	2	6	157512	157517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135026
2500	NC_021008	CGG	2	6	157545	157550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135026

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