MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Brachyspira pilosicoli P43/6/78 chromosome

Total Repeats: 64205

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_019908	TTG	2	6	155447	155452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	431806866
4003	NC_019908	TAA	2	6	155462	155467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431806866
4004	NC_019908	AT	3	6	155488	155493	50 %	50 %	0 %	0 %	431806866
4005	NC_019908	ATT	2	6	155518	155523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431806866
4006	NC_019908	AGCA	2	8	155535	155542	50 %	0 %	25 %	25 %	431806866
4007	NC_019908	TA	3	6	155582	155587	50 %	50 %	0 %	0 %	431806866
4008	NC_019908	TATT	2	8	155621	155628	25 %	75 %	0 %	0 %	431806866
4009	NC_019908	A	7	7	155635	155641	100 %	0 %	0 %	0 %	431806866
4010	NC_019908	AAT	2	6	155661	155666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431806866
4011	NC_019908	AATT	2	8	155672	155679	50 %	50 %	0 %	0 %	431806866
4012	NC_019908	AAT	2	6	155710	155715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431806866
4013	NC_019908	A	7	7	155727	155733	100 %	0 %	0 %	0 %	431806866
4014	NC_019908	TA	3	6	155734	155739	50 %	50 %	0 %	0 %	431806866
4015	NC_019908	T	8	8	155743	155750	0 %	100 %	0 %	0 %	431806866
4016	NC_019908	T	6	6	155864	155869	0 %	100 %	0 %	0 %	431806867
4017	NC_019908	T	6	6	155880	155885	0 %	100 %	0 %	0 %	431806867
4018	NC_019908	CAT	2	6	155903	155908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431806867
4019	NC_019908	TAT	2	6	155921	155926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431806867
4020	NC_019908	AT	3	6	155963	155968	50 %	50 %	0 %	0 %	431806867
4021	NC_019908	T	6	6	155968	155973	0 %	100 %	0 %	0 %	431806867
4022	NC_019908	ATGC	2	8	156006	156013	25 %	25 %	25 %	25 %	431806867
4023	NC_019908	T	7	7	156017	156023	0 %	100 %	0 %	0 %	431806867
4024	NC_019908	ATT	2	6	156045	156050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431806867
4025	NC_019908	AT	3	6	156070	156075	50 %	50 %	0 %	0 %	431806867
4026	NC_019908	TAT	2	6	156080	156085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431806867
4027	NC_019908	T	6	6	156088	156093	0 %	100 %	0 %	0 %	431806867
4028	NC_019908	T	7	7	156108	156114	0 %	100 %	0 %	0 %	431806867
4029	NC_019908	TTA	2	6	156125	156130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431806867
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4031	NC_019908	ATT	2	6	156183	156188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431806867
4032	NC_019908	TA	3	6	156201	156206	50 %	50 %	0 %	0 %	431806867
4033	NC_019908	ATT	2	6	156219	156224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431806867
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4035	NC_019908	TTGT	2	8	156265	156272	0 %	75 %	25 %	0 %	431806867
4036	NC_019908	TAAA	2	8	156276	156283	75 %	25 %	0 %	0 %	431806867
4037	NC_019908	T	6	6	156298	156303	0 %	100 %	0 %	0 %	431806867
4038	NC_019908	TCT	2	6	156307	156312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431806867
4039	NC_019908	CTT	2	6	156350	156355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431806867
4040	NC_019908	AAT	2	6	156373	156378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431806867
4041	NC_019908	TCA	2	6	156388	156393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431806867
4042	NC_019908	TTA	2	6	156407	156412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431806867
4043	NC_019908	ATT	2	6	156509	156514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431806868
4044	NC_019908	CTT	2	6	156620	156625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431806868
4045	NC_019908	AAC	2	6	156636	156641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	431806868
4046	NC_019908	TCA	2	6	156643	156648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431806868
4047	NC_019908	CAA	2	6	156743	156748	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	431806868
4048	NC_019908	AGATAA	2	12	156786	156797	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	431806868
4049	NC_019908	TCC	2	6	156828	156833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	431806868
4050	NC_019908	AGCACA	2	12	156843	156854	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	431806868
4051	NC_019908	AAT	2	6	156930	156935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431806868
4052	NC_019908	TCC	2	6	156945	156950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	431806868
4053	NC_019908	TCT	2	6	156976	156981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431806868
4054	NC_019908	ATT	2	6	157024	157029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431806868
4055	NC_019908	CTG	2	6	157040	157045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431806868
4056	NC_019908	TGC	2	6	157050	157055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431806868
4057	NC_019908	GCT	2	6	157099	157104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431806868
