MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium breve UCC2003

Total Repeats: 43805

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_020517	CGC	2	6	276806	276811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	476417345
5002	NC_020517	TCG	2	6	276830	276835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417345
5003	NC_020517	CGCC	2	8	276852	276859	0 %	0 %	25 %	75 %	476417345
5004	NC_020517	GC	4	8	276870	276877	0 %	0 %	50 %	50 %	476417345
5005	NC_020517	CTT	2	6	277751	277756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	476417346
5006	NC_020517	GTG	2	6	277794	277799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	476417346
5007	NC_020517	CTG	2	6	277820	277825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417346
5008	NC_020517	GTC	2	6	277862	277867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417346
5009	NC_020517	GCG	2	6	277962	277967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	476417346
5010	NC_020517	GCA	2	6	277974	277979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417346
5011	NC_020517	GTT	2	6	277994	277999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	476417346
5012	NC_020517	TGG	2	6	278008	278013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	476417346
5013	NC_020517	TACG	2	8	278017	278024	25 %	25 %	25 %	25 %	476417346
5014	NC_020517	GGC	3	9	278033	278041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	476417346
5015	NC_020517	GGC	2	6	278045	278050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	476417346
5016	NC_020517	CGCCAC	2	12	278117	278128	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	476417346
5017	NC_020517	TTG	2	6	278166	278171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	476417346
5018	NC_020517	CTG	2	6	278228	278233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417346
5019	NC_020517	GTCA	2	8	278237	278244	25 %	25 %	25 %	25 %	476417346
5020	NC_020517	GCCG	2	8	278416	278423	0 %	0 %	50 %	50 %	476417347
5021	NC_020517	ATC	3	9	278457	278465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	476417347
5022	NC_020517	CAG	2	6	278477	278482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417347
5023	NC_020517	GAT	2	6	278504	278509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	476417347
5024	NC_020517	GC	3	6	278536	278541	0 %	0 %	50 %	50 %	476417347
5025	NC_020517	GC	3	6	278548	278553	0 %	0 %	50 %	50 %	476417347
5026	NC_020517	CGCCAG	2	12	278558	278569	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	476417347
5027	NC_020517	CGC	2	6	278583	278588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	476417347
5028	NC_020517	CTG	2	6	278600	278605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417347
5029	NC_020517	CGA	2	6	278629	278634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417347
5030	NC_020517	GGT	2	6	278660	278665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	476417347
5031	NC_020517	GCGG	2	8	278690	278697	0 %	0 %	75 %	25 %	476417347
5032	NC_020517	CAG	2	6	278738	278743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417347
5033	NC_020517	GAT	2	6	278744	278749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	476417347
5034	NC_020517	GGT	2	6	278813	278818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	476417347
5035	NC_020517	GAG	2	6	278838	278843	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	476417347
5036	NC_020517	TGA	2	6	278872	278877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	476417347
5037	NC_020517	GCG	2	6	278907	278912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	476417347
5038	NC_020517	ACGA	2	8	278916	278923	50 %	0 %	25 %	25 %	476417347
5039	NC_020517	GAT	2	6	278981	278986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	476417347
5040	NC_020517	CCG	2	6	278991	278996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	476417347
5041	NC_020517	GC	3	6	279001	279006	0 %	0 %	50 %	50 %	476417347
5042	NC_020517	CCA	2	6	279041	279046	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	476417347
5043	NC_020517	CCA	2	6	279148	279153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	476417347
5044	NC_020517	CGA	2	6	279160	279165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417347
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5047	NC_020517	TCT	2	6	279618	279623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	476417348
5048	NC_020517	AG	3	6	279678	279683	50 %	0 %	50 %	0 %	476417348
5049	NC_020517	CG	3	6	279691	279696	0 %	0 %	50 %	50 %	476417348
5050	NC_020517	CAG	2	6	279827	279832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417348
5051	NC_020517	CAT	2	6	280116	280121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	476417349
5052	NC_020517	CTG	2	6	280208	280213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417349
5053	NC_020517	CAT	2	6	280251	280256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	476417349
5054	NC_020517	GCA	2	6	280279	280284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417349
5055	NC_020517	GTC	2	6	280306	280311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417349
5056	NC_020517	CGT	2	6	280358	280363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417349
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5058	NC_020517	TCC	2	6	280493	280498	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	476417349
5059	NC_020517	CAT	2	6	280524	280529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	476417349
5060	NC_020517	GGGGC	2	10	280535	280544	0 %	0 %	80 %	20 %	476417349
5061	NC_020517	GTC	2	6	280572	280577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417349
5062	NC_020517	CGT	2	6	280765	280770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417350
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5064	NC_020517	GAT	2	6	280876	280881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	476417350
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5072	NC_020517	ATG	2	6	281489	281494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	476417350
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5091	NC_020517	ATGGGC	2	12	282806	282817	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	476417351
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5099	NC_020517	GGA	2	6	283126	283131	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	476417351
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5101	NC_020517	CGTT	2	8	283388	283395	0 %	50 %	25 %	25 %	476417352
5102	NC_020517	CACG	2	8	283424	283431	25 %	0 %	25 %	50 %	476417352
