MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum UCMB5036 complete genome

Total Repeats: 72176

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_020410	CAAA	2	8	89933	89940	75 %	0 %	0 %	25 %	452854145
1502	NC_020410	GCA	2	6	89953	89958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854145
1503	NC_020410	ATC	2	6	89961	89966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854145
1504	NC_020410	GAG	2	6	90040	90045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452854145
1505	NC_020410	GC	3	6	90051	90056	0 %	0 %	50 %	50 %	452854145
1506	NC_020410	TCA	2	6	90061	90066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854145
1507	NC_020410	CGG	2	6	90140	90145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854145
1508	NC_020410	GAT	2	6	90221	90226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854145
1509	NC_020410	CAC	2	6	90317	90322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452854145
1510	NC_020410	AAG	2	6	90394	90399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854145
1511	NC_020410	GAA	2	6	90435	90440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854145
1512	NC_020410	GC	3	6	90441	90446	0 %	0 %	50 %	50 %	452854145
1513	NC_020410	ATC	2	6	90501	90506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854145
1514	NC_020410	TTC	2	6	90513	90518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854145
1515	NC_020410	A	6	6	90523	90528	100 %	0 %	0 %	0 %	452854145
1516	NC_020410	GAA	2	6	90531	90536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854145
1517	NC_020410	ATTT	2	8	90554	90561	25 %	75 %	0 %	0 %	452854145
1518	NC_020410	GGA	2	6	90605	90610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452854145
1519	NC_020410	TCG	2	6	90643	90648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854145
1520	NC_020410	AGA	2	6	90731	90736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854145
1521	NC_020410	ATG	2	6	90756	90761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854145
1522	NC_020410	GCC	2	6	90797	90802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854145
1523	NC_020410	GTATCG	2	12	90817	90828	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	452854145
1524	NC_020410	TAT	2	6	90877	90882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452854145
1525	NC_020410	TAA	2	6	90903	90908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452854145
1526	NC_020410	ATA	2	6	102231	102236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452854146
1527	NC_020410	CAT	2	6	102244	102249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854146
1528	NC_020410	TTCC	2	8	102339	102346	0 %	50 %	0 %	50 %	452854146
1529	NC_020410	AAAT	2	8	102348	102355	75 %	25 %	0 %	0 %	452854146
1530	NC_020410	TCA	2	6	102360	102365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854146
1531	NC_020410	AT	3	6	102391	102396	50 %	50 %	0 %	0 %	452854146
1532	NC_020410	GGC	2	6	102416	102421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854146
1533	NC_020410	TAT	2	6	102433	102438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452854146
1534	NC_020410	GTC	2	6	102461	102466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854146
1535	NC_020410	TCA	2	6	102468	102473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854146
1536	NC_020410	ATA	2	6	102474	102479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452854146
1537	NC_020410	TGA	2	6	102520	102525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854146
1538	NC_020410	ATT	2	6	102527	102532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452854146
1539	NC_020410	ATG	2	6	102578	102583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854146
1540	NC_020410	TA	3	6	102609	102614	50 %	50 %	0 %	0 %	452854146
1541	NC_020410	ATG	2	6	102650	102655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854146
1542	NC_020410	CAG	2	6	102966	102971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854147
1543	NC_020410	A	7	7	103136	103142	100 %	0 %	0 %	0 %	452854147
1544	NC_020410	AGC	2	6	103181	103186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854147
1545	NC_020410	CAG	2	6	103336	103341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854148
1546	NC_020410	GAA	2	6	103400	103405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854148
1547	NC_020410	CATC	2	8	103410	103417	25 %	25 %	0 %	50 %	452854148
1548	NC_020410	GGC	2	6	103568	103573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854148
1549	NC_020410	GAA	2	6	103592	103597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854148
1550	NC_020410	GAA	2	6	103616	103621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854148
1551	NC_020410	GCG	2	6	103679	103684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854148
1552	NC_020410	TGA	2	6	103693	103698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854148
1553	NC_020410	GAG	2	6	103706	103711	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452854148
1554	NC_020410	GA	3	6	103731	103736	50 %	0 %	50 %	0 %	452854148
1555	NC_020410	AG	3	6	103737	103742	50 %	0 %	50 %	0 %	452854148
1556	NC_020410	GGGAC	2	10	103772	103781	20 %	0 %	60 %	20 %	452854148
1557	NC_020410	ATG	2	6	103796	103801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854148
1558	NC_020410	GTT	2	6	103871	103876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452854148
1559	NC_020410	TCAAA	2	10	103928	103937	60 %	20 %	0 %	20 %	452854148
1560	NC_020410	GAT	2	6	103970	103975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854148
1561	NC_020410	GGA	2	6	104056	104061	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452854148
1562	NC_020410	ATC	2	6	104165	104170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854148
