MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum UCMB5036 complete genome

Total Repeats: 72176

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_020410	GC	3	6	279738	279743	0 %	0 %	50 %	50 %	452854315
4502	NC_020410	GCG	2	6	279758	279763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854315
4503	NC_020410	TTTC	2	8	279919	279926	0 %	75 %	0 %	25 %	452854315
4504	NC_020410	T	6	6	279958	279963	0 %	100 %	0 %	0 %	452854315
4505	NC_020410	CAG	2	6	279964	279969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854315
4506	NC_020410	A	6	6	279984	279989	100 %	0 %	0 %	0 %	452854315
4507	NC_020410	AAC	2	6	280001	280006	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452854315
4508	NC_020410	TTC	2	6	280172	280177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854316
4509	NC_020410	CCG	2	6	280255	280260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854316
4510	NC_020410	GAA	2	6	280266	280271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854316
4511	NC_020410	GCG	2	6	280272	280277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854316
4512	NC_020410	CAT	2	6	280280	280285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854316
4513	NC_020410	AGA	2	6	280334	280339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854316
4514	NC_020410	GCC	2	6	280362	280367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854316
4515	NC_020410	CAA	2	6	280400	280405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452854316
4516	NC_020410	A	6	6	280539	280544	100 %	0 %	0 %	0 %	452854316
4517	NC_020410	TCA	2	6	280571	280576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854316
4518	NC_020410	ATG	2	6	280632	280637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854316
4519	NC_020410	A	7	7	280761	280767	100 %	0 %	0 %	0 %	452854316
4520	NC_020410	GAA	2	6	280794	280799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854316
4521	NC_020410	CGC	2	6	280802	280807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854316
4522	NC_020410	GCC	2	6	280809	280814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854316
4523	NC_020410	ATGG	2	8	280817	280824	25 %	25 %	50 %	0 %	452854316
4524	NC_020410	GAA	2	6	280830	280835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854316
4525	NC_020410	TCG	2	6	280864	280869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854316
4526	NC_020410	TTC	2	6	280941	280946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854317
4527	NC_020410	GAAGT	2	10	280973	280982	40 %	20 %	40 %	0 %	452854317
4528	NC_020410	TAA	2	6	281012	281017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452854317
4529	NC_020410	GCCT	2	8	281022	281029	0 %	25 %	25 %	50 %	452854317
4530	NC_020410	CAG	2	6	281144	281149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854317
4531	NC_020410	TG	3	6	281249	281254	0 %	50 %	50 %	0 %	452854317
4532	NC_020410	A	6	6	281317	281322	100 %	0 %	0 %	0 %	452854317
4533	NC_020410	GAA	2	6	281336	281341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854317
4534	NC_020410	GCA	2	6	281365	281370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854317
4535	NC_020410	CTT	2	6	281417	281422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854317
4536	NC_020410	CAG	2	6	281490	281495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854317
4537	NC_020410	GCA	3	9	281566	281574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854317
4538	NC_020410	AGT	2	6	281591	281596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854317
4539	NC_020410	TTA	2	6	281597	281602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452854317
4540	NC_020410	A	6	6	281626	281631	100 %	0 %	0 %	0 %	452854317
4541	NC_020410	AAT	2	6	281659	281664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452854317
4542	NC_020410	GATA	2	8	281784	281791	50 %	25 %	25 %	0 %	452854317
4543	NC_020410	CAG	2	6	281817	281822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854317
4544	NC_020410	A	7	7	281829	281835	100 %	0 %	0 %	0 %	452854317
4545	NC_020410	AATA	2	8	281838	281845	75 %	25 %	0 %	0 %	452854317
4546	NC_020410	GAAA	2	8	281892	281899	75 %	0 %	25 %	0 %	452854317
4547	NC_020410	T	6	6	281938	281943	0 %	100 %	0 %	0 %	452854317
4548	NC_020410	TAT	2	6	281945	281950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452854317
4549	NC_020410	TGC	2	6	281979	281984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854317
4550	NC_020410	TAA	2	6	282057	282062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452854317
4551	NC_020410	AT	4	8	282078	282085	50 %	50 %	0 %	0 %	452854317
4552	NC_020410	CTG	2	6	282112	282117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854317
4553	NC_020410	ACA	2	6	282118	282123	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452854317
4554	NC_020410	AAG	2	6	282126	282131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854317
