MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Blattabacterium sp. (Blatta orientalis) str. Tarazona

Total Repeats: 337

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020195	ATAGAT	2	12	322	333	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	444335300
2	NC_020195	ATGTTA	2	12	591	602	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	444335301
3	NC_020195	ATTTGA	2	12	1963	1974	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	444335301
4	NC_020195	AGAAAA	2	12	4945	4956	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	444335303
5	NC_020195	GCTTCT	2	12	5930	5941	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	444335304
6	NC_020195	ATTTTG	2	12	6476	6487	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	444335305
7	NC_020195	TTTTTC	2	12	9572	9583	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	444335307
8	NC_020195	AAATAA	2	12	10427	10438	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	444335308
9	NC_020195	CTATAG	2	12	10598	10609	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	444335308
10	NC_020195	TTTCCA	2	12	11290	11301	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	444335309
11	NC_020195	CCCATT	2	12	12066	12077	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	444335310
12	NC_020195	CTATTT	2	12	12681	12692	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	444335310
13	NC_020195	GAAATG	2	12	12694	12705	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	444335310
14	NC_020195	TTATTT	2	12	12753	12764	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	444335310
15	NC_020195	TTTCTA	2	12	16070	16081	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	444335313
16	NC_020195	AGGAAT	2	12	16233	16244	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	444335313
17	NC_020195	CTTTAT	2	12	18507	18518	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	444335314
18	NC_020195	GATTTT	2	12	18824	18835	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	444335314
19	NC_020195	TCTATT	2	12	20270	20281	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	444335315
20	NC_020195	TTTAAA	2	12	20540	20551	50 %	50 %	0 %	0 %	444335315
21	NC_020195	GATCTT	2	12	23130	23141	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	444335318
22	NC_020195	AAATAA	2	12	24241	24252	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	444335320
23	NC_020195	ACATAT	2	12	25201	25212	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	444335321
24	NC_020195	CAAAAA	2	12	25371	25382	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	444335322
25	NC_020195	TATTAA	2	12	29433	29444	50 %	50 %	0 %	0 %	444335326
26	NC_020195	GTAGAA	2	12	30540	30551	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	444335327
27	NC_020195	TATTTT	2	12	32387	32398	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	444335330
28	NC_020195	AAATAA	2	12	34810	34821	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	444335333
29	NC_020195	TTGATT	2	12	37584	37595	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	444335336
30	NC_020195	CTAAAA	2	12	38362	38373	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	444335336
31	NC_020195	GGATTT	2	12	41584	41595	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	444335340
32	NC_020195	ATCACT	2	12	42063	42074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	444335340
33	NC_020195	GAAAAC	2	12	42263	42274	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	444335340
34	NC_020195	TTTACA	2	12	42727	42738	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	444335341
35	NC_020195	AGTACT	2	12	44733	44744	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	444335343
36	NC_020195	ATTTTT	2	12	46788	46799	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	444335345
37	NC_020195	ATTTTC	2	12	49261	49272	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	444335346
38	NC_020195	TTTGAA	2	12	49507	49518	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	444335346
39	NC_020195	AACTAA	2	12	50424	50435	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	444335347
40	NC_020195	GGAGAA	2	12	52163	52174	50 %	0 %	50 %	0 %	444335350
41	NC_020195	AAAAGA	2	12	53721	53732	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	444335351
42	NC_020195	ATAGAT	2	12	53815	53826	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	444335351
43	NC_020195	GTTTAG	2	12	56055	56066	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	444335352
44	NC_020195	ATGGAA	2	12	59835	59846	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	444335356
45	NC_020195	CAATAA	2	12	61336	61347	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	444335357
46	NC_020195	TCTTTT	2	12	61643	61654	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	444335358
47	NC_020195	CCATAT	2	12	63949	63960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	444335359
48	NC_020195	AAAAGG	2	12	64291	64302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	444335359
49	NC_020195	TTGGAA	2	12	71455	71466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	444335365
50	NC_020195	GGAATG	2	12	71913	71924	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	444335365
51	NC_020195	TACAGA	2	12	78173	78184	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	444335370
52	NC_020195	AAGGAA	2	12	84086	84097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	444335376
53	NC_020195	TTTTGG	2	12	84456	84467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	444335376
54	NC_020195	TCTATT	2	12	86368	86379	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	444335379
55	NC_020195	TTCATT	2	12	87801	87812	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	444335381
56	NC_020195	TTCTAA	2	12	90682	90693	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	444335385
57	NC_020195	TGAAAA	2	12	92955	92966	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	444335385
58	NC_020195	TGGATT	2	12	92974	92985	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	444335385
59	NC_020195	AAAAAT	2	12	93389	93400	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	444335386
60	NC_020195	TTTATC	2	12	98504	98515	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	444335391
61	NC_020195	TCCATT	2	12	102219	102230	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	444335392
62	NC_020195	TACTGC	2	12	103274	103285	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	444335393
63	NC_020195	TTTCTT	2	12	106008	106019	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	444335395
64	NC_020195	CCAAAA	2	12	107589	107600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	444335397
65	NC_020195	TAGAAA	2	12	109455	109466	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	444335399
66	NC_020195	GATTCA	2	12	110412	110423	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	444335400
67	NC_020195	AAGAAA	2	12	111834	111845	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	444335401
68	NC_020195	AGAAAT	2	12	113467	113478	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	444335403
69	NC_020195	TTTTTG	2	12	114129	114140	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	444335403
