MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum UCMB5036 complete genome

Total Repeats: 2563

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020410	ATCGG	2	10	821	830	20 %	20 %	40 %	20 %	452854063
2	NC_020410	AATTT	2	10	2317	2326	40 %	60 %	0 %	0 %	452854064
3	NC_020410	CTGAG	2	10	2608	2617	20 %	20 %	40 %	20 %	452854064
4	NC_020410	AGTGA	2	10	4588	4597	40 %	20 %	40 %	0 %	452854066
5	NC_020410	TTGCA	2	10	5689	5698	20 %	40 %	20 %	20 %	452854068
6	NC_020410	GGGAC	2	10	6230	6239	20 %	0 %	60 %	20 %	452854068
7	NC_020410	TTCGG	2	10	7376	7385	0 %	40 %	40 %	20 %	452854069
8	NC_020410	ACGAT	2	10	8709	8718	40 %	20 %	20 %	20 %	452854069
9	NC_020410	CTTCA	2	10	15267	15276	20 %	40 %	0 %	40 %	452854070
10	NC_020410	AATAA	2	10	15584	15593	80 %	20 %	0 %	0 %	452854070
11	NC_020410	CCTTT	2	10	15638	15647	0 %	60 %	0 %	40 %	452854070
12	NC_020410	CTGAA	2	10	16558	16567	40 %	20 %	20 %	20 %	452854071
13	NC_020410	AAGAG	2	10	17105	17114	60 %	0 %	40 %	0 %	452854071
14	NC_020410	AGCAC	2	10	18170	18179	40 %	0 %	20 %	40 %	452854072
15	NC_020410	CGGAA	2	10	18182	18191	40 %	0 %	40 %	20 %	452854072
16	NC_020410	AGAGA	2	10	20817	20826	60 %	0 %	40 %	0 %	452854075
17	NC_020410	CCAAG	2	10	21731	21740	40 %	0 %	20 %	40 %	452854075
18	NC_020410	ATCTG	2	10	22298	22307	20 %	40 %	20 %	20 %	452854076
19	NC_020410	CCCGC	2	10	22763	22772	0 %	0 %	20 %	80 %	452854076
20	NC_020410	ACTCC	2	10	24693	24702	20 %	20 %	0 %	60 %	452854078
21	NC_020410	GTTTT	2	10	25657	25666	0 %	80 %	20 %	0 %	452854079
22	NC_020410	ATGAC	2	10	29879	29888	40 %	20 %	20 %	20 %	452854083
23	NC_020410	AGGCA	2	10	30564	30573	40 %	0 %	40 %	20 %	452854085
24	NC_020410	GAAGC	2	10	30756	30765	40 %	0 %	40 %	20 %	452854085
25	NC_020410	TTGCT	2	10	30898	30907	0 %	60 %	20 %	20 %	452854086
26	NC_020410	AAGAA	2	10	36910	36919	80 %	0 %	20 %	0 %	452854088
27	NC_020410	TGCTC	2	10	37147	37156	0 %	40 %	20 %	40 %	452854088
28	NC_020410	AAAGA	2	10	37554	37563	80 %	0 %	20 %	0 %	452854089
29	NC_020410	TGTGC	2	10	40241	40250	0 %	40 %	40 %	20 %	452854091
30	NC_020410	GAAAA	2	10	41541	41550	80 %	0 %	20 %	0 %	452854094
31	NC_020410	GCAGA	2	10	43525	43534	40 %	0 %	40 %	20 %	452854096
32	NC_020410	GCGAT	2	10	46528	46537	20 %	20 %	40 %	20 %	452854101
33	NC_020410	TGACA	2	10	48705	48714	40 %	20 %	20 %	20 %	452854102
34	NC_020410	TCAAA	2	10	51358	51367	60 %	20 %	0 %	20 %	452854104
35	NC_020410	TGAAG	2	10	58172	58181	40 %	20 %	40 %	0 %	452854113
36	NC_020410	AAGCA	2	10	58226	58235	60 %	0 %	20 %	20 %	452854113
37	NC_020410	ATTGA	2	10	60378	60387	40 %	40 %	20 %	0 %	452854116
38	NC_020410	AACAC	2	10	61112	61121	60 %	0 %	0 %	40 %	452854117
39	NC_020410	TTTGC	2	10	63144	63153	0 %	60 %	20 %	20 %	452854118
