MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum UCMB5036 complete genome

Total Repeats: 72176

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6002	NC_020410	GATACG	2	12	359609	359620	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	452854377
6003	NC_020410	TGC	2	6	359655	359660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854377
6004	NC_020410	CGG	2	6	359703	359708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854377
6005	NC_020410	A	7	7	359789	359795	100 %	0 %	0 %	0 %	452854377
6006	NC_020410	GAA	2	6	359867	359872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854377
6007	NC_020410	TCT	2	6	359987	359992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854377
6008	NC_020410	CAT	3	9	360002	360010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854377
6009	NC_020410	CCG	2	6	360109	360114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854377
6010	NC_020410	CTG	2	6	360188	360193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854377
6011	NC_020410	TGA	2	6	360223	360228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854377
6012	NC_020410	ACGG	2	8	360232	360239	25 %	0 %	50 %	25 %	452854377
6013	NC_020410	A	6	6	360291	360296	100 %	0 %	0 %	0 %	452854377
6014	NC_020410	CGG	2	6	360309	360314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854377
6015	NC_020410	GCGG	2	8	360317	360324	0 %	0 %	75 %	25 %	452854377
6016	NC_020410	TGA	2	6	360349	360354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854377
6017	NC_020410	ATG	2	6	360422	360427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854377
6018	NC_020410	AG	3	6	360514	360519	50 %	0 %	50 %	0 %	452854377
6019	NC_020410	CT	3	6	360529	360534	0 %	50 %	0 %	50 %	452854377
6020	NC_020410	GTC	2	6	360560	360565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854377
6021	NC_020410	GA	3	6	360569	360574	50 %	0 %	50 %	0 %	452854377
6022	NC_020410	GCC	2	6	360587	360592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854377
6023	NC_020410	AT	3	6	360688	360693	50 %	50 %	0 %	0 %	452854377
6024	NC_020410	AAC	2	6	360709	360714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452854377
6025	NC_020410	TGC	2	6	360813	360818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854377
6026	NC_020410	TCT	2	6	360821	360826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854377
6027	NC_020410	TTC	2	6	360864	360869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854377
6028	NC_020410	GGCG	2	8	360871	360878	0 %	0 %	75 %	25 %	452854377
6029	NC_020410	TA	3	6	360935	360940	50 %	50 %	0 %	0 %	452854377
6030	NC_020410	GTG	2	6	361046	361051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452854377
6031	NC_020410	CGG	2	6	361054	361059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854377
6032	NC_020410	ATC	2	6	361067	361072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854377
6033	NC_020410	TCA	2	6	361119	361124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854377
6034	NC_020410	ACG	2	6	361145	361150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854377
6035	NC_020410	CGGA	2	8	361165	361172	25 %	0 %	50 %	25 %	452854377
6036	NC_020410	AGC	2	6	361200	361205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854377
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6038	NC_020410	GC	3	6	361239	361244	0 %	0 %	50 %	50 %	452854377
6039	NC_020410	TCC	2	6	361273	361278	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452854377
6040	NC_020410	GCG	2	6	361287	361292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854377
6041	NC_020410	CGG	2	6	361350	361355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854377
6042	NC_020410	TC	3	6	361363	361368	0 %	50 %	0 %	50 %	452854377
6043	NC_020410	GTC	2	6	361412	361417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854377
6044	NC_020410	GAT	2	6	361460	361465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854377
6045	NC_020410	AGG	2	6	361539	361544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452854377
6046	NC_020410	GGA	2	6	361798	361803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452854377
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6049	NC_020410	CGG	2	6	361876	361881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854377
6050	NC_020410	ATG	2	6	361898	361903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854377
6051	NC_020410	CTC	2	6	361904	361909	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452854377
6052	NC_020410	AT	3	6	361990	361995	50 %	50 %	0 %	0 %	452854377
6053	NC_020410	GAT	2	6	362026	362031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854377
6054	NC_020410	ATC	2	6	362065	362070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854377
6055	NC_020410	CCGT	2	8	362132	362139	0 %	25 %	25 %	50 %	452854377
6056	NC_020410	TCT	2	6	362140	362145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854377
6057	NC_020410	GAT	2	6	362194	362199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854377
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6059	NC_020410	GCA	2	6	362254	362259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854377
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6061	NC_020410	GAG	2	6	362309	362314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452854377
6062	NC_020410	CATT	2	8	362337	362344	25 %	50 %	0 %	25 %	452854377
6063	NC_020410	TGAA	2	8	362397	362404	50 %	25 %	25 %	0 %	452854377
