MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum UCMB5036 complete genome

Total Repeats: 72176

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_020410	AATA	2	8	64579	64586	75 %	25 %	0 %	0 %	452854118
1003	NC_020410	CGGC	2	8	64587	64594	0 %	0 %	50 %	50 %	452854118
1004	NC_020410	GAA	2	6	64710	64715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854118
1005	NC_020410	CGT	2	6	64895	64900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854119
1006	NC_020410	TGA	2	6	64903	64908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854119
1007	NC_020410	GTC	2	6	64919	64924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854119
1008	NC_020410	A	6	6	65012	65017	100 %	0 %	0 %	0 %	452854119
1009	NC_020410	A	6	6	65141	65146	100 %	0 %	0 %	0 %	452854119
1010	NC_020410	A	6	6	65181	65186	100 %	0 %	0 %	0 %	452854119
1011	NC_020410	ACG	2	6	65217	65222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854119
1012	NC_020410	TGA	2	6	65251	65256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854119
1013	NC_020410	T	6	6	65383	65388	0 %	100 %	0 %	0 %	452854119
1014	NC_020410	TCG	2	6	65634	65639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854120
1015	NC_020410	CAG	2	6	65726	65731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854120
1016	NC_020410	ATC	2	6	65786	65791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854120
1017	NC_020410	A	6	6	65826	65831	100 %	0 %	0 %	0 %	452854120
1018	NC_020410	CGG	2	6	65859	65864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854120
1019	NC_020410	CGGCG	2	10	65896	65905	0 %	0 %	60 %	40 %	452854120
1020	NC_020410	CGCC	2	8	65929	65936	0 %	0 %	25 %	75 %	452854120
1021	NC_020410	CGG	2	6	65988	65993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854120
1022	NC_020410	ATGAT	2	10	66021	66030	40 %	40 %	20 %	0 %	452854120
1023	NC_020410	CTT	2	6	66062	66067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854120
1024	NC_020410	AGC	2	6	66110	66115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854120
1025	NC_020410	CGG	2	6	66129	66134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854120
1026	NC_020410	GGC	2	6	66142	66147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854120
1027	NC_020410	GAA	2	6	66212	66217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854120
1028	NC_020410	AAAG	2	8	66220	66227	75 %	0 %	25 %	0 %	452854120
1029	NC_020410	A	6	6	66259	66264	100 %	0 %	0 %	0 %	452854120
1030	NC_020410	GCT	3	9	66265	66273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854120
1031	NC_020410	CAG	2	6	66295	66300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854120
1032	NC_020410	GCT	2	6	66349	66354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854120
1033	NC_020410	GACGG	2	10	66359	66368	20 %	0 %	60 %	20 %	452854120
1034	NC_020410	TGC	2	6	66376	66381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854120
1035	NC_020410	AT	3	6	66398	66403	50 %	50 %	0 %	0 %	452854120
1036	NC_020410	CGC	2	6	66454	66459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854120
1037	NC_020410	TTCC	2	8	66468	66475	0 %	50 %	0 %	50 %	452854120
1038	NC_020410	T	6	6	66579	66584	0 %	100 %	0 %	0 %	452854120
1039	NC_020410	TATC	2	8	66657	66664	25 %	50 %	0 %	25 %	452854120
1040	NC_020410	T	6	6	66665	66670	0 %	100 %	0 %	0 %	452854120
1041	NC_020410	CCG	2	6	66729	66734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854120
1042	NC_020410	TGGT	2	8	66779	66786	0 %	50 %	50 %	0 %	452854120
1043	NC_020410	GGC	2	6	66896	66901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854120
1044	NC_020410	CTG	2	6	66929	66934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854120
1045	NC_020410	TCT	2	6	66939	66944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854120
1046	NC_020410	CAG	2	6	66988	66993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854120
1047	NC_020410	GTCT	2	8	67014	67021	0 %	50 %	25 %	25 %	452854120
1048	NC_020410	GTCA	2	8	67024	67031	25 %	25 %	25 %	25 %	452854120
1049	NC_020410	TTTA	2	8	67046	67053	25 %	75 %	0 %	0 %	452854120
1050	NC_020410	CCTT	2	8	67099	67106	0 %	50 %	0 %	50 %	452854120
1051	NC_020410	GA	3	6	67138	67143	50 %	0 %	50 %	0 %	452854120
1052	NC_020410	GTC	2	6	67167	67172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854121
1053	NC_020410	GCT	2	6	67220	67225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854121
1054	NC_020410	TA	4	8	67243	67250	50 %	50 %	0 %	0 %	452854121
1055	NC_020410	ACC	2	6	67261	67266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452854121
1056	NC_020410	TGA	2	6	67316	67321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854121
1057	NC_020410	AAG	2	6	67396	67401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854121
1058	NC_020410	GTC	2	6	67404	67409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854121
1059	NC_020410	GAA	2	6	67473	67478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854121
1060	NC_020410	ATC	2	6	67623	67628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854121
1061	NC_020410	GAC	2	6	67692	67697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854121
1062	NC_020410	TTTG	2	8	67757	67764	0 %	75 %	25 %	0 %	452854121
1063	NC_020410	AAAT	2	8	67783	67790	75 %	25 %	0 %	0 %	452854121
1064	NC_020410	CCG	2	6	67812	67817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854121
1065	NC_020410	A	6	6	67821	67826	100 %	0 %	0 %	0 %	452854121