40	NC_020410	AACGG	2	10	63373	63382	40 %	0 %	40 %	20 %	452854118
41	NC_020410	CGGCG	2	10	65896	65905	0 %	0 %	60 %	40 %	452854120
42	NC_020410	ATGAT	2	10	66021	66030	40 %	40 %	20 %	0 %	452854120
43	NC_020410	GACGG	2	10	66359	66368	20 %	0 %	60 %	20 %	452854120
44	NC_020410	GGAGA	2	10	68609	68618	40 %	0 %	60 %	0 %	452854121
45	NC_020410	GGCCT	2	10	71776	71785	0 %	20 %	40 %	40 %	452854127
46	NC_020410	TTTCA	2	10	71918	71927	20 %	60 %	0 %	20 %	452854127
47	NC_020410	GTTCG	2	10	73044	73053	0 %	40 %	40 %	20 %	452854127
48	NC_020410	CGGGC	2	10	74339	74348	0 %	0 %	60 %	40 %	452854128
49	NC_020410	CCTCT	2	10	76142	76151	0 %	40 %	0 %	60 %	452854130
50	NC_020410	TTATT	2	10	77742	77751	20 %	80 %	0 %	0 %	452854132
51	NC_020410	TGAAG	2	10	82250	82259	40 %	20 %	40 %	0 %	452854135
52	NC_020410	CGGAG	2	10	82778	82787	20 %	0 %	60 %	20 %	452854136
53	NC_020410	GATCA	2	10	83163	83172	40 %	20 %	20 %	20 %	452854136
54	NC_020410	CGGAA	2	10	83803	83812	40 %	0 %	40 %	20 %	452854137
55	NC_020410	AGCGG	2	10	85255	85264	20 %	0 %	60 %	20 %	452854138
56	NC_020410	GGCCG	2	10	88990	88999	0 %	0 %	60 %	40 %	452854144
57	NC_020410	GGGAC	2	10	103772	103781	20 %	0 %	60 %	20 %	452854148
58	NC_020410	TCAAA	2	10	103928	103937	60 %	20 %	0 %	20 %	452854148
59	NC_020410	GAACA	2	10	104657	104666	60 %	0 %	20 %	20 %	452854149
60	NC_020410	AAATG	2	10	107655	107664	60 %	20 %	20 %	0 %	452854150
61	NC_020410	CGGAA	2	10	108900	108909	40 %	0 %	40 %	20 %	452854151
62	NC_020410	CCGTA	2	10	109773	109782	20 %	20 %	20 %	40 %	452854152
63	NC_020410	GAAAA	2	10	113917	113926	80 %	0 %	20 %	0 %	452854156
64	NC_020410	GTTTG	2	10	115343	115352	0 %	60 %	40 %	0 %	452854157
65	NC_020410	TGAAT	2	10	119029	119038	40 %	40 %	20 %	0 %	452854163
66	NC_020410	TTGAA	2	10	121426	121435	40 %	40 %	20 %	0 %	452854167
67	NC_020410	GACCG	2	10	122080	122089	20 %	0 %	40 %	40 %	452854168
68	NC_020410	GTGAA	2	10	126407	126416	40 %	20 %	40 %	0 %	452854170
69	NC_020410	ACCGG	2	10	127246	127255	20 %	0 %	40 %	40 %	452854170
70	NC_020410	CCGTT	2	10	127350	127359	0 %	40 %	20 %	40 %	452854170
71	NC_020410	GAAGA	2	10	128089	128098	60 %	0 %	40 %	0 %	452854170
72	NC_020410	CAAAG	2	10	128359	128368	60 %	0 %	20 %	20 %	452854170
73	NC_020410	GTGCT	2	10	128903	128912	0 %	40 %	40 %	20 %	452854170
74	NC_020410	CTGAC	2	10	129443	129452	20 %	20 %	20 %	40 %	452854170
75	NC_020410	GTCCT	2	10	129680	129689	0 %	40 %	20 %	40 %	452854170
76	NC_020410	CAATT	2	10	131923	131932	40 %	40 %	0 %	20 %	452854174
77	NC_020410	CTGAA	2	10	132154	132163	40 %	20 %	20 %	20 %	452854174
78	NC_020410	GAGGG	2	10	135524	135533	20 %	0 %	80 %	0 %	452854176
