MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Brachyspira pilosicoli P43/6/78 chromosome

Total Repeats: 1452

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019908	AGAAAA	2	12	5858	5869	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	431806732
2	NC_019908	ATAAAA	2	12	6890	6901	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	431806734
3	NC_019908	ATACTA	2	12	7750	7761	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	431806735
4	NC_019908	ATTTTT	2	12	14204	14215	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	431806739
5	NC_019908	TTTTTC	2	12	15603	15614	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	431806740
6	NC_019908	AAAGTA	2	12	16336	16347	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	431806741
7	NC_019908	TACTAT	2	12	19837	19848	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	431806742
8	NC_019908	TCCTCT	2	12	20097	20108	0 %	50 %	0 %	50 %	431806743
9	NC_019908	TTGTTT	2	12	20954	20965	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	431806745
10	NC_019908	TGATGT	2	12	22653	22664	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	431806747
11	NC_019908	AATATT	2	12	23643	23654	50 %	50 %	0 %	0 %	431806748
12	NC_019908	AAATCA	2	12	27142	27153	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	431806752
13	NC_019908	TTGTTT	2	12	27458	27469	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	431806753
14	NC_019908	TATCCT	2	12	29168	29179	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	431806754
15	NC_019908	AGCACC	2	12	32573	32584	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	431806760
16	NC_019908	TAATTC	2	12	34532	34543	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	431806761
17	NC_019908	TAAAAA	2	12	42266	42277	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	431806767
18	NC_019908	TAGACA	2	12	42895	42906	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	431806767
19	NC_019908	AAATAA	2	12	44902	44913	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	431806768
20	NC_019908	AATAGA	2	12	45517	45528	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	431806768
21	NC_019908	AAAAAG	2	12	46102	46113	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	431806768
22	NC_019908	ATAATG	2	12	47697	47708	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	431806770
23	NC_019908	GGTACT	2	12	53031	53042	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	431806774
24	NC_019908	TGGCTA	2	12	57216	57227	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	431806777
25	NC_019908	TAAAAT	2	12	57685	57696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431806777
26	NC_019908	TGGATA	2	12	61255	61266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431806780
27	NC_019908	CTAATG	2	12	61709	61720	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	431806780
28	NC_019908	ATAAAA	2	12	62493	62504	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	431806781
29	NC_019908	TAATTA	2	12	62714	62725	50 %	50 %	0 %	0 %	431806781
30	NC_019908	AGATAT	2	12	62949	62960	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	431806781
31	NC_019908	TTTTAT	2	12	63600	63611	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	431806782
32	NC_019908	GAATAT	2	12	66009	66020	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	431806785
33	NC_019908	TTATAT	2	12	66693	66704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431806785
34	NC_019908	ATTGAT	2	12	68044	68055	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	431806786
35	NC_019908	TACTTG	2	12	72253	72264	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	431806791
36	NC_019908	TTTTGG	2	12	72734	72745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	431806791
37	NC_019908	TTCTAT	2	12	74238	74249	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	431806792
38	NC_019908	CATTTG	2	12	75429	75440	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	431806794
39	NC_019908	CTTTTG	2	12	75459	75470	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	431806794
40	NC_019908	AAAAGA	2	12	77929	77940	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	431806797
41	NC_019908	AAACAG	2	12	78654	78665	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	431806798
42	NC_019908	AAAAAG	2	12	80230	80241	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	431806801
43	NC_019908	TATCTT	2	12	84384	84395	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	431806806
44	NC_019908	GCTTTA	2	12	89746	89757	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	431806810
45	NC_019908	AATGAA	2	12	90147	90158	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	431806810
46	NC_019908	AAAATG	2	12	93875	93886	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	431806814
47	NC_019908	TTTGTA	2	12	100320	100331	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	431806817
48	NC_019908	TAATTT	3	18	103747	103764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431806821
49	NC_019908	CATCTG	2	12	104038	104049	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	431806821
50	NC_019908	TTATAT	2	12	105780	105791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431806821
51	NC_019908	AGCAGG	2	12	107022	107033	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	431806822
52	NC_019908	TTTATC	2	12	111415	111426	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	431806826
53	NC_019908	CAGGTA	2	12	114501	114512	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	431806828
54	NC_019908	ATATAA	2	12	117130	117141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431806830
55	NC_019908	TATGAT	2	12	117161	117172	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	431806830
56	NC_019908	TAATTG	2	12	118780	118791	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	431806831
57	NC_019908	AAATTT	2	12	119028	119039	50 %	50 %	0 %	0 %	431806832
58	NC_019908	CTCTAA	2	12	122258	122269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431806834
59	NC_019908	ATTCTA	2	12	130646	130657	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	431806839
60	NC_019908	TATAAA	2	12	131993	132004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431806840
61	NC_019908	TAAAAA	2	12	133148	133159	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	431806841
62	NC_019908	ATGAAG	2	12	133788	133799	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	431806842
63	NC_019908	ATTTAT	2	12	135448	135459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431806845
64	NC_019908	CTGTTT	2	12	138131	138142	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	431806847