70	NC_020195	TCCTGT	2	12	115091	115102	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	444335404
71	NC_020195	TATAGA	2	12	117088	117099	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	444335407
72	NC_020195	TTTTAG	2	12	118686	118697	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	444335408
73	NC_020195	AGGATA	2	12	120934	120945	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	444335410
74	NC_020195	TCCTAT	2	12	123127	123138	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	444335411
75	NC_020195	CTAAAG	2	12	124470	124481	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	444335412
76	NC_020195	TTTCTT	2	12	125156	125167	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	444335413
77	NC_020195	TGTTTT	2	12	125323	125334	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	444335413
78	NC_020195	TTTATT	2	12	125557	125568	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	444335413
79	NC_020195	ATTCTA	2	12	126966	126977	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	444335415
80	NC_020195	TTTCTC	2	12	127398	127409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	444335415
81	NC_020195	AATTTT	2	12	128159	128170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	444335416
82	NC_020195	ATCTTC	2	12	133038	133049	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	444335418
83	NC_020195	ATAGAT	2	12	134057	134068	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	444335419
84	NC_020195	CCTATT	2	12	135725	135736	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	444335421
85	NC_020195	ATTCCT	2	12	137003	137014	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	444335421
86	NC_020195	AGAAAA	2	12	138112	138123	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	444335423
87	NC_020195	ATGCTA	2	12	140974	140985	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	444335426
88	NC_020195	TAGCTG	2	12	143647	143658	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	444335429
89	NC_020195	TATCCA	2	12	145202	145213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	444335431
90	NC_020195	TCCAGC	2	12	147801	147812	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	444335432
91	NC_020195	AATTCC	2	12	148961	148972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	444335433
92	NC_020195	AAATTT	2	12	149579	149590	50 %	50 %	0 %	0 %	444335433
93	NC_020195	AAAAAT	2	12	150897	150908	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	444335435
94	NC_020195	TCAACA	2	12	154405	154416	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	444335439
95	NC_020195	TTCTTT	2	12	156329	156340	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	444335441
96	NC_020195	TCTTTT	2	12	160971	160982	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	444335445
97	NC_020195	GAATAG	2	12	164935	164946	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	444335448
98	NC_020195	GAAAAA	2	12	166758	166769	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	444335449
99	NC_020195	TAATGT	2	12	167641	167652	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	444335450
100	NC_020195	ATGTTG	2	12	167913	167924	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	444335450
101	NC_020195	AAATGT	2	12	171509	171520	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	444335454
102	NC_020195	AGAAAT	2	12	177841	177852	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	444335456
103	NC_020195	TCATTT	2	12	179206	179217	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	444335458
104	NC_020195	ATATGA	2	12	180273	180284	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	444335459
105	NC_020195	TCTTTT	2	12	182049	182060	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	444335462
106	NC_020195	TAAAAA	2	12	183178	183189	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	444335464
107	NC_020195	TATCTA	2	12	183501	183512	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	444335464
108	NC_020195	TTTAGA	2	12	188423	188434	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	444335467
109	NC_020195	ACAAAT	2	12	189909	189920	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	444335467
110	NC_020195	ATAAGA	2	12	191788	191799	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	444335467
111	NC_020195	GAAAAA	2	12	194160	194171	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	444335469
112	NC_020195	TCTTTT	2	12	195208	195219	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	444335470
113	NC_020195	ATAAAT	2	12	202811	202822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	444335477
114	NC_020195	AAAAAT	2	12	203959	203970	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	444335478
115	NC_020195	CAGAAA	2	12	204042	204053	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	444335478
116	NC_020195	TCTTTC	2	12	204891	204902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	444335479
117	NC_020195	TTGATG	2	12	210626	210637	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	444335487
118	NC_020195	CTCCAG	2	12	211154	211165	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	444335488
119	NC_020195	ATTTTT	2	12	216239	216250	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	444335493
120	NC_020195	ATGGAA	2	12	216731	216742	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	444335494
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122	NC_020195	TTTCAT	2	12	217905	217916	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	444335494
123	NC_020195	TTCTAT	2	12	220873	220884	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	444335499
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233	NC_020195	AGCTAA	2	12	440991	441002	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	444335705
234	NC_020195	AGAAAA	2	12	441144	441155	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	444335705
235	NC_020195	TTTTCT	2	12	449313	449324	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	444335713
236	NC_020195	ATAGAT	2	12	452559	452570	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	444335715
237	NC_020195	TAAAAA	2	12	452719	452730	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	444335715
238	NC_020195	ATTAAA	2	12	453251	453262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	444335715
239	NC_020195	TATCCT	2	12	458250	458261	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	444335719
240	NC_020195	TCACTA	2	12	459767	459778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	444335720
241	NC_020195	TTTTAT	2	12	460077	460088	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	444335720
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262	NC_020195	ATTTCT	2	12	509491	509502	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	444335762
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336	NC_020195	ATAAAA	2	12	632304	632315	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	444335869
337	NC_020195	TATTTT	2	12	633698	633709	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	444335871

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.