MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum AS43.3 chromosome

Total Repeats: 1194

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019842	AAAAGA	2	12	4190	4201	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	429503535
2	NC_019842	TCCGGA	2	12	5385	5396	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	429503537
3	NC_019842	TGAAGA	2	12	8486	8497	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	429503538
4	NC_019842	ACTGGC	2	12	17514	17525	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	429503541
5	NC_019842	ACGGAT	2	12	22681	22692	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	429503545
6	NC_019842	GAAGGT	2	12	28927	28938	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	429503552
7	NC_019842	TTAAAT	2	12	29433	29444	50 %	50 %	0 %	0 %	429503552
8	NC_019842	CAGGCG	2	12	37469	37480	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	429503559
9	NC_019842	AATGTG	2	12	42372	42383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503564
10	NC_019842	GAAAAA	2	12	47753	47764	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	429503571
11	NC_019842	GTTTCT	2	12	49600	49611	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	429503573
12	NC_019842	AGCGGA	2	12	55016	55027	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	429503579
13	NC_019842	TTGCCA	2	12	58427	58438	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	429503583
14	NC_019842	GAATCG	2	12	60632	60643	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	429503586
15	NC_019842	ATGATC	2	12	75133	75144	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	429503600
16	NC_019842	AGCTGC	2	12	76630	76641	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	429503601
17	NC_019842	TGTCGG	2	12	78371	78382	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	429503603
18	NC_019842	AACACC	2	12	79762	79773	50 %	0 %	0 %	50 %	429503604
19	NC_019842	TCAAAT	2	12	89638	89649	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	429503616
20	NC_019842	GTATCG	2	12	90780	90791	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	429503616
21	NC_019842	TGGCAC	2	12	104231	104242	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	429503620
22	NC_019842	ACTCGG	2	12	104346	104357	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	429503620
23	NC_019842	TGCCGA	2	12	109007	109018	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	429503622
24	NC_019842	GTCATT	2	12	109869	109880	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	429503623
25	NC_019842	CCAAGC	2	12	110365	110376	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	429503623
26	NC_019842	GCATGG	2	12	118836	118847	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	429503635
27	NC_019842	CATTTA	2	12	119396	119407	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	429503636
28	NC_019842	TCTGGT	2	12	119461	119472	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	429503636
29	NC_019842	GAAGCT	2	12	119978	119989	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	429503637
30	NC_019842	CTTGCA	2	12	121123	121134	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	429503638
31	NC_019842	CTGTAG	2	12	121330	121341	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	429503639
32	NC_019842	AGTTGA	2	12	131552	131563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503646
33	NC_019842	TAAAGG	2	12	136680	136691	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	429503650
34	NC_019842	GTCGGT	2	12	143299	143310	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	429503665
35	NC_019842	ATCGAA	2	12	143392	143403	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	429503665
36	NC_019842	CATTAA	2	12	146832	146843	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	429503671
37	NC_019842	GAAAAG	2	12	148530	148541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503674
38	NC_019842	AAACAA	2	12	148571	148582	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	429503674
39	NC_019842	AAAAAG	2	12	150299	150310	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	429503677
40	NC_019842	TTAACT	2	12	155096	155107	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	429503684
41	NC_019842	CGGTTG	2	12	155540	155551	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	429503685
42	NC_019842	GTTTTT	2	12	180064	180075	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	429503695
43	NC_019842	ACGGAT	2	12	182432	182443	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	429503697
44	NC_019842	TCCGGC	2	12	185681	185692	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	429503700
45	NC_019842	ATAAAT	2	12	187336	187347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429503702
46	NC_019842	TCTGAT	2	12	187357	187368	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	429503702
47	NC_019842	TTCTTT	2	12	195799	195810	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	429503708
48	NC_019842	TGTTGA	2	12	201420	201431	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	429503714
49	NC_019842	AGACAA	2	12	202086	202097	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	429503714
50	NC_019842	TGGCCG	2	12	204837	204848	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	429503716
51	NC_019842	GAAATG	2	12	205349	205360	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	429503716
52	NC_019842	TGCGGA	2	12	211213	211224	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	429503721
53	NC_019842	TATCTT	2	12	213313	213324	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	429503724
54	NC_019842	CGGAAT	2	12	213655	213666	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	429503724
55	NC_019842	TTCGGT	2	12	213674	213685	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	429503724
