MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum UCMB5036 complete genome

Total Repeats: 72176

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_020410	AAAAT	2	10	251997	252006	80 %	20 %	0 %	0 %	452854287
4002	NC_020410	TCG	2	6	252090	252095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854287
4003	NC_020410	CGC	3	9	252103	252111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854287
4004	NC_020410	GCC	2	6	252190	252195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854287
4005	NC_020410	T	6	6	252221	252226	0 %	100 %	0 %	0 %	452854287
4006	NC_020410	AAAG	2	8	252277	252284	75 %	0 %	25 %	0 %	452854287
4007	NC_020410	AT	3	6	252293	252298	50 %	50 %	0 %	0 %	452854287
4008	NC_020410	GAC	2	6	252310	252315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854287
4009	NC_020410	CGC	2	6	252351	252356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854287
4010	NC_020410	CCG	2	6	252368	252373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854287
4011	NC_020410	AAT	2	6	252388	252393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452854287
4012	NC_020410	GC	3	6	252507	252512	0 %	0 %	50 %	50 %	452854287
4013	NC_020410	TTC	2	6	252524	252529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854287
4014	NC_020410	CAA	2	6	252612	252617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452854287
4015	NC_020410	CCG	2	6	252674	252679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854287
4016	NC_020410	CGC	2	6	252727	252732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854287
4017	NC_020410	T	6	6	252770	252775	0 %	100 %	0 %	0 %	452854287
4018	NC_020410	GGC	2	6	252781	252786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854287
4019	NC_020410	CCTT	2	8	252791	252798	0 %	50 %	0 %	50 %	452854287
4020	NC_020410	A	6	6	252856	252861	100 %	0 %	0 %	0 %	452854287
4021	NC_020410	AGAA	2	8	252871	252878	75 %	0 %	25 %	0 %	452854287
4022	NC_020410	A	6	6	252905	252910	100 %	0 %	0 %	0 %	452854287
4023	NC_020410	GCCGA	2	10	252917	252926	20 %	0 %	40 %	40 %	452854287
4024	NC_020410	A	6	6	252978	252983	100 %	0 %	0 %	0 %	452854288
4025	NC_020410	CAG	2	6	253015	253020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854288
4026	NC_020410	GCC	2	6	253024	253029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854288
4027	NC_020410	TCA	2	6	253049	253054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854288
4028	NC_020410	ATGCCG	2	12	253070	253081	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	452854288
4029	NC_020410	TCT	2	6	253105	253110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854288
4030	NC_020410	GCC	2	6	253138	253143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854288
4031	NC_020410	CGA	2	6	253170	253175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854288
4032	NC_020410	TCGGA	2	10	253270	253279	20 %	20 %	40 %	20 %	452854288
4033	NC_020410	TTC	2	6	253372	253377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854288
4034	NC_020410	TAG	2	6	253412	253417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854288
4035	NC_020410	AGC	2	6	253553	253558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854288
4036	NC_020410	ATC	2	6	253586	253591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854288
4037	NC_020410	GAT	2	6	253630	253635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854288
4038	NC_020410	GGC	2	6	253708	253713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854288
4039	NC_020410	TGA	2	6	253722	253727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854288
4040	NC_020410	CATTC	2	10	253758	253767	20 %	40 %	0 %	40 %	452854288
4041	NC_020410	TA	3	6	253846	253851	50 %	50 %	0 %	0 %	452854288
4042	NC_020410	CGGT	2	8	253879	253886	0 %	25 %	50 %	25 %	452854288
4043	NC_020410	CT	3	6	253939	253944	0 %	50 %	0 %	50 %	452854288
4044	NC_020410	A	6	6	254227	254232	100 %	0 %	0 %	0 %	452854289
4045	NC_020410	T	6	6	254337	254342	0 %	100 %	0 %	0 %	452854289
4046	NC_020410	T	6	6	254344	254349	0 %	100 %	0 %	0 %	452854289
4047	NC_020410	CTG	3	9	254350	254358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854289
4048	NC_020410	GAG	2	6	254441	254446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452854289
4049	NC_020410	T	6	6	254469	254474	0 %	100 %	0 %	0 %	452854289
4050	NC_020410	T	7	7	254494	254500	0 %	100 %	0 %	0 %	452854289
4051	NC_020410	T	6	6	254543	254548	0 %	100 %	0 %	0 %	452854289
4052	NC_020410	CGG	2	6	254631	254636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854289
