MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Bacillus subtilis subsp. subtilis str. BSP1 chromosome

Total Repeats: 1164

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019896	AAGAGA	2	12	712	723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430756780
2	NC_019896	CTCTTT	2	12	1666	1677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430756779
3	NC_019896	GCGATT	2	12	2760	2771	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	430756777
4	NC_019896	TGTGAT	2	12	4144	4155	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	430756776
5	NC_019896	GGAGCG	2	12	6246	6257	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	430756775
6	NC_019896	AAAGCC	2	12	7548	7559	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	430756774
7	NC_019896	ATTTAG	2	12	9174	9185	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	430756772
8	NC_019896	TTTGAG	2	12	15127	15138	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	430756770
9	NC_019896	AGAAAA	2	12	19271	19282	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	430756763
10	NC_019896	AGTTTC	2	12	26982	26993	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	430756757
11	NC_019896	TTTTTG	2	12	29326	29337	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	430756755
12	NC_019896	CCTGTG	2	12	38183	38194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430756751
13	NC_019896	AAAAAG	2	12	41598	41609	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	430756747
14	NC_019896	TGAAGA	2	12	43015	43026	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	430756745
15	NC_019896	AAAAGG	2	12	49014	49025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430756739
16	NC_019896	GCCTCC	2	12	50564	50575	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	430756738
17	NC_019896	AAAATA	2	12	51492	51503	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	430756738
18	NC_019896	CCGATA	2	12	51913	51924	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	430756737
19	NC_019896	ATGTGG	2	12	52830	52841	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	430756737
20	NC_019896	CGAGAA	2	12	60611	60622	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	430755617
21	NC_019896	ATCAAC	2	12	62008	62019	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	430755618
22	NC_019896	TGTGTT	2	12	63470	63481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	430755620
23	NC_019896	GTGAAG	2	12	64986	64997	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	430755621
24	NC_019896	TGCTTT	2	12	65369	65380	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	430755622
25	NC_019896	GACATA	2	12	65486	65497	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	430755622
26	NC_019896	TTCACT	2	12	65902	65913	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	430755623
27	NC_019896	TTTTGT	2	12	66033	66044	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	430755623
28	NC_019896	ATCTAA	2	12	70750	70761	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	430755627
29	NC_019896	CAAAGG	2	12	79261	79272	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	430757877
30	NC_019896	TTGATT	2	12	86182	86193	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	430757885
31	NC_019896	GTAAAA	2	12	86805	86816	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	430757886
32	NC_019896	AGTGCC	2	12	103114	103125	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	430757889
33	NC_019896	TTTCTC	2	12	108723	108734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430757894
34	NC_019896	CAAAAT	2	12	109328	109339	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	430757895
35	NC_019896	ATTTGG	2	12	113046	113057	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	430757899
36	NC_019896	CATCGG	2	12	113604	113615	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	430757899
37	NC_019896	ATTGCC	2	12	120172	120183	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	430757450
38	NC_019896	AGCTGA	2	12	122264	122275	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	430757452
39	NC_019896	GAGGAA	2	12	122725	122736	50 %	0 %	50 %	0 %	430757452
40	NC_019896	TTTTGA	2	12	132485	132496	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	430757461
41	NC_019896	CGGCAG	2	12	133133	133144	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	430757461
42	NC_019896	ATCAAT	2	12	139261	139272	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	430757467
43	NC_019896	GTCCGG	2	12	141487	141498	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	430757470
44	NC_019896	GCCAGC	2	12	141804	141815	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	430757470
45	NC_019896	TGAAGG	2	12	144251	144262	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	430757472
46	NC_019896	TGAGCC	2	12	145109	145120	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	430757473
47	NC_019896	TAGAAA	2	12	145645	145656	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	430757474
48	NC_019896	ACAGCA	2	12	157891	157902	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	430757489
49	NC_019896	AATAAA	2	12	163517	163528	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	430757493
50	NC_019896	TAAGGG	2	12	176824	176835	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	430757494
51	NC_019896	ATTGAA	2	12	181297	181308	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	430757498
52	NC_019896	CTTTCT	2	12	186832	186843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430757506
53	NC_019896	AGGTGA	2	12	188702	188713	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	430757510
54	NC_019896	AAAGAA	2	12	190851	190862	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	430757511
55	NC_019896	AAGCGG	2	12	195556	195567	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	430757515
56	NC_019896	ATGGTC	2	12	196305	196316	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	430757515
57	NC_019896	TTTGAT	2	12	197722	197733	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	430757516
58	NC_019896	AGGAGT	2	12	198351	198362	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	430757516
59	NC_019896	TTTTCT	2	12	201199	201210	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	430757519
60	NC_019896	GTTGAT	2	12	202709	202720	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	430757520
61	NC_019896	TTTACG	2	12	203342	203353	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	430757521
62	NC_019896	CTTCAT	2	12	209326	209337	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	430757527
63	NC_019896	GCGGCA	2	12	211303	211314	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	430757529
64	NC_019896	ACAGGC	2	12	215364	215375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430757533
65	NC_019896	TTGCGG	2	12	217020	217031	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	430757535
66	NC_019896	AGAAAA	2	12	219933	219944	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	430757537
67	NC_019896	CTGCAT	2	12	220063	220074	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	430757537