65	NC_019908	TAGTTT	2	12	138980	138991	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	431806848
66	NC_019908	GTCCTT	2	12	140954	140965	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	431806850
67	NC_019908	AAAAAT	2	12	141991	142002	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	431806852
68	NC_019908	AAAATG	2	12	143843	143854	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	431806854
69	NC_019908	ATTTAG	2	12	145736	145747	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	431806855
70	NC_019908	ATATTA	2	12	147051	147062	50 %	50 %	0 %	0 %	431806857
71	NC_019908	TAGATA	2	12	147348	147359	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	431806857
72	NC_019908	TAGTTG	2	12	148206	148217	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	431806857
73	NC_019908	AGAAAA	2	12	151853	151864	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	431806862
74	NC_019908	ATTTTA	2	12	152191	152202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431806862
75	NC_019908	GGCTTT	2	12	153008	153019	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	431806863
76	NC_019908	AGATAA	2	12	156786	156797	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	431806868
77	NC_019908	AGCACA	2	12	156843	156854	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	431806868
78	NC_019908	TTTTTG	2	12	157141	157152	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	431806868
79	NC_019908	TCTATA	2	12	157309	157320	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	431806868
80	NC_019908	CTGTAG	2	12	157349	157360	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	431806868
81	NC_019908	CTATAG	2	12	157641	157652	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	431806869
82	NC_019908	GGTAAA	2	12	158948	158959	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	431806870
83	NC_019908	CTGATG	2	12	166813	166824	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	431806875
84	NC_019908	CCTGTT	2	12	166836	166847	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	431806875
85	NC_019908	TGAAGG	2	12	168183	168194	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	431806876
86	NC_019908	AAAGAT	2	12	168619	168630	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	431806876
87	NC_019908	TTTATG	2	12	176619	176630	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	431806884
88	NC_019908	TAAAAA	2	12	176678	176689	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	431806884
89	NC_019908	AAGATG	2	12	179012	179023	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	431806887
90	NC_019908	GATTTT	2	12	184353	184364	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	431806891
91	NC_019908	AGAGAA	2	12	185846	185857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431806893
92	NC_019908	TGATGT	2	12	186389	186400	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	431806894
93	NC_019908	ATAGAT	2	12	188270	188281	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	431806895
94	NC_019908	AAAGCA	2	12	189761	189772	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	431806896
95	NC_019908	TTTTTG	2	12	190662	190673	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	431806897
96	NC_019908	CAATCT	2	12	191313	191324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431806898
97	NC_019908	CTAGCA	2	12	191383	191394	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	431806898
98	NC_019908	TATAAT	2	12	194096	194107	50 %	50 %	0 %	0 %	431806901
99	NC_019908	TATTAA	2	12	194318	194329	50 %	50 %	0 %	0 %	431806901
100	NC_019908	ACCTAT	2	12	194918	194929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431806902
101	NC_019908	ATAAAA	2	12	195888	195899	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	431806904
102	NC_019908	TATTTA	2	12	197152	197163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431806904
103	NC_019908	TGGAGA	2	12	198529	198540	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	431806905
104	NC_019908	AATGAA	2	12	198845	198856	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	431806905
105	NC_019908	TAATTT	2	12	199950	199961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431806906
106	NC_019908	TAATAT	2	12	201048	201059	50 %	50 %	0 %	0 %	431806906
107	NC_019908	ATAAAA	2	12	204737	204748	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	431806908
108	NC_019908	CTGGTA	2	12	206180	206191	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	431806909
109	NC_019908	TGGTTT	2	12	206466	206477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	431806909
110	NC_019908	TTGATA	2	12	206744	206755	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	431806909
111	NC_019908	AAGATT	2	12	206766	206777	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	431806909
112	NC_019908	ATAGGT	2	12	207650	207661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431806910
113	NC_019908	GGAGTT	2	12	207695	207706	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	431806910
114	NC_019908	GTTTTT	2	12	211764	211775	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	431806914
115	NC_019908	CATTAG	2	12	211906	211917	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	431806914
116	NC_019908	TTTTTC	2	12	212333	212344	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	431806914
117	NC_019908	TTACAT	2	12	212917	212928	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	431806915
118	NC_019908	AAAACT	2	12	213143	213154	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	431806915
119	NC_019908	ATCTAA	2	12	213569	213580	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	431806916
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236	NC_019908	CAAAAG	2	12	441032	441043	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	431807102
237	NC_019908	TAAGAG	2	12	442014	442025	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	431807102
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351	NC_019908	TTGGTG	2	12	607579	607590	0 %	50 %	50 %	0 %	431807245
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463	NC_019908	TTATCA	2	12	814742	814753	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	431807417
464	NC_019908	TTAAAG	2	12	814863	814874	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	431807417
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467	NC_019908	ATATCT	2	12	822631	822642	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	431807423
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470	NC_019908	TCATTT	2	12	828768	828779	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	431807431
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