4053	NC_020410	ATG	2	6	254647	254652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854289
4054	NC_020410	CA	3	6	254692	254697	50 %	0 %	0 %	50 %	452854289
4055	NC_020410	T	6	6	254712	254717	0 %	100 %	0 %	0 %	452854289
4056	NC_020410	TGA	2	6	254723	254728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854289
4057	NC_020410	TCAGG	2	10	254742	254751	20 %	20 %	40 %	20 %	452854289
4058	NC_020410	AAAC	2	8	254755	254762	75 %	0 %	0 %	25 %	452854289
4059	NC_020410	AGC	2	6	254768	254773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854289
4060	NC_020410	TGA	2	6	254786	254791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854289
4061	NC_020410	GAA	2	6	254809	254814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854289
4062	NC_020410	A	7	7	254827	254833	100 %	0 %	0 %	0 %	452854289
4063	NC_020410	ACG	2	6	254842	254847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854289
4064	NC_020410	TGC	2	6	254921	254926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854289
4065	NC_020410	A	6	6	254953	254958	100 %	0 %	0 %	0 %	452854289
4066	NC_020410	GA	3	6	255004	255009	50 %	0 %	50 %	0 %	452854289
4067	NC_020410	GCC	2	6	255028	255033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854289
4068	NC_020410	A	6	6	255287	255292	100 %	0 %	0 %	0 %	452854289
4069	NC_020410	CTTA	2	8	255367	255374	25 %	50 %	0 %	25 %	452854289
4070	NC_020410	ATA	2	6	255492	255497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452854289
4071	NC_020410	T	7	7	255502	255508	0 %	100 %	0 %	0 %	452854290
4072	NC_020410	TGA	3	9	255514	255522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854290
4073	NC_020410	GAT	2	6	255550	255555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854290
4074	NC_020410	GTC	2	6	255578	255583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854290
4075	NC_020410	TTA	2	6	255647	255652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452854290
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4077	NC_020410	CGGGA	2	10	255674	255683	20 %	0 %	60 %	20 %	452854290
4078	NC_020410	TGA	2	6	255729	255734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854290
4079	NC_020410	TGG	2	6	255759	255764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452854290
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4081	NC_020410	A	7	7	255926	255932	100 %	0 %	0 %	0 %	452854290
4082	NC_020410	G	7	7	255940	255946	0 %	0 %	100 %	0 %	452854290
4083	NC_020410	ATCA	2	8	255958	255965	50 %	25 %	0 %	25 %	452854290
4084	NC_020410	TATT	2	8	256046	256053	25 %	75 %	0 %	0 %	452854290
4085	NC_020410	GAAA	2	8	256070	256077	75 %	0 %	25 %	0 %	452854290
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4087	NC_020410	TCAT	2	8	256197	256204	25 %	50 %	0 %	25 %	452854290
4088	NC_020410	GAAA	2	8	256309	256316	75 %	0 %	25 %	0 %	452854290
4089	NC_020410	A	6	6	256364	256369	100 %	0 %	0 %	0 %	452854290
4090	NC_020410	TTCA	2	8	256370	256377	25 %	50 %	0 %	25 %	452854290
4091	NC_020410	TCT	2	6	256380	256385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854290
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4093	NC_020410	GAG	2	6	257287	257292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452854291
4094	NC_020410	AAG	2	6	257294	257299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854291
4095	NC_020410	GCG	2	6	257318	257323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854291
4096	NC_020410	GCT	2	6	257358	257363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854291
4097	NC_020410	TCG	2	6	257567	257572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854292
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4099	NC_020410	TTC	2	6	257856	257861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854293
4100	NC_020410	CTT	2	6	257888	257893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854293
4101	NC_020410	ATTTC	2	10	257917	257926	20 %	60 %	0 %	20 %	452854293
4102	NC_020410	T	6	6	258104	258109	0 %	100 %	0 %	0 %	452854293
4103	NC_020410	ACA	2	6	258200	258205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452854293
4104	NC_020410	GT	3	6	258221	258226	0 %	50 %	50 %	0 %	452854293
4105	NC_020410	AG	3	6	258265	258270	50 %	0 %	50 %	0 %	452854293
4106	NC_020410	CAA	2	6	258428	258433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452854293
4107	NC_020410	TCGCT	2	10	258494	258503	0 %	40 %	20 %	40 %	452854293
4108	NC_020410	TTA	2	6	258553	258558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452854293
