MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum F8 draft genome

Total Repeats: 38496

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_021008	AGC	2	6	102101	102106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479134987
1502	NC_021008	GCG	2	6	102120	102125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479134987
1503	NC_021008	TGC	2	6	102146	102151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479134987
1504	NC_021008	ACC	2	6	102187	102192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479134987
1505	NC_021008	GAT	2	6	102193	102198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479134987
1506	NC_021008	CTC	2	6	102211	102216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479134987
1507	NC_021008	CAGC	2	8	102237	102244	25 %	0 %	25 %	50 %	479134988
1508	NC_021008	CGGC	2	8	102341	102348	0 %	0 %	50 %	50 %	479134988
1509	NC_021008	CG	3	6	102361	102366	0 %	0 %	50 %	50 %	479134988
1510	NC_021008	GC	3	6	102408	102413	0 %	0 %	50 %	50 %	479134988
1511	NC_021008	GCA	2	6	102476	102481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479134988
1512	NC_021008	GCCCG	2	10	102495	102504	0 %	0 %	40 %	60 %	479134988
1513	NC_021008	CG	3	6	102521	102526	0 %	0 %	50 %	50 %	479134988
1514	NC_021008	CGT	2	6	102536	102541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479134988
1515	NC_021008	CGG	2	6	102543	102548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479134988
1516	NC_021008	TGCG	2	8	102577	102584	0 %	25 %	50 %	25 %	479134988
1517	NC_021008	GGC	2	6	103252	103257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479134989
1518	NC_021008	CTG	2	6	103258	103263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479134989
1519	NC_021008	TCG	2	6	103320	103325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479134989
1520	NC_021008	GCT	2	6	104543	104548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479134990
1521	NC_021008	GGAC	2	8	104617	104624	25 %	0 %	50 %	25 %	479134990
1522	NC_021008	AGCTTG	2	12	104756	104767	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	479134990
1523	NC_021008	CAC	2	6	104779	104784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479134990
1524	NC_021008	CGG	2	6	104790	104795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479134990
1525	NC_021008	TTC	2	6	104822	104827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479134990
1526	NC_021008	TCC	2	6	104831	104836	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479134990
1527	NC_021008	TCG	2	6	104837	104842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479134990
1528	NC_021008	GAAGCC	2	12	104977	104988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479134990
1529	NC_021008	GGA	2	6	104989	104994	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479134990
1530	NC_021008	GCCAT	2	10	105026	105035	20 %	20 %	20 %	40 %	479134990
1531	NC_021008	GCT	3	9	105072	105080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479134990
1532	NC_021008	GCC	2	6	105082	105087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479134990
1533	NC_021008	GC	3	6	105100	105105	0 %	0 %	50 %	50 %	479134990
1534	NC_021008	CAGG	2	8	105109	105116	25 %	0 %	50 %	25 %	479134990
1535	NC_021008	TTC	2	6	105136	105141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479134990
1536	NC_021008	GAC	2	6	105220	105225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479134990
1537	NC_021008	CG	3	6	105228	105233	0 %	0 %	50 %	50 %	479134990
1538	NC_021008	GGC	2	6	105316	105321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479134990
1539	NC_021008	CCA	2	6	105336	105341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479134990
1540	NC_021008	GAA	2	6	105451	105456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479134990
1541	NC_021008	GCC	2	6	105521	105526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479134990
1542	NC_021008	TGG	2	6	105570	105575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479134990
1543	NC_021008	GTT	2	6	105619	105624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479134990
1544	NC_021008	GCC	2	6	105694	105699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479134990
1545	NC_021008	TTC	2	6	105731	105736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479134990
1546	NC_021008	TCA	2	6	105821	105826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479134990
1547	NC_021008	GAC	2	6	105985	105990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479134990
1548	NC_021008	TCG	2	6	106100	106105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479134990
1549	NC_021008	CA	4	8	106155	106162	50 %	0 %	0 %	50 %	479134990
1550	NC_021008	GTG	2	6	106184	106189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479134990
