MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium breve UCC2003

Total Repeats: 43805

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020517	CTC	2	6	32276	32281	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	476417181
502	NC_020517	GCC	2	6	32306	32311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	476417181
503	NC_020517	CACGC	2	10	32344	32353	20 %	0 %	20 %	60 %	476417181
504	NC_020517	CCG	2	6	32390	32395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	476417181
505	NC_020517	GAA	2	6	32402	32407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	476417181
506	NC_020517	CGA	2	6	32488	32493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417181
507	NC_020517	CGG	3	9	32590	32598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	476417181
508	NC_020517	GCA	2	6	32626	32631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417181
509	NC_020517	CATC	2	8	32656	32663	25 %	25 %	0 %	50 %	476417181
510	NC_020517	CTC	2	6	32780	32785	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	476417181
511	NC_020517	GCC	2	6	32807	32812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	476417181
512	NC_020517	CCA	2	6	32825	32830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	476417181
513	NC_020517	CGC	2	6	33049	33054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	476417181
514	NC_020517	CTG	2	6	33056	33061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417181
515	NC_020517	CCA	2	6	33071	33076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	476417181
516	NC_020517	CGC	2	6	33166	33171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	476417181
517	NC_020517	CCG	2	6	33172	33177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	476417181
518	NC_020517	CG	3	6	33238	33243	0 %	0 %	50 %	50 %	476417181
519	NC_020517	CGT	2	6	33257	33262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417181
520	NC_020517	TCGGGG	2	12	33300	33311	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	476417181
521	NC_020517	GTG	2	6	33405	33410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	476417181
522	NC_020517	GGT	2	6	33472	33477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	476417181
523	NC_020517	CCA	2	6	33485	33490	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	476417181
524	NC_020517	GCA	2	6	33511	33516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417181
525	NC_020517	GCG	2	6	33517	33522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	476417181
526	NC_020517	CG	3	6	33610	33615	0 %	0 %	50 %	50 %	476417181
527	NC_020517	GGC	2	6	33659	33664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	476417181
528	NC_020517	CGA	2	6	33676	33681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417181
529	NC_020517	TCG	2	6	33699	33704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417181
530	NC_020517	CG	3	6	33777	33782	0 %	0 %	50 %	50 %	476417181
531	NC_020517	GAC	2	6	33854	33859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417181
532	NC_020517	CCTT	2	8	33870	33877	0 %	50 %	0 %	50 %	476417181
533	NC_020517	GAT	2	6	33923	33928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	476417181
534	NC_020517	AGC	2	6	33930	33935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417181
535	NC_020517	CGG	2	6	33962	33967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	476417181
536	NC_020517	TGA	2	6	34108	34113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	476417181
537	NC_020517	GTG	2	6	34366	34371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	476417182
538	NC_020517	GCA	2	6	34376	34381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417182
539	NC_020517	GC	3	6	34449	34454	0 %	0 %	50 %	50 %	476417182
540	NC_020517	TCG	2	6	34525	34530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417182
541	NC_020517	TCG	2	6	34606	34611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417182
542	NC_020517	GTGGGC	2	12	34630	34641	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	476417182
543	NC_020517	TGG	2	6	34646	34651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	476417182
544	NC_020517	GCGCC	2	10	34664	34673	0 %	0 %	40 %	60 %	476417182
545	NC_020517	AGC	2	6	34694	34699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417182
546	NC_020517	GC	3	6	34799	34804	0 %	0 %	50 %	50 %	476417182
547	NC_020517	ATGC	2	8	34860	34867	25 %	25 %	25 %	25 %	476417182
548	NC_020517	GTC	2	6	34875	34880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417182
549	NC_020517	TGG	2	6	34907	34912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	476417182
550	NC_020517	GAC	2	6	34955	34960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417182
551	NC_020517	CGA	2	6	35014	35019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417182
552	NC_020517	GAA	2	6	35034	35039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	476417182
553	NC_020517	CG	3	6	35053	35058	0 %	0 %	50 %	50 %	476417182
554	NC_020517	CCGG	2	8	35089	35096	0 %	0 %	50 %	50 %	476417182
555	NC_020517	GCC	2	6	35203	35208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	476417182
556	NC_020517	TGCG	2	8	35234	35241	0 %	25 %	50 %	25 %	476417182
557	NC_020517	GCG	3	9	35239	35247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	476417182
558	NC_020517	GCA	2	6	35270	35275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417182
559	NC_020517	GAG	2	6	35623	35628	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	476417183
560	NC_020517	CGA	2	6	35655	35660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417183
561	NC_020517	GCG	2	6	35716	35721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	476417183
562	NC_020517	TGC	2	6	35745	35750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417183
563	NC_020517	CCA	2	6	35808	35813	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	476417183
