MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum UCMB5036 complete genome

Total Repeats: 72176

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_020410	CTT	2	6	126725	126730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854170
2003	NC_020410	CGT	2	6	126732	126737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854170
2004	NC_020410	TAA	2	6	126855	126860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452854170
2005	NC_020410	AAG	2	6	126887	126892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854170
2006	NC_020410	AGA	2	6	126906	126911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854170
2007	NC_020410	GAT	2	6	127005	127010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854170
2008	NC_020410	CGG	2	6	127065	127070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854170
2009	NC_020410	CGT	2	6	127105	127110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854170
2010	NC_020410	TCA	2	6	127112	127117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854170
2011	NC_020410	TAA	2	6	127122	127127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452854170
2012	NC_020410	GC	3	6	127154	127159	0 %	0 %	50 %	50 %	452854170
2013	NC_020410	CAT	2	6	127164	127169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854170
2014	NC_020410	CGC	2	6	127228	127233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854170
2015	NC_020410	ACCGG	2	10	127246	127255	20 %	0 %	40 %	40 %	452854170
2016	NC_020410	ACT	2	6	127340	127345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854170
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2020	NC_020410	TTG	2	6	127619	127624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452854170
2021	NC_020410	GC	3	6	127735	127740	0 %	0 %	50 %	50 %	452854170
2022	NC_020410	GTT	2	6	127792	127797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452854170
2023	NC_020410	ACT	2	6	127826	127831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854170
2024	NC_020410	GC	3	6	127845	127850	0 %	0 %	50 %	50 %	452854170
2025	NC_020410	CTT	2	6	127897	127902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854170
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2030	NC_020410	TCT	2	6	128111	128116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854170
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2033	NC_020410	ATC	2	6	128197	128202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854170
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2041	NC_020410	AAG	2	6	128819	128824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854170
2042	NC_020410	ATC	2	6	128833	128838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854170
2043	NC_020410	GTGCT	2	10	128903	128912	0 %	40 %	40 %	20 %	452854170
2044	NC_020410	GAA	2	6	128974	128979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854170
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2049	NC_020410	CA	3	6	129177	129182	50 %	0 %	0 %	50 %	452854170
2050	NC_020410	CGA	2	6	129236	129241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854170
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2052	NC_020410	TTG	2	6	129302	129307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452854170
2053	NC_020410	CTT	2	6	129430	129435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854170
2054	NC_020410	CTGAC	2	10	129443	129452	20 %	20 %	20 %	40 %	452854170
2055	NC_020410	TCT	2	6	129468	129473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854170
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2057	NC_020410	TGC	2	6	129647	129652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854170
2058	NC_020410	GTCCT	2	10	129680	129689	0 %	40 %	20 %	40 %	452854170
2059	NC_020410	ATTC	2	8	129722	129729	25 %	50 %	0 %	25 %	452854170
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2063	NC_020410	ATC	2	6	129826	129831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854170
2064	NC_020410	CCGG	2	8	129844	129851	0 %	0 %	50 %	50 %	452854170
2065	NC_020410	ATG	2	6	129859	129864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854170
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2090	NC_020410	A	6	6	131464	131469	100 %	0 %	0 %	0 %	452854174
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2103	NC_020410	GCA	2	6	132073	132078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854174
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2107	NC_020410	GCT	2	6	132165	132170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854174
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2113	NC_020410	TGAC	2	8	132388	132395	25 %	25 %	25 %	25 %	452854174
2114	NC_020410	TTC	2	6	132417	132422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854174
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2116	NC_020410	TGA	2	6	132608	132613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854174
2117	NC_020410	GAA	2	6	132732	132737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854174
2118	NC_020410	ACAA	2	8	132755	132762	75 %	0 %	0 %	25 %	452854174
2119	NC_020410	ATC	2	6	132783	132788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854174
