MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium breve UCC2003

Total Repeats: 43805

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_020517	TTTCC	2	10	227625	227634	0 %	60 %	0 %	40 %	476417310
4002	NC_020517	CAT	2	6	228005	228010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	476417311
4003	NC_020517	TCG	3	9	228011	228019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417311
4004	NC_020517	CTA	2	6	228063	228068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	476417311
4005	NC_020517	AGC	2	6	228083	228088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417311
4006	NC_020517	CCG	2	6	228137	228142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	476417311
4007	NC_020517	CTGG	2	8	228150	228157	0 %	25 %	50 %	25 %	476417311
4008	NC_020517	ACCGTC	2	12	228190	228201	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	476417311
4009	NC_020517	GCA	2	6	228216	228221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417311
4010	NC_020517	AGC	2	6	228296	228301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417311
4011	NC_020517	GCCA	2	8	228337	228344	25 %	0 %	25 %	50 %	476417311
4012	NC_020517	GCC	2	6	228406	228411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	476417311
4013	NC_020517	CGGC	2	8	228545	228552	0 %	0 %	50 %	50 %	476417311
4014	NC_020517	GGT	2	6	228582	228587	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	476417311
4015	NC_020517	CCG	2	6	228608	228613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	476417311
4016	NC_020517	GCC	2	6	228628	228633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	476417311
4017	NC_020517	GGA	2	6	228681	228686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	476417311
4018	NC_020517	TACGGC	2	12	228694	228705	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	476417311
4019	NC_020517	CGC	3	9	228759	228767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	476417311
4020	NC_020517	GCC	2	6	228775	228780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	476417311
4021	NC_020517	GC	3	6	228783	228788	0 %	0 %	50 %	50 %	476417311
4022	NC_020517	GTGC	2	8	228834	228841	0 %	25 %	50 %	25 %	476417311
4023	NC_020517	GAG	2	6	228859	228864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	476417311
4024	NC_020517	CG	3	6	228879	228884	0 %	0 %	50 %	50 %	476417311
4025	NC_020517	GTC	2	6	228898	228903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417311
4026	NC_020517	GCG	2	6	228918	228923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	476417312
4027	NC_020517	ACCT	2	8	228927	228934	25 %	25 %	0 %	50 %	476417312
4028	NC_020517	CGG	2	6	228947	228952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	476417312
4029	NC_020517	CGCAAA	2	12	228986	228997	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	476417312
4030	NC_020517	CG	4	8	229055	229062	0 %	0 %	50 %	50 %	476417312
4031	NC_020517	GCG	3	9	229060	229068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	476417312
4032	NC_020517	GAA	2	6	229076	229081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	476417312
4033	NC_020517	TCG	2	6	229087	229092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417312
4034	NC_020517	GC	3	6	229115	229120	0 %	0 %	50 %	50 %	476417312
4035	NC_020517	CGG	3	9	229159	229167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	476417312
4036	NC_020517	ACG	2	6	229243	229248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417312
4037	NC_020517	GACC	2	8	229262	229269	25 %	0 %	25 %	50 %	476417312
4038	NC_020517	GC	3	6	229297	229302	0 %	0 %	50 %	50 %	476417312
4039	NC_020517	GGCGA	2	10	229311	229320	20 %	0 %	60 %	20 %	476417312
4040	NC_020517	CGG	2	6	229379	229384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	476417312
4041	NC_020517	GTG	2	6	229392	229397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	476417312
4042	NC_020517	GC	3	6	229417	229422	0 %	0 %	50 %	50 %	476417312
4043	NC_020517	GGCC	2	8	229430	229437	0 %	0 %	50 %	50 %	476417312
4044	NC_020517	GC	3	6	229456	229461	0 %	0 %	50 %	50 %	476417312
4045	NC_020517	GAG	2	6	229560	229565	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	476417312
4046	NC_020517	CGA	2	6	229571	229576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417312
4047	NC_020517	GCC	2	6	229608	229613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	476417312
4048	NC_020517	CG	3	6	229614	229619	0 %	0 %	50 %	50 %	476417312
4049	NC_020517	GAG	2	6	229629	229634	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	476417312
4050	NC_020517	CGC	2	6	229641	229646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	476417312
4051	NC_020517	CGG	2	6	229685	229690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	476417312
4052	NC_020517	GTC	2	6	229737	229742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417312
4053	NC_020517	TGG	2	6	229758	229763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	476417312
4054	NC_020517	GC	3	6	229772	229777	0 %	0 %	50 %	50 %	476417312
4055	NC_020517	GCGCTC	2	12	229794	229805	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	476417312
4056	NC_020517	CGC	2	6	229816	229821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	476417312
4057	NC_020517	TCG	2	6	229822	229827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417312
4058	NC_020517	GCG	2	6	229845	229850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	476417312