564	NC_020517	CG	4	8	35859	35866	0 %	0 %	50 %	50 %	476417183
565	NC_020517	CGG	2	6	35869	35874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	476417183
566	NC_020517	GTC	2	6	35926	35931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417183
567	NC_020517	CGGCG	2	10	35995	36004	0 %	0 %	60 %	40 %	476417183
568	NC_020517	ACC	2	6	36008	36013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	476417183
569	NC_020517	CG	3	6	36144	36149	0 %	0 %	50 %	50 %	476417183
570	NC_020517	GC	3	6	36314	36319	0 %	0 %	50 %	50 %	476417183
571	NC_020517	CGGC	2	8	36387	36394	0 %	0 %	50 %	50 %	476417183
572	NC_020517	TCCTC	2	10	36594	36603	0 %	40 %	0 %	60 %	476417183
573	NC_020517	GAC	2	6	36605	36610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417183
574	NC_020517	GCCA	2	8	39062	39069	25 %	0 %	25 %	50 %	476417184
575	NC_020517	TGA	2	6	39079	39084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	476417184
576	NC_020517	AGA	2	6	39106	39111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	476417184
577	NC_020517	GAT	2	6	39122	39127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	476417184
578	NC_020517	CAT	2	6	39146	39151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	476417184
579	NC_020517	ACC	2	6	39176	39181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	476417184
580	NC_020517	AGG	2	6	39246	39251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	476417184
581	NC_020517	ACGG	2	8	39297	39304	25 %	0 %	50 %	25 %	476417184
582	NC_020517	GAA	2	6	39329	39334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	476417184
583	NC_020517	GAACAG	2	12	39542	39553	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	476417184
584	NC_020517	GTT	2	6	39578	39583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	476417184
585	NC_020517	CACG	2	8	39586	39593	25 %	0 %	25 %	50 %	476417184
586	NC_020517	CCA	2	6	39596	39601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	476417184
587	NC_020517	CAG	2	6	39620	39625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417184
588	NC_020517	AGC	2	6	39630	39635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417184
589	NC_020517	GT	3	6	39703	39708	0 %	50 %	50 %	0 %	476417184
590	NC_020517	CGA	2	6	39721	39726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417184
591	NC_020517	CAC	2	6	39794	39799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	476417184
592	NC_020517	GAT	2	6	39830	39835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	476417184
593	NC_020517	CCT	2	6	39891	39896	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	476417185
594	NC_020517	GTG	2	6	39902	39907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	476417185
595	NC_020517	GAT	2	6	39919	39924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	476417185
596	NC_020517	GAT	2	6	39940	39945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	476417185
597	NC_020517	GAA	2	6	39946	39951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	476417185
598	NC_020517	ACG	2	6	39953	39958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417185
599	NC_020517	CAG	2	6	40024	40029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417185
600	NC_020517	CAT	2	6	40132	40137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	476417185
601	NC_020517	GTTG	2	8	40171	40178	0 %	50 %	50 %	0 %	476417185
602	NC_020517	CGG	2	6	40191	40196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	476417185
603	NC_020517	GAT	2	6	40240	40245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	476417185
604	NC_020517	CAT	2	6	40246	40251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	476417185
605	NC_020517	CTG	2	6	40261	40266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417185
606	NC_020517	CAG	2	6	40268	40273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417185
607	NC_020517	AC	3	6	40302	40307	50 %	0 %	0 %	50 %	476417185
608	NC_020517	CAG	2	6	40357	40362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417185
609	NC_020517	GAT	2	6	40378	40383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	476417185
610	NC_020517	GCC	2	6	40384	40389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	476417185
611	NC_020517	GAA	2	6	40405	40410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	476417185
612	NC_020517	GTC	2	6	40493	40498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417185
613	NC_020517	CGTC	2	8	40590	40597	0 %	25 %	25 %	50 %	476417185
614	NC_020517	ATG	2	6	40634	40639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	476417185
615	NC_020517	CAC	2	6	40645	40650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	476417185
616	NC_020517	TGC	2	6	40666	40671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417185
617	NC_020517	CAC	2	6	40697	40702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	476417185
618	NC_020517	AC	3	6	44067	44072	50 %	0 %	0 %	50 %	476417186
619	NC_020517	CGAT	2	8	44124	44131	25 %	25 %	25 %	25 %	476417186
620	NC_020517	CGT	2	6	44136	44141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417186
621	NC_020517	GAA	2	6	44152	44157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	476417186
622	NC_020517	CTG	2	6	44179	44184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417186
623	NC_020517	CGGAT	2	10	44213	44222	20 %	20 %	40 %	20 %	476417186
624	NC_020517	CGG	2	6	44254	44259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	476417186
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871	NC_020517	GTG	2	6	58380	58385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	476417195
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873	NC_020517	GTT	2	6	58490	58495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	476417195
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