4058	NC_019908	TAC	2	6	157107	157112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431806868
4059	NC_019908	TC	3	6	157124	157129	0 %	50 %	0 %	50 %	431806868
4060	NC_019908	TTTTTG	2	12	157141	157152	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	431806868
4061	NC_019908	CTA	2	6	157163	157168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431806868
4062	NC_019908	T	6	6	157215	157220	0 %	100 %	0 %	0 %	431806868
4063	NC_019908	TTA	2	6	157226	157231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431806868
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4065	NC_019908	ATA	2	6	157243	157248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431806868
4066	NC_019908	ATA	2	6	157251	157256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431806868
4067	NC_019908	TCTATA	2	12	157309	157320	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	431806868
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4069	NC_019908	CTGTAG	2	12	157349	157360	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	431806868
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4071	NC_019908	GAG	2	6	157551	157556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	431806869
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4073	NC_019908	AAT	2	6	157615	157620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431806869
4074	NC_019908	CTATAG	2	12	157641	157652	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	431806869
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4078	NC_019908	ATT	2	6	157831	157836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431806869
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4081	NC_019908	T	7	7	157995	158001	0 %	100 %	0 %	0 %	431806869
4082	NC_019908	TAT	2	6	158068	158073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431806869
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4088	NC_019908	AGA	2	6	158782	158787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431806870
4089	NC_019908	TGA	2	6	158791	158796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431806870
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4093	NC_019908	TGA	2	6	158923	158928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431806870
4094	NC_019908	GGTAAA	2	12	158948	158959	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	431806870
4095	NC_019908	AG	4	8	158960	158967	50 %	0 %	50 %	0 %	431806870
4096	NC_019908	AT	3	6	159010	159015	50 %	50 %	0 %	0 %	431806870
4097	NC_019908	CAG	2	6	159022	159027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431806870
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4101	NC_019908	CA	3	6	159187	159192	50 %	0 %	0 %	50 %	431806870
4102	NC_019908	TAC	2	6	159253	159258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431806870
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4104	NC_019908	A	6	6	159295	159300	100 %	0 %	0 %	0 %	431806870
4105	NC_019908	A	7	7	159351	159357	100 %	0 %	0 %	0 %	431806870
4106	NC_019908	A	7	7	159388	159394	100 %	0 %	0 %	0 %	431806871
4107	NC_019908	TTAC	2	8	159442	159449	25 %	50 %	0 %	25 %	431806871
4108	NC_019908	AAT	2	6	159474	159479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431806871
4109	NC_019908	TAA	2	6	159486	159491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431806871
4110	NC_019908	AGA	3	9	159510	159518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431806871
4111	NC_019908	TAA	2	6	159522	159527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431806871
4112	NC_019908	ATAGA	2	10	159539	159548	60 %	20 %	20 %	0 %	431806871
4113	NC_019908	GAT	2	6	159625	159630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431806871
4114	NC_019908	GA	3	6	159657	159662	50 %	0 %	50 %	0 %	431806871
4115	NC_019908	ATT	3	9	159687	159695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431806871
4116	NC_019908	TGA	2	6	159699	159704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431806871
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4118	NC_019908	TAC	2	6	159765	159770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431806871
4119	NC_019908	AGAT	2	8	159783	159790	50 %	25 %	25 %	0 %	431806871
4120	NC_019908	AAGA	2	8	159958	159965	75 %	0 %	25 %	0 %	431806871
4121	NC_019908	AGAA	2	8	159976	159983	75 %	0 %	25 %	0 %	431806871
4122	NC_019908	TGA	2	6	159987	159992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431806871
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4496	NC_019908	TTA	2	6	175851	175856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431806883
4497	NC_019908	AGT	4	12	175865	175876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431806883
4498	NC_019908	TGT	3	9	175880	175888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	431806883
4499	NC_019908	T	7	7	175954	175960	0 %	100 %	0 %	0 %	431806883
4500	NC_019908	TGGT	2	8	176152	176159	0 %	50 %	50 %	0 %	431806884

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