4059	NC_020517	CGGCG	2	10	229859	229868	0 %	0 %	60 %	40 %	476417312
4060	NC_020517	GC	3	6	229891	229896	0 %	0 %	50 %	50 %	476417312
4061	NC_020517	GAC	2	6	229899	229904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417312
4062	NC_020517	GCAT	2	8	229941	229948	25 %	25 %	25 %	25 %	476417313
4063	NC_020517	GGC	2	6	229970	229975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	476417313
4064	NC_020517	GTG	2	6	229979	229984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	476417313
4065	NC_020517	GGC	2	6	230047	230052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	476417313
4066	NC_020517	GAG	2	6	230156	230161	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	476417313
4067	NC_020517	GT	3	6	230163	230168	0 %	50 %	50 %	0 %	476417313
4068	NC_020517	GCT	2	6	230196	230201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417313
4069	NC_020517	GCC	3	9	230204	230212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	476417313
4070	NC_020517	CAT	2	6	230221	230226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	476417313
4071	NC_020517	GC	3	6	230284	230289	0 %	0 %	50 %	50 %	476417313
4072	NC_020517	ACG	2	6	230295	230300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417313
4073	NC_020517	CGTGAT	2	12	230305	230316	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	476417313
4074	NC_020517	CGCCGA	2	12	230335	230346	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	476417313
4075	NC_020517	GC	3	6	230347	230352	0 %	0 %	50 %	50 %	476417313
4076	NC_020517	CAT	2	6	230371	230376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	476417313
4077	NC_020517	CCA	2	6	230379	230384	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	476417313
4078	NC_020517	GCT	2	6	230437	230442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417313
4079	NC_020517	GAT	2	6	230449	230454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	476417313
4080	NC_020517	GCC	2	6	230528	230533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	476417313
4081	NC_020517	GGT	2	6	230548	230553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	476417313
4082	NC_020517	CGA	2	6	230574	230579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417313
4083	NC_020517	GTC	2	6	230668	230673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417314
4084	NC_020517	CTG	2	6	230674	230679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417314
4085	NC_020517	CGC	2	6	230780	230785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	476417314
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4087	NC_020517	CGT	2	6	230935	230940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417314
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4091	NC_020517	CGT	2	6	231091	231096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417314
4092	NC_020517	GGA	2	6	231111	231116	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	476417314
4093	NC_020517	GGA	2	6	231189	231194	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	476417314
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4099	NC_020517	GC	3	6	231693	231698	0 %	0 %	50 %	50 %	476417315
4100	NC_020517	GGA	2	6	231719	231724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	476417315
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4102	NC_020517	CAG	2	6	231790	231795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417315
4103	NC_020517	GCC	2	6	231911	231916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	476417315
4104	NC_020517	TCA	2	6	231951	231956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	476417315
4105	NC_020517	ACG	2	6	232005	232010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417315
4106	NC_020517	CGG	2	6	232042	232047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	476417315
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4108	NC_020517	AAG	2	6	232199	232204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	476417315
4109	NC_020517	CAG	2	6	232250	232255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417315
4110	NC_020517	CCGC	2	8	232341	232348	0 %	0 %	25 %	75 %	476417315
4111	NC_020517	CAT	2	6	232378	232383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	476417315
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4113	NC_020517	TCA	2	6	232467	232472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	476417315
4114	NC_020517	CGA	2	6	232498	232503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417315
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4118	NC_020517	AAC	2	6	232763	232768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	476417315
4119	NC_020517	TCC	2	6	232811	232816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	476417315
4120	NC_020517	GAC	2	6	232844	232849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417315
4121	NC_020517	TGC	2	6	232911	232916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417315
4122	NC_020517	TGG	2	6	232922	232927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	476417315
4123	NC_020517	AGC	2	6	232950	232955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417315
4124	NC_020517	ACA	2	6	232983	232988	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	476417315
4125	NC_020517	GCC	2	6	233012	233017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	476417315
