MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum UCMB5036 complete genome

Total Repeats: 72176

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_020410	CAA	2	6	223137	223142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452854258
3502	NC_020410	ATG	2	6	223170	223175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854258
3503	NC_020410	GAA	2	6	223215	223220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854258
3504	NC_020410	ATC	2	6	223272	223277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854258
3505	NC_020410	CGGC	2	8	223321	223328	0 %	0 %	50 %	50 %	452854258
3506	NC_020410	GATGC	2	10	223347	223356	20 %	20 %	40 %	20 %	452854258
3507	NC_020410	TAT	2	6	223359	223364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452854258
3508	NC_020410	GTC	2	6	223377	223382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854258
3509	NC_020410	AG	3	6	223430	223435	50 %	0 %	50 %	0 %	452854258
3510	NC_020410	CAG	2	6	223437	223442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854258
3511	NC_020410	AATCA	2	10	223457	223466	60 %	20 %	0 %	20 %	452854258
3512	NC_020410	TCA	2	6	223546	223551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854258
3513	NC_020410	AGC	2	6	223557	223562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854258
3514	NC_020410	TTTG	2	8	223589	223596	0 %	75 %	25 %	0 %	452854258
3515	NC_020410	CTT	2	6	223647	223652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854258
3516	NC_020410	A	6	6	223667	223672	100 %	0 %	0 %	0 %	452854258
3517	NC_020410	GGC	2	6	223694	223699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854258
3518	NC_020410	T	6	6	223721	223726	0 %	100 %	0 %	0 %	452854258
3519	NC_020410	GCA	2	6	223829	223834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854258
3520	NC_020410	GCC	2	6	223875	223880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854258
3521	NC_020410	AGG	2	6	223927	223932	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452854258
3522	NC_020410	TGC	2	6	223983	223988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854259
3523	NC_020410	CGA	2	6	224010	224015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854259
3524	NC_020410	CTTTTC	2	12	224044	224055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854259
3525	NC_020410	CAG	2	6	224069	224074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854259
3526	NC_020410	GGA	2	6	224173	224178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452854259
3527	NC_020410	ATC	2	6	224199	224204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854259
3528	NC_020410	GAA	2	6	224243	224248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854259
3529	NC_020410	ATT	2	6	224251	224256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452854259
3530	NC_020410	GAA	2	6	224294	224299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854259
3531	NC_020410	AGC	2	6	224322	224327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854259
3532	NC_020410	GCA	2	6	224335	224340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854259
3533	NC_020410	GGCG	2	8	224341	224348	0 %	0 %	75 %	25 %	452854259
3534	NC_020410	A	7	7	224354	224360	100 %	0 %	0 %	0 %	452854259
3535	NC_020410	CCG	2	6	224451	224456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854259
3536	NC_020410	TTG	2	6	224538	224543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452854259
3537	NC_020410	CATA	2	8	224585	224592	50 %	25 %	0 %	25 %	452854259
3538	NC_020410	GCG	3	9	224648	224656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854259
3539	NC_020410	TGC	2	6	224709	224714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854259
3540	NC_020410	TGC	2	6	224740	224745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854259
3541	NC_020410	CTG	2	6	224781	224786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854259
3542	NC_020410	GCTT	2	8	224836	224843	0 %	50 %	25 %	25 %	452854259
3543	NC_020410	TTC	2	6	224882	224887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854259
3544	NC_020410	GCA	2	6	224979	224984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854259
3545	NC_020410	TGC	2	6	225013	225018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854259
3546	NC_020410	A	8	8	225068	225075	100 %	0 %	0 %	0 %	452854259
3547	NC_020410	GCT	2	6	225090	225095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854260
3548	NC_020410	AAT	2	6	225110	225115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452854260
3549	NC_020410	GGCT	2	8	225162	225169	0 %	25 %	50 %	25 %	452854260
3550	NC_020410	GCC	2	6	225412	225417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854261
3551	NC_020410	GCT	2	6	225418	225423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854261
3552	NC_020410	TTG	2	6	225424	225429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452854261
3553	NC_020410	GCG	2	6	225463	225468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854261
3554	NC_020410	TAT	2	6	225495	225500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452854261
3555	NC_020410	AAC	2	6	225646	225651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452854261
3556	NC_020410	A	6	6	225702	225707	100 %	0 %	0 %	0 %	452854261
