MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Bifidobacterium breve UCC2003

Total Repeats: 33387

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020517	CTT	2	6	64	69	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	476417162
2	NC_020517	TTG	2	6	211	216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	476417162
3	NC_020517	AGT	2	6	264	269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	476417162
4	NC_020517	CTG	2	6	374	379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417162
5	NC_020517	CAG	2	6	385	390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417162
6	NC_020517	GCA	2	6	402	407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417162
7	NC_020517	CCG	2	6	726	731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	476417162
8	NC_020517	TGC	2	6	749	754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417162
9	NC_020517	TGA	2	6	759	764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	476417162
10	NC_020517	GGC	2	6	778	783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	476417162
11	NC_020517	TTC	2	6	805	810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	476417162
12	NC_020517	GCC	2	6	942	947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	476417162
13	NC_020517	CCG	2	6	1088	1093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	476417162
14	NC_020517	CTT	2	6	1152	1157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	476417162
15	NC_020517	ACC	2	6	1159	1164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	476417162
16	NC_020517	CAT	2	6	1188	1193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	476417162
17	NC_020517	TCG	2	6	1235	1240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417162
18	NC_020517	TCA	2	6	1243	1248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	476417162
19	NC_020517	GTG	2	6	1261	1266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	476417162
20	NC_020517	GCA	2	6	1398	1403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417162
21	NC_020517	CCG	2	6	2062	2067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	476417163
22	NC_020517	CAC	2	6	2205	2210	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	476417163
23	NC_020517	TGA	2	6	2225	2230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	476417163
24	NC_020517	ACC	2	6	2307	2312	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	476417163
25	NC_020517	GCC	2	6	2402	2407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	476417163
26	NC_020517	GAA	2	6	2478	2483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	476417163
27	NC_020517	GAC	2	6	2523	2528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417163
28	NC_020517	TCA	2	6	2533	2538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	476417163
29	NC_020517	ATG	2	6	2889	2894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	476417163
30	NC_020517	CCG	2	6	2920	2925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	476417163
31	NC_020517	CCG	2	6	2929	2934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	476417163
32	NC_020517	CGA	2	6	2978	2983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417163
33	NC_020517	GCA	2	6	3095	3100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417163
34	NC_020517	CTG	2	6	3138	3143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417163
35	NC_020517	TGG	2	6	3307	3312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	476417164
36	NC_020517	TGC	2	6	3361	3366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417164
37	NC_020517	GTA	2	6	3411	3416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	476417164
38	NC_020517	GAC	2	6	3417	3422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417164
39	NC_020517	CAC	2	6	3434	3439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	476417164
40	NC_020517	ATC	2	6	3516	3521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	476417164
41	NC_020517	CTG	2	6	3618	3623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417164
42	NC_020517	AGC	2	6	3670	3675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417164
43	NC_020517	AGC	2	6	3691	3696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417164
44	NC_020517	TGA	2	6	4154	4159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	476417164
45	NC_020517	GAC	2	6	4176	4181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417164
46	NC_020517	CGT	2	6	4185	4190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417164
47	NC_020517	CCG	2	6	4309	4314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	476417164
48	NC_020517	CGC	2	6	4448	4453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	476417165
49	NC_020517	TGA	2	6	4518	4523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	476417165
50	NC_020517	GGT	2	6	4594	4599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	476417165
51	NC_020517	CGG	2	6	4776	4781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	476417165
52	NC_020517	AGA	2	6	5004	5009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	476417166
53	NC_020517	AGC	2	6	5024	5029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417166
54	NC_020517	GGC	2	6	5034	5039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	476417166
55	NC_020517	CAA	2	6	5052	5057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	476417166
56	NC_020517	CAC	2	6	5200	5205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	476417166
57	NC_020517	TCG	2	6	5219	5224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417166
58	NC_020517	GTG	2	6	5302	5307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	476417166
59	NC_020517	TGA	2	6	5331	5336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	476417166
60	NC_020517	TGA	2	6	5372	5377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	476417166
61	NC_020517	CGG	2	6	5391	5396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	476417166
62	NC_020517	TGG	2	6	5403	5408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	476417166
63	NC_020517	CGG	2	6	5409	5414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	476417166
64	NC_020517	CGG	2	6	5427	5432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	476417166
65	NC_020517	GTG	2	6	5455	5460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	476417166
66	NC_020517	ACC	2	6	5632	5637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	476417166
67	NC_020517	CGA	2	6	5715	5720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417166
68	NC_020517	CGA	2	6	5742	5747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417166
69	NC_020517	TCA	2	6	5879	5884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	476417166
70	NC_020517	CCA	2	6	5987	5992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	476417166
71	NC_020517	GGC	2	6	5998	6003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	476417166
72	NC_020517	GAG	2	6	6010	6015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	476417166
73	NC_020517	CGA	2	6	6102	6107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417166
74	NC_020517	TGA	2	6	6221	6226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	476417166
75	NC_020517	CAT	2	6	6276	6281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	476417166
76	NC_020517	GCC	2	6	6316	6321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	476417166
77	NC_020517	AAG	2	6	6322	6327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	476417166
78	NC_020517	CGC	2	6	6343	6348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	476417166
79	NC_020517	CCG	2	6	6365	6370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	476417166
80	NC_020517	TCC	2	6	6400	6405	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	476417166
81	NC_020517	ATG	2	6	6547	6552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	476417166
82	NC_020517	TCA	3	9	6641	6649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	476417166
83	NC_020517	TTC	2	6	6703	6708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	476417166
84	NC_020517	GAT	2	6	6723	6728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	476417166
85	NC_020517	CCG	2	6	6731	6736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	476417166
86	NC_020517	GCC	2	6	6756	6761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	476417166