4555	NC_020410	TACTC	2	10	282220	282229	20 %	40 %	0 %	40 %	452854318
4556	NC_020410	TTC	2	6	282257	282262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854318
4557	NC_020410	GCA	2	6	282297	282302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854318
4558	NC_020410	GCAAT	2	10	282331	282340	40 %	20 %	20 %	20 %	452854318
4559	NC_020410	GAG	2	6	282361	282366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452854318
4560	NC_020410	TGA	2	6	282376	282381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854318
4561	NC_020410	CTT	2	6	282394	282399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854318
4562	NC_020410	TA	4	8	282454	282461	50 %	50 %	0 %	0 %	452854318
4563	NC_020410	T	6	6	282569	282574	0 %	100 %	0 %	0 %	452854319
4564	NC_020410	CTT	2	6	282589	282594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854319
4565	NC_020410	T	6	6	282600	282605	0 %	100 %	0 %	0 %	452854319
4566	NC_020410	TTG	2	6	282642	282647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452854319
4567	NC_020410	T	6	6	282679	282684	0 %	100 %	0 %	0 %	452854319
4568	NC_020410	A	6	6	282688	282693	100 %	0 %	0 %	0 %	452854319
4569	NC_020410	ATT	2	6	282722	282727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452854319
4570	NC_020410	TTG	2	6	282733	282738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452854319
4571	NC_020410	T	6	6	282771	282776	0 %	100 %	0 %	0 %	452854319
4572	NC_020410	TGA	2	6	282858	282863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854319
4573	NC_020410	TC	3	6	282877	282882	0 %	50 %	0 %	50 %	452854319
4574	NC_020410	CAAT	2	8	282885	282892	50 %	25 %	0 %	25 %	452854319
4575	NC_020410	ATC	2	6	282983	282988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854319
4576	NC_020410	A	6	6	282992	282997	100 %	0 %	0 %	0 %	452854319
4577	NC_020410	CCA	2	6	283030	283035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452854319
4578	NC_020410	ATA	2	6	283064	283069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452854319
4579	NC_020410	T	8	8	283071	283078	0 %	100 %	0 %	0 %	452854319
4580	NC_020410	T	6	6	283102	283107	0 %	100 %	0 %	0 %	452854319
4581	NC_020410	CTT	2	6	283132	283137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854320
4582	NC_020410	T	7	7	283136	283142	0 %	100 %	0 %	0 %	452854320
4583	NC_020410	TGT	2	6	283225	283230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452854320
4584	NC_020410	CTT	2	6	283256	283261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854320
4585	NC_020410	GGATA	2	10	283265	283274	40 %	20 %	40 %	0 %	452854320
4586	NC_020410	TCTA	2	8	283317	283324	25 %	50 %	0 %	25 %	452854320
4587	NC_020410	CAT	2	6	283334	283339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854320
4588	NC_020410	GA	3	6	283369	283374	50 %	0 %	50 %	0 %	452854320
4589	NC_020410	T	7	7	283454	283460	0 %	100 %	0 %	0 %	452854320
4590	NC_020410	ATA	2	6	283470	283475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452854320
4591	NC_020410	TAC	2	6	283482	283487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854320
4592	NC_020410	T	6	6	283488	283493	0 %	100 %	0 %	0 %	452854320
4593	NC_020410	CAA	2	6	283523	283528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452854320
4594	NC_020410	GAT	2	6	283536	283541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854320
4595	NC_020410	T	6	6	283541	283546	0 %	100 %	0 %	0 %	452854320
4596	NC_020410	A	7	7	283560	283566	100 %	0 %	0 %	0 %	452854320
4597	NC_020410	ATCT	2	8	283571	283578	25 %	50 %	0 %	25 %	452854320
4598	NC_020410	TCA	2	6	283684	283689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854320
4599	NC_020410	TA	3	6	283700	283705	50 %	50 %	0 %	0 %	452854320
4600	NC_020410	T	7	7	283708	283714	0 %	100 %	0 %	0 %	452854320
4601	NC_020410	TGG	2	6	284000	284005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452854321
4602	NC_020410	CG	3	6	284089	284094	0 %	0 %	50 %	50 %	452854321
4603	NC_020410	TA	3	6	284102	284107	50 %	50 %	0 %	0 %	452854321
4604	NC_020410	ATC	2	6	284187	284192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854321
4605	NC_020410	GGA	2	6	284221	284226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452854321
4606	NC_020410	ATT	2	6	284358	284363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452854321
4607	NC_020410	GGC	2	6	284370	284375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854321
4608	NC_020410	CCGA	2	8	284396	284403	25 %	0 %	25 %	50 %	452854321
4609	NC_020410	GAA	2	6	284441	284446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854321
4610	NC_020410	GAT	2	6	284536	284541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854321
4611	NC_020410	TCT	2	6	284593	284598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854321
4612	NC_020410	A	7	7	284602	284608	100 %	0 %	0 %	0 %	452854321