5103	NC_020517	CTG	2	6	283478	283483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417352
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5120	NC_020517	ATC	2	6	284066	284071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	476417352
5121	NC_020517	GGCT	2	8	284087	284094	0 %	25 %	50 %	25 %	476417352
5122	NC_020517	GGC	2	6	284111	284116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	476417352
5123	NC_020517	CGG	2	6	284151	284156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	476417352
5124	NC_020517	ACGC	2	8	284168	284175	25 %	0 %	25 %	50 %	476417352
5125	NC_020517	AGC	2	6	284219	284224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417352
5126	NC_020517	TTC	2	6	284246	284251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	476417352
5127	NC_020517	CTTCAT	2	12	284263	284274	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	476417352
5128	NC_020517	CAC	2	6	284275	284280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	476417352
5129	NC_020517	CGG	2	6	284322	284327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	476417352
5130	NC_020517	GGT	2	6	284347	284352	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	476417352
5131	NC_020517	GGC	2	6	284356	284361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	476417352
5132	NC_020517	CGGT	2	8	284405	284412	0 %	25 %	50 %	25 %	476417352
5133	NC_020517	CTG	2	6	284426	284431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417352
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5138	NC_020517	TCC	2	6	284669	284674	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	476417352
5139	NC_020517	CGA	2	6	284683	284688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417352
5140	NC_020517	GGA	2	6	284743	284748	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	476417352
5141	NC_020517	GGCA	2	8	284788	284795	25 %	0 %	50 %	25 %	476417352
5142	NC_020517	GCT	2	6	284890	284895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417352
5143	NC_020517	CTG	2	6	284896	284901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417352
5144	NC_020517	GAC	2	6	284966	284971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417353
5145	NC_020517	CGGC	2	8	285021	285028	0 %	0 %	50 %	50 %	476417353
5146	NC_020517	GGA	2	6	285037	285042	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	476417353
5147	NC_020517	CGA	2	6	285163	285168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417353
5148	NC_020517	ACG	2	6	285203	285208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417353
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5150	NC_020517	GC	3	6	285354	285359	0 %	0 %	50 %	50 %	476417353
5151	NC_020517	CGG	2	6	285399	285404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	476417353
5152	NC_020517	ATCC	2	8	285430	285437	25 %	25 %	0 %	50 %	476417353
5153	NC_020517	CGT	2	6	285508	285513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417353
5154	NC_020517	CGA	2	6	285562	285567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417353
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5157	NC_020517	TCGA	2	8	285632	285639	25 %	25 %	25 %	25 %	476417353
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5161	NC_020517	TCG	2	6	285891	285896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417353
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5175	NC_020517	CGGC	3	12	286687	286698	0 %	0 %	50 %	50 %	476417353
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5189	NC_020517	AAGGG	2	10	287166	287175	40 %	0 %	60 %	0 %	476417353
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5191	NC_020517	CAGGAC	2	12	287315	287326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417353
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5193	NC_020517	GGAA	2	8	287419	287426	50 %	0 %	50 %	0 %	476417353
5194	NC_020517	CTT	2	6	287434	287439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	476417353
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5199	NC_020517	CGA	2	6	287536	287541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417353
5200	NC_020517	CGA	2	6	287572	287577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417353
5201	NC_020517	CTCG	2	8	287632	287639	0 %	25 %	25 %	50 %	476417353
5202	NC_020517	GGA	2	6	287656	287661	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	476417353
5203	NC_020517	GATCG	2	10	287666	287675	20 %	20 %	40 %	20 %	476417353
5204	NC_020517	CCG	2	6	287709	287714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	476417353
5205	NC_020517	ACG	2	6	287722	287727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417353
5206	NC_020517	GGA	2	6	287773	287778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	476417353
5207	NC_020517	G	6	6	287805	287810	0 %	0 %	100 %	0 %	476417353
5208	NC_020517	CGC	2	6	287830	287835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	476417353
5209	NC_020517	CGG	2	6	287908	287913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	476417353
5210	NC_020517	TCA	2	6	287916	287921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	476417353
5211	NC_020517	CCA	2	6	287934	287939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	476417353
5212	NC_020517	GCC	4	12	288023	288034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	476417353
5213	NC_020517	CCG	2	6	288075	288080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	476417353
5214	NC_020517	GGA	2	6	288084	288089	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	476417353
5215	NC_020517	GCAGGA	2	12	288163	288174	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	476417353
5216	NC_020517	GGAAT	2	10	288179	288188	40 %	20 %	40 %	0 %	476417353
5217	NC_020517	TTC	2	6	288215	288220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	476417353
5218	NC_020517	CGA	2	6	288223	288228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417353
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5220	NC_020517	GAC	2	6	288314	288319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417353
5221	NC_020517	CGT	2	6	288361	288366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417353
5222	NC_020517	CAGG	2	8	288403	288410	25 %	0 %	50 %	25 %	476417353
5223	NC_020517	ACC	2	6	288471	288476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	476417353
5224	NC_020517	GCC	2	6	288533	288538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	476417353
5225	NC_020517	ACG	2	6	288618	288623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417353
5226	NC_020517	ACGG	2	8	288662	288669	25 %	0 %	50 %	25 %	476417353
5227	NC_020517	TCA	2	6	288756	288761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	476417353