3557	NC_020410	AGC	2	6	225820	225825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854261
3558	NC_020410	ATG	2	6	225933	225938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854262
3559	NC_020410	ATG	2	6	225988	225993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854262
3560	NC_020410	TG	3	6	225992	225997	0 %	50 %	50 %	0 %	452854262
3561	NC_020410	TGAA	2	8	226156	226163	50 %	25 %	25 %	0 %	452854262
3562	NC_020410	A	7	7	226305	226311	100 %	0 %	0 %	0 %	452854263
3563	NC_020410	GCC	2	6	226362	226367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854263
3564	NC_020410	ATT	2	6	226368	226373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452854263
3565	NC_020410	ATTGG	2	10	226425	226434	20 %	40 %	40 %	0 %	452854263
3566	NC_020410	CTT	2	6	226466	226471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854263
3567	NC_020410	GGCTGC	2	12	226485	226496	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	452854263
3568	NC_020410	AT	3	6	226597	226602	50 %	50 %	0 %	0 %	452854263
3569	NC_020410	GAA	2	6	226606	226611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854263
3570	NC_020410	GT	3	6	226640	226645	0 %	50 %	50 %	0 %	452854263
3571	NC_020410	CGG	2	6	226715	226720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854263
3572	NC_020410	CTGG	2	8	226761	226768	0 %	25 %	50 %	25 %	452854263
3573	NC_020410	AGA	2	6	226788	226793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854263
3574	NC_020410	GGTG	2	8	226802	226809	0 %	25 %	75 %	0 %	452854263
3575	NC_020410	GA	3	6	226857	226862	50 %	0 %	50 %	0 %	452854263
3576	NC_020410	AGG	2	6	226877	226882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452854263
3577	NC_020410	A	6	6	226991	226996	100 %	0 %	0 %	0 %	452854263
3578	NC_020410	ATT	2	6	227036	227041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452854264
3579	NC_020410	TCT	2	6	227042	227047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854264
3580	NC_020410	TCA	2	6	227050	227055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854264
3581	NC_020410	TTG	2	6	227134	227139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452854264
3582	NC_020410	TCA	2	6	227201	227206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854264
3583	NC_020410	ATG	2	6	227522	227527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854265
3584	NC_020410	GAT	2	6	227542	227547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854265
3585	NC_020410	GGCG	2	8	227574	227581	0 %	0 %	75 %	25 %	452854265
3586	NC_020410	ATT	2	6	227606	227611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452854265
3587	NC_020410	ATT	2	6	227912	227917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452854265
3588	NC_020410	ATT	2	6	227931	227936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452854265
3589	NC_020410	ATT	3	9	227987	227995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452854265
3590	NC_020410	GCT	2	6	228016	228021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854265
3591	NC_020410	CGG	2	6	228037	228042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854265
3592	NC_020410	CGG	2	6	228096	228101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854265
3593	NC_020410	A	6	6	228169	228174	100 %	0 %	0 %	0 %	452854265
3594	NC_020410	ATT	2	6	228362	228367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452854265
3595	NC_020410	ACG	2	6	228422	228427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854265
3596	NC_020410	A	7	7	228450	228456	100 %	0 %	0 %	0 %	452854265
3597	NC_020410	AT	3	6	228460	228465	50 %	50 %	0 %	0 %	452854265
3598	NC_020410	GAT	2	6	228517	228522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854265
3599	NC_020410	ATCGT	2	10	228533	228542	20 %	40 %	20 %	20 %	452854265
3600	NC_020410	TGCT	2	8	228576	228583	0 %	50 %	25 %	25 %	452854265
3601	NC_020410	TGA	2	6	228636	228641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854265
3602	NC_020410	GCG	2	6	228646	228651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854265
3603	NC_020410	CGG	3	9	228654	228662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854265
3604	NC_020410	TC	3	6	228728	228733	0 %	50 %	0 %	50 %	452854265
3605	NC_020410	GC	3	6	228746	228751	0 %	0 %	50 %	50 %	452854265
3606	NC_020410	ATTT	2	8	228800	228807	25 %	75 %	0 %	0 %	452854265
3607	NC_020410	CTA	2	6	228808	228813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854265
3608	NC_020410	AAGCGA	2	12	228816	228827	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	452854265
3609	NC_020410	GGC	2	6	228857	228862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854265
3610	NC_020410	ATG	2	6	228890	228895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854265
3611	NC_020410	CGG	2	6	228925	228930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854265
3612	NC_020410	CAT	2	6	228937	228942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854265
3613	NC_020410	AAT	2	6	229098	229103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452854265
3614	NC_020410	TTA	2	6	229644	229649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452854266
3615	NC_020410	AAAC	2	8	229727	229734	75 %	0 %	0 %	25 %	452854266
