MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum UCMB5036 complete genome

Total Repeats: 72176

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020410	GAA	2	6	38122	38127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854089
502	NC_020410	GCA	2	6	38179	38184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854089
503	NC_020410	GGC	2	6	38188	38193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854089
504	NC_020410	TGC	2	6	38211	38216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854089
505	NC_020410	TTG	2	6	38280	38285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452854089
506	NC_020410	A	6	6	38300	38305	100 %	0 %	0 %	0 %	452854089
507	NC_020410	GAA	2	6	38333	38338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854089
508	NC_020410	AAG	3	9	38352	38360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854089
509	NC_020410	GAG	3	9	38384	38392	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452854089
510	NC_020410	A	6	6	38416	38421	100 %	0 %	0 %	0 %	452854089
511	NC_020410	GCT	2	6	38425	38430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854089
512	NC_020410	CCGG	2	8	38442	38449	0 %	0 %	50 %	50 %	452854089
513	NC_020410	AC	3	6	38543	38548	50 %	0 %	0 %	50 %	452854090
514	NC_020410	TA	3	6	38552	38557	50 %	50 %	0 %	0 %	452854090
515	NC_020410	TGA	2	6	38564	38569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854090
516	NC_020410	T	6	6	38629	38634	0 %	100 %	0 %	0 %	452854090
517	NC_020410	TGA	2	6	38697	38702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854090
518	NC_020410	TTTC	2	8	38775	38782	0 %	75 %	0 %	25 %	452854090
519	NC_020410	CCG	2	6	38798	38803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854090
520	NC_020410	GAT	2	6	38814	38819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854090
521	NC_020410	TG	4	8	38826	38833	0 %	50 %	50 %	0 %	452854090
522	NC_020410	CATG	2	8	38943	38950	25 %	25 %	25 %	25 %	452854090
523	NC_020410	TAC	2	6	39037	39042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854090
524	NC_020410	CGC	2	6	39048	39053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854090
525	NC_020410	TGG	2	6	39104	39109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452854090
526	NC_020410	GGCC	2	8	39139	39146	0 %	0 %	50 %	50 %	452854090
527	NC_020410	TCA	2	6	39157	39162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854090
528	NC_020410	GTT	2	6	39184	39189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452854090
529	NC_020410	TTA	2	6	39276	39281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452854090
530	NC_020410	AGC	3	9	39298	39306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854090
531	NC_020410	GC	4	8	39340	39347	0 %	0 %	50 %	50 %	452854090
532	NC_020410	TCT	2	6	39433	39438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854090
533	NC_020410	AAT	2	6	39444	39449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452854090
534	NC_020410	GCGG	2	8	39471	39478	0 %	0 %	75 %	25 %	452854090
535	NC_020410	TTC	2	6	39494	39499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854090
536	NC_020410	TTG	2	6	39557	39562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452854090
537	NC_020410	GCTG	2	8	39567	39574	0 %	25 %	50 %	25 %	452854090
538	NC_020410	GGC	2	6	39607	39612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854090
539	NC_020410	CGG	2	6	39613	39618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854090
540	NC_020410	CAG	2	6	39649	39654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854090
541	NC_020410	ATAA	2	8	39775	39782	75 %	25 %	0 %	0 %	452854090
542	NC_020410	GGC	2	6	39783	39788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854090
543	NC_020410	ATT	2	6	39811	39816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452854090
544	NC_020410	CCG	2	6	39823	39828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854090
545	NC_020410	AGA	2	6	39864	39869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854090
546	NC_020410	TA	3	6	39949	39954	50 %	50 %	0 %	0 %	452854090
547	NC_020410	TTTA	2	8	39977	39984	25 %	75 %	0 %	0 %	452854091
548	NC_020410	GGC	2	6	40089	40094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854091
549	NC_020410	TAAA	2	8	40129	40136	75 %	25 %	0 %	0 %	452854091
550	NC_020410	GATG	2	8	40148	40155	25 %	25 %	50 %	0 %	452854091
551	NC_020410	GCT	2	6	40169	40174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854091
552	NC_020410	GCG	2	6	40182	40187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854091
553	NC_020410	AGA	2	6	40188	40193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854091
554	NC_020410	AAG	2	6	40228	40233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854091
555	NC_020410	TGTGC	2	10	40241	40250	0 %	40 %	40 %	20 %	452854091
556	NC_020410	TGA	2	6	40307	40312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854091
557	NC_020410	TTCT	2	8	40315	40322	0 %	75 %	0 %	25 %	452854091