1551	NC_021008	GTATC	2	10	106220	106229	20 %	40 %	20 %	20 %	479134990
1552	NC_021008	CAC	2	6	106237	106242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479134990
1553	NC_021008	GGT	2	6	106273	106278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479134990
1554	NC_021008	CCG	2	6	106284	106289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479134990
1555	NC_021008	ATC	2	6	106337	106342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479134990
1556	NC_021008	TTG	2	6	106365	106370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479134990
1557	NC_021008	GGT	2	6	106492	106497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479134991
1558	NC_021008	TGGC	2	8	106628	106635	0 %	25 %	50 %	25 %	479134991
1559	NC_021008	TTG	2	6	106661	106666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479134991
1560	NC_021008	CGT	2	6	106686	106691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479134991
1561	NC_021008	CTT	2	6	106738	106743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479134991
1562	NC_021008	CA	3	6	106770	106775	50 %	0 %	0 %	50 %	479134991
1563	NC_021008	C	6	6	106933	106938	0 %	0 %	0 %	100 %	479134992
1564	NC_021008	ACCAC	2	10	106973	106982	40 %	0 %	0 %	60 %	479134992
1565	NC_021008	CGG	2	6	107063	107068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479134992
1566	NC_021008	GCGCG	2	10	107077	107086	0 %	0 %	60 %	40 %	479134992
1567	NC_021008	CGC	2	6	107135	107140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479134992
1568	NC_021008	CAG	2	6	107151	107156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479134992
1569	NC_021008	AAC	2	6	107176	107181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479134992
1570	NC_021008	CAG	2	6	107205	107210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479134992
1571	NC_021008	TCC	2	6	107223	107228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479134992
1572	NC_021008	CAAT	2	8	107269	107276	50 %	25 %	0 %	25 %	479134992
1573	NC_021008	CGT	2	6	107299	107304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479134992
1574	NC_021008	CGG	2	6	107335	107340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479134992
1575	NC_021008	CG	3	6	107341	107346	0 %	0 %	50 %	50 %	479134992
1576	NC_021008	TGCCGG	2	12	107429	107440	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	479134992
1577	NC_021008	TTCCAG	2	12	107448	107459	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	479134992
1578	NC_021008	GCGA	2	8	107508	107515	25 %	0 %	50 %	25 %	479134992
1579	NC_021008	TCG	2	6	107539	107544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479134992
1580	NC_021008	ACC	2	6	107686	107691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479134992
1581	NC_021008	GAA	2	6	107766	107771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479134992
1582	NC_021008	CACG	3	12	107779	107790	25 %	0 %	25 %	50 %	479134992
1583	NC_021008	GGC	3	9	107807	107815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479134992
1584	NC_021008	TCG	2	6	107845	107850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479134992
1585	NC_021008	GCA	2	6	107894	107899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479134992
1586	NC_021008	TGC	2	6	107972	107977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479134992
1587	NC_021008	CCA	2	6	108073	108078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479134992
1588	NC_021008	GCG	2	6	108104	108109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479134992
1589	NC_021008	GT	3	6	108167	108172	0 %	50 %	50 %	0 %	479134992
1590	NC_021008	TTCG	2	8	108182	108189	0 %	50 %	25 %	25 %	479134992
1591	NC_021008	ACGG	2	8	108200	108207	25 %	0 %	50 %	25 %	479134992
1592	NC_021008	GTG	2	6	108309	108314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479134992
1593	NC_021008	ATG	2	6	108337	108342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479134992
1594	NC_021008	TCG	2	6	108343	108348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479134992
1595	NC_021008	TCG	2	6	108479	108484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479134992
1596	NC_021008	CG	3	6	108494	108499	0 %	0 %	50 %	50 %	479134992
1597	NC_021008	GC	3	6	108517	108522	0 %	0 %	50 %	50 %	479134992
1598	NC_021008	GCAG	2	8	108551	108558	25 %	0 %	50 %	25 %	479134992
1599	NC_021008	ATC	2	6	108583	108588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479134992
1600	NC_021008	CCA	2	6	108631	108636	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479134992
1601	NC_021008	CA	4	8	108702	108709	50 %	0 %	0 %	50 %	479134992
1602	NC_021008	CCCGCA	2	12	108751	108762	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	479134992
1603	NC_021008	CGG	2	6	108788	108793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479134992