2120	NC_020410	TTG	2	6	132820	132825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452854174
2121	NC_020410	CTC	2	6	132868	132873	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452854174
2122	NC_020410	CGAA	2	8	132982	132989	50 %	0 %	25 %	25 %	452854174
2123	NC_020410	TCG	2	6	133021	133026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854174
2124	NC_020410	GTG	2	6	133027	133032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452854174
2125	NC_020410	CT	3	6	133079	133084	0 %	50 %	0 %	50 %	452854174
2126	NC_020410	ATG	2	6	133153	133158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854174
2127	NC_020410	GCT	2	6	133188	133193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854174
2128	NC_020410	TTC	2	6	133234	133239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854174
2129	NC_020410	GTT	2	6	133263	133268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452854174
2130	NC_020410	GAA	2	6	133275	133280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854174
2131	NC_020410	CAT	2	6	133292	133297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854174
2132	NC_020410	TCG	2	6	133313	133318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854174
2133	NC_020410	TGCG	2	8	133363	133370	0 %	25 %	50 %	25 %	452854174
2134	NC_020410	GAA	2	6	133464	133469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854174
2135	NC_020410	GAA	2	6	133488	133493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854174
2136	NC_020410	A	8	8	133500	133507	100 %	0 %	0 %	0 %	452854174
2137	NC_020410	AAT	2	6	133516	133521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452854174
2138	NC_020410	ACA	2	6	133715	133720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452854175
2139	NC_020410	CTG	2	6	133725	133730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854175
2140	NC_020410	AGA	2	6	133804	133809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854175
2141	NC_020410	TGC	2	6	133927	133932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854175
2142	NC_020410	GTA	2	6	133955	133960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854175
2143	NC_020410	CTG	3	9	133962	133970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854175
2144	NC_020410	CTT	2	6	134003	134008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854175
2145	NC_020410	GTA	2	6	134036	134041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854175
2146	NC_020410	GAC	2	6	134066	134071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854175
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2148	NC_020410	TTG	2	6	134088	134093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452854175
2149	NC_020410	TCT	2	6	134110	134115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854175
2150	NC_020410	TGA	2	6	134137	134142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854175
2151	NC_020410	GTT	2	6	134150	134155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452854175
2152	NC_020410	GAA	2	6	134198	134203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854175
2153	NC_020410	A	6	6	134202	134207	100 %	0 %	0 %	0 %	452854175
2154	NC_020410	ATG	2	6	134276	134281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854175
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2158	NC_020410	CTT	2	6	134438	134443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854175
2159	NC_020410	ACA	2	6	134463	134468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452854175
2160	NC_020410	CTT	2	6	134477	134482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854175
2161	NC_020410	CA	3	6	134547	134552	50 %	0 %	0 %	50 %	452854175
2162	NC_020410	TTCT	2	8	134577	134584	0 %	75 %	0 %	25 %	452854175
2163	NC_020410	AGA	2	6	134587	134592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854175
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2165	NC_020410	ATC	2	6	134666	134671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854175
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2171	NC_020410	AG	3	6	135145	135150	50 %	0 %	50 %	0 %	452854176
2172	NC_020410	TC	3	6	135158	135163	0 %	50 %	0 %	50 %	452854176
2173	NC_020410	CATT	2	8	135221	135228	25 %	50 %	0 %	25 %	452854176
2174	NC_020410	GCAA	2	8	135244	135251	50 %	0 %	25 %	25 %	452854176
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2180	NC_020410	TAT	2	6	135336	135341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452854176
2181	NC_020410	TCAG	2	8	135355	135362	25 %	25 %	25 %	25 %	452854176
2182	NC_020410	GAA	2	6	135381	135386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854176
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2186	NC_020410	GAGGG	2	10	135524	135533	20 %	0 %	80 %	0 %	452854176
2187	NC_020410	CAT	2	6	135543	135548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854176
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2189	NC_020410	CG	3	6	135623	135628	0 %	0 %	50 %	50 %	452854176
2190	NC_020410	GGA	2	6	135659	135664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452854176
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2194	NC_020410	GAAA	2	8	135898	135905	75 %	0 %	25 %	0 %	452854176
