MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum F8 draft genome

Total Repeats: 38496

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_021008	AGCTTG	2	12	310182	310193	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	479135131
5002	NC_021008	CAG	2	6	310274	310279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135131
5003	NC_021008	ATGGCG	2	12	310287	310298	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	479135131
5004	NC_021008	GGC	2	6	310346	310351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135131
5005	NC_021008	CGA	2	6	310357	310362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135131
5006	NC_021008	TGAGCA	2	12	310447	310458	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	479135131
5007	NC_021008	ATG	2	6	310473	310478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135131
5008	NC_021008	GAT	2	6	310508	310513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135131
5009	NC_021008	CCA	2	6	310540	310545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479135131
5010	NC_021008	GCTG	2	8	310582	310589	0 %	25 %	50 %	25 %	479135131
5011	NC_021008	ATG	2	6	310596	310601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135131
5012	NC_021008	GGT	2	6	310872	310877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479135132
5013	NC_021008	GCG	2	6	311077	311082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135132
5014	NC_021008	TCGGC	2	10	311090	311099	0 %	20 %	40 %	40 %	479135132
5015	NC_021008	GTT	2	6	311100	311105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479135132
5016	NC_021008	TGA	2	6	311123	311128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135132
5017	NC_021008	TTGGTG	2	12	311140	311151	0 %	50 %	50 %	0 %	479135132
5018	NC_021008	GTC	2	6	311154	311159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135132
5019	NC_021008	AGT	2	6	311165	311170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135132
5020	NC_021008	GTG	2	6	311173	311178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479135132
5021	NC_021008	TAG	2	6	311179	311184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135132
5022	NC_021008	TTG	2	6	311188	311193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479135132
5023	NC_021008	GAT	2	6	311283	311288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135132
5024	NC_021008	GCCA	2	8	311295	311302	25 %	0 %	25 %	50 %	479135132
5025	NC_021008	AGT	3	9	311306	311314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135132
5026	NC_021008	AGC	2	6	311326	311331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135132
5027	NC_021008	TCT	2	6	311351	311356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479135132
5028	NC_021008	GTC	2	6	311379	311384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135132
5029	NC_021008	GGA	3	9	311388	311396	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479135132
5030	NC_021008	CCA	2	6	311408	311413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479135132
5031	NC_021008	CGG	2	6	311432	311437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135132
5032	NC_021008	GGA	2	6	311463	311468	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479135132
5033	NC_021008	CTT	2	6	311502	311507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479135132
5034	NC_021008	CGG	2	6	311522	311527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135132
5035	NC_021008	GGC	2	6	311613	311618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135132
5036	NC_021008	GGT	2	6	311670	311675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479135132
5037	NC_021008	GGCC	2	8	311690	311697	0 %	0 %	50 %	50 %	479135132
5038	NC_021008	GTT	2	6	311709	311714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479135132
5039	NC_021008	TTG	2	6	311728	311733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479135132
5040	NC_021008	GTC	2	6	311766	311771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135132
5041	NC_021008	CTT	2	6	311790	311795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479135132
5042	NC_021008	GCC	2	6	311805	311810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135132
5043	NC_021008	GCG	3	9	311869	311877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135132
5044	NC_021008	TGG	2	6	311888	311893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479135132
5045	NC_021008	CTGGAG	2	12	311935	311946	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	479135132
5046	NC_021008	ATC	2	6	311949	311954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135132
5047	NC_021008	TGC	2	6	311957	311962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135132
5048	NC_021008	AGC	2	6	311969	311974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135132
5049	NC_021008	TCG	2	6	313316	313321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135133
5050	NC_021008	CGA	2	6	313407	313412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135133
5051	NC_021008	CGG	2	6	313488	313493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135133
5052	NC_021008	CGG	2	6	313497	313502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135133
5053	NC_021008	CCT	2	6	313503	313508	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479135133
5054	NC_021008	CAG	2	6	313525	313530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135133
5055	NC_021008	CGG	2	6	313554	313559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135133
5056	NC_021008	CGG	2	6	313632	313637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135133
5057	NC_021008	GTG	2	6	313643	313648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479135133
5058	NC_021008	GCC	2	6	313660	313665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135133
5059	NC_021008	GATC	2	8	313707	313714	25 %	25 %	25 %	25 %	479135133
5060	NC_021008	TCG	2	6	313721	313726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135133
