MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Bacillus amyloliquefaciens IT-45

Total Repeats: 46291

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020272	TAT	2	6	104	109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451344760
2	NC_020272	CTG	2	6	130	135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451344760
3	NC_020272	GTC	2	6	294	299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451344761
4	NC_020272	CGC	2	6	317	322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451344761
5	NC_020272	TAT	2	6	336	341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451344761
6	NC_020272	GAA	2	6	506	511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451344762
7	NC_020272	CGT	2	6	665	670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451344762
8	NC_020272	AGG	2	6	709	714	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451344762
9	NC_020272	GCT	2	6	722	727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451344762
10	NC_020272	TAT	3	9	743	751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451344762
11	NC_020272	CCG	2	6	763	768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451344762
12	NC_020272	GAA	2	6	783	788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451344762
13	NC_020272	GCA	2	6	803	808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451344762
14	NC_020272	TAC	2	6	1004	1009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451344763
15	NC_020272	TGC	2	6	1031	1036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451344763
16	NC_020272	TGT	2	6	1101	1106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451344763
17	NC_020272	ATC	3	9	1171	1179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451344763
18	NC_020272	CTG	2	6	1198	1203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451344763
19	NC_020272	TGA	2	6	1214	1219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451344763
20	NC_020272	AGC	2	6	1223	1228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451344763
21	NC_020272	GCA	2	6	1311	1316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451344763
22	NC_020272	CAG	2	6	1324	1329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451344763
23	NC_020272	TTC	2	6	1502	1507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451344763
24	NC_020272	CAG	2	6	1537	1542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451344763
25	NC_020272	TGA	2	6	1547	1552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451344763
26	NC_020272	ATG	2	6	1588	1593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451344763
27	NC_020272	TTA	2	6	1700	1705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451344763
28	NC_020272	GGA	2	6	1747	1752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451344763
29	NC_020272	GAA	2	6	1763	1768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451344763
30	NC_020272	CTG	2	6	1774	1779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451344764
31	NC_020272	GAA	2	6	1794	1799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451344764
32	NC_020272	GGT	2	6	1856	1861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451344764
33	NC_020272	AAG	2	6	1864	1869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451344764
34	NC_020272	AGA	2	6	1964	1969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451344764
35	NC_020272	ATC	2	6	1971	1976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451344764
36	NC_020272	GAA	2	6	2010	2015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451344764
37	NC_020272	GCG	2	6	2055	2060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451344764
38	NC_020272	CGG	2	6	2175	2180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451344764
39	NC_020272	AGA	2	6	2184	2189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451344764
40	NC_020272	ATC	2	6	2286	2291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451344764
41	NC_020272	ACG	2	6	2865	2870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451344765
42	NC_020272	ATT	2	6	2877	2882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451344765
43	NC_020272	CCG	2	6	3170	3175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451344765
44	NC_020272	TGA	2	6	3182	3187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451344765
45	NC_020272	GTT	2	6	3188	3193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451344765
46	NC_020272	ATG	2	6	3238	3243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451344765
47	NC_020272	GAA	2	6	3249	3254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451344765
48	NC_020272	GCG	2	6	3286	3291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451344765
49	NC_020272	GAA	2	6	3293	3298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451344765
50	NC_020272	GCT	2	6	3311	3316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451344765
51	NC_020272	ATC	2	6	3366	3371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451344765
52	NC_020272	ACG	2	6	3453	3458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451344765
53	NC_020272	CCG	2	6	3517	3522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451344765
54	NC_020272	AGA	2	6	3536	3541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451344765
55	NC_020272	TCG	2	6	3544	3549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451344765
56	NC_020272	GAA	2	6	3636	3641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451344765
57	NC_020272	GTC	2	6	3759	3764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451344765
58	NC_020272	TTG	2	6	3774	3779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451344765
59	NC_020272	AGA	2	6	3782	3787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451344765
60	NC_020272	TGA	2	6	3914	3919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451344765
61	NC_020272	CTG	2	6	3990	3995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451344765
62	NC_020272	ATC	2	6	4002	4007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451344765
63	NC_020272	ACG	2	6	4109	4114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451344766
64	NC_020272	CGG	2	6	4242	4247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451344766
65	NC_020272	GTC	2	6	4264	4269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451344766
66	NC_020272	CGG	2	6	4287	4292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451344766
67	NC_020272	CTT	2	6	4447	4452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451344766
68	NC_020272	CAG	2	6	4618	4623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451344766
69	NC_020272	CCT	2	6	4693	4698	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451344766
70	NC_020272	ATC	2	6	4846	4851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451344766
71	NC_020272	GCA	2	6	5046	5051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451344766
72	NC_020272	GAT	2	6	5091	5096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451344766
73	NC_020272	AGC	2	6	5223	5228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451344766
74	NC_020272	AGA	2	6	5280	5285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451344766
75	NC_020272	CTG	2	6	5368	5373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451344766
76	NC_020272	CTG	2	6	5395	5400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451344766
77	NC_020272	TGA	2	6	5463	5468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451344766
