MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bibersteinia trehalosi USDA-ARS-USMARC-192

Total Repeats: 41577

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020515	GCT	2	6	30241	30246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470166024
502	NC_020515	TTGC	2	8	30295	30302	0 %	50 %	25 %	25 %	470166024
503	NC_020515	T	6	6	30309	30314	0 %	100 %	0 %	0 %	470166024
504	NC_020515	TG	3	6	30418	30423	0 %	50 %	50 %	0 %	470166024
505	NC_020515	CTT	2	6	30425	30430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470166024
506	NC_020515	TGA	2	6	30436	30441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470166024
507	NC_020515	TTA	2	6	30469	30474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470166024
508	NC_020515	AG	3	6	30501	30506	50 %	0 %	50 %	0 %	470166024
509	NC_020515	TTTC	2	8	30509	30516	0 %	75 %	0 %	25 %	470166024
510	NC_020515	T	6	6	30521	30526	0 %	100 %	0 %	0 %	470166024
511	NC_020515	CAT	2	6	30547	30552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470166025
512	NC_020515	ACG	2	6	30554	30559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470166025
513	NC_020515	CCG	2	6	30570	30575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470166025
514	NC_020515	AGC	2	6	30605	30610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470166025
515	NC_020515	T	6	6	30683	30688	0 %	100 %	0 %	0 %	470166025
516	NC_020515	AAT	2	6	30752	30757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470166025
517	NC_020515	CAG	2	6	30802	30807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470166025
518	NC_020515	ATC	2	6	30936	30941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470166025
519	NC_020515	TTTA	2	8	30977	30984	25 %	75 %	0 %	0 %	470166025
520	NC_020515	TCA	2	6	31011	31016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470166025
521	NC_020515	CTT	2	6	31192	31197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470166025
522	NC_020515	CCG	2	6	31228	31233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470166025
523	NC_020515	ACC	2	6	31235	31240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470166025
524	NC_020515	CCA	2	6	31287	31292	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470166025
525	NC_020515	TAA	2	6	31298	31303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470166025
526	NC_020515	CTA	2	6	31336	31341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470166026
527	NC_020515	GTT	2	6	31398	31403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470166026
528	NC_020515	TAC	2	6	31440	31445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470166026
529	NC_020515	CAT	2	6	31449	31454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470166026
530	NC_020515	TTC	2	6	31519	31524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470166026
531	NC_020515	ATC	2	6	31550	31555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470166026
532	NC_020515	CGG	2	6	31561	31566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470166026
533	NC_020515	CTT	2	6	31617	31622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470166026
534	NC_020515	CAT	2	6	31635	31640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470166026
535	NC_020515	AATA	2	8	31644	31651	75 %	25 %	0 %	0 %	470166026
536	NC_020515	GAT	2	6	31795	31800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470166027
537	NC_020515	ACA	2	6	31837	31842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470166027
538	NC_020515	CAA	2	6	31850	31855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470166027
539	NC_020515	GTG	2	6	31958	31963	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470166027
540	NC_020515	AGCC	2	8	32068	32075	25 %	0 %	25 %	50 %	470166027
541	NC_020515	TGT	2	6	32118	32123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470166027
542	NC_020515	ACCG	2	8	32156	32163	25 %	0 %	25 %	50 %	470166027
543	NC_020515	CT	5	10	32179	32188	0 %	50 %	0 %	50 %	470166027
544	NC_020515	CTG	2	6	32196	32201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470166027
545	NC_020515	ATG	2	6	32202	32207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470166027
546	NC_020515	ACA	2	6	32245	32250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470166027
547	NC_020515	TTGA	2	8	32279	32286	25 %	50 %	25 %	0 %	470166027
548	NC_020515	TTA	2	6	32306	32311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470166027
549	NC_020515	ACT	2	6	32341	32346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470166027
550	NC_020515	AACAT	2	10	32364	32373	60 %	20 %	0 %	20 %	470166027
551	NC_020515	A	6	6	32412	32417	100 %	0 %	0 %	0 %	470166027
552	NC_020515	CAT	2	6	32457	32462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470166027
553	NC_020515	A	7	7	32480	32486	100 %	0 %	0 %	0 %	470166027
554	NC_020515	AAC	2	6	32517	32522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470166027
555	NC_020515	ACA	2	6	32557	32562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470166027
556	NC_020515	AGA	2	6	32677	32682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470166027
557	NC_020515	TTA	2	6	32841	32846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470166028
558	NC_020515	CAC	2	6	32909	32914	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470166028
559	NC_020515	TAT	2	6	32925	32930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470166028
560	NC_020515	TTGG	2	8	32946	32953	0 %	50 %	50 %	0 %	470166028
561	NC_020515	AAG	2	6	32965	32970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470166028
562	NC_020515	GAT	2	6	33015	33020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470166028
563	NC_020515	TTG	2	6	33054	33059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470166028