1604	NC_021008	ACGG	2	8	108843	108850	25 %	0 %	50 %	25 %	479134992
1605	NC_021008	CGC	2	6	108854	108859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479134992
1606	NC_021008	GCT	2	6	108884	108889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479134992
1607	NC_021008	GTC	2	6	109200	109205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479134993
1608	NC_021008	ATG	2	6	109215	109220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479134993
1609	NC_021008	GAA	2	6	109238	109243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479134993
1610	NC_021008	CAC	3	9	109244	109252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479134993
1611	NC_021008	CCG	2	6	109287	109292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479134993
1612	NC_021008	TGG	2	6	109306	109311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479134993
1613	NC_021008	GAC	2	6	109323	109328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479134993
1614	NC_021008	TGA	2	6	109402	109407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479134993
1615	NC_021008	GAA	2	6	109532	109537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479134993
1616	NC_021008	GCA	2	6	109564	109569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479134993
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1618	NC_021008	GAT	3	9	109631	109639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479134993
1619	NC_021008	GAT	2	6	109646	109651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479134993
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1621	NC_021008	GAA	2	6	109739	109744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479134993
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1743	NC_021008	CGTGAA	2	12	116676	116687	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	479134998
1744	NC_021008	TCGAT	2	10	116762	116771	20 %	40 %	20 %	20 %	479134998
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1862	NC_021008	GAT	2	6	123125	123130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135000
1863	NC_021008	GAT	2	6	123166	123171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135000
1864	NC_021008	CGAGC	2	10	123220	123229	20 %	0 %	40 %	40 %	479135000
1865	NC_021008	TCCT	2	8	123257	123264	0 %	50 %	0 %	50 %	479135000
1866	NC_021008	GGTG	2	8	123271	123278	0 %	25 %	75 %	0 %	479135000
1867	NC_021008	CGG	2	6	123292	123297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135000
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1871	NC_021008	CGA	2	6	123487	123492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135000
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1886	NC_021008	CAG	2	6	124378	124383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135001
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1979	NC_021008	GCCG	2	8	129592	129599	0 %	0 %	50 %	50 %	479135006
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1982	NC_021008	GTG	2	6	129674	129679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479135006
1983	NC_021008	GAT	2	6	129745	129750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135006
1984	NC_021008	CTG	2	6	129761	129766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135006
1985	NC_021008	CTG	2	6	129836	129841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135006
1986	NC_021008	AGC	2	6	129846	129851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135006
1987	NC_021008	CGA	2	6	130016	130021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135007
1988	NC_021008	CCG	2	6	130051	130056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135007
1989	NC_021008	GCCT	2	8	130058	130065	0 %	25 %	25 %	50 %	479135007
1990	NC_021008	CGC	2	6	130070	130075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135007
1991	NC_021008	TCAC	2	8	130137	130144	25 %	25 %	0 %	50 %	479135007
1992	NC_021008	GGTC	2	8	130172	130179	0 %	25 %	50 %	25 %	479135007
1993	NC_021008	GGT	2	6	130239	130244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479135007
1994	NC_021008	TGC	2	6	130304	130309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135007
1995	NC_021008	CAC	2	6	130358	130363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479135007
1996	NC_021008	GGA	2	6	130370	130375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479135007
1997	NC_021008	CCGAC	2	10	130480	130489	20 %	0 %	20 %	60 %	479135007
1998	NC_021008	GCG	2	6	130498	130503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135007
1999	NC_021008	GCA	3	9	130505	130513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135007
2000	NC_021008	GAT	2	6	130623	130628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135007

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