79	NC_020410	CAAAA	2	10	136152	136161	80 %	0 %	0 %	20 %	452854177
80	NC_020410	AATCA	2	10	137479	137488	60 %	20 %	0 %	20 %	452854179
81	NC_020410	TGGTA	2	10	139841	139850	20 %	40 %	40 %	0 %	452854184
82	NC_020410	AAAGT	2	10	140756	140765	60 %	20 %	20 %	0 %	452854186
83	NC_020410	CAAAC	2	10	144752	144761	60 %	0 %	0 %	40 %	452854195
84	NC_020410	TAAAT	2	10	147600	147609	60 %	40 %	0 %	0 %	452854199
85	NC_020410	AAACA	2	10	149169	149178	80 %	0 %	0 %	20 %	452854202
86	NC_020410	TTATC	2	10	150251	150260	20 %	60 %	0 %	20 %	452854203
87	NC_020410	TTAAA	2	10	151930	151939	60 %	40 %	0 %	0 %	452854205
88	NC_020410	CGTTT	2	10	153274	153283	0 %	60 %	20 %	20 %	452854207
89	NC_020410	ATGGA	2	10	153341	153350	40 %	20 %	40 %	0 %	452854207
90	NC_020410	CGAAG	2	10	154401	154410	40 %	0 %	40 %	20 %	452854208
91	NC_020410	GCACC	2	10	154430	154439	20 %	0 %	20 %	60 %	452854208
92	NC_020410	TGCTT	2	10	155354	155363	0 %	60 %	20 %	20 %	452854210
93	NC_020410	ATTCC	2	10	156177	156186	20 %	40 %	0 %	40 %	452854211
94	NC_020410	AAACA	2	10	159915	159924	80 %	0 %	0 %	20 %	452854216
95	NC_020410	TTTTC	2	10	160087	160096	0 %	80 %	0 %	20 %	452854217
96	NC_020410	ATTAT	2	10	179364	179373	40 %	60 %	0 %	0 %	452854220
97	NC_020410	TTGAA	2	10	180014	180023	40 %	40 %	20 %	0 %	452854221
98	NC_020410	CGGAC	2	10	180778	180787	20 %	0 %	40 %	40 %	452854222
99	NC_020410	AATGG	2	10	180982	180991	40 %	20 %	40 %	0 %	452854222
100	NC_020410	CTTTT	2	10	186149	186158	0 %	80 %	0 %	20 %	452854226
101	NC_020410	TCCGA	2	10	186310	186319	20 %	20 %	20 %	40 %	452854226
102	NC_020410	TCCTT	2	10	188009	188018	0 %	60 %	0 %	40 %	452854227
103	NC_020410	TTTTG	2	10	191795	191804	0 %	80 %	20 %	0 %	452854230
104	NC_020410	CTGAA	2	10	192533	192542	40 %	20 %	20 %	20 %	452854230
105	NC_020410	TAAAA	2	10	197268	197277	80 %	20 %	0 %	0 %	452854234
106	NC_020410	AAGAT	2	10	198826	198835	60 %	20 %	20 %	0 %	452854236
107	NC_020410	CTGAG	2	10	200360	200369	20 %	20 %	40 %	20 %	452854238
108	NC_020410	AGTGA	2	10	200743	200752	40 %	20 %	40 %	0 %	452854238
109	NC_020410	CATTG	2	10	200965	200974	20 %	40 %	20 %	20 %	452854239
110	NC_020410	GGAAG	2	10	201654	201663	40 %	0 %	60 %	0 %	452854239
111	NC_020410	ATGAA	2	10	203474	203483	60 %	20 %	20 %	0 %	452854240
112	NC_020410	CTGCA	2	10	205897	205906	20 %	20 %	20 %	40 %	452854241
113	NC_020410	AATTT	2	10	207826	207835	40 %	60 %	0 %	0 %	452854243
114	NC_020410	TCATT	2	10	212232	212241	20 %	60 %	0 %	20 %	452854246
115	NC_020410	CTTGG	2	10	212605	212614	0 %	40 %	40 %	20 %	452854247
116	NC_020410	GGATC	2	10	215051	215060	20 %	20 %	40 %	20 %	452854249
117	NC_020410	AATAA	2	10	216601	216610	80 %	20 %	0 %	0 %	452854251
118	NC_020410	AATTT	2	10	218103	218112	40 %	60 %	0 %	0 %	452854253