5061	NC_021008	TCG	2	6	313733	313738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135133
5062	NC_021008	CGC	2	6	313824	313829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135133
5063	NC_021008	CGC	2	6	313911	313916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135133
5064	NC_021008	GGT	2	6	313924	313929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479135133
5065	NC_021008	GCA	2	6	313989	313994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135133
5066	NC_021008	CGC	2	6	314022	314027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135133
5067	NC_021008	ATG	2	6	314048	314053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135133
5068	NC_021008	CG	3	6	314058	314063	0 %	0 %	50 %	50 %	479135133
5069	NC_021008	CAT	2	6	314064	314069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135133
5070	NC_021008	GAC	3	9	314253	314261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135133
5071	NC_021008	TTC	2	6	314314	314319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479135133
5072	NC_021008	CTC	2	6	314332	314337	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479135133
5073	NC_021008	GCC	3	9	314348	314356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135133
5074	NC_021008	CTT	2	6	314539	314544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479135134
5075	NC_021008	TCT	2	6	314592	314597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479135134
5076	NC_021008	GGAT	2	8	314723	314730	25 %	25 %	50 %	0 %	479135134
5077	NC_021008	CTG	2	6	314734	314739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135134
5078	NC_021008	CGG	2	6	315161	315166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135135
5079	NC_021008	TCG	2	6	315243	315248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135135
5080	NC_021008	CCA	2	6	315292	315297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479135135
5081	NC_021008	CGG	2	6	315304	315309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135135
5082	NC_021008	CGG	2	6	315334	315339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135135
5083	NC_021008	GGA	2	6	315388	315393	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479135135
5084	NC_021008	GCT	2	6	315410	315415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135135
5085	NC_021008	CATC	2	8	315517	315524	25 %	25 %	0 %	50 %	479135135
5086	NC_021008	CAC	2	6	315572	315577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479135135
5087	NC_021008	CAC	2	6	315590	315595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479135135
5088	NC_021008	CGC	2	6	315598	315603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135135
5089	NC_021008	TAAA	2	8	315627	315634	75 %	25 %	0 %	0 %	479135135
5090	NC_021008	CCA	2	6	315649	315654	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479135135
5091	NC_021008	GGC	2	6	315704	315709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135135
5092	NC_021008	CCA	2	6	315730	315735	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479135135
5093	NC_021008	CAC	2	6	315749	315754	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479135135
5094	NC_021008	CCA	2	6	315799	315804	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479135135
5095	NC_021008	GTC	2	6	315815	315820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135135
5096	NC_021008	CAC	2	6	315854	315859	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479135135
5097	NC_021008	CGT	2	6	315870	315875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135135
5098	NC_021008	CATCG	2	10	315902	315911	20 %	20 %	20 %	40 %	479135135
5099	NC_021008	CTCA	2	8	315953	315960	25 %	25 %	0 %	50 %	479135135
5100	NC_021008	CCG	2	6	316053	316058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135135
5101	NC_021008	GCG	2	6	316069	316074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135135
5102	NC_021008	GCC	2	6	316081	316086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135135
5103	NC_021008	TGG	2	6	316093	316098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479135135
5104	NC_021008	CAC	2	6	316121	316126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479135135
5105	NC_021008	TCC	2	6	316269	316274	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479135135
5106	NC_021008	TGAT	2	8	316275	316282	25 %	50 %	25 %	0 %	479135135
5107	NC_021008	ATG	2	6	318253	318258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135136
5108	NC_021008	CCG	2	6	318272	318277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135136
5109	NC_021008	ACG	2	6	318323	318328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135136
5110	NC_021008	ATC	2	6	318334	318339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135136
5111	NC_021008	CAT	2	6	318351	318356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135136
5112	NC_021008	TGG	2	6	318415	318420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479135136
5113	NC_021008	TGA	2	6	318447	318452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135136
5114	NC_021008	CGA	2	6	318453	318458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135136
5115	NC_021008	GCCGAA	2	12	318481	318492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135136
5116	NC_021008	GAA	2	6	318499	318504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479135136
5117	NC_021008	ACG	3	9	318512	318520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135136
5118	NC_021008	GACACC	2	12	318535	318546	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	479135136
5119	NC_021008	CAT	2	6	318588	318593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135137
5120	NC_021008	TTC	2	6	318874	318879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479135138
5121	NC_021008	GAA	2	6	318927	318932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479135138
5122	NC_021008	GC	3	6	319230	319235	0 %	0 %	50 %	50 %	479135139