1066	NC_020410	GAA	2	6	67827	67832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854121
1067	NC_020410	TAT	2	6	67865	67870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452854121
1068	NC_020410	AC	3	6	67917	67922	50 %	0 %	0 %	50 %	452854121
1069	NC_020410	AGA	2	6	68003	68008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854121
1070	NC_020410	TGC	2	6	68035	68040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854121
1071	NC_020410	TGA	2	6	68078	68083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854121
1072	NC_020410	TCA	2	6	68086	68091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854121
1073	NC_020410	ATG	2	6	68161	68166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854121
1074	NC_020410	TCG	2	6	68167	68172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854121
1075	NC_020410	GAA	2	6	68181	68186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854121
1076	NC_020410	ACA	2	6	68208	68213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452854121
1077	NC_020410	GCC	2	6	68265	68270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854121
1078	NC_020410	A	6	6	68280	68285	100 %	0 %	0 %	0 %	452854121
1079	NC_020410	GCC	2	6	68286	68291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854121
1080	NC_020410	AT	3	6	68323	68328	50 %	50 %	0 %	0 %	452854121
1081	NC_020410	CCG	2	6	68374	68379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854121
1082	NC_020410	CAG	2	6	68383	68388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854121
1083	NC_020410	GCA	2	6	68535	68540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854121
1084	NC_020410	GGAGA	2	10	68609	68618	40 %	0 %	60 %	0 %	452854121
1085	NC_020410	ATTA	2	8	68658	68665	50 %	50 %	0 %	0 %	452854122
1086	NC_020410	CGC	2	6	68668	68673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854122
1087	NC_020410	TGA	2	6	68757	68762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854122
1088	NC_020410	GAAA	2	8	68814	68821	75 %	0 %	25 %	0 %	452854122
1089	NC_020410	A	6	6	68827	68832	100 %	0 %	0 %	0 %	452854122
1090	NC_020410	GAA	2	6	68833	68838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854122
1091	NC_020410	AGA	2	6	68865	68870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854122
1092	NC_020410	TTC	3	9	68991	68999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854123
1093	NC_020410	ATG	2	6	69014	69019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854123
1094	NC_020410	AGC	2	6	69218	69223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854123
1095	NC_020410	T	6	6	69244	69249	0 %	100 %	0 %	0 %	452854123
1096	NC_020410	GTT	2	6	69255	69260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452854123
1097	NC_020410	ACC	2	6	69273	69278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452854124
1098	NC_020410	ATAC	2	8	69337	69344	50 %	25 %	0 %	25 %	452854124
1099	NC_020410	ATTC	2	8	69386	69393	25 %	50 %	0 %	25 %	452854124
1100	NC_020410	CTG	2	6	69423	69428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854124
1101	NC_020410	TGC	2	6	69439	69444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854124
1102	NC_020410	TGAA	2	8	69451	69458	50 %	25 %	25 %	0 %	452854124
1103	NC_020410	TA	3	6	69534	69539	50 %	50 %	0 %	0 %	452854124
1104	NC_020410	A	6	6	69590	69595	100 %	0 %	0 %	0 %	452854124
1105	NC_020410	TCCG	2	8	69616	69623	0 %	25 %	25 %	50 %	452854124
1106	NC_020410	GCT	2	6	69641	69646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854124
1107	NC_020410	GTT	2	6	69663	69668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452854124
1108	NC_020410	T	6	6	69696	69701	0 %	100 %	0 %	0 %	452854124
1109	NC_020410	ATT	2	6	69764	69769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452854124
1110	NC_020410	CTT	2	6	69774	69779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854124
1111	NC_020410	A	6	6	69817	69822	100 %	0 %	0 %	0 %	452854124
1112	NC_020410	AGG	2	6	69901	69906	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452854125
1113	NC_020410	ATCT	2	8	69921	69928	25 %	50 %	0 %	25 %	452854125
1114	NC_020410	AAG	2	6	70000	70005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854125
1115	NC_020410	TGT	2	6	70050	70055	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452854125
1116	NC_020410	GAA	2	6	70115	70120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854125
1117	NC_020410	AGA	2	6	70229	70234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854125
1118	NC_020410	AGA	2	6	70281	70286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854125
1119	NC_020410	GCA	2	6	70391	70396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854126
1120	NC_020410	TTG	2	6	70439	70444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452854126
1121	NC_020410	TCA	2	6	70553	70558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854126
1122	NC_020410	A	6	6	70594	70599	100 %	0 %	0 %	0 %	452854126
1123	NC_020410	TCCG	2	8	70637	70644	0 %	25 %	25 %	50 %	452854126
1124	NC_020410	ATC	2	6	70701	70706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854126
1125	NC_020410	AAG	2	6	70749	70754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854126
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1127	NC_020410	T	6	6	71353	71358	0 %	100 %	0 %	0 %	452854127
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1251	NC_020410	TGTT	2	8	76619	76626	0 %	75 %	25 %	0 %	452854130
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