87	NC_020517	ACC	2	6	6931	6936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	476417166
88	NC_020517	CGA	2	6	6993	6998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417166
89	NC_020517	CGA	2	6	7020	7025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417166
90	NC_020517	GCG	2	6	7373	7378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	476417167
91	NC_020517	GCA	2	6	7401	7406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417167
92	NC_020517	CCG	2	6	7497	7502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	476417167
93	NC_020517	ACG	2	6	7520	7525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417167
94	NC_020517	ACA	2	6	7550	7555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	476417167
95	NC_020517	TCG	2	6	7667	7672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417167
96	NC_020517	CGA	2	6	7701	7706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417167
97	NC_020517	GCC	3	9	7711	7719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	476417167
98	NC_020517	ACG	2	6	7808	7813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417167
99	NC_020517	CTG	2	6	7858	7863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417167
100	NC_020517	CCG	2	6	7874	7879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	476417167
101	NC_020517	CCA	2	6	7898	7903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	476417167
102	NC_020517	CCG	2	6	7909	7914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	476417167
103	NC_020517	GCT	2	6	7983	7988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417167
104	NC_020517	CAT	2	6	8004	8009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	476417167
105	NC_020517	TCA	2	6	8090	8095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	476417167
106	NC_020517	GAG	2	6	8119	8124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	476417167
107	NC_020517	TGG	2	6	8144	8149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	476417167
108	NC_020517	GTC	2	6	8188	8193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417167
109	NC_020517	CGA	2	6	8247	8252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417167
110	NC_020517	GGT	2	6	8313	8318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	476417167
111	NC_020517	AAC	2	6	8323	8328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	476417167
112	NC_020517	GCA	2	6	8349	8354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417167
113	NC_020517	ACC	2	6	8438	8443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	476417167
114	NC_020517	ATC	2	6	8770	8775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	476417167
115	NC_020517	CGA	2	6	8787	8792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417167
116	NC_020517	GTG	2	6	8884	8889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	476417167
117	NC_020517	TCA	2	6	8912	8917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	476417167
118	NC_020517	CGA	2	6	8931	8936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417167
119	NC_020517	GGC	2	6	8956	8961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	476417167
120	NC_020517	GAC	2	6	8992	8997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417167
121	NC_020517	GTG	2	6	8998	9003	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	476417167
122	NC_020517	CTT	2	6	9009	9014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	476417167
123	NC_020517	GCT	2	6	9036	9041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417167
124	NC_020517	TTC	2	6	9043	9048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	476417167
125	NC_020517	CTG	2	6	9133	9138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417167
126	NC_020517	CGA	2	6	9150	9155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417167
127	NC_020517	AAG	2	6	9235	9240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	476417167
128	NC_020517	GGC	2	6	9274	9279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	476417167
129	NC_020517	CGA	2	6	9303	9308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417167
130	NC_020517	CAT	2	6	9366	9371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	476417167
131	NC_020517	AGC	2	6	9419	9424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417167
132	NC_020517	GTC	2	6	9437	9442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417167
133	NC_020517	CGA	2	6	9480	9485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417167
134	NC_020517	GTG	2	6	9661	9666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	476417167
135	NC_020517	CAT	2	6	9690	9695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	476417167
136	NC_020517	CGA	2	6	9789	9794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417167
137	NC_020517	GAA	2	6	9817	9822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	476417167
138	NC_020517	AGG	2	6	9839	9844	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	476417167
139	NC_020517	CCG	2	6	9881	9886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	476417167
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141	NC_020517	ACA	2	6	10039	10044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	476417168
142	NC_020517	CAG	2	6	10166	10171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417168
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144	NC_020517	CGC	2	6	10313	10318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	476417168
145	NC_020517	CGT	2	6	10322	10327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417168
146	NC_020517	GCT	3	9	10331	10339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417168
147	NC_020517	TTC	2	6	10379	10384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	476417168
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149	NC_020517	ACC	2	6	10434	10439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	476417168
150	NC_020517	GTG	2	6	10440	10445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	476417168
151	NC_020517	TCT	2	6	10459	10464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	476417168
152	NC_020517	GTG	2	6	10476	10481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	476417168
153	NC_020517	CCA	2	6	10498	10503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	476417168
154	NC_020517	TGG	2	6	10657	10662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	476417169
155	NC_020517	TCA	2	6	10719	10724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	476417169
156	NC_020517	CAG	2	6	10751	10756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417169
157	NC_020517	GCG	2	6	10801	10806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	476417169
158	NC_020517	GTT	2	6	10832	10837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	476417169
159	NC_020517	TGA	2	6	10843	10848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	476417169
160	NC_020517	TGC	2	6	10948	10953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417169
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162	NC_020517	CAT	2	6	11108	11113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	476417169
163	NC_020517	CGC	2	6	11122	11127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	476417169
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249	NC_020517	CTC	2	6	18457	18462	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	476417172
250	NC_020517	GCG	2	6	18473	18478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	476417172
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253	NC_020517	CGG	2	6	18558	18563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	476417172
254	NC_020517	GTA	2	6	18565	18570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	476417172
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257	NC_020517	CGG	2	6	18720	18725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	476417172
258	NC_020517	GCC	2	6	18829	18834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	476417172
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499	NC_020517	GTT	2	6	47046	47051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	476417187
500	NC_020517	TGC	2	6	47072	47077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417187

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