56	NC_019842	AAACCG	2	12	216628	216639	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	429503727
57	NC_019842	GTGAAC	2	12	218757	218768	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	429503729
58	NC_019842	CTTTTC	2	12	219516	219527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429503730
59	NC_019842	GGCTGC	2	12	221958	221969	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	429503734
60	NC_019842	AAGCGA	2	12	224290	224301	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	429503736
61	NC_019842	ACAATA	2	12	229798	229809	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	429503742
62	NC_019842	ACGCCG	2	12	231145	231156	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	429503742
63	NC_019842	TTTTAT	2	12	237259	237270	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	429503749
64	NC_019842	ACCATT	2	12	240228	240239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429503753
65	NC_019842	CTGCCG	2	12	240609	240620	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	429503753
66	NC_019842	GAGACG	2	12	242569	242580	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	429503755
67	NC_019842	ATGCCG	2	12	246406	246417	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	429503758
68	NC_019842	CGAGGA	2	12	248891	248902	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	429503760
69	NC_019842	GCGGAA	2	12	255623	255634	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	429503770
70	NC_019842	AGCGGG	2	12	257498	257509	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	429503771
71	NC_019842	CAGGAT	2	12	262690	262701	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	429503777
72	NC_019842	GCAGCC	2	12	263210	263221	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	429503778
73	NC_019842	TGAGAT	2	12	272316	272327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503786
74	NC_019842	TTTTCA	2	12	274996	275007	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	429503788
75	NC_019842	TCATTG	2	12	276050	276061	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	429503789
76	NC_019842	GAAGAG	2	12	276415	276426	50 %	0 %	50 %	0 %	429503789
77	NC_019842	CCACAG	2	12	276450	276461	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	429503789
78	NC_019842	TTCTGC	2	12	278455	278466	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	429503791
79	NC_019842	TGATTT	2	12	280582	280593	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	429503793
80	NC_019842	GAAGCG	2	12	280808	280819	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	429503793
81	NC_019842	GGGCGA	2	12	281328	281339	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	429503794
82	NC_019842	TTTATC	2	12	281934	281945	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	429503795
83	NC_019842	AAAATC	2	12	284182	284193	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	429503796
84	NC_019842	AAACAG	2	12	287909	287920	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	429503798
85	NC_019842	TTTCGG	2	12	290326	290337	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	429503801
86	NC_019842	AGAGTG	2	12	292802	292813	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	429503803
87	NC_019842	GAAAGA	2	12	292815	292826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503803
88	NC_019842	ACGCTG	2	12	295304	295315	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	429503804
89	NC_019842	GGAAAA	2	12	299193	299204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503808
90	NC_019842	AGGATG	2	12	302796	302807	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	429503812
91	NC_019842	AGAATG	2	12	302951	302962	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	429503812
92	NC_019842	CGGATG	2	12	303593	303604	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	429503813
93	NC_019842	TATTGA	2	12	306383	306394	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	429503816
94	NC_019842	AGCGAC	2	12	308095	308106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429503818
95	NC_019842	GATCTC	2	12	309282	309293	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	429503819
96	NC_019842	ATGGGG	2	12	313742	313753	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	429503822
97	NC_019842	ATCAAT	2	12	325369	325380	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	429503828
98	NC_019842	TTTGAG	2	12	326727	326738	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	429503829
99	NC_019842	GAGCAG	2	12	327030	327041	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	429503829
100	NC_019842	GCCTGA	2	12	332379	332390	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	429503836
101	NC_019842	AAATGC	2	12	341778	341789	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	429503840
102	NC_019842	CGGCGA	2	12	343050	343061	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	429503840
103	NC_019842	GATGAC	2	12	345018	345029	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	429503840
104	NC_019842	ATGAAA	2	12	347924	347935	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	429503841
105	NC_019842	ACTGGA	2	12	352563	352574	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	429503841
106	NC_019842	CGGCGA	2	12	353817	353828	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	429503841
107	NC_019842	AATGTC	2	12	358121	358132	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	429503842
108	NC_019842	TCAGGC	2	12	358906	358917	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	429503842
109	NC_019842	ATGAAA	2	12	370797	370808	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	429503856
110	NC_019842	ATCAAA	2	12	371321	371332	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	429503856
111	NC_019842	ATCCAG	2	12	373057	373068	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	429503859