78	NC_020272	GAA	2	6	5487	5492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451344766
79	NC_020272	GCG	2	6	5497	5502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451344766
80	NC_020272	TTA	2	6	5534	5539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451344766
81	NC_020272	CGG	2	6	5580	5585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451344766
82	NC_020272	GCA	2	6	5751	5756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451344766
83	NC_020272	GAA	2	6	5769	5774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451344766
84	NC_020272	AAG	2	6	5855	5860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451344766
85	NC_020272	CTG	2	6	5926	5931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451344766
86	NC_020272	CGG	2	6	6165	6170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451344767
87	NC_020272	CAC	2	6	6196	6201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451344767
88	NC_020272	TCG	2	6	6279	6284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451344767
89	NC_020272	TGA	2	6	6517	6522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451344767
90	NC_020272	GAG	2	6	6561	6566	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451344767
91	NC_020272	GAA	2	6	6602	6607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451344767
92	NC_020272	TTC	2	6	6849	6854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451344768
93	NC_020272	AGA	2	6	6908	6913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451344768
94	NC_020272	CAT	2	6	7022	7027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451344768
95	NC_020272	TTG	2	6	7036	7041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451344768
96	NC_020272	AGA	2	6	7052	7057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451344768
97	NC_020272	ATT	2	6	7137	7142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451344768
98	NC_020272	GAA	2	6	7200	7205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451344768
99	NC_020272	TCC	2	6	7209	7214	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451344768
100	NC_020272	GTG	2	6	7488	7493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451344768
101	NC_020272	CAG	2	6	7544	7549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451344768
102	NC_020272	TGG	2	6	7594	7599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451344768
103	NC_020272	GCG	2	6	7606	7611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451344768
104	NC_020272	GAA	4	12	7626	7637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451344768
105	NC_020272	GAC	3	9	8025	8033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451344769
106	NC_020272	TTC	2	6	8078	8083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451344769
107	NC_020272	TTG	2	6	8084	8089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451344769
108	NC_020272	TAG	2	6	8168	8173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451344769
109	NC_020272	ATG	2	6	8174	8179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451344769
110	NC_020272	ATT	2	6	8194	8199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451344769
111	NC_020272	CGA	2	6	8276	8281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451344769
112	NC_020272	ATT	2	6	8344	8349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451344769
113	NC_020272	TCC	2	6	8355	8360	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451344769
114	NC_020272	TTA	2	6	8371	8376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451344769
115	NC_020272	TAC	2	6	8431	8436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451344769
116	NC_020272	ATT	2	6	8457	8462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451344769
117	NC_020272	AGA	2	6	8568	8573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451344769
118	NC_020272	ATT	2	6	8611	8616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451344769
119	NC_020272	GTT	2	6	8767	8772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451344770
120	NC_020272	GAA	2	6	8804	8809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451344770
121	NC_020272	TGA	3	9	8860	8868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451344770
122	NC_020272	CAT	2	6	8893	8898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451344770
123	NC_020272	TTC	2	6	8910	8915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451344770
124	NC_020272	CGC	2	6	8980	8985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451344770
125	NC_020272	GAA	2	6	9098	9103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451344770
126	NC_020272	CTG	2	6	9122	9127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451344770
127	NC_020272	CTG	2	6	9206	9211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451344770
128	NC_020272	GAA	2	6	9319	9324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451344770
129	NC_020272	GAA	2	6	9332	9337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451344770
130	NC_020272	AGC	2	6	9360	9365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451344770
131	NC_020272	CAG	2	6	9371	9376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451344770
132	NC_020272	ACA	2	6	9381	9386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451344770
133	NC_020272	TGT	2	6	9427	9432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451344770
134	NC_020272	AAC	2	6	9472	9477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451344770
135	NC_020272	TAA	2	6	9909	9914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451344771
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249	NC_020272	GCA	2	6	20258	20263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451344784
250	NC_020272	CAG	2	6	20496	20501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451344785
251	NC_020272	CCG	2	6	20502	20507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451344785
252	NC_020272	CGA	2	6	20554	20559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451344785
253	NC_020272	GAC	2	6	20693	20698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451344785
254	NC_020272	AAT	2	6	20711	20716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451344785
255	NC_020272	CAG	2	6	20906	20911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451344785
256	NC_020272	GAT	2	6	20975	20980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451344785
257	NC_020272	GCC	2	6	21048	21053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451344785
258	NC_020272	GCG	2	6	21157	21162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451344785
259	NC_020272	CGG	2	6	21174	21179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451344785
260	NC_020272	GCC	2	6	21204	21209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451344785
261	NC_020272	GCC	2	6	21226	21231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451344785
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284	NC_020272	ACA	2	6	22761	22766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451344786
285	NC_020272	CGG	2	6	22772	22777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451344786
286	NC_020272	CAT	2	6	22817	22822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451344786
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292	NC_020272	GCG	2	6	23037	23042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451344787
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