119	NC_020410	CGGGG	2	10	220639	220648	0 %	0 %	80 %	20 %	452854255
120	NC_020410	TTTTA	2	10	222860	222869	20 %	80 %	0 %	0 %	452854258
121	NC_020410	GATGC	2	10	223347	223356	20 %	20 %	40 %	20 %	452854258
122	NC_020410	AATCA	2	10	223457	223466	60 %	20 %	0 %	20 %	452854258
123	NC_020410	ATTGG	2	10	226425	226434	20 %	40 %	40 %	0 %	452854263
124	NC_020410	ATCGT	2	10	228533	228542	20 %	40 %	20 %	20 %	452854265
125	NC_020410	AAATG	2	10	233045	233054	60 %	20 %	20 %	0 %	452854269
126	NC_020410	CCAAG	2	10	233449	233458	40 %	0 %	20 %	40 %	452854269
127	NC_020410	GAACG	2	10	234521	234530	40 %	0 %	40 %	20 %	452854271
128	NC_020410	TGAGC	2	10	234982	234991	20 %	20 %	40 %	20 %	452854271
129	NC_020410	GCCCG	2	10	235512	235521	0 %	0 %	40 %	60 %	452854271
130	NC_020410	TTTTA	2	10	236565	236574	20 %	80 %	0 %	0 %	452854273
131	NC_020410	CCGCT	2	10	237098	237107	0 %	20 %	20 %	60 %	452854273
132	NC_020410	AAGGG	2	10	239155	239164	40 %	0 %	60 %	0 %	452854274
133	NC_020410	ACGGT	2	10	245341	245350	20 %	20 %	40 %	20 %	452854282
134	NC_020410	GGTCT	2	10	246228	246237	0 %	40 %	40 %	20 %	452854283
135	NC_020410	GACGG	2	10	246430	246439	20 %	0 %	60 %	20 %	452854283
136	NC_020410	AAGAA	2	10	247862	247871	80 %	0 %	20 %	0 %	452854284
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138	NC_020410	GAATA	2	10	250423	250432	60 %	20 %	20 %	0 %	452854285
139	NC_020410	AAAAT	2	10	251997	252006	80 %	20 %	0 %	0 %	452854287
140	NC_020410	GCCGA	2	10	252917	252926	20 %	0 %	40 %	40 %	452854287
141	NC_020410	TCGGA	2	10	253270	253279	20 %	20 %	40 %	20 %	452854288
142	NC_020410	CATTC	2	10	253758	253767	20 %	40 %	0 %	40 %	452854288
143	NC_020410	TCAGG	2	10	254742	254751	20 %	20 %	40 %	20 %	452854289
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145	NC_020410	ATTTC	2	10	257917	257926	20 %	60 %	0 %	20 %	452854293
146	NC_020410	TCGCT	2	10	258494	258503	0 %	40 %	20 %	40 %	452854293
147	NC_020410	AAAAG	2	10	259345	259354	80 %	0 %	20 %	0 %	452854294
148	NC_020410	CGTTT	2	10	259519	259528	0 %	60 %	20 %	20 %	452854294
149	NC_020410	TGGTG	2	10	260927	260936	0 %	40 %	60 %	0 %	452854296
150	NC_020410	TGACA	2	10	263084	263093	40 %	20 %	20 %	20 %	452854300
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152	NC_020410	AAAAC	2	10	264536	264545	80 %	0 %	0 %	20 %	452854300
153	NC_020410	GCTTT	2	10	265408	265417	0 %	60 %	20 %	20 %	452854302
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156	NC_020410	TCATT	2	10	269574	269583	20 %	60 %	0 %	20 %	452854306
157	NC_020410	GCTCT	2	10	269974	269983	0 %	40 %	20 %	40 %	452854307
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168	NC_020410	TTACA	2	10	286876	286885	40 %	40 %	0 %	20 %	452854323