4126	NC_020517	TCC	2	6	233021	233026	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	476417315
4127	NC_020517	CGA	2	6	233029	233034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417315
4128	NC_020517	CAG	2	6	233036	233041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417315
4129	NC_020517	CCG	2	6	233118	233123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	476417315
4130	NC_020517	AAG	2	6	233126	233131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	476417315
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4132	NC_020517	CGT	2	6	233376	233381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417316
4133	NC_020517	TTC	2	6	233392	233397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	476417316
4134	NC_020517	AGC	2	6	233459	233464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417316
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4136	NC_020517	ATC	2	6	233641	233646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	476417316
4137	NC_020517	GTG	2	6	233650	233655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	476417316
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4139	NC_020517	CAT	2	6	233730	233735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	476417316
4140	NC_020517	CTGG	2	8	233757	233764	0 %	25 %	50 %	25 %	476417316
4141	NC_020517	TGC	2	6	233768	233773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417316
4142	NC_020517	CTG	2	6	233782	233787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417316
4143	NC_020517	CTG	2	6	233803	233808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417316
4144	NC_020517	GC	3	6	233860	233865	0 %	0 %	50 %	50 %	476417316
4145	NC_020517	CAT	2	6	233919	233924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	476417316
4146	NC_020517	CGT	2	6	233997	234002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417316
4147	NC_020517	GC	3	6	234007	234012	0 %	0 %	50 %	50 %	476417316
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4149	NC_020517	CAT	2	6	234087	234092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	476417316
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4151	NC_020517	GTG	2	6	234178	234183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	476417316
4152	NC_020517	TGG	3	9	234185	234193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	476417316
4153	NC_020517	ATC	2	6	234208	234213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	476417316
4154	NC_020517	CAT	2	6	234216	234221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	476417316
4155	NC_020517	GCT	2	6	234382	234387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417317
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4157	NC_020517	CGC	2	6	234403	234408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	476417317
4158	NC_020517	GGA	2	6	234424	234429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	476417317
4159	NC_020517	CCG	2	6	234465	234470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	476417317
4160	NC_020517	TGA	2	6	234507	234512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	476417317
4161	NC_020517	CTG	2	6	234554	234559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417317
4162	NC_020517	ATC	2	6	234635	234640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	476417317
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4164	NC_020517	CAT	2	6	234727	234732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	476417317
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4166	NC_020517	CAT	2	6	234787	234792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	476417317
4167	NC_020517	GC	3	6	234817	234822	0 %	0 %	50 %	50 %	476417317
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4173	NC_020517	TGG	2	6	235037	235042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	476417317
4174	NC_020517	TGA	2	6	235062	235067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	476417317
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4180	NC_020517	CGC	2	6	235219	235224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	476417317
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4193	NC_020517	GTC	2	6	235805	235810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417317
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4197	NC_020517	GTC	2	6	235976	235981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417317
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4200	NC_020517	CGG	2	6	236112	236117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	476417317
4201	NC_020517	CGCGC	2	10	236140	236149	0 %	0 %	40 %	60 %	476417317
4202	NC_020517	CCCG	2	8	236178	236185	0 %	0 %	25 %	75 %	476417317
4203	NC_020517	CGA	2	6	236233	236238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417317
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4205	NC_020517	AAGG	2	8	236282	236289	50 %	0 %	50 %	0 %	476417317
4206	NC_020517	ATC	2	6	236323	236328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	476417318
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4210	NC_020517	GCA	2	6	236502	236507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417318
4211	NC_020517	CACCG	2	10	236551	236560	20 %	0 %	20 %	60 %	476417318
4212	NC_020517	GTG	2	6	236587	236592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	476417318