4109	NC_020410	A	6	6	258657	258662	100 %	0 %	0 %	0 %	452854293
4110	NC_020410	T	6	6	258714	258719	0 %	100 %	0 %	0 %	452854293
4111	NC_020410	T	6	6	258746	258751	0 %	100 %	0 %	0 %	452854293
4112	NC_020410	TGAA	2	8	259197	259204	50 %	25 %	25 %	0 %	452854294
4113	NC_020410	AGA	2	6	259205	259210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854294
4114	NC_020410	GCAA	2	8	259214	259221	50 %	0 %	25 %	25 %	452854294
4115	NC_020410	TTC	2	6	259224	259229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854294
4116	NC_020410	GCA	2	6	259306	259311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854294
4117	NC_020410	AAAAG	2	10	259345	259354	80 %	0 %	20 %	0 %	452854294
4118	NC_020410	TCA	2	6	259394	259399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854294
4119	NC_020410	TAAA	2	8	259482	259489	75 %	25 %	0 %	0 %	452854294
4120	NC_020410	CGTTT	2	10	259519	259528	0 %	60 %	20 %	20 %	452854294
4121	NC_020410	AG	3	6	259554	259559	50 %	0 %	50 %	0 %	452854294
4122	NC_020410	GAT	2	6	259591	259596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854294
4123	NC_020410	GAT	2	6	259639	259644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854294
4124	NC_020410	AGAT	2	8	259680	259687	50 %	25 %	25 %	0 %	452854294
4125	NC_020410	GTC	2	6	259700	259705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854294
4126	NC_020410	ATG	2	6	259706	259711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854294
4127	NC_020410	GAAA	2	8	259723	259730	75 %	0 %	25 %	0 %	452854294
4128	NC_020410	A	6	6	259728	259733	100 %	0 %	0 %	0 %	452854294
4129	NC_020410	CG	3	6	259749	259754	0 %	0 %	50 %	50 %	452854294
4130	NC_020410	A	7	7	259826	259832	100 %	0 %	0 %	0 %	452854295
4131	NC_020410	CATC	2	8	259840	259847	25 %	25 %	0 %	50 %	452854295
4132	NC_020410	TGA	2	6	259939	259944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854295
4133	NC_020410	ATC	2	6	259997	260002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854295
4134	NC_020410	GGGC	2	8	260016	260023	0 %	0 %	75 %	25 %	452854295
4135	NC_020410	CAT	2	6	260035	260040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854295
4136	NC_020410	AT	3	6	260161	260166	50 %	50 %	0 %	0 %	452854295
4137	NC_020410	TGA	2	6	260173	260178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854295
4138	NC_020410	AGA	2	6	260212	260217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854295
4139	NC_020410	A	6	6	260310	260315	100 %	0 %	0 %	0 %	452854295
4140	NC_020410	CAT	2	6	260335	260340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854295
4141	NC_020410	AAG	2	6	260361	260366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854295
4142	NC_020410	TTCG	2	8	260372	260379	0 %	50 %	25 %	25 %	452854295
4143	NC_020410	TGC	2	6	260524	260529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854295
4144	NC_020410	CCG	2	6	260627	260632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854295
4145	NC_020410	ATG	2	6	260643	260648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854295
4146	NC_020410	A	6	6	260658	260663	100 %	0 %	0 %	0 %	452854295
4147	NC_020410	GCT	2	6	260725	260730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854295
4148	NC_020410	GA	3	6	260743	260748	50 %	0 %	50 %	0 %	452854295
4149	NC_020410	GATT	2	8	260753	260760	25 %	50 %	25 %	0 %	452854295
4150	NC_020410	TGGTG	2	10	260927	260936	0 %	40 %	60 %	0 %	452854296
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4153	NC_020410	TCC	2	6	261103	261108	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452854296
4154	NC_020410	GCT	2	6	261117	261122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854296
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4158	NC_020410	CATT	2	8	261479	261486	25 %	50 %	0 %	25 %	452854297
4159	NC_020410	TTA	2	6	261504	261509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452854297
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4162	NC_020410	GA	3	6	261718	261723	50 %	0 %	50 %	0 %	452854297
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4166	NC_020410	GATA	2	8	261912	261919	50 %	25 %	25 %	0 %	452854298
4167	NC_020410	A	6	6	261923	261928	100 %	0 %	0 %	0 %	452854298
4168	NC_020410	GAT	2	6	261943	261948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854298
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4183	NC_020410	CCG	2	6	263162	263167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854300
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4191	NC_020410	CAG	2	6	263768	263773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854300