169	NC_020410	CGTAC	2	10	287760	287769	20 %	20 %	20 %	40 %	452854324
170	NC_020410	TGGCT	2	10	291829	291838	0 %	40 %	40 %	20 %	452854329
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174	NC_020410	GAAAC	2	10	296377	296386	60 %	0 %	20 %	20 %	452854332
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178	NC_020410	TCCTC	2	10	299978	299987	0 %	40 %	0 %	60 %	452854336
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186	NC_020410	AGCGG	2	10	321123	321132	20 %	0 %	60 %	20 %	452854356
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199	NC_020410	GTTAT	2	10	339180	339189	20 %	60 %	20 %	0 %	452854368
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203	NC_020410	GAATT	2	10	347127	347136	40 %	40 %	20 %	0 %	452854376
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241	NC_020410	GCTGA	2	10	398940	398949	20 %	20 %	40 %	20 %	452854408
242	NC_020410	GCTGA	2	10	399345	399354	20 %	20 %	40 %	20 %	452854408
243	NC_020410	GGACA	2	10	400034	400043	40 %	0 %	40 %	20 %	452854408
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246	NC_020410	TCAGC	2	10	408256	408265	20 %	20 %	20 %	40 %	452854415
247	NC_020410	TATGA	2	10	408551	408560	40 %	40 %	20 %	0 %	452854415
248	NC_020410	AAACA	2	10	408869	408878	80 %	0 %	0 %	20 %	452854416
249	NC_020410	TCCGC	2	10	413359	413368	0 %	20 %	20 %	60 %	452854421
250	NC_020410	GTATC	2	10	414169	414178	20 %	40 %	20 %	20 %	452854422
251	NC_020410	ATGAA	2	10	414626	414635	60 %	20 %	20 %	0 %	452854422
252	NC_020410	TCGTT	2	10	418224	418233	0 %	60 %	20 %	20 %	452854425
253	NC_020410	TCAAA	2	10	420577	420586	60 %	20 %	0 %	20 %	452854428
254	NC_020410	AGCGA	2	10	421263	421272	40 %	0 %	40 %	20 %	452854428
255	NC_020410	GCACG	2	10	425022	425031	20 %	0 %	40 %	40 %	452854432
256	NC_020410	GGATC	2	10	425740	425749	20 %	20 %	40 %	20 %	452854433
257	NC_020410	CGTGT	2	10	425999	426008	0 %	40 %	40 %	20 %	452854433
258	NC_020410	ATCGG	2	10	426994	427003	20 %	20 %	40 %	20 %	452854435
259	NC_020410	CAGCG	2	10	429317	429326	20 %	0 %	40 %	40 %	452854438
260	NC_020410	TACAT	2	10	429534	429543	40 %	40 %	0 %	20 %	452854438
261	NC_020410	GTCAC	2	10	430684	430693	20 %	20 %	20 %	40 %	452854439
262	NC_020410	CATAT	2	10	432551	432560	40 %	40 %	0 %	20 %	452854441
263	NC_020410	AATGG	2	10	432694	432703	40 %	20 %	40 %	0 %	452854441
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389	NC_020410	AGAAA	2	10	634055	634064	80 %	0 %	20 %	0 %	452854643
390	NC_020410	GACCG	2	10	635649	635658	20 %	0 %	40 %	40 %	452854645
391	NC_020410	AGAAA	2	10	635932	635941	80 %	0 %	20 %	0 %	452854646
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