MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium thermophilum RBL67

Total Repeats: 41225

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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41002	NC_020546	CGG	2	6	2276525	2276530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470203832
41003	NC_020546	CAC	2	6	2276583	2276588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470203832
41004	NC_020546	GAT	2	6	2276622	2276627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470203832
41005	NC_020546	CAA	2	6	2276730	2276735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470203832
41006	NC_020546	TCA	2	6	2276738	2276743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470203832
41007	NC_020546	ATG	2	6	2276782	2276787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470203832
41008	NC_020546	CTG	2	6	2276788	2276793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470203832
41009	NC_020546	CCA	2	6	2276798	2276803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470203832
41010	NC_020546	CGG	2	6	2276832	2276837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470203832
41011	NC_020546	TCT	3	9	2276891	2276899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470203832
41012	NC_020546	GGC	2	6	2276931	2276936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470203832
41013	NC_020546	AGC	2	6	2277038	2277043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470203832
41014	NC_020546	CCG	2	6	2277080	2277085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470203832
41015	NC_020546	GCT	2	6	2277246	2277251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470203832
41016	NC_020546	CAT	2	6	2277255	2277260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470203832
41017	NC_020546	CAC	2	6	2277273	2277278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470203832
41018	NC_020546	TGCG	2	8	2277290	2277297	0 %	25 %	50 %	25 %	470203832
41019	NC_020546	TGA	2	6	2277315	2277320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470203832
41020	NC_020546	TTC	2	6	2277371	2277376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470203832
41021	NC_020546	CCGC	2	8	2277458	2277465	0 %	0 %	25 %	75 %	470203832
41022	NC_020546	GAT	2	6	2277466	2277471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470203832
41023	NC_020546	TGCGC	2	10	2277480	2277489	0 %	20 %	40 %	40 %	470203832
41024	NC_020546	CTT	2	6	2277510	2277515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470203832
41025	NC_020546	TCG	2	6	2277527	2277532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470203832
41026	NC_020546	TGT	2	6	2277533	2277538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470203832
41027	NC_020546	TCGC	2	8	2277550	2277557	0 %	25 %	25 %	50 %	470203832
41028	NC_020546	TGC	2	6	2277560	2277565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470203832
41029	NC_020546	GAT	2	6	2277606	2277611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470203832
41030	NC_020546	CTGTCA	2	12	2277616	2277627	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	470203832
41031	NC_020546	ATC	2	6	2277652	2277657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470203832
41032	NC_020546	CTG	2	6	2277739	2277744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470203832
41033	NC_020546	ACC	2	6	2277748	2277753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470203832
41034	NC_020546	CTG	2	6	2277829	2277834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470203832
41035	NC_020546	TGC	2	6	2277842	2277847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470203832
41036	NC_020546	CGT	2	6	2277877	2277882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470203832
41037	NC_020546	CTG	2	6	2277967	2277972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470203832
41038	NC_020546	CGG	2	6	2277993	2277998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470203832
41039	NC_020546	CGT	2	6	2278032	2278037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470203832
41040	NC_020546	TGT	2	6	2278109	2278114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470203832
41041	NC_020546	GCG	2	6	2278156	2278161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470203832
41042	NC_020546	CGA	2	6	2278197	2278202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470203832
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41045	NC_020546	ACT	3	9	2278447	2278455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470203832
41046	NC_020546	CG	3	6	2278608	2278613	0 %	0 %	50 %	50 %	470203832
41047	NC_020546	CAT	2	6	2278673	2278678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470203832
41048	NC_020546	CGT	2	6	2278699	2278704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470203832
41049	NC_020546	CA	3	6	2278707	2278712	50 %	0 %	0 %	50 %	470203832
41050	NC_020546	ATC	2	6	2278750	2278755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470203832
41051	NC_020546	TGG	2	6	2278877	2278882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470203832
41052	NC_020546	CGC	2	6	2279034	2279039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470203832
41053	NC_020546	AGC	2	6	2279366	2279371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470203832
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41056	NC_020546	GCA	2	6	2279438	2279443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470203832
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41061	NC_020546	GCA	2	6	2279502	2279507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470203832
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41064	NC_020546	CGC	2	6	2279619	2279624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470203832
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41066	NC_020546	CGATT	2	10	2279734	2279743	20 %	40 %	20 %	20 %	470203832
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41102	NC_020546	TGA	2	6	2281631	2281636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470203833
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41114	NC_020546	CAAG	2	8	2283002	2283009	50 %	0 %	25 %	25 %	470203834
41115	NC_020546	CG	3	6	2283013	2283018	0 %	0 %	50 %	50 %	470203834
41116	NC_020546	CAG	2	6	2283023	2283028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470203834
41117	NC_020546	TCT	2	6	2283050	2283055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470203834
41118	NC_020546	TCA	2	6	2283154	2283159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470203834
41119	NC_020546	ATC	2	6	2283160	2283165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470203834
41120	NC_020546	GCC	2	6	2283178	2283183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470203834
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41122	NC_020546	TCCAG	2	10	2283283	2283292	20 %	20 %	20 %	40 %	470203834
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41132	NC_020546	GTCA	2	8	2283714	2283721	25 %	25 %	25 %	25 %	470203834
41133	NC_020546	GC	3	6	2283754	2283759	0 %	0 %	50 %	50 %	470203834
41134	NC_020546	ATTGC	2	10	2283782	2283791	20 %	40 %	20 %	20 %	470203834
41135	NC_020546	GAA	2	6	2283795	2283800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470203834
41136	NC_020546	TTC	2	6	2283822	2283827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470203834
41137	NC_020546	TGC	2	6	2283850	2283855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470203834
41138	NC_020546	TGC	2	6	2283877	2283882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470203834
41139	NC_020546	GCA	2	6	2283898	2283903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470203834
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41142	NC_020546	CATGC	2	10	2284299	2284308	20 %	20 %	20 %	40 %	470203835
41143	NC_020546	CTG	2	6	2284329	2284334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470203835
41144	NC_020546	TCG	2	6	2284373	2284378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470203835
41145	NC_020546	CTTCA	2	10	2284407	2284416	20 %	40 %	0 %	40 %	470203835
41146	NC_020546	ACCAA	2	10	2284507	2284516	60 %	0 %	0 %	40 %	470203835
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41150	NC_020546	CTGTC	2	10	2284706	2284715	0 %	40 %	20 %	40 %	470203835
41151	NC_020546	CGC	2	6	2284742	2284747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470203835
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41167	NC_020546	GCAC	2	8	2288105	2288112	25 %	0 %	25 %	50 %	470203836
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41177	NC_020546	TCA	2	6	2288887	2288892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470203837
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41183	NC_020546	TCT	2	6	2289173	2289178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470203837
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41225	NC_020546	GAC	2	6	2291518	2291523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470203840

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.