564	NC_020515	CGG	2	6	33066	33071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470166028
565	NC_020515	CAT	2	6	33108	33113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470166028
566	NC_020515	ATG	2	6	33118	33123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470166028
567	NC_020515	ATT	2	6	33134	33139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470166028
568	NC_020515	GAT	2	6	33302	33307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470166028
569	NC_020515	ACCA	2	8	33789	33796	50 %	0 %	0 %	50 %	470166029
570	NC_020515	AGCA	2	8	33866	33873	50 %	0 %	25 %	25 %	470166029
571	NC_020515	CA	3	6	33947	33952	50 %	0 %	0 %	50 %	470166029
572	NC_020515	CAT	2	6	33970	33975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470166029
573	NC_020515	CCT	2	6	33978	33983	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470166029
574	NC_020515	CA	3	6	34105	34110	50 %	0 %	0 %	50 %	470166029
575	NC_020515	CAT	2	6	34153	34158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470166029
576	NC_020515	TCA	2	6	34194	34199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470166029
577	NC_020515	TCA	2	6	34279	34284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470166029
578	NC_020515	TTGC	2	8	34330	34337	0 %	50 %	25 %	25 %	470166029
579	NC_020515	GTAA	2	8	34380	34387	50 %	25 %	25 %	0 %	470166029
580	NC_020515	CGG	2	6	34420	34425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470166029
581	NC_020515	GGT	2	6	34442	34447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470166029
582	NC_020515	AAC	2	6	34502	34507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470166029
583	NC_020515	TAA	2	6	34607	34612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470166029
584	NC_020515	TCAA	2	8	34731	34738	50 %	25 %	0 %	25 %	470166029
585	NC_020515	TG	3	6	34818	34823	0 %	50 %	50 %	0 %	470166029
586	NC_020515	AACC	2	8	34871	34878	50 %	0 %	0 %	50 %	470166029
587	NC_020515	A	6	6	34992	34997	100 %	0 %	0 %	0 %	470166030
588	NC_020515	AGTC	2	8	35013	35020	25 %	25 %	25 %	25 %	470166030
589	NC_020515	CAT	2	6	35022	35027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470166030
590	NC_020515	ATC	2	6	35114	35119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470166031
591	NC_020515	GATA	2	8	35147	35154	50 %	25 %	25 %	0 %	470166031
592	NC_020515	TAA	2	6	35297	35302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470166031
593	NC_020515	TTGC	2	8	35338	35345	0 %	50 %	25 %	25 %	470166031
594	NC_020515	CACG	2	8	35837	35844	25 %	0 %	25 %	50 %	470166032
595	NC_020515	TTC	2	6	35901	35906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470166032
596	NC_020515	CTT	2	6	35978	35983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470166032
597	NC_020515	T	6	6	35997	36002	0 %	100 %	0 %	0 %	470166032
598	NC_020515	TTCA	2	8	36081	36088	25 %	50 %	0 %	25 %	470166032
599	NC_020515	ATC	2	6	36115	36120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470166032
600	NC_020515	TCA	2	6	36151	36156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470166032
601	NC_020515	GCGA	2	8	36186	36193	25 %	0 %	50 %	25 %	470166032
602	NC_020515	TCA	2	6	36250	36255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470166032
603	NC_020515	GCCT	2	8	36387	36394	0 %	25 %	25 %	50 %	470166032
604	NC_020515	TGTGG	2	10	36415	36424	0 %	40 %	60 %	0 %	470166032
605	NC_020515	GGCA	2	8	36474	36481	25 %	0 %	50 %	25 %	470166032
606	NC_020515	GTG	3	9	36601	36609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470166032
607	NC_020515	GTG	2	6	36745	36750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470166032
608	NC_020515	T	6	6	36773	36778	0 %	100 %	0 %	0 %	470166032
609	NC_020515	CAC	2	6	36804	36809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470166032
610	NC_020515	GCGA	2	8	36833	36840	25 %	0 %	50 %	25 %	470166032
611	NC_020515	CCA	2	6	36868	36873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470166032
612	NC_020515	ATA	2	6	36942	36947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470166032
613	NC_020515	TGG	2	6	37341	37346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470166033
614	NC_020515	TCA	2	6	37392	37397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470166033
615	NC_020515	CAA	2	6	37410	37415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470166033
616	NC_020515	CTG	2	6	37420	37425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470166033
617	NC_020515	GTT	3	9	37432	37440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470166033
618	NC_020515	TCA	2	6	37488	37493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470166033
619	NC_020515	TCA	2	6	37501	37506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470166033
620	NC_020515	AGCA	2	8	37598	37605	50 %	0 %	25 %	25 %	470166033
621	NC_020515	CCACG	2	10	37624	37633	20 %	0 %	20 %	60 %	470166033
622	NC_020515	ATA	2	6	37712	37717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470166033
623	NC_020515	T	6	6	37864	37869	0 %	100 %	0 %	0 %	470166033
624	NC_020515	CCA	2	6	37956	37961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470166033
625	NC_020515	AAT	2	6	37976	37981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470166033
626	NC_020515	TCA	2	6	37990	37995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470166033
627	NC_020515	CCAAT	2	10	38019	38028	40 %	20 %	0 %	40 %	470166034
628	NC_020515	AAT	2	6	38187	38192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470166034
629	NC_020515	TG	3	6	38215	38220	0 %	50 %	50 %	0 %	470166034
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631	NC_020515	TG	3	6	38347	38352	0 %	50 %	50 %	0 %	470166034
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