MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum F8 draft genome

Total Repeats: 38496

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021008	AGC	3	9	43569	43577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479134938
502	NC_021008	CGC	2	6	43588	43593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479134938
503	NC_021008	AGC	2	6	43605	43610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479134938
504	NC_021008	CCG	2	6	43733	43738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479134938
505	NC_021008	ACA	2	6	43749	43754	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479134938
506	NC_021008	GAAG	2	8	43777	43784	50 %	0 %	50 %	0 %	479134938
507	NC_021008	GCC	3	9	43845	43853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479134938
508	NC_021008	GC	3	6	43876	43881	0 %	0 %	50 %	50 %	479134938
509	NC_021008	CCA	2	6	43899	43904	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479134938
510	NC_021008	ACC	2	6	43947	43952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479134938
511	NC_021008	CGCC	2	8	43972	43979	0 %	0 %	25 %	75 %	479134938
512	NC_021008	CAT	2	6	43984	43989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479134938
513	NC_021008	GCC	2	6	44057	44062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479134938
514	NC_021008	CG	3	6	44066	44071	0 %	0 %	50 %	50 %	479134938
515	NC_021008	ACC	2	6	44091	44096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479134938
516	NC_021008	GCCGA	2	10	44102	44111	20 %	0 %	40 %	40 %	479134938
517	NC_021008	CCT	2	6	44172	44177	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479134938
518	NC_021008	CCA	2	6	44211	44216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479134938
519	NC_021008	ACC	2	6	44267	44272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479134938
520	NC_021008	TTC	2	6	44283	44288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479134938
521	NC_021008	GAT	2	6	44348	44353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479134938
522	NC_021008	AGCTG	2	10	44361	44370	20 %	20 %	40 %	20 %	479134938
523	NC_021008	TGC	3	9	44442	44450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479134938
524	NC_021008	CAT	2	6	44506	44511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479134938
525	NC_021008	CCA	3	9	44530	44538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479134938
526	NC_021008	CGA	2	6	44563	44568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479134938
527	NC_021008	ACG	2	6	44592	44597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479134938
528	NC_021008	TC	3	6	44604	44609	0 %	50 %	0 %	50 %	479134938
529	NC_021008	ACG	2	6	44649	44654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479134938
530	NC_021008	GC	3	6	44698	44703	0 %	0 %	50 %	50 %	479134938
531	NC_021008	TGA	2	6	44724	44729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479134938
532	NC_021008	ACC	2	6	44831	44836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479134938
533	NC_021008	ATCAC	2	10	44856	44865	40 %	20 %	0 %	40 %	479134938
534	NC_021008	GAT	2	6	44957	44962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479134938
535	NC_021008	CGC	2	6	45001	45006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479134938
536	NC_021008	CAC	2	6	45020	45025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479134938
537	NC_021008	ACG	2	6	45132	45137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479134938
538	NC_021008	CCG	2	6	45147	45152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479134938
539	NC_021008	CAG	2	6	45254	45259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479134938
540	NC_021008	AGG	2	6	45270	45275	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479134938
541	NC_021008	CTG	2	6	45276	45281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479134938
542	NC_021008	GGCCAA	2	12	45310	45321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479134938
543	NC_021008	GTG	2	6	45335	45340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479134938
544	NC_021008	GAA	2	6	45362	45367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479134938
545	NC_021008	ATT	2	6	45478	45483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479134939
546	NC_021008	GGT	2	6	45490	45495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479134939
547	NC_021008	GAC	2	6	45508	45513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479134939
548	NC_021008	CTCG	2	8	45520	45527	0 %	25 %	25 %	50 %	479134939
549	NC_021008	CA	3	6	45636	45641	50 %	0 %	0 %	50 %	479134939
550	NC_021008	CGA	2	6	45673	45678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479134939
551	NC_021008	TG	3	6	45726	45731	0 %	50 %	50 %	0 %	479134939
552	NC_021008	GT	3	6	45732	45737	0 %	50 %	50 %	0 %	479134939
553	NC_021008	CGG	2	6	46014	46019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479134940
554	NC_021008	GCG	2	6	46058	46063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479134940
555	NC_021008	ACC	2	6	46105	46110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479134940
556	NC_021008	GCGT	2	8	46112	46119	0 %	25 %	50 %	25 %	479134940
557	NC_021008	CCG	2	6	46183	46188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479134940
558	NC_021008	CAT	2	6	46224	46229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479134940
559	NC_021008	TGG	2	6	46292	46297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479134940
560	NC_021008	TCA	2	6	46316	46321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479134940
561	NC_021008	AGG	2	6	46430	46435	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479134940
562	NC_021008	GCC	3	9	46444	46452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479134940
563	NC_021008	GGT	2	6	46495	46500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479134940
564	NC_021008	GC	3	6	46565	46570	0 %	0 %	50 %	50 %	479134940
565	NC_021008	AAT	2	6	46576	46581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479134940