558	NC_020410	GAA	2	6	40386	40391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854091
559	NC_020410	AG	3	6	40422	40427	50 %	0 %	50 %	0 %	452854091
560	NC_020410	AAG	2	6	40539	40544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854091
561	NC_020410	A	7	7	40590	40596	100 %	0 %	0 %	0 %	452854091
562	NC_020410	GTG	2	6	40696	40701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452854092
563	NC_020410	ACA	2	6	40771	40776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452854092
564	NC_020410	ACG	2	6	40801	40806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854092
565	NC_020410	GAT	2	6	40884	40889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854092
566	NC_020410	CGG	2	6	40956	40961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854092
567	NC_020410	TCC	2	6	40976	40981	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452854092
568	NC_020410	TCA	2	6	40995	41000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854092
569	NC_020410	AAAT	2	8	41024	41031	75 %	25 %	0 %	0 %	452854093
570	NC_020410	AGC	3	9	41060	41068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854093
571	NC_020410	AGC	2	6	41125	41130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854093
572	NC_020410	AGC	2	6	41314	41319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854093
573	NC_020410	GAAA	2	8	41337	41344	75 %	0 %	25 %	0 %	452854093
574	NC_020410	AGA	2	6	41370	41375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854093
575	NC_020410	AG	3	6	41459	41464	50 %	0 %	50 %	0 %	452854093
576	NC_020410	GGAA	2	8	41485	41492	50 %	0 %	50 %	0 %	452854094
577	NC_020410	GCA	2	6	41501	41506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854094
578	NC_020410	GAAAA	2	10	41541	41550	80 %	0 %	20 %	0 %	452854094
579	NC_020410	TTTG	2	8	41567	41574	0 %	75 %	25 %	0 %	452854094
580	NC_020410	A	6	6	41580	41585	100 %	0 %	0 %	0 %	452854094
581	NC_020410	T	7	7	41628	41634	0 %	100 %	0 %	0 %	452854094
582	NC_020410	GAC	2	6	41837	41842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854094
583	NC_020410	CTG	2	6	41859	41864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854094
584	NC_020410	TTA	2	6	41905	41910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452854094
585	NC_020410	AGC	2	6	41914	41919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854094
586	NC_020410	AGA	2	6	41993	41998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854094
587	NC_020410	ATA	2	6	42058	42063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452854094
588	NC_020410	ATG	2	6	42091	42096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854094
589	NC_020410	TTCA	2	8	42171	42178	25 %	50 %	0 %	25 %	452854094
590	NC_020410	A	6	6	42205	42210	100 %	0 %	0 %	0 %	452854094
591	NC_020410	TAT	2	6	42259	42264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452854094
592	NC_020410	CAAT	2	8	42312	42319	50 %	25 %	0 %	25 %	452854094
593	NC_020410	ACA	2	6	42344	42349	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452854094
594	NC_020410	A	7	7	42386	42392	100 %	0 %	0 %	0 %	452854094
595	NC_020410	AGG	2	6	42451	42456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452854094
596	NC_020410	A	6	6	42491	42496	100 %	0 %	0 %	0 %	452854095
597	NC_020410	TAT	2	6	42509	42514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452854095
598	NC_020410	TTG	2	6	42558	42563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452854095
599	NC_020410	ATG	2	6	42624	42629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854095
600	NC_020410	TGA	2	6	42664	42669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854095
601	NC_020410	TCT	2	6	42676	42681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854095
602	NC_020410	AGA	2	6	42688	42693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854095
603	NC_020410	AAAC	2	8	42694	42701	75 %	0 %	0 %	25 %	452854095
604	NC_020410	AGG	2	6	42702	42707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452854095
605	NC_020410	A	6	6	42734	42739	100 %	0 %	0 %	0 %	452854095
606	NC_020410	T	6	6	42807	42812	0 %	100 %	0 %	0 %	452854095
607	NC_020410	CAG	2	6	42819	42824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854095
608	NC_020410	ACGG	2	8	42825	42832	25 %	0 %	50 %	25 %	452854095
609	NC_020410	CGG	2	6	42928	42933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854095
610	NC_020410	TGC	2	6	42959	42964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854095
611	NC_020410	ATG	2	6	43089	43094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854095
612	NC_020410	ACG	2	6	43142	43147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854095
613	NC_020410	GAA	2	6	43210	43215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854095
614	NC_020410	CGT	2	6	43264	43269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854095
615	NC_020410	A	6	6	43312	43317	100 %	0 %	0 %	0 %	452854096