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4220	NC_020517	TGT	2	6	236897	236902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	476417318
4221	NC_020517	AAG	2	6	236911	236916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	476417318
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4223	NC_020517	CGA	2	6	236976	236981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417318
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4225	NC_020517	ACG	2	6	237029	237034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417318
4226	NC_020517	GCT	3	9	237066	237074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417318
4227	NC_020517	GCGCC	2	10	237077	237086	0 %	0 %	40 %	60 %	476417318
4228	NC_020517	GCT	2	6	237090	237095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417318
4229	NC_020517	GGA	2	6	237108	237113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	476417318
4230	NC_020517	ACA	2	6	237235	237240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	476417319
4231	NC_020517	C	6	6	237258	237263	0 %	0 %	0 %	100 %	476417319
4232	NC_020517	GTC	2	6	237265	237270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417319
4233	NC_020517	CCG	2	6	237281	237286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	476417319
4234	NC_020517	CG	3	6	237312	237317	0 %	0 %	50 %	50 %	476417319
4235	NC_020517	CTC	2	6	237369	237374	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	476417319
4236	NC_020517	CGCC	2	8	237399	237406	0 %	0 %	25 %	75 %	476417319
4237	NC_020517	ATC	2	6	237415	237420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	476417319
4238	NC_020517	TCG	2	6	237461	237466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417319
4239	NC_020517	AGG	2	6	237509	237514	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	476417319
4240	NC_020517	CGG	2	6	237567	237572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	476417319
4241	NC_020517	GTGC	2	8	237654	237661	0 %	25 %	50 %	25 %	476417319
4242	NC_020517	GGC	2	6	237676	237681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	476417319
4243	NC_020517	AGG	2	6	237701	237706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	476417319
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4264	NC_020517	GTC	2	6	238497	238502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417320
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4266	NC_020517	GCGCCG	2	12	238591	238602	0 %	0 %	50 %	50 %	476417320
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4270	NC_020517	CG	3	6	238714	238719	0 %	0 %	50 %	50 %	476417320
4271	NC_020517	CG	3	6	238754	238759	0 %	0 %	50 %	50 %	476417320
4272	NC_020517	CTT	2	6	238760	238765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	476417320
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4335	NC_020517	ATC	2	6	242065	242070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	476417322
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4349	NC_020517	ATCC	2	8	242689	242696	25 %	25 %	0 %	50 %	476417322
4350	NC_020517	TCGT	2	8	242785	242792	0 %	50 %	25 %	25 %	476417322
4351	NC_020517	AGG	2	6	242876	242881	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	476417322
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4357	NC_020517	GAA	2	6	243336	243341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	476417323
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4359	NC_020517	CCTT	2	8	243452	243459	0 %	50 %	0 %	50 %	476417323
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4361	NC_020517	GACA	2	8	243604	243611	50 %	0 %	25 %	25 %	476417323
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4484	NC_020517	CGC	2	6	250016	250021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	476417326
4485	NC_020517	CAG	2	6	250030	250035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417326
4486	NC_020517	CTG	2	6	250063	250068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417326
4487	NC_020517	CGG	2	6	250077	250082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	476417326
4488	NC_020517	CGG	2	6	250095	250100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	476417326
4489	NC_020517	ATG	2	6	250139	250144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	476417326
4490	NC_020517	GGAGGG	2	12	250204	250215	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	476417326
4491	NC_020517	GAT	2	6	250216	250221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	476417326
4492	NC_020517	ATC	2	6	250229	250234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	476417326
4493	NC_020517	TTG	2	6	250268	250273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	476417326
4494	NC_020517	GGC	3	9	250285	250293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	476417326
4495	NC_020517	ATG	2	6	250388	250393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	476417326
4496	NC_020517	AGG	2	6	250416	250421	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	476417326
4497	NC_020517	GTA	2	6	250435	250440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	476417326
4498	NC_020517	CTG	2	6	250453	250458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417326
4499	NC_020517	GTT	2	6	250498	250503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	476417326
4500	NC_020517	CG	3	6	250510	250515	0 %	0 %	50 %	50 %	476417326

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