2195	NC_020410	CAAAA	2	10	136152	136161	80 %	0 %	0 %	20 %	452854177
2196	NC_020410	A	6	6	136158	136163	100 %	0 %	0 %	0 %	452854177
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2199	NC_020410	GAA	2	6	136515	136520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854178
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2202	NC_020410	ATG	2	6	136623	136628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854178
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2204	NC_020410	TAAAGG	2	12	136837	136848	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	452854178
2205	NC_020410	ACC	2	6	136911	136916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452854178
2206	NC_020410	GTC	2	6	136917	136922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854178
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2209	NC_020410	GTA	2	6	137246	137251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854179
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2212	NC_020410	GGT	2	6	137408	137413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452854179
2213	NC_020410	A	6	6	137459	137464	100 %	0 %	0 %	0 %	452854179
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2215	NC_020410	AATCA	2	10	137479	137488	60 %	20 %	0 %	20 %	452854179
2216	NC_020410	TCT	2	6	137495	137500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854179
2217	NC_020410	ACA	3	9	137511	137519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452854179
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2219	NC_020410	GTT	2	6	137675	137680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452854179
2220	NC_020410	AGG	2	6	137760	137765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452854179
2221	NC_020410	CTG	2	6	137825	137830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854180
2222	NC_020410	A	8	8	137843	137850	100 %	0 %	0 %	0 %	452854180
2223	NC_020410	TAA	2	6	137877	137882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452854180
2224	NC_020410	CAT	2	6	137940	137945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854180
2225	NC_020410	CGT	2	6	138131	138136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854181
2226	NC_020410	CTTG	2	8	138190	138197	0 %	50 %	25 %	25 %	452854181
2227	NC_020410	A	6	6	138209	138214	100 %	0 %	0 %	0 %	452854181
2228	NC_020410	AAC	2	6	138224	138229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452854181
2229	NC_020410	AAG	2	6	138594	138599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854181
2230	NC_020410	AGC	2	6	138687	138692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854181
2231	NC_020410	GGT	3	9	138791	138799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452854181
2232	NC_020410	CG	3	6	138806	138811	0 %	0 %	50 %	50 %	452854181
2233	NC_020410	CGT	3	9	138908	138916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854181
2234	NC_020410	ATAA	2	8	138921	138928	75 %	25 %	0 %	0 %	452854181
2235	NC_020410	A	6	6	139001	139006	100 %	0 %	0 %	0 %	452854182
2236	NC_020410	TGA	2	6	139029	139034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854182
2237	NC_020410	GACG	2	8	139142	139149	25 %	0 %	50 %	25 %	452854182
2238	NC_020410	A	7	7	139247	139253	100 %	0 %	0 %	0 %	452854182
2239	NC_020410	AG	3	6	139264	139269	50 %	0 %	50 %	0 %	452854182
2240	NC_020410	CTC	2	6	139318	139323	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452854183
2241	NC_020410	TATC	2	8	139378	139385	25 %	50 %	0 %	25 %	452854183
2242	NC_020410	GCT	2	6	139404	139409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854183
2243	NC_020410	ATC	2	6	139416	139421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854183
2244	NC_020410	TTG	2	6	139504	139509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452854183
2245	NC_020410	CCGC	2	8	139535	139542	0 %	0 %	25 %	75 %	452854183
2246	NC_020410	CAA	2	6	139568	139573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452854183
2247	NC_020410	AGG	2	6	139612	139617	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452854183
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2250	NC_020410	TGGTA	2	10	139841	139850	20 %	40 %	40 %	0 %	452854184
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2253	NC_020410	ACA	2	6	140027	140032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452854184
2254	NC_020410	TAC	2	6	140121	140126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854184
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2256	NC_020410	CTA	2	6	140248	140253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854184
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2265	NC_020410	GAA	2	6	140686	140691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854185
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2350	NC_020410	GATG	2	8	145576	145583	25 %	25 %	50 %	0 %	452854197
2351	NC_020410	GCC	2	6	145626	145631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854197
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2356	NC_020410	ATC	3	9	145853	145861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854197
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2362	NC_020410	GA	3	6	146187	146192	50 %	0 %	50 %	0 %	452854197