616	NC_020410	GGA	2	6	43344	43349	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452854096
617	NC_020410	AGC	2	6	43388	43393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854096
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619	NC_020410	AGAA	2	8	43502	43509	75 %	0 %	25 %	0 %	452854096
620	NC_020410	GCAGA	2	10	43525	43534	40 %	0 %	40 %	20 %	452854096
621	NC_020410	AAG	2	6	43577	43582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854096
622	NC_020410	T	6	6	43634	43639	0 %	100 %	0 %	0 %	452854096
623	NC_020410	CTT	2	6	43647	43652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854096
624	NC_020410	A	6	6	43657	43662	100 %	0 %	0 %	0 %	452854096
625	NC_020410	TGA	3	9	43740	43748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854097
626	NC_020410	TTA	2	6	43762	43767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452854097
627	NC_020410	TGC	2	6	43826	43831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854097
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629	NC_020410	GAT	2	6	44029	44034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854097
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757	NC_020410	AAG	2	6	50245	50250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854103
758	NC_020410	TGT	2	6	50273	50278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452854103
759	NC_020410	AAG	2	6	50293	50298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854103
760	NC_020410	AGA	2	6	50318	50323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854103
761	NC_020410	A	6	6	50332	50337	100 %	0 %	0 %	0 %	452854103
762	NC_020410	AGC	2	6	50389	50394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854103
763	NC_020410	TCT	2	6	50415	50420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854103
764	NC_020410	GAAA	2	8	50695	50702	75 %	0 %	25 %	0 %	452854103
765	NC_020410	AATT	2	8	50724	50731	50 %	50 %	0 %	0 %	452854103
766	NC_020410	ATT	2	6	50879	50884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452854104
767	NC_020410	GC	3	6	50909	50914	0 %	0 %	50 %	50 %	452854104
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770	NC_020410	CGC	2	6	51281	51286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854104
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772	NC_020410	AGC	2	6	51330	51335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854104
773	NC_020410	TCAAA	2	10	51358	51367	60 %	20 %	0 %	20 %	452854104
774	NC_020410	AGG	2	6	51405	51410	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452854104
775	NC_020410	AT	3	6	51523	51528	50 %	50 %	0 %	0 %	452854105
776	NC_020410	GC	3	6	51598	51603	0 %	0 %	50 %	50 %	452854105
777	NC_020410	AGC	2	6	51610	51615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854105
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780	NC_020410	TCAT	2	8	51712	51719	25 %	50 %	0 %	25 %	452854105
781	NC_020410	TGA	2	6	51776	51781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854105
782	NC_020410	GAC	2	6	51815	51820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854105
783	NC_020410	ATC	2	6	51825	51830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854105
784	NC_020410	GAA	2	6	51843	51848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854105
785	NC_020410	TGC	2	6	51877	51882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854105
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787	NC_020410	CGG	2	6	52060	52065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854105
788	NC_020410	TTC	2	6	52089	52094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854105
789	NC_020410	AAGC	2	8	52105	52112	50 %	0 %	25 %	25 %	452854105
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791	NC_020410	A	6	6	52176	52181	100 %	0 %	0 %	0 %	452854105
792	NC_020410	GAA	2	6	52191	52196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854105
793	NC_020410	TTC	2	6	52198	52203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854105
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798	NC_020410	GAAA	2	8	52661	52668	75 %	0 %	25 %	0 %	452854106
799	NC_020410	ATGA	2	8	52684	52691	50 %	25 %	25 %	0 %	452854106
800	NC_020410	TC	3	6	52693	52698	0 %	50 %	0 %	50 %	452854106
801	NC_020410	GCT	2	6	52701	52706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854106
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810	NC_020410	GA	4	8	53271	53278	50 %	0 %	50 %	0 %	452854106
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884	NC_020410	AAGCA	2	10	58226	58235	60 %	0 %	20 %	20 %	452854113
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886	NC_020410	GAA	2	6	58319	58324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854113
887	NC_020410	TTGCCA	2	12	58459	58470	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	452854113
888	NC_020410	TAAA	2	8	58483	58490	75 %	25 %	0 %	0 %	452854113
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