MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum F8 draft genome

Total Repeats: 38496

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_021008	CCG	2	6	367449	367454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135177
6002	NC_021008	ATG	2	6	367619	367624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135177
6003	NC_021008	CTG	2	6	367697	367702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135177
6004	NC_021008	ACC	2	6	367704	367709	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479135177
6005	NC_021008	CGA	2	6	367753	367758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135177
6006	NC_021008	GC	3	6	367797	367802	0 %	0 %	50 %	50 %	479135177
6007	NC_021008	GTG	2	6	367844	367849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479135177
6008	NC_021008	GAC	2	6	367922	367927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135177
6009	NC_021008	GCC	2	6	367979	367984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135177
6010	NC_021008	TGG	2	6	368090	368095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479135177
6011	NC_021008	TCA	2	6	368361	368366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135178
6012	NC_021008	CGC	2	6	368449	368454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135178
6013	NC_021008	GCC	2	6	368462	368467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135178
6014	NC_021008	CTG	2	6	368477	368482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135178
6015	NC_021008	GGC	2	6	368533	368538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135178
6016	NC_021008	CGG	3	9	368557	368565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135178
6017	NC_021008	TCG	2	6	368592	368597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135178
6018	NC_021008	CAAGGC	2	12	368617	368628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135178
6019	NC_021008	CTG	2	6	368636	368641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135178
6020	NC_021008	CTG	2	6	368653	368658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135178
6021	NC_021008	CTGTTT	2	12	368690	368701	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	479135178
6022	NC_021008	GCTT	2	8	368732	368739	0 %	50 %	25 %	25 %	479135178
6023	NC_021008	TGCC	2	8	368751	368758	0 %	25 %	25 %	50 %	479135178
6024	NC_021008	GAA	2	6	368842	368847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479135178
6025	NC_021008	ATG	2	6	368873	368878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135178
6026	NC_021008	GCGCGG	2	12	368883	368894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135178
6027	NC_021008	TGA	2	6	368994	368999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135178
6028	NC_021008	CATT	2	8	369054	369061	25 %	50 %	0 %	25 %	479135178
6029	NC_021008	CAG	2	6	369064	369069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135178
6030	NC_021008	TAT	2	6	369166	369171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479135178
6031	NC_021008	CTA	2	6	369236	369241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135178
6032	NC_021008	CGG	2	6	369268	369273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135178
6033	NC_021008	TGG	2	6	369291	369296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479135178
6034	NC_021008	GCGT	2	8	369365	369372	0 %	25 %	50 %	25 %	479135178
6035	NC_021008	GCG	2	6	369377	369382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135178
6036	NC_021008	GTT	2	6	369392	369397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479135178
6037	NC_021008	TCAG	2	8	369933	369940	25 %	25 %	25 %	25 %	479135179
6038	NC_021008	CGT	2	6	370022	370027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135179
6039	NC_021008	GCG	2	6	370082	370087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135179
6040	NC_021008	CGGCG	2	10	370094	370103	0 %	0 %	60 %	40 %	479135179
6041	NC_021008	CTT	2	6	370140	370145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479135179
6042	NC_021008	TCG	2	6	370150	370155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135179
6043	NC_021008	CGT	2	6	370202	370207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135179
6044	NC_021008	GCG	2	6	370240	370245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135179
6045	NC_021008	CGCA	2	8	370285	370292	25 %	0 %	25 %	50 %	479135179
6046	NC_021008	GTC	2	6	370314	370319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135179
6047	NC_021008	AGCGC	2	10	370433	370442	20 %	0 %	40 %	40 %	479135179
6048	NC_021008	GCT	2	6	370463	370468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135179
6049	NC_021008	GCA	2	6	370526	370531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135179
6050	NC_021008	GAC	2	6	370536	370541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135179
6051	NC_021008	CAC	2	6	370551	370556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479135179
6052	NC_021008	CGG	2	6	370563	370568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135179
6053	NC_021008	GGC	2	6	370581	370586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135179
6054	NC_021008	CTT	2	6	370605	370610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479135179
6055	NC_021008	CTG	2	6	370665	370670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135179
6056	NC_021008	GTA	2	6	370671	370676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135179
6057	NC_021008	TCG	2	6	370852	370857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135179
6058	NC_021008	AGCCGC	2	12	370916	370927	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	479135179
6059	NC_021008	AATG	2	8	371228	371235	50 %	25 %	25 %	0 %	479135180
6060	NC_021008	GCG	2	6	371245	371250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135180
6061	NC_021008	AT	3	6	371270	371275	50 %	50 %	0 %	0 %	479135180