3616	NC_020410	AGAAAA	2	12	229741	229752	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	452854266
3617	NC_020410	TA	3	6	229780	229785	50 %	50 %	0 %	0 %	452854266
3618	NC_020410	CAA	2	6	229794	229799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452854266
3619	NC_020410	TA	3	6	229830	229835	50 %	50 %	0 %	0 %	452854266
3620	NC_020410	TGA	2	6	229837	229842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854266
3621	NC_020410	AGC	2	6	229849	229854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854266
3622	NC_020410	A	7	7	229905	229911	100 %	0 %	0 %	0 %	452854266
3623	NC_020410	A	6	6	229928	229933	100 %	0 %	0 %	0 %	452854266
3624	NC_020410	TA	3	6	229938	229943	50 %	50 %	0 %	0 %	452854266
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3627	NC_020410	T	6	6	230041	230046	0 %	100 %	0 %	0 %	452854266
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3630	NC_020410	AT	3	6	230164	230169	50 %	50 %	0 %	0 %	452854266
3631	NC_020410	TCAA	2	8	230192	230199	50 %	25 %	0 %	25 %	452854266
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3645	NC_020410	A	6	6	230748	230753	100 %	0 %	0 %	0 %	452854266
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3653	NC_020410	TA	3	6	230991	230996	50 %	50 %	0 %	0 %	452854267
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3732	NC_020410	GCA	2	6	235301	235306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854271
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3740	NC_020410	GCCCG	2	10	235512	235521	0 %	0 %	40 %	60 %	452854271
3741	NC_020410	T	6	6	235525	235530	0 %	100 %	0 %	0 %	452854271
3742	NC_020410	AG	3	6	235589	235594	50 %	0 %	50 %	0 %	452854271
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3746	NC_020410	GGCC	2	8	236018	236025	0 %	0 %	50 %	50 %	452854272
3747	NC_020410	TCAA	2	8	236053	236060	50 %	25 %	0 %	25 %	452854272
3748	NC_020410	A	8	8	236080	236087	100 %	0 %	0 %	0 %	452854272
3749	NC_020410	AT	3	6	236089	236094	50 %	50 %	0 %	0 %	452854272
3750	NC_020410	TGA	2	6	236099	236104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854272
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3868	NC_020410	TAA	2	6	244014	244019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452854280
3869	NC_020410	GAT	2	6	244074	244079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854280
3870	NC_020410	AGA	2	6	244205	244210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854280
3871	NC_020410	CGT	2	6	244236	244241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854280
3872	NC_020410	ATT	2	6	244295	244300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452854280
3873	NC_020410	CGG	2	6	244347	244352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854280
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3884	NC_020410	CAG	2	6	245071	245076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854281
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3888	NC_020410	ACGGT	2	10	245341	245350	20 %	20 %	40 %	20 %	452854282
3889	NC_020410	A	6	6	245478	245483	100 %	0 %	0 %	0 %	452854282
3890	NC_020410	GAT	2	6	245508	245513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854282
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3893	NC_020410	GGC	2	6	245742	245747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854282
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3898	NC_020410	ATC	2	6	245928	245933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854282
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3900	NC_020410	A	7	7	246000	246006	100 %	0 %	0 %	0 %	452854282
3901	NC_020410	GAAT	2	8	246023	246030	50 %	25 %	25 %	0 %	452854282
3902	NC_020410	ACGA	2	8	246066	246073	50 %	0 %	25 %	25 %	452854282
3903	NC_020410	ATGT	2	8	246081	246088	25 %	50 %	25 %	0 %	452854282
3904	NC_020410	GAA	2	6	246111	246116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854282
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3933	NC_020410	GA	3	6	247944	247949	50 %	0 %	50 %	0 %	452854284
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3988	NC_020410	CG	3	6	251165	251170	0 %	0 %	50 %	50 %	452854286
3989	NC_020410	TGCA	2	8	251241	251248	25 %	25 %	25 %	25 %	452854286
3990	NC_020410	TC	3	6	251268	251273	0 %	50 %	0 %	50 %	452854286
3991	NC_020410	ATC	2	6	251298	251303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854286
3992	NC_020410	CAG	2	6	251564	251569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854287
3993	NC_020410	TCA	3	9	251579	251587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854287
3994	NC_020410	CTTT	2	8	251625	251632	0 %	75 %	0 %	25 %	452854287
3995	NC_020410	T	6	6	251665	251670	0 %	100 %	0 %	0 %	452854287
3996	NC_020410	ACC	2	6	251702	251707	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452854287
3997	NC_020410	CA	3	6	251738	251743	50 %	0 %	0 %	50 %	452854287
3998	NC_020410	T	6	6	251812	251817	0 %	100 %	0 %	0 %	452854287
3999	NC_020410	TAA	2	6	251852	251857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452854287
4000	NC_020410	GGC	2	6	251944	251949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854287

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