566	NC_021008	GAA	2	6	46674	46679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479134940
567	NC_021008	ATT	2	6	46815	46820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479134941
568	NC_021008	GCC	2	6	46890	46895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479134941
569	NC_021008	GAC	2	6	47025	47030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479134941
570	NC_021008	GCC	2	6	47052	47057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479134941
571	NC_021008	AAG	2	6	47058	47063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479134941
572	NC_021008	TGC	2	6	47095	47100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479134941
573	NC_021008	TGG	2	6	47152	47157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479134941
574	NC_021008	CTG	3	9	47699	47707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479134942
575	NC_021008	CAG	2	6	47710	47715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479134942
576	NC_021008	ACC	2	6	47758	47763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479134942
577	NC_021008	CATCG	2	10	47833	47842	20 %	20 %	20 %	40 %	479134942
578	NC_021008	CGC	2	6	47853	47858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479134942
579	NC_021008	TA	3	6	47885	47890	50 %	50 %	0 %	0 %	479134942
580	NC_021008	CTG	2	6	47980	47985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479134942
581	NC_021008	GCT	2	6	47994	47999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479134942
582	NC_021008	TCG	2	6	48008	48013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479134942
583	NC_021008	GCC	2	6	48026	48031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479134942
584	NC_021008	CTG	3	9	48052	48060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479134942
585	NC_021008	GGC	2	6	48064	48069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479134942
586	NC_021008	GCTGT	2	10	48103	48112	0 %	40 %	40 %	20 %	479134942
587	NC_021008	CCG	2	6	48198	48203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479134942
588	NC_021008	TGC	2	6	48260	48265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479134942
589	NC_021008	TG	3	6	48266	48271	0 %	50 %	50 %	0 %	479134942
590	NC_021008	ATC	2	6	48277	48282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479134942
591	NC_021008	TGG	2	6	48323	48328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479134942
592	NC_021008	CAT	2	6	48333	48338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479134942
593	NC_021008	TGG	2	6	48340	48345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479134942
594	NC_021008	AGC	2	6	48422	48427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479134942
595	NC_021008	GCC	2	6	48460	48465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479134942
596	NC_021008	CTGC	2	8	48516	48523	0 %	25 %	25 %	50 %	479134942
597	NC_021008	GCC	2	6	48544	48549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479134942
598	NC_021008	CTT	2	6	48575	48580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479134942
599	NC_021008	CGA	2	6	48587	48592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479134942
600	NC_021008	GCT	2	6	48627	48632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479134942
601	NC_021008	TGA	2	6	48644	48649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479134942
602	NC_021008	CT	3	6	48681	48686	0 %	50 %	0 %	50 %	479134942
603	NC_021008	ATG	2	6	48811	48816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479134942
604	NC_021008	GTG	2	6	48841	48846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479134942
605	NC_021008	CCA	2	6	48872	48877	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479134942
606	NC_021008	GCT	2	6	48921	48926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479134942
607	NC_021008	TGG	3	9	48944	48952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479134942
608	NC_021008	CTT	2	6	49035	49040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479134942
609	NC_021008	GC	3	6	49478	49483	0 %	0 %	50 %	50 %	479134943
610	NC_021008	GTTGCG	2	12	49533	49544	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	479134943
611	NC_021008	CTT	2	6	49547	49552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479134943
612	NC_021008	GCC	3	9	49754	49762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479134944
613	NC_021008	CG	3	6	49796	49801	0 %	0 %	50 %	50 %	479134944
614	NC_021008	ATTGG	2	10	49803	49812	20 %	40 %	40 %	0 %	479134944
615	NC_021008	TGC	2	6	49836	49841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479134944
616	NC_021008	TCA	2	6	49856	49861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479134944
617	NC_021008	CGA	2	6	49876	49881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479134944
618	NC_021008	GTCT	2	8	49995	50002	0 %	50 %	25 %	25 %	479134944
619	NC_021008	ATC	2	6	50021	50026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479134944
620	NC_021008	GAGC	2	8	50173	50180	25 %	0 %	50 %	25 %	479134945
621	NC_021008	CGC	2	6	50236	50241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479134945
622	NC_021008	AGT	2	6	50251	50256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479134945
623	NC_021008	CGG	2	6	50275	50280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479134945
624	NC_021008	TGG	2	6	50285	50290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479134945
625	NC_021008	CGGC	2	8	50292	50299	0 %	0 %	50 %	50 %	479134945
626	NC_021008	ACCGC	2	10	50388	50397	20 %	0 %	20 %	60 %	479134945
627	NC_021008	ACT	2	6	50448	50453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479134945
628	NC_021008	CGC	2	6	50485	50490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479134945
629	NC_021008	GAAC	2	8	50524	50531	50 %	0 %	25 %	25 %	479134945
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660	NC_021008	TCA	2	6	51895	51900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479134946
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