MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum F8 draft genome

Total Repeats: 38496

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021008	TTG	2	6	73794	73799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479134961
1002	NC_021008	GAC	2	6	73803	73808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479134961
1003	NC_021008	TCA	2	6	73811	73816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479134961
1004	NC_021008	GCA	2	6	73832	73837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479134961
1005	NC_021008	CGG	2	6	73855	73860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479134961
1006	NC_021008	GAC	2	6	73872	73877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479134961
1007	NC_021008	CCCGAT	2	12	73881	73892	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	479134961
1008	NC_021008	GACCG	2	10	73962	73971	20 %	0 %	40 %	40 %	479134961
1009	NC_021008	TTC	2	6	74054	74059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479134961
1010	NC_021008	CTC	2	6	74082	74087	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479134961
1011	NC_021008	ACG	2	6	74109	74114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479134961
1012	NC_021008	CCG	2	6	74143	74148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479134961
1013	NC_021008	CGAC	2	8	74152	74159	25 %	0 %	25 %	50 %	479134961
1014	NC_021008	GAA	2	6	74247	74252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479134961
1015	NC_021008	CAT	2	6	74326	74331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479134961
1016	NC_021008	AAT	2	6	74335	74340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479134961
1017	NC_021008	CGA	2	6	74541	74546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479134962
1018	NC_021008	ACA	2	6	74591	74596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479134962
1019	NC_021008	CGA	2	6	74597	74602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479134962
1020	NC_021008	CAT	2	6	74631	74636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479134962
1021	NC_021008	ATC	2	6	74665	74670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479134962
1022	NC_021008	CGC	2	6	74793	74798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479134963
1023	NC_021008	TCG	2	6	74825	74830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479134963
1024	NC_021008	TTTGCC	2	12	74857	74868	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	479134963
1025	NC_021008	CAG	2	6	74893	74898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479134963
1026	NC_021008	CGG	2	6	74906	74911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479134963
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1028	NC_021008	ACA	2	6	75015	75020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479134963
1029	NC_021008	CGG	2	6	75084	75089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479134963
1030	NC_021008	CCA	2	6	75090	75095	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479134963
1031	NC_021008	GGCC	2	8	75218	75225	0 %	0 %	50 %	50 %	479134963
1032	NC_021008	TGG	2	6	75228	75233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479134963
1033	NC_021008	CCT	2	6	75243	75248	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479134963
1034	NC_021008	ACA	2	6	75294	75299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479134963
1035	NC_021008	TGCG	2	8	75314	75321	0 %	25 %	50 %	25 %	479134963
1036	NC_021008	CGG	2	6	75495	75500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479134963
1037	NC_021008	CGG	2	6	75621	75626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479134963
1038	NC_021008	ATG	2	6	75801	75806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479134964
1039	NC_021008	CAT	2	6	75829	75834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479134964
1040	NC_021008	CAC	2	6	75839	75844	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479134964
1041	NC_021008	CGC	2	6	75853	75858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479134964
1042	NC_021008	TTGGC	2	10	75859	75868	0 %	40 %	40 %	20 %	479134964
1043	NC_021008	TCA	2	6	75919	75924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479134964
1044	NC_021008	CGG	2	6	76030	76035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479134964
1045	NC_021008	CGG	2	6	76045	76050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479134964
1046	NC_021008	CGG	2	6	76085	76090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479134964
1047	NC_021008	TTC	2	6	76110	76115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479134964
1048	NC_021008	CGC	2	6	76121	76126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479134964
1049	NC_021008	GTG	2	6	76283	76288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479134964
1050	NC_021008	CCA	3	9	76306	76314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479134964
1051	NC_021008	GGC	2	6	76379	76384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479134964
1052	NC_021008	TGA	2	6	76385	76390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479134964
1053	NC_021008	GCCG	2	8	76421	76428	0 %	0 %	50 %	50 %	479134964
1054	NC_021008	TCA	2	6	76501	76506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479134964
1055	NC_021008	ACA	2	6	76549	76554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479134965
1056	NC_021008	GCT	2	6	76578	76583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479134965
1057	NC_021008	GCA	2	6	76675	76680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479134965
1058	NC_021008	CGC	2	6	76723	76728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479134965
1059	NC_021008	CGTT	2	8	76734	76741	0 %	50 %	25 %	25 %	479134965
1060	NC_021008	GTC	2	6	76784	76789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479134965
1061	NC_021008	CCA	2	6	76834	76839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479134965
1062	NC_021008	CG	3	6	76942	76947	0 %	0 %	50 %	50 %	479134965
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1064	NC_021008	ATC	2	6	77249	77254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479134965
1065	NC_021008	CGG	2	6	77347	77352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479134965
1066	NC_021008	GT	3	6	77408	77413	0 %	50 %	50 %	0 %	479134965
1067	NC_021008	ATTCG	2	10	77574	77583	20 %	40 %	20 %	20 %	479134966
1068	NC_021008	GCCG	2	8	77628	77635	0 %	0 %	50 %	50 %	479134966
1069	NC_021008	CCG	2	6	77783	77788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479134966
1070	NC_021008	ATC	2	6	77824	77829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479134966
1071	NC_021008	GTG	2	6	77864	77869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479134966
1072	NC_021008	CAT	2	6	77887	77892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479134966
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1093	NC_021008	CG	3	6	78859	78864	0 %	0 %	50 %	50 %	479134967
1094	NC_021008	TGA	2	6	78872	78877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479134967
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1097	NC_021008	TGG	2	6	78931	78936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479134967
1098	NC_021008	GGC	2	6	78957	78962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479134967
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1101	NC_021008	TGATTC	2	12	79015	79026	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	479134967
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1103	NC_021008	CGC	2	6	79103	79108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479134967
1104	NC_021008	ACG	2	6	79144	79149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479134967
1105	NC_021008	AACTCG	2	12	79150	79161	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	479134967
1106	NC_021008	GAA	3	9	79232	79240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479134967
1107	NC_021008	ATG	2	6	79257	79262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479134967
1108	NC_021008	CGG	2	6	79279	79284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479134967
1109	NC_021008	CCG	2	6	79444	79449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479134968
1110	NC_021008	GCA	2	6	79463	79468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479134968
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1112	NC_021008	AGCG	2	8	79498	79505	25 %	0 %	50 %	25 %	479134968
1113	NC_021008	CAC	2	6	79533	79538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479134968
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1118	NC_021008	TGGCC	2	10	79625	79634	0 %	20 %	40 %	40 %	479134968
1119	NC_021008	TCT	2	6	79652	79657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479134968
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1124	NC_021008	CCGG	2	8	79954	79961	0 %	0 %	50 %	50 %	479134968
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1495	NC_021008	GGGAAG	2	12	101882	101893	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479134987
1496	NC_021008	ATG	2	6	101894	101899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479134987
1497	NC_021008	TG	3	6	101912	101917	0 %	50 %	50 %	0 %	479134987
1498	NC_021008	CTT	2	6	101959	101964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479134987
1499	NC_021008	CGT	2	6	101973	101978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479134987
1500	NC_021008	GCATGC	2	12	102089	102100	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	479134987

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