1563	NC_020410	TGA	2	6	104202	104207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854148
1564	NC_020410	CGAA	2	8	104259	104266	50 %	0 %	25 %	25 %	452854148
1565	NC_020410	AGA	2	6	104276	104281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854148
1566	NC_020410	AGG	2	6	104331	104336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452854148
1567	NC_020410	ATG	2	6	104347	104352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854148
1568	NC_020410	TGGCAC	2	12	104387	104398	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	452854149
1569	NC_020410	GAA	2	6	104401	104406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854149
1570	NC_020410	TTA	2	6	104449	104454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452854149
1571	NC_020410	ACTCGG	2	12	104502	104513	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	452854149
1572	NC_020410	AGAA	2	8	104528	104535	75 %	0 %	25 %	0 %	452854149
1573	NC_020410	A	7	7	104598	104604	100 %	0 %	0 %	0 %	452854149
1574	NC_020410	GAACA	2	10	104657	104666	60 %	0 %	20 %	20 %	452854149
1575	NC_020410	GCG	2	6	104704	104709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854149
1576	NC_020410	AAT	2	6	104719	104724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452854149
1577	NC_020410	TGC	2	6	104759	104764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854149
1578	NC_020410	TCT	2	6	104791	104796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854149
1579	NC_020410	GAAG	2	8	104868	104875	50 %	0 %	50 %	0 %	452854149
1580	NC_020410	GAA	2	6	104946	104951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854149
1581	NC_020410	CAG	2	6	105013	105018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854149
1582	NC_020410	ATC	2	6	105019	105024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854149
1583	NC_020410	AAT	2	6	105025	105030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452854149
1584	NC_020410	A	6	6	105130	105135	100 %	0 %	0 %	0 %	452854149
1585	NC_020410	ATT	2	6	105166	105171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452854149
1586	NC_020410	G	6	6	105207	105212	0 %	0 %	100 %	0 %	452854149
1587	NC_020410	TGA	2	6	105297	105302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854149
1588	NC_020410	AT	3	6	105312	105317	50 %	50 %	0 %	0 %	452854149
1589	NC_020410	GCG	2	6	105463	105468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854149
1590	NC_020410	CTTC	2	8	105501	105508	0 %	50 %	0 %	50 %	452854149
1591	NC_020410	CGAT	2	8	105518	105525	25 %	25 %	25 %	25 %	452854149
1592	NC_020410	TGA	2	6	105531	105536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854149
1593	NC_020410	GCT	2	6	105631	105636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854149
1594	NC_020410	AGC	2	6	105683	105688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854149
1595	NC_020410	GA	3	6	105693	105698	50 %	0 %	50 %	0 %	452854149
1596	NC_020410	A	7	7	105715	105721	100 %	0 %	0 %	0 %	452854149
1597	NC_020410	GAAA	2	8	105726	105733	75 %	0 %	25 %	0 %	452854149
1598	NC_020410	TTCA	2	8	105963	105970	25 %	50 %	0 %	25 %	452854149
1599	NC_020410	TGA	2	6	106038	106043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854149
1600	NC_020410	GAT	2	6	106050	106055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854149
1601	NC_020410	TCC	2	6	106113	106118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452854149
1602	NC_020410	ATG	2	6	106133	106138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854149
1603	NC_020410	GGC	2	6	106141	106146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854149
1604	NC_020410	GAA	2	6	106166	106171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854149
1605	NC_020410	TGA	2	6	106194	106199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854149
1606	NC_020410	GACG	2	8	106252	106259	25 %	0 %	50 %	25 %	452854149
1607	NC_020410	GAGC	3	12	106328	106339	25 %	0 %	50 %	25 %	452854149
1608	NC_020410	CAA	2	6	106347	106352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452854149
1609	NC_020410	A	6	6	106492	106497	100 %	0 %	0 %	0 %	452854149
1610	NC_020410	TC	3	6	106560	106565	0 %	50 %	0 %	50 %	452854149
1611	NC_020410	TGC	2	6	106581	106586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854149
1612	NC_020410	AGA	2	6	106602	106607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854149
1613	NC_020410	AAG	2	6	106641	106646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854149
1614	NC_020410	GGA	2	6	106665	106670	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452854149
1615	NC_020410	AGA	2	6	106680	106685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854149
1616	NC_020410	CTC	2	6	106687	106692	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452854149
1617	NC_020410	AAC	2	6	106758	106763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452854149
1618	NC_020410	ATGG	2	8	106929	106936	25 %	25 %	50 %	0 %	452854150
1619	NC_020410	TGG	2	6	106970	106975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452854150
1620	NC_020410	A	7	7	106986	106992	100 %	0 %	0 %	0 %	452854150
1621	NC_020410	CGG	2	6	107005	107010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854150
1622	NC_020410	AGA	2	6	107076	107081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854150
1623	NC_020410	CAAA	2	8	107092	107099	75 %	0 %	0 %	25 %	452854150
1624	NC_020410	GAA	2	6	107104	107109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854150
1625	NC_020410	GGC	3	9	107125	107133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854150
1626	NC_020410	CGG	2	6	107160	107165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854150
1627	NC_020410	CGGC	2	8	107225	107232	0 %	0 %	50 %	50 %	452854150