6062	NC_021008	CGC	2	6	371309	371314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135180
6063	NC_021008	CGC	2	6	371376	371381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135180
6064	NC_021008	GC	3	6	371408	371413	0 %	0 %	50 %	50 %	479135180
6065	NC_021008	CGGC	2	8	371452	371459	0 %	0 %	50 %	50 %	479135180
6066	NC_021008	CTG	2	6	371463	371468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135180
6067	NC_021008	CG	3	6	371496	371501	0 %	0 %	50 %	50 %	479135180
6068	NC_021008	GCA	2	6	371577	371582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135180
6069	NC_021008	GCT	3	9	371648	371656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135180
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6071	NC_021008	CTT	2	6	371756	371761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479135180
6072	NC_021008	AAG	3	9	371778	371786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479135180
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6075	NC_021008	TGCACG	2	12	371893	371904	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	479135180
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6080	NC_021008	GCC	2	6	372081	372086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135180
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6085	NC_021008	ACGG	2	8	373014	373021	25 %	0 %	50 %	25 %	479135181
6086	NC_021008	CG	3	6	373228	373233	0 %	0 %	50 %	50 %	479135182
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6088	NC_021008	CGG	2	6	373259	373264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135182
6089	NC_021008	TGG	2	6	373385	373390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479135183
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6091	NC_021008	TC	3	6	373426	373431	0 %	50 %	0 %	50 %	479135183
6092	NC_021008	CG	3	6	373445	373450	0 %	0 %	50 %	50 %	479135183
6093	NC_021008	CGA	2	6	373462	373467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135183
6094	NC_021008	GAC	2	6	373514	373519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135183
6095	NC_021008	TCGA	2	8	373527	373534	25 %	25 %	25 %	25 %	479135183
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6099	NC_021008	CTA	2	6	373623	373628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135184
6100	NC_021008	CGA	2	6	373629	373634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135184
6101	NC_021008	GCC	2	6	373639	373644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135184
6102	NC_021008	CGTT	2	8	373705	373712	0 %	50 %	25 %	25 %	479135184
6103	NC_021008	GC	3	6	373765	373770	0 %	0 %	50 %	50 %	479135184
6104	NC_021008	CG	3	6	373811	373816	0 %	0 %	50 %	50 %	479135184
6105	NC_021008	TCA	2	6	373826	373831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135184
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6108	NC_021008	CGA	2	6	374123	374128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135184
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6110	NC_021008	CCG	2	6	374253	374258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135184
6111	NC_021008	GCT	2	6	374328	374333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135184
6112	NC_021008	CGAC	2	8	374337	374344	25 %	0 %	25 %	50 %	479135184
6113	NC_021008	GTC	2	6	374356	374361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135184
6114	NC_021008	CGA	2	6	374363	374368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135184
6115	NC_021008	CGC	2	6	374427	374432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135184
6116	NC_021008	CCCGA	2	10	374470	374479	20 %	0 %	20 %	60 %	479135184
6117	NC_021008	GTC	2	6	374512	374517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135184
6118	NC_021008	GCG	2	6	374581	374586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135184
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6480	NC_021008	CGGC	2	8	399720	399727	0 %	0 %	50 %	50 %	479135201
6481	NC_021008	GGA	2	6	399779	399784	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479135201
6482	NC_021008	CTG	2	6	399786	399791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135201
6483	NC_021008	CGATGA	2	12	403275	403286	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	479135202
6484	NC_021008	GGT	2	6	403318	403323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479135202
6485	NC_021008	AGC	2	6	403377	403382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135202
6486	NC_021008	CGC	2	6	403383	403388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135202
6487	NC_021008	CAT	2	6	403390	403395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135202
6488	NC_021008	TGG	2	6	403440	403445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479135202
6489	NC_021008	TGC	3	9	403521	403529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135202
6490	NC_021008	TGC	2	6	403548	403553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135202
6491	NC_021008	CGG	2	6	403564	403569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135202
6492	NC_021008	TA	3	6	403578	403583	50 %	50 %	0 %	0 %	479135202
6493	NC_021008	GCT	2	6	403793	403798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135203
6494	NC_021008	CGA	2	6	403811	403816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135203
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6496	NC_021008	CCA	2	6	403886	403891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479135203
6497	NC_021008	GATC	2	8	403892	403899	25 %	25 %	25 %	25 %	479135203
6498	NC_021008	GC	3	6	403966	403971	0 %	0 %	50 %	50 %	479135203
6499	NC_021008	GCCG	2	8	403974	403981	0 %	0 %	50 %	50 %	479135203
6500	NC_021008	GCA	2	6	403982	403987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135203

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