4613	NC_020410	GCC	2	6	284617	284622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854321
4614	NC_020410	CGCC	2	8	284638	284645	0 %	0 %	25 %	75 %	452854321
4615	NC_020410	GTCG	2	8	284740	284747	0 %	25 %	50 %	25 %	452854321
4616	NC_020410	GAG	2	6	284771	284776	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452854321
4617	NC_020410	TTTTCA	2	12	284821	284832	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	452854321
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4619	NC_020410	GCC	2	6	285044	285049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854321
4620	NC_020410	GAA	2	6	285092	285097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854321
4621	NC_020410	AGA	2	6	285199	285204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854321
4622	NC_020410	GCA	2	6	285267	285272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854321
4623	NC_020410	GAT	2	6	285353	285358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854321
4624	NC_020410	A	6	6	285383	285388	100 %	0 %	0 %	0 %	452854321
4625	NC_020410	GCT	3	9	285439	285447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854321
4626	NC_020410	TGA	2	6	285451	285456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854321
4627	NC_020410	AGA	2	6	285526	285531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854321
4628	NC_020410	GCT	2	6	285577	285582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854321
4629	NC_020410	CGG	2	6	285604	285609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854321
4630	NC_020410	TCA	2	6	285817	285822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854322
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4632	NC_020410	TCATTG	2	12	285874	285885	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	452854322
4633	NC_020410	CGG	2	6	285904	285909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854322
4634	NC_020410	TTC	2	6	285944	285949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854322
4635	NC_020410	CGT	2	6	285968	285973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854322
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4639	NC_020410	A	6	6	286165	286170	100 %	0 %	0 %	0 %	452854322
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4644	NC_020410	AT	3	6	286406	286411	50 %	50 %	0 %	0 %	452854322
4645	NC_020410	ACA	2	6	286446	286451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452854322
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4647	NC_020410	GCG	2	6	286461	286466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854322
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4649	NC_020410	CA	3	6	286481	286486	50 %	0 %	0 %	50 %	452854322
4650	NC_020410	GAA	2	6	286557	286562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854322
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4654	NC_020410	TTACA	2	10	286876	286885	40 %	40 %	0 %	20 %	452854323
4655	NC_020410	GCG	2	6	286948	286953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854323
4656	NC_020410	TCG	2	6	286957	286962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854323
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4659	NC_020410	A	8	8	287055	287062	100 %	0 %	0 %	0 %	452854323
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4680	NC_020410	ATTT	2	8	287874	287881	25 %	75 %	0 %	0 %	452854324
4681	NC_020410	CAGC	2	8	287899	287906	25 %	0 %	25 %	50 %	452854324
4682	NC_020410	TAT	2	6	287917	287922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452854324
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4727	NC_020410	ACG	2	6	290394	290399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854327
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4732	NC_020410	CG	3	6	290643	290648	0 %	0 %	50 %	50 %	452854327
4733	NC_020410	GAG	2	6	290708	290713	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452854327
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4741	NC_020410	CAT	2	6	291537	291542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854329
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4743	NC_020410	T	6	6	291564	291569	0 %	100 %	0 %	0 %	452854329
4744	NC_020410	CTGA	2	8	291594	291601	25 %	25 %	25 %	25 %	452854329
4745	NC_020410	CTG	2	6	291636	291641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854329
4746	NC_020410	GCT	2	6	291647	291652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854329
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4748	NC_020410	AT	3	6	291746	291751	50 %	50 %	0 %	0 %	452854329
4749	NC_020410	TTTATC	2	12	291759	291770	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	452854329
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4753	NC_020410	TGGCT	2	10	291829	291838	0 %	40 %	40 %	20 %	452854329
4754	NC_020410	TGA	2	6	291869	291874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854329
