MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Brachyspira pilosicoli P43/6/78 chromosome

Total Repeats: 36783

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019908	ATA	2	6	63	68	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431806728
2	NC_019908	TGA	3	9	125	133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431806728
3	NC_019908	TAT	2	6	146	151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431806728
4	NC_019908	TGT	2	6	269	274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	431806728
5	NC_019908	TAA	3	9	275	283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431806728
6	NC_019908	GAA	3	9	285	293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431806728
7	NC_019908	TGA	2	6	299	304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431806728
8	NC_019908	TGC	2	6	305	310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431806728
9	NC_019908	AAC	2	6	323	328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	431806728
10	NC_019908	ATA	5	15	334	348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431806728
11	NC_019908	AAT	2	6	408	413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431806728
12	NC_019908	GCT	2	6	429	434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431806728
13	NC_019908	ATT	3	9	532	540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431806728
14	NC_019908	TGA	2	6	674	679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431806728
15	NC_019908	TGA	2	6	923	928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431806728
16	NC_019908	AGT	2	6	932	937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431806728
17	NC_019908	ACA	2	6	960	965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	431806728
18	NC_019908	TGA	2	6	1018	1023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431806728
19	NC_019908	ATT	2	6	1072	1077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431806728
20	NC_019908	TAA	2	6	1082	1087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431806728
21	NC_019908	CTA	2	6	1105	1110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431806728
22	NC_019908	ATT	2	6	1138	1143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431806728
23	NC_019908	TAT	2	6	1289	1294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431806728
24	NC_019908	AGA	2	6	1316	1321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431806728
25	NC_019908	ATA	2	6	1362	1367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431806728
26	NC_019908	AAG	3	9	1856	1864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431806729
27	NC_019908	AAG	2	6	1871	1876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431806729
28	NC_019908	GCT	2	6	1885	1890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431806729
29	NC_019908	GAA	3	9	1969	1977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431806729
30	NC_019908	AAT	2	6	1993	1998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431806729
31	NC_019908	AGA	2	6	2031	2036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431806729
32	NC_019908	TAA	2	6	2148	2153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431806729
33	NC_019908	TAT	3	9	2159	2167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431806729
34	NC_019908	ATG	2	6	2219	2224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431806729
35	NC_019908	ATG	2	6	2432	2437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431806729
36	NC_019908	TAA	2	6	2588	2593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431806730
37	NC_019908	GAA	2	6	2717	2722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431806730
38	NC_019908	ATT	2	6	2793	2798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431806731
39	NC_019908	AAC	2	6	2813	2818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	431806731
40	NC_019908	GTA	2	6	2856	2861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431806731
41	NC_019908	AAC	2	6	2885	2890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	431806731
42	NC_019908	TAG	2	6	2899	2904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431806731
43	NC_019908	TAG	2	6	2929	2934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431806731
44	NC_019908	AGA	2	6	3026	3031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431806731
45	NC_019908	CTC	2	6	3106	3111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	431806731
46	NC_019908	ATC	2	6	3189	3194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431806731
47	NC_019908	GAA	2	6	3247	3252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431806731
48	NC_019908	AAT	2	6	3275	3280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431806731
49	NC_019908	GCT	3	9	3294	3302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431806731
50	NC_019908	GCG	2	6	3358	3363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431806731
51	NC_019908	TGA	2	6	3446	3451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431806731
52	NC_019908	AGA	2	6	3482	3487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431806731
53	NC_019908	GCT	2	6	3552	3557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431806731
54	NC_019908	CAG	2	6	3619	3624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431806731
55	NC_019908	TAG	2	6	3694	3699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431806731
56	NC_019908	CTA	2	6	3748	3753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431806731
57	NC_019908	TTG	2	6	3775	3780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	431806731
58	NC_019908	TGC	2	6	3881	3886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431806731
59	NC_019908	TAT	2	6	3899	3904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431806731
60	NC_019908	TTC	3	9	3925	3933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431806731
61	NC_019908	ACT	2	6	4005	4010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431806731
62	NC_019908	CAG	3	9	4042	4050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431806731
63	NC_019908	ACA	2	6	4108	4113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	431806731
64	NC_019908	ACC	2	6	4145	4150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	431806731
65	NC_019908	CTT	2	6	4264	4269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431806731
66	NC_019908	GAA	2	6	4287	4292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431806731
67	NC_019908	GAA	2	6	4329	4334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431806731
68	NC_019908	CAG	2	6	4480	4485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431806731
69	NC_019908	GAT	2	6	4524	4529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431806731
70	NC_019908	AGC	2	6	4535	4540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431806731
71	NC_019908	CAG	2	6	4608	4613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431806731
72	NC_019908	GTT	2	6	4683	4688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	431806731
73	NC_019908	ATA	3	9	4700	4708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431806731
74	NC_019908	TGA	2	6	5141	5146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431806732
75	NC_019908	ATA	2	6	5293	5298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431806732
76	NC_019908	ATA	2	6	5307	5312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431806732
77	NC_019908	TAT	3	9	5355	5363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431806732