68	NC_019896	TCCGAG	2	12	225257	225268	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	430757542
69	NC_019896	CACTAT	2	12	234769	234780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430757549
70	NC_019896	CGATGA	2	12	246384	246395	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	430757563
71	NC_019896	GTAAAG	2	12	255305	255316	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	430757571
72	NC_019896	GCTCGC	2	12	259504	259515	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	430757576
73	NC_019896	TTCGAC	2	12	260282	260293	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	430757577
74	NC_019896	CCCATA	2	12	261562	261573	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	430757578
75	NC_019896	TGTTTT	2	12	262257	262268	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	430757579
76	NC_019896	TCGGCA	2	12	262272	262283	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	430757579
77	NC_019896	GCCATG	2	12	262561	262572	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	430757579
78	NC_019896	GCTGAT	2	12	265880	265891	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	430757582
79	NC_019896	TTTGTT	2	12	272484	272495	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	430757588
80	NC_019896	AAAGAT	2	12	272555	272566	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	430757588
81	NC_019896	ATTTGG	2	12	279904	279915	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	430757596
82	NC_019896	CGAACA	2	12	286044	286055	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	430757603
83	NC_019896	GCAGAA	2	12	287450	287461	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	430757604
84	NC_019896	AATCGA	2	12	296755	296766	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	430757330
85	NC_019896	GACAGA	2	12	297233	297244	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	430757331
86	NC_019896	GAAAGC	2	12	300098	300109	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	430755719
87	NC_019896	ATGAGG	2	12	303550	303561	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	430755716
88	NC_019896	TTTCTG	2	12	307074	307085	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	430755711
89	NC_019896	TGGGAT	2	12	308411	308422	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	430755709
90	NC_019896	TTATTT	2	12	309187	309198	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	430755708
91	NC_019896	GCCTTG	2	12	313527	313538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430755703
92	NC_019896	GGAGCT	2	12	315799	315810	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	430755701
93	NC_019896	GCAAAA	2	12	323173	323184	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	430755693
94	NC_019896	AATTTC	2	12	324616	324627	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	430755691
95	NC_019896	AGCAAA	2	12	334170	334181	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	430755684
96	NC_019896	CGGTCG	2	12	335140	335151	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	430755682
97	NC_019896	ATAAAA	2	12	335395	335406	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	430755682
98	NC_019896	AAGCAA	2	12	340907	340918	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	430755677
99	NC_019896	CGTATT	2	12	341532	341543	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	430755677
100	NC_019896	ATGTTC	2	12	346296	346307	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	430755671
101	NC_019896	GAAAAT	2	12	347500	347511	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	430755671
102	NC_019896	TGAGGA	2	12	347958	347969	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	430755670
103	NC_019896	ATGAAA	2	12	348185	348196	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	430755669
104	NC_019896	GCGGGC	2	12	349065	349076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430755668
105	NC_019896	AAGAGA	2	12	353054	353065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430755666
106	NC_019896	AGCGCC	2	12	355727	355738	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	430755662
107	NC_019896	ATTGAC	2	12	358732	358743	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	430755660
108	NC_019896	TTGGCT	2	12	360090	360101	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	430755657
109	NC_019896	TGCGAT	2	12	363785	363796	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	430755655
110	NC_019896	AATGGC	2	12	368997	369008	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	430755649
111	NC_019896	GCGAAG	2	12	371232	371243	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	430755645
112	NC_019896	TGAGCT	2	12	371332	371343	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	430755645
113	NC_019896	CACGTA	2	12	372417	372428	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	430755644
114	NC_019896	GAAAAT	2	12	372618	372629	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	430755644
115	NC_019896	GCGATG	2	12	377780	377791	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	430755639
116	NC_019896	ATGAAT	2	12	379596	379607	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	430755639
117	NC_019896	TGAAAA	2	12	381374	381385	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	430755638
118	NC_019896	TGAAGG	2	12	387188	387199	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	430755633
119	NC_019896	CATGGA	2	12	389808	389819	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	430755630
120	NC_019896	GAAAAA	2	12	394069	394080	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	430758218
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342	NC_019896	CCTTTT	2	12	1086778	1086789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430757655
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345	NC_019896	TCAATC	2	12	1098787	1098798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430757671
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447	NC_019896	CTTCCT	2	12	1411273	1411284	0 %	50 %	0 %	50 %	430755889
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451	NC_019896	AGATGA	2	12	1421071	1421082	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	430755881
452	NC_019896	CAATAT	2	12	1423644	1423655	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	430755878
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454	NC_019896	TGAAGA	2	12	1426562	1426573	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	430755875
455	NC_019896	TGCAGG	2	12	1427497	1427508	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	430755875
456	NC_019896	GACGAA	2	12	1429863	1429874	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	430755872
457	NC_019896	ATCGAA	2	12	1433377	1433388	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	430755868
458	NC_019896	TTCTTG	2	12	1434464	1434475	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	430755867
459	NC_019896	GATTCA	2	12	1437685	1437696	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	430755864
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