5228	NC_020517	CTG	2	6	288764	288769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417353
5229	NC_020517	GGC	2	6	288801	288806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	476417353
5230	NC_020517	TCA	2	6	288873	288878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	476417353
5231	NC_020517	GACC	2	8	288885	288892	25 %	0 %	25 %	50 %	476417353
5232	NC_020517	GCG	2	6	288935	288940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	476417353
5233	NC_020517	CTG	2	6	289003	289008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417353
5234	NC_020517	GCT	2	6	289012	289017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417353
5235	NC_020517	CGG	2	6	289122	289127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	476417353
5236	NC_020517	ATC	2	6	289196	289201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	476417353
5237	NC_020517	CGG	2	6	289260	289265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	476417353
5238	NC_020517	CAT	2	6	289279	289284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	476417353
5239	NC_020517	GAT	2	6	289326	289331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	476417354
5240	NC_020517	ATC	2	6	289351	289356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	476417354
5241	NC_020517	GAA	2	6	289396	289401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	476417354
5242	NC_020517	CATC	2	8	289434	289441	25 %	25 %	0 %	50 %	476417354
5243	NC_020517	GGA	2	6	289525	289530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	476417354
5244	NC_020517	GCGG	2	8	289557	289564	0 %	0 %	75 %	25 %	476417354
5245	NC_020517	CCT	2	6	289565	289570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	476417354
5246	NC_020517	GAT	2	6	289602	289607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	476417354
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5250	NC_020517	CGG	2	6	290055	290060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	476417354
5251	NC_020517	ACGCGA	2	12	290090	290101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417354
5252	NC_020517	GCG	3	9	290125	290133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	476417354
5253	NC_020517	CTG	2	6	290137	290142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417354
5254	NC_020517	TCA	2	6	290189	290194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	476417354
5255	NC_020517	ACG	2	6	290206	290211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417354
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5258	NC_020517	ATC	2	6	290374	290379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	476417354
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5260	NC_020517	CGGC	2	8	290456	290463	0 %	0 %	50 %	50 %	476417354
5261	NC_020517	CTG	2	6	290473	290478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417354
5262	NC_020517	GAC	2	6	290529	290534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417354
5263	NC_020517	TCG	2	6	290662	290667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417354
5264	NC_020517	TCG	2	6	290672	290677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417354
5265	NC_020517	ATG	2	6	290684	290689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	476417354
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5267	NC_020517	GCT	2	6	290793	290798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417354
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5269	NC_020517	GGC	2	6	290889	290894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	476417354
5270	NC_020517	ATG	2	6	290911	290916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	476417354
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5272	NC_020517	CACG	2	8	291030	291037	25 %	0 %	25 %	50 %	476417354
5273	NC_020517	ACG	2	6	291094	291099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417354
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5276	NC_020517	CGG	2	6	291207	291212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	476417354
5277	NC_020517	CCTC	2	8	291245	291252	0 %	25 %	0 %	75 %	476417354
5278	NC_020517	TCG	2	6	291284	291289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417354
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5282	NC_020517	TGC	2	6	291362	291367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417354
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5286	NC_020517	GCCAT	2	10	291562	291571	20 %	20 %	20 %	40 %	476417354
5287	NC_020517	ACCG	2	8	291587	291594	25 %	0 %	25 %	50 %	476417354
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5295	NC_020517	GGGA	2	8	292208	292215	25 %	0 %	75 %	0 %	476417355
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5310	NC_020517	GCCG	2	8	293389	293396	0 %	0 %	50 %	50 %	476417355
5311	NC_020517	CGA	2	6	293437	293442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417355
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5318	NC_020517	ACGCC	2	10	293714	293723	20 %	0 %	20 %	60 %	476417356
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5344	NC_020517	CGTCC	2	10	295447	295456	0 %	20 %	20 %	60 %	476417358
5345	NC_020517	GGC	2	6	295477	295482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	476417358
5346	NC_020517	GCC	2	6	295499	295504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	476417358
5347	NC_020517	GAG	2	6	295517	295522	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	476417358
5348	NC_020517	TCCG	2	8	295585	295592	0 %	25 %	25 %	50 %	476417358
5349	NC_020517	CGTCCA	2	12	295596	295607	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	476417358
5350	NC_020517	CACGG	2	10	295612	295621	20 %	0 %	40 %	40 %	476417358
5351	NC_020517	CCG	2	6	295629	295634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	476417358
5352	NC_020517	CGG	2	6	295641	295646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	476417358
5353	NC_020517	CGT	2	6	295748	295753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417358
5354	NC_020517	CTT	2	6	295793	295798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	476417358
5355	NC_020517	TCCCC	2	10	295860	295869	0 %	20 %	0 %	80 %	476417358
5356	NC_020517	AGC	2	6	295898	295903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417358
5357	NC_020517	CGC	2	6	295922	295927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	476417358
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5359	NC_020517	CAGCAA	2	12	295981	295992	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	476417358
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