112	NC_019842	TGCTCG	2	12	380269	380280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503864
113	NC_019842	GGATGC	2	12	381713	381724	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	429503865
114	NC_019842	CGGAAA	2	12	382663	382674	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	429503867
115	NC_019842	TTTTGT	2	12	388821	388832	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	429503873
116	NC_019842	ATTTTG	2	12	390532	390543	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	429503875
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227	NC_019842	CATGAC	2	12	751341	751352	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	429504249
228	NC_019842	GCAATT	2	12	752125	752136	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	429504250
229	NC_019842	TAAACC	2	12	763707	763718	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	429504256
230	NC_019842	AATGAA	2	12	764758	764769	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	429504256
231	NC_019842	AATCGA	2	12	765528	765539	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	429504256
232	NC_019842	AAGTGA	2	12	767409	767420	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	429504258
233	NC_019842	AACGGG	2	12	768881	768892	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	429504258
234	NC_019842	TCAATG	2	12	769953	769964	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	429504258
235	NC_019842	TCAGGA	2	12	770375	770386	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	429504258
236	NC_019842	CGGCTG	2	12	778003	778014	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	429504263
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240	NC_019842	CTGATC	2	12	788625	788636	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	429504277
241	NC_019842	CAAAGG	2	12	792754	792765	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	429504281
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243	NC_019842	GCGTAT	2	12	797825	797836	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	429504285
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248	NC_019842	TCGGCC	2	12	817814	817825	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	429504306
249	NC_019842	AAAGGC	2	12	823514	823525	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	429504311
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251	NC_019842	GCTGAC	2	12	825841	825852	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	429504313
252	NC_019842	AAGGAG	2	12	826829	826840	50 %	0 %	50 %	0 %	429504314
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255	NC_019842	ACCCGC	2	12	842380	842391	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	429504326
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257	NC_019842	CACTGA	2	12	850502	850513	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	429504334
258	NC_019842	CGGCAT	2	12	855490	855501	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	429504338
259	NC_019842	TAAGCA	2	12	858991	859002	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	429504344
260	NC_019842	CCGCAT	2	12	859922	859933	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	429504345
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262	NC_019842	CGTAGT	2	12	860320	860331	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	429504346
263	NC_019842	CGGTGA	2	12	862035	862046	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	429504349
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332	NC_019842	TTAATT	2	12	1126164	1126175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429504619
333	NC_019842	TAACAA	2	12	1130007	1130018	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	429504622
334	NC_019842	TTGTGA	2	12	1131042	1131053	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	429504623
335	NC_019842	GAAAAA	2	12	1136487	1136498	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	429504628
336	NC_019842	TTCAGG	2	12	1138586	1138597	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	429504631
337	NC_019842	CATTTC	2	12	1139998	1140009	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	429504632
338	NC_019842	ATTTCT	2	12	1145687	1145698	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	429504639
339	NC_019842	GAAAGC	2	12	1148702	1148713	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	429504644
340	NC_019842	CTTTTT	2	12	1159779	1159790	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	429504657
341	NC_019842	TTTCTT	2	12	1160552	1160563	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	429504658
342	NC_019842	AAAAGG	2	12	1161452	1161463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429504660
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366	NC_019842	ATCCGA	2	12	1302063	1302074	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	429504836
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448	NC_019842	TATTCA	2	12	1571401	1571412	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	429505079
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450	NC_019842	AATGGG	2	12	1575899	1575910	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	429505081
451	NC_019842	TGATAT	2	12	1583592	1583603	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	429505087
452	NC_019842	AAAGGA	2	12	1584218	1584229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429505088
453	NC_019842	ATGAAT	2	12	1590045	1590056	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	429505094
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455	NC_019842	CGGCGT	2	12	1596417	1596428	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	429505101
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