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4198	NC_020410	TGA	2	6	264140	264145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854300
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4200	NC_020410	GCC	2	6	264210	264215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854300
4201	NC_020410	GCA	2	6	264242	264247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854300
4202	NC_020410	AAC	2	6	264275	264280	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452854300
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4218	NC_020410	GT	3	6	265192	265197	0 %	50 %	50 %	0 %	452854302
4219	NC_020410	CTG	2	6	265209	265214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854302
4220	NC_020410	CGAG	2	8	265280	265287	25 %	0 %	50 %	25 %	452854302
4221	NC_020410	ATG	2	6	265303	265308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854302
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4224	NC_020410	ATC	2	6	265444	265449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854302
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4227	NC_020410	TTTG	2	8	265590	265597	0 %	75 %	25 %	0 %	452854302
4228	NC_020410	TCG	2	6	265691	265696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854302
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4232	NC_020410	CCG	2	6	265849	265854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854303
4233	NC_020410	CGG	2	6	265880	265885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854303
4234	NC_020410	CGC	2	6	265988	265993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854303
4235	NC_020410	GAT	2	6	266003	266008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854303
4236	NC_020410	GGC	2	6	266009	266014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854303
4237	NC_020410	CATC	2	8	266021	266028	25 %	25 %	0 %	50 %	452854303
4238	NC_020410	CCG	2	6	266063	266068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854303
4239	NC_020410	CCTT	2	8	266092	266099	0 %	50 %	0 %	50 %	452854303
4240	NC_020410	GC	3	6	266208	266213	0 %	0 %	50 %	50 %	452854303
4241	NC_020410	GCC	2	6	266259	266264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854303
4242	NC_020410	GAT	2	6	266280	266285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854303
4243	NC_020410	GCA	2	6	266318	266323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854303
4244	NC_020410	A	6	6	266339	266344	100 %	0 %	0 %	0 %	452854303
4245	NC_020410	CCG	2	6	266437	266442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854303
4246	NC_020410	T	6	6	266469	266474	0 %	100 %	0 %	0 %	452854303
4247	NC_020410	CA	3	6	266599	266604	50 %	0 %	0 %	50 %	452854304
4248	NC_020410	GCT	2	6	266619	266624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854304
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4250	NC_020410	GAA	2	6	266771	266776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854304
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4270	NC_020410	A	7	7	267678	267684	100 %	0 %	0 %	0 %	452854304
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4319	NC_020410	GAAA	2	8	270018	270025	75 %	0 %	25 %	0 %	452854307
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4332	NC_020410	TGA	2	6	270627	270632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854307
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4351	NC_020410	CGG	2	6	271776	271781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854308
4352	NC_020410	TGA	2	6	271823	271828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854308
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4356	NC_020410	A	6	6	272081	272086	100 %	0 %	0 %	0 %	452854309
4357	NC_020410	TGC	2	6	272087	272092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854309
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4360	NC_020410	ATC	2	6	272197	272202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854309
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4362	NC_020410	GACA	3	12	272237	272248	50 %	0 %	25 %	25 %	452854309
4363	NC_020410	TCCG	2	8	272292	272299	0 %	25 %	25 %	50 %	452854309
4364	NC_020410	GGC	2	6	272306	272311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854309
4365	NC_020410	GAA	2	6	272324	272329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854309
4366	NC_020410	A	6	6	272339	272344	100 %	0 %	0 %	0 %	452854309
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