6064	NC_020410	CTG	4	12	362414	362425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854377
6065	NC_020410	CAT	2	6	362432	362437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854377
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6067	NC_020410	GCTC	2	8	362479	362486	0 %	25 %	25 %	50 %	452854377
6068	NC_020410	TGAAT	2	10	362626	362635	40 %	40 %	20 %	0 %	452854377
6069	NC_020410	CCGA	2	8	362639	362646	25 %	0 %	25 %	50 %	452854377
6070	NC_020410	CCG	2	6	362657	362662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854377
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6072	NC_020410	ATC	2	6	362740	362745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854377
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6078	NC_020410	GA	3	6	363028	363033	50 %	0 %	50 %	0 %	452854377
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6081	NC_020410	ACTGGA	2	12	363094	363105	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	452854377
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6085	NC_020410	AAGC	2	8	363275	363282	50 %	0 %	25 %	25 %	452854377
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6088	NC_020410	GAA	2	6	363413	363418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854377
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6091	NC_020410	CG	3	6	363508	363513	0 %	0 %	50 %	50 %	452854377
6092	NC_020410	GCG	2	6	363528	363533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854377
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6101	NC_020410	CCTC	2	8	364164	364171	0 %	25 %	0 %	75 %	452854377
6102	NC_020410	TCG	2	6	364182	364187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854377
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6104	NC_020410	GCGG	2	8	364204	364211	0 %	0 %	75 %	25 %	452854377
6105	NC_020410	ATC	2	6	364229	364234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854377
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6108	NC_020410	GCG	2	6	364275	364280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854377
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6111	NC_020410	CGGCGA	2	12	364348	364359	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	452854377
6112	NC_020410	GGCC	2	8	364399	364406	0 %	0 %	50 %	50 %	452854377
6113	NC_020410	GC	3	6	364415	364420	0 %	0 %	50 %	50 %	452854377
6114	NC_020410	GAA	3	9	364436	364444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854377
6115	NC_020410	ACCGG	2	10	364494	364503	20 %	0 %	40 %	40 %	452854377
6116	NC_020410	CAG	2	6	364559	364564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854377
6117	NC_020410	CAG	2	6	364703	364708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854377
6118	NC_020410	A	6	6	364823	364828	100 %	0 %	0 %	0 %	452854377
6119	NC_020410	GCT	2	6	364897	364902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854377
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6121	NC_020410	CGG	2	6	364969	364974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854377
6122	NC_020410	CGGA	2	8	365090	365097	25 %	0 %	50 %	25 %	452854377
6123	NC_020410	TGG	2	6	365244	365249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452854377
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6126	NC_020410	GAA	2	6	365306	365311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854377
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6131	NC_020410	ATC	2	6	365505	365510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854377
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6148	NC_020410	GGTT	2	8	365996	366003	0 %	50 %	50 %	0 %	452854377
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6152	NC_020410	GGC	2	6	366308	366313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854377
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6167	NC_020410	A	6	6	366960	366965	100 %	0 %	0 %	0 %	452854378
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6230	NC_020410	A	6	6	370011	370016	100 %	0 %	0 %	0 %	452854378
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6233	NC_020410	A	7	7	370131	370137	100 %	0 %	0 %	0 %	452854378
6234	NC_020410	GCC	2	6	370232	370237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854378
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6237	NC_020410	AAGG	2	8	370364	370371	50 %	0 %	50 %	0 %	452854378
6238	NC_020410	CAAAT	2	10	370574	370583	60 %	20 %	0 %	20 %	452854379
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6241	NC_020410	A	6	6	370783	370788	100 %	0 %	0 %	0 %	452854379
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6488	NC_020410	AGC	2	6	382863	382868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854393
6489	NC_020410	GGA	2	6	382908	382913	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452854393
6490	NC_020410	CCG	2	6	382950	382955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854393
6491	NC_020410	GA	3	6	383093	383098	50 %	0 %	50 %	0 %	452854393
6492	NC_020410	GAG	2	6	383106	383111	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452854393
6493	NC_020410	AGA	2	6	383212	383217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854394
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6496	NC_020410	ACT	2	6	383299	383304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854394
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6499	NC_020410	ATCCAG	2	12	383590	383601	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	452854394
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