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4773	NC_020410	GCT	2	6	292715	292720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854330
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4822	NC_020410	GCTG	2	8	295259	295266	0 %	25 %	50 %	25 %	452854332
4823	NC_020410	GATG	2	8	295275	295282	25 %	25 %	50 %	0 %	452854332
4824	NC_020410	TAT	2	6	295299	295304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452854332
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4828	NC_020410	ATC	2	6	295609	295614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854332
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4836	NC_020410	CGT	2	6	295878	295883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854332
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4840	NC_020410	GCG	2	6	296008	296013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854332
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4850	NC_020410	TCG	2	6	296273	296278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854332
4851	NC_020410	CGTTT	2	10	296298	296307	0 %	60 %	20 %	20 %	452854332
4852	NC_020410	TCA	2	6	296351	296356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854332
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4854	NC_020410	GAAAC	2	10	296377	296386	60 %	0 %	20 %	20 %	452854332
4855	NC_020410	A	7	7	296856	296862	100 %	0 %	0 %	0 %	452854333
4856	NC_020410	A	6	6	296886	296891	100 %	0 %	0 %	0 %	452854333
4857	NC_020410	A	6	6	296893	296898	100 %	0 %	0 %	0 %	452854333
4858	NC_020410	TCAA	2	8	296933	296940	50 %	25 %	0 %	25 %	452854333
4859	NC_020410	ATG	2	6	296957	296962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854333
4860	NC_020410	TCA	2	6	296975	296980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854333
4861	NC_020410	A	7	7	297118	297124	100 %	0 %	0 %	0 %	452854333
4862	NC_020410	A	6	6	297214	297219	100 %	0 %	0 %	0 %	452854333
4863	NC_020410	TCAGC	2	10	297291	297300	20 %	20 %	20 %	40 %	452854333
4864	NC_020410	GGA	2	6	297301	297306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452854333
4865	NC_020410	GCA	2	6	297309	297314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854333
4866	NC_020410	GC	4	8	297328	297335	0 %	0 %	50 %	50 %	452854333
4867	NC_020410	TTC	2	6	297356	297361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854333
4868	NC_020410	GATG	2	8	297363	297370	25 %	25 %	50 %	0 %	452854333
4869	NC_020410	ATC	2	6	297454	297459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854333
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4871	NC_020410	TGA	2	6	297512	297517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854333
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4873	NC_020410	TGA	2	6	297560	297565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854333
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4881	NC_020410	GC	3	6	297959	297964	0 %	0 %	50 %	50 %	452854333
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4883	NC_020410	CTG	2	6	298001	298006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854333
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4982	NC_020410	A	6	6	303059	303064	100 %	0 %	0 %	0 %	452854338
4983	NC_020410	ATC	2	6	303068	303073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854338
4984	NC_020410	CGG	2	6	303389	303394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854339
4985	NC_020410	CAAA	2	8	303413	303420	75 %	0 %	0 %	25 %	452854339
4986	NC_020410	CATG	2	8	303466	303473	25 %	25 %	25 %	25 %	452854339
4987	NC_020410	AAGG	2	8	303565	303572	50 %	0 %	50 %	0 %	452854339
4988	NC_020410	TG	3	6	303677	303682	0 %	50 %	50 %	0 %	452854339
4989	NC_020410	ATCA	2	8	303727	303734	50 %	25 %	0 %	25 %	452854339
4990	NC_020410	TAC	2	6	303735	303740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854339
4991	NC_020410	AC	3	6	303800	303805	50 %	0 %	0 %	50 %	452854339
4992	NC_020410	ATG	2	6	303953	303958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854339
4993	NC_020410	GAT	2	6	303982	303987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854339
4994	NC_020410	CGG	2	6	304031	304036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854339
4995	NC_020410	GT	3	6	304163	304168	0 %	50 %	50 %	0 %	452854339
4996	NC_020410	ATG	3	9	304247	304255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854339
4997	NC_020410	TGA	2	6	304275	304280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854339
4998	NC_020410	CTTTT	2	10	304333	304342	0 %	80 %	0 %	20 %	452854339
4999	NC_020410	GGA	2	6	304357	304362	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452854339
5000	NC_020410	AAC	2	6	304501	304506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452854339

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