2363	NC_020410	ATTA	2	8	146263	146270	50 %	50 %	0 %	0 %	452854197
2364	NC_020410	A	6	6	146333	146338	100 %	0 %	0 %	0 %	452854197
2365	NC_020410	TTC	2	6	146451	146456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854197
2366	NC_020410	TTCA	2	8	146465	146472	25 %	50 %	0 %	25 %	452854197
2367	NC_020410	CAT	2	6	146511	146516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854197
2368	NC_020410	GTC	2	6	146525	146530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854197
2369	NC_020410	AGC	2	6	146553	146558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854197
2370	NC_020410	CA	3	6	146701	146706	50 %	0 %	0 %	50 %	452854198
2371	NC_020410	TTG	2	6	146718	146723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452854198
2372	NC_020410	TGC	2	6	146767	146772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854198
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2375	NC_020410	GAT	2	6	146882	146887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854198
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2377	NC_020410	GATT	2	8	146977	146984	25 %	50 %	25 %	0 %	452854198
2378	NC_020410	CATTAA	2	12	146989	147000	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	452854198
2379	NC_020410	CCG	2	6	147086	147091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854198
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2392	NC_020410	GAAG	2	8	147711	147718	50 %	0 %	50 %	0 %	452854199
2393	NC_020410	GTT	2	6	147790	147795	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452854199
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2398	NC_020410	CGT	2	6	149104	149109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854201
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2400	NC_020410	TAAG	2	8	149131	149138	50 %	25 %	25 %	0 %	452854201
2401	NC_020410	GCT	3	9	149157	149165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854202
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2452	NC_020410	GA	3	6	151772	151777	50 %	0 %	50 %	0 %	452854205
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2457	NC_020410	GAAA	2	8	152000	152007	75 %	0 %	25 %	0 %	452854205
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2461	NC_020410	A	7	7	152410	152416	100 %	0 %	0 %	0 %	452854206
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2466	NC_020410	CGA	2	6	152701	152706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854206
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2468	NC_020410	GAG	2	6	152834	152839	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452854206
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2473	NC_020410	ATC	2	6	152967	152972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854207
2474	NC_020410	TCTT	2	8	153014	153021	0 %	75 %	0 %	25 %	452854207
2475	NC_020410	TGTA	2	8	153024	153031	25 %	50 %	25 %	0 %	452854207
2476	NC_020410	T	7	7	153035	153041	0 %	100 %	0 %	0 %	452854207
2477	NC_020410	AAC	2	6	153046	153051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452854207
2478	NC_020410	GTTT	2	8	153074	153081	0 %	75 %	25 %	0 %	452854207
2479	NC_020410	TTA	2	6	153172	153177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452854207
2480	NC_020410	CGTTT	2	10	153274	153283	0 %	60 %	20 %	20 %	452854207
2481	NC_020410	GAC	2	6	153297	153302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854207
2482	NC_020410	GCT	2	6	153303	153308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854207
2483	NC_020410	ACA	2	6	153316	153321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452854207
2484	NC_020410	ATGGA	2	10	153341	153350	40 %	20 %	40 %	0 %	452854207
2485	NC_020410	TGA	2	6	153404	153409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854207
2486	NC_020410	GTT	2	6	153529	153534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452854207
2487	NC_020410	GCT	2	6	153537	153542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854207
2488	NC_020410	CG	3	6	153571	153576	0 %	0 %	50 %	50 %	452854207
2489	NC_020410	TCA	2	6	153683	153688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854207
2490	NC_020410	AAG	2	6	153717	153722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854207
2491	NC_020410	ATTT	2	8	153773	153780	25 %	75 %	0 %	0 %	452854208
2492	NC_020410	ACGG	2	8	153856	153863	25 %	0 %	50 %	25 %	452854208
2493	NC_020410	TGC	2	6	153909	153914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854208
2494	NC_020410	TCAT	2	8	153923	153930	25 %	50 %	0 %	25 %	452854208
2495	NC_020410	CTG	2	6	153985	153990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854208
2496	NC_020410	TGA	2	6	153993	153998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854208
2497	NC_020410	CAG	2	6	154013	154018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854208
2498	NC_020410	GAT	2	6	154027	154032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854208
2499	NC_020410	TA	3	6	154082	154087	50 %	50 %	0 %	0 %	452854208
2500	NC_020410	TCG	2	6	154181	154186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854208

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