5123	NC_021008	CAA	2	6	319267	319272	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479135139
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5129	NC_021008	CG	3	6	319640	319645	0 %	0 %	50 %	50 %	479135140
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5134	NC_021008	TCA	2	6	319801	319806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135140
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5239	NC_021008	GCC	2	6	326628	326633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135143
5240	NC_021008	ATG	2	6	326638	326643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135143
5241	NC_021008	AGC	2	6	326674	326679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135143
5242	NC_021008	GAA	2	6	326685	326690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479135143
5243	NC_021008	GAC	2	6	326694	326699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135143
5244	NC_021008	CTTGCC	2	12	326760	326771	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	479135143
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5246	NC_021008	GTC	2	6	326791	326796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135143
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5248	NC_021008	CTG	2	6	326821	326826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135144
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5250	NC_021008	ACG	2	6	326882	326887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135144
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5254	NC_021008	GTT	2	6	327014	327019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479135144
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5259	NC_021008	TGG	2	6	327160	327165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479135144
5260	NC_021008	CTG	2	6	327194	327199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135144
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5269	NC_021008	CTG	2	6	327593	327598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135144
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5334	NC_021008	TCG	2	6	331186	331191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135147
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5342	NC_021008	GAT	2	6	331653	331658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135147
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5347	NC_021008	ATG	2	6	332223	332228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135148
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5350	NC_021008	TGG	2	6	332272	332277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479135148
5351	NC_021008	TCG	2	6	332346	332351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135148
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5353	NC_021008	CGG	2	6	332449	332454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135148
5354	NC_021008	TCC	2	6	332493	332498	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479135148
5355	NC_021008	AGG	2	6	332506	332511	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479135148
5356	NC_021008	ACC	2	6	332540	332545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479135148
5357	NC_021008	TCGG	2	8	332607	332614	0 %	25 %	50 %	25 %	479135148
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5359	NC_021008	TGGCGG	2	12	332797	332808	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	479135148
5360	NC_021008	CTTCGG	2	12	332840	332851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135148
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5478	NC_021008	TTC	2	6	339366	339371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479135156
5479	NC_021008	GAC	2	6	339386	339391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135156
5480	NC_021008	GGA	2	6	339446	339451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479135156
5481	NC_021008	GAT	2	6	339491	339496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135156
5482	NC_021008	GAGGAT	2	12	339548	339559	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	479135156
5483	NC_021008	AGC	2	6	339588	339593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135156
5484	NC_021008	CTG	2	6	339599	339604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135156
5485	NC_021008	ACC	2	6	339608	339613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479135156
5486	NC_021008	GTC	2	6	339701	339706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135156
5487	NC_021008	TC	3	6	339754	339759	0 %	50 %	0 %	50 %	479135156
5488	NC_021008	GCA	2	6	339769	339774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135156
5489	NC_021008	CGA	2	6	339964	339969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135156
5490	NC_021008	GAT	2	6	340030	340035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135156
5491	NC_021008	GGT	2	6	340087	340092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479135156
5492	NC_021008	GAC	2	6	340114	340119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135156
5493	NC_021008	CCA	2	6	340120	340125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479135156
5494	NC_021008	TTC	2	6	340139	340144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479135156
5495	NC_021008	GCG	2	6	340153	340158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135156
5496	NC_021008	ATG	2	6	340203	340208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135156
5497	NC_021008	GGC	2	6	340226	340231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135156
5498	NC_021008	TGA	3	9	340252	340260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135156
5499	NC_021008	AGC	2	6	340359	340364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135156
5500	NC_021008	CGA	2	6	340396	340401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135156

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