1628	NC_020410	GAA	2	6	107254	107259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854150
1629	NC_020410	GC	3	6	107280	107285	0 %	0 %	50 %	50 %	452854150
1630	NC_020410	TGT	2	6	107382	107387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452854150
1631	NC_020410	TGA	2	6	107474	107479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854150
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1633	NC_020410	TCG	2	6	107513	107518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854150
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1635	NC_020410	A	6	6	107634	107639	100 %	0 %	0 %	0 %	452854150
1636	NC_020410	AAATG	2	10	107655	107664	60 %	20 %	20 %	0 %	452854150
1637	NC_020410	GGAA	2	8	107775	107782	50 %	0 %	50 %	0 %	452854150
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1639	NC_020410	GGGT	2	8	107906	107913	0 %	25 %	75 %	0 %	452854150
1640	NC_020410	CGG	2	6	107952	107957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854150
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1642	NC_020410	CCG	2	6	108028	108033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854150
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1652	NC_020410	CGG	2	6	108593	108598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854151
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1672	NC_020410	A	6	6	109285	109290	100 %	0 %	0 %	0 %	452854151
1673	NC_020410	TA	3	6	109318	109323	50 %	50 %	0 %	0 %	452854151
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1728	NC_020410	CGA	3	9	111650	111658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854154
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1730	NC_020410	TATT	2	8	111908	111915	25 %	75 %	0 %	0 %	452854155
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1734	NC_020410	GCTT	2	8	112132	112139	0 %	50 %	25 %	25 %	452854155
1735	NC_020410	GAA	3	9	112157	112165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854155
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1738	NC_020410	A	6	6	112574	112579	100 %	0 %	0 %	0 %	452854155
1739	NC_020410	TGA	2	6	112591	112596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854155
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1742	NC_020410	GAA	2	6	112694	112699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854155
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1744	NC_020410	GAG	2	6	112895	112900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452854155
1745	NC_020410	AATT	2	8	112917	112924	50 %	50 %	0 %	0 %	452854155
1746	NC_020410	CTGA	2	8	112970	112977	25 %	25 %	25 %	25 %	452854155
1747	NC_020410	TGC	2	6	113065	113070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854155
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1749	NC_020410	TCAA	2	8	113117	113124	50 %	25 %	0 %	25 %	452854155
1750	NC_020410	AGAA	2	8	113133	113140	75 %	0 %	25 %	0 %	452854155
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1859	NC_020410	CTT	2	6	118958	118963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854163
1860	NC_020410	GCATGG	2	12	118992	119003	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	452854163
1861	NC_020410	TGAAT	2	10	119029	119038	40 %	40 %	20 %	0 %	452854163
1862	NC_020410	GATT	2	8	119095	119102	25 %	50 %	25 %	0 %	452854163
1863	NC_020410	A	6	6	119365	119370	100 %	0 %	0 %	0 %	452854164
1864	NC_020410	GTA	2	6	119371	119376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854164
1865	NC_020410	CTG	2	6	119399	119404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854164
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1867	NC_020410	CATTTA	2	12	119552	119563	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	452854164
1868	NC_020410	CTG	2	6	119579	119584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854164
1869	NC_020410	A	6	6	119596	119601	100 %	0 %	0 %	0 %	452854164
1870	NC_020410	TCTGGT	2	12	119617	119628	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	452854164
1871	NC_020410	TAA	2	6	119640	119645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452854164
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1875	NC_020410	GAAGCT	2	12	120134	120145	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	452854165
1876	NC_020410	ATG	2	6	120236	120241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854165
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1923	NC_020410	A	6	6	122332	122337	100 %	0 %	0 %	0 %	452854168
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1988	NC_020410	GAA	2	6	125699	125704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854169
1989	NC_020410	TGA	2	6	125818	125823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854169
1990	NC_020410	GCA	2	6	125866	125871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854169
1991	NC_020410	CGG	2	6	125878	125883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854169
1992	NC_020410	CGG	2	6	125896	125901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854169
1993	NC_020410	GAA	3	9	126131	126139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854169
1994	NC_020410	GA	3	6	126148	126153	50 %	0 %	50 %	0 %	452854169
1995	NC_020410	AGA	2	6	126157	126162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854169
1996	NC_020410	TGA	2	6	126205	126210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854169
1997	NC_020410	GAA	2	6	126218	126223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854169
1998	NC_020410	GTGAA	2	10	126407	126416	40 %	20 %	40 %	0 %	452854170
1999	NC_020410	CGT	2	6	126592	126597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854170
2000	NC_020410	GA	3	6	126598	126603	50 %	0 %	50 %	0 %	452854170

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