78	NC_019908	AAT	2	6	5423	5428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431806732
79	NC_019908	GAA	2	6	5595	5600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431806732
80	NC_019908	AGG	2	6	5677	5682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	431806732
81	NC_019908	ATT	2	6	5688	5693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431806732
82	NC_019908	TGA	2	6	5732	5737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431806732
83	NC_019908	AGA	2	6	5810	5815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431806732
84	NC_019908	AAG	2	6	5824	5829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431806732
85	NC_019908	AGA	2	6	5945	5950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431806732
86	NC_019908	ATA	2	6	6001	6006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431806733
87	NC_019908	GAA	2	6	6193	6198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431806733
88	NC_019908	ATT	2	6	6201	6206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431806733
89	NC_019908	TGT	2	6	6209	6214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	431806733
90	NC_019908	AAT	2	6	6282	6287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431806733
91	NC_019908	GTT	2	6	6291	6296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	431806733
92	NC_019908	GAA	2	6	6312	6317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431806733
93	NC_019908	CTT	2	6	6543	6548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431806734
94	NC_019908	ATA	2	6	6554	6559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431806734
95	NC_019908	GAT	2	6	6566	6571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431806734
96	NC_019908	ACT	2	6	6617	6622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431806734
97	NC_019908	TTA	2	6	6628	6633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431806734
98	NC_019908	CTT	2	6	6647	6652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431806734
99	NC_019908	TAA	3	9	6705	6713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431806734
100	NC_019908	GGC	2	6	6782	6787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431806734
101	NC_019908	CTT	2	6	6848	6853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431806734
102	NC_019908	AGA	2	6	6860	6865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431806734
103	NC_019908	ATG	3	9	6936	6944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431806734
104	NC_019908	AGA	2	6	7021	7026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431806734
105	NC_019908	TGA	3	9	7060	7068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431806734
106	NC_019908	CTT	2	6	7119	7124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431806734
107	NC_019908	TGA	2	6	7270	7275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431806734
108	NC_019908	AAT	2	6	7290	7295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431806734
109	NC_019908	ATT	2	6	7330	7335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431806735
110	NC_019908	ATT	2	6	7345	7350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431806735
111	NC_019908	TAA	2	6	7352	7357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431806735
112	NC_019908	CTG	2	6	7375	7380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431806735
113	NC_019908	ATA	2	6	7402	7407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431806735
114	NC_019908	AGT	2	6	7412	7417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431806735
115	NC_019908	ATT	2	6	7446	7451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431806735
116	NC_019908	ATT	2	6	7544	7549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431806735
117	NC_019908	TAG	2	6	7552	7557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431806735
118	NC_019908	TTG	2	6	7645	7650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	431806735
119	NC_019908	GAT	2	6	7653	7658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431806735
120	NC_019908	TGA	2	6	7688	7693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431806735
121	NC_019908	TGG	2	6	7841	7846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	431806735
122	NC_019908	TAA	2	6	7856	7861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431806735
123	NC_019908	TTG	2	6	7915	7920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	431806735
124	NC_019908	TGA	2	6	7925	7930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431806735
125	NC_019908	TAA	2	6	7954	7959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431806735
126	NC_019908	TAA	4	12	7974	7985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431806735
127	NC_019908	TAA	3	9	8464	8472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431806736
128	NC_019908	TAA	2	6	8553	8558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431806736
129	NC_019908	TTC	2	6	8587	8592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431806736
130	NC_019908	TGA	2	6	8632	8637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431806736
131	NC_019908	TTA	2	6	8650	8655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431806736
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257	NC_019908	TGC	2	6	18946	18951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431806742
258	NC_019908	ACT	2	6	19094	19099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431806742
259	NC_019908	TGA	2	6	19156	19161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431806742
260	NC_019908	AAT	2	6	19190	19195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431806742
261	NC_019908	AAT	2	6	19307	19312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431806742
262	NC_019908	TTA	2	6	19326	19331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431806742
263	NC_019908	CTG	2	6	19371	19376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431806742
264	NC_019908	CTC	2	6	19386	19391	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	431806742
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269	NC_019908	ATT	2	6	19911	19916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431806742
270	NC_019908	GAT	2	6	19983	19988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431806743
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273	NC_019908	TGA	2	6	20051	20056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431806743
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276	NC_019908	TAT	2	6	20258	20263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431806744
277	NC_019908	TAT	2	6	20351	20356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431806744
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280	NC_019908	AAC	2	6	20728	20733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	431806745
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285	NC_019908	AAG	2	6	21005	21010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431806745
286	NC_019908	CTT	2	6	21245	21250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431806746
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288	NC_019908	TGT	2	6	21304	21309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	431806746
289	NC_019908	ATA	2	6	21345	21350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431806746
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291	NC_019908	GAG	2	6	21372	21377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	431806746
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