MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum AS43.3 chromosome

Total Repeats: 73099

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_019842	GCGGAA	2	12	255623	255634	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	429503770
4002	NC_019842	AATC	2	8	255676	255683	50 %	25 %	0 %	25 %	429503770
4003	NC_019842	CCG	2	6	255817	255822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429503770
4004	NC_019842	GCC	2	6	255877	255882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429503770
4005	NC_019842	CCG	2	6	255893	255898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429503770
4006	NC_019842	TGACA	2	10	256254	256263	40 %	20 %	20 %	20 %	429503771
4007	NC_019842	CCG	2	6	256332	256337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429503771
4008	NC_019842	GGC	2	6	256534	256539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429503771
4009	NC_019842	CGC	2	6	256575	256580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429503771
4010	NC_019842	TGA	2	6	256581	256586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503771
4011	NC_019842	CGGAA	2	10	256611	256620	40 %	0 %	40 %	20 %	429503771
4012	NC_019842	CAG	2	6	256798	256803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429503771
4013	NC_019842	TAT	2	6	256816	256821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429503771
4014	NC_019842	CGAA	2	8	256898	256905	50 %	0 %	25 %	25 %	429503771
4015	NC_019842	CAG	2	6	256938	256943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429503771
4016	NC_019842	GCC	2	6	257014	257019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429503771
4017	NC_019842	CGC	2	6	257022	257027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429503771
4018	NC_019842	AGG	2	6	257125	257130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429503771
4019	NC_019842	TTA	2	6	257148	257153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429503771
4020	NC_019842	GAT	2	6	257272	257277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503771
4021	NC_019842	GCC	2	6	257301	257306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429503771
4022	NC_019842	TGA	2	6	257310	257315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503771
4023	NC_019842	GA	3	6	257319	257324	50 %	0 %	50 %	0 %	429503771
4024	NC_019842	GCA	2	6	257412	257417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429503771
4025	NC_019842	AAC	2	6	257445	257450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429503771
4026	NC_019842	AGCGGG	2	12	257498	257509	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	429503771
4027	NC_019842	TCA	2	6	257510	257515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429503771
4028	NC_019842	TCG	2	6	257639	257644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503771
4029	NC_019842	GGA	2	6	257662	257667	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429503771
4030	NC_019842	AAAAC	2	10	257706	257715	80 %	0 %	0 %	20 %	429503771
4031	NC_019842	GTG	2	6	257797	257802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429503771
4032	NC_019842	TTCA	2	8	257844	257851	25 %	50 %	0 %	25 %	429503771
4033	NC_019842	TC	3	6	257885	257890	0 %	50 %	0 %	50 %	429503771
4034	NC_019842	TTC	2	6	257944	257949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429503771
4035	NC_019842	GAAA	2	8	257981	257988	75 %	0 %	25 %	0 %	429503771
4036	NC_019842	AGG	2	6	258009	258014	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429503771
4037	NC_019842	TCA	2	6	258074	258079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429503772
4038	NC_019842	GCC	2	6	258115	258120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429503772
4039	NC_019842	GCT	2	6	258129	258134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503772
4040	NC_019842	A	6	6	258287	258292	100 %	0 %	0 %	0 %	429503773
4041	NC_019842	T	6	6	258365	258370	0 %	100 %	0 %	0 %	429503773
4042	NC_019842	CTG	2	6	258379	258384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503773
4043	NC_019842	CGAG	2	8	258450	258457	25 %	0 %	50 %	25 %	429503773
4044	NC_019842	ATG	2	6	258473	258478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503773
4045	NC_019842	CGC	2	6	258569	258574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429503773
4046	NC_019842	GCTTT	2	10	258578	258587	0 %	60 %	20 %	20 %	429503773
4047	NC_019842	TAT	2	6	258613	258618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429503773
4048	NC_019842	CCG	2	6	258681	258686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429503773
4049	NC_019842	CGG	2	6	258708	258713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429503773
4050	NC_019842	TTTG	2	8	258760	258767	0 %	75 %	25 %	0 %	429503773
4051	NC_019842	TCG	2	6	258861	258866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503773
4052	NC_019842	GCT	2	6	258922	258927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503773
4053	NC_019842	GAA	2	6	258973	258978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503773
4054	NC_019842	CCG	2	6	259019	259024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429503774
4055	NC_019842	CGG	2	6	259050	259055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429503774
4056	NC_019842	CGC	2	6	259158	259163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429503774
4057	NC_019842	GAT	2	6	259173	259178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503774
4058	NC_019842	GGC	2	6	259179	259184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429503774
4059	NC_019842	CATC	2	8	259191	259198	25 %	25 %	0 %	50 %	429503774
4060	NC_019842	GAT	2	6	259212	259217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503774
4061	NC_019842	CCG	2	6	259233	259238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429503774
4062	NC_019842	CCTT	2	8	259262	259269	0 %	50 %	0 %	50 %	429503774
4063	NC_019842	GC	3	6	259378	259383	0 %	0 %	50 %	50 %	429503774
4064	NC_019842	GCC	2	6	259429	259434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429503774
4065	NC_019842	GAT	2	6	259450	259455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503774
4066	NC_019842	GCA	2	6	259488	259493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429503774
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4068	NC_019842	CCG	2	6	259607	259612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429503774
4069	NC_019842	T	6	6	259639	259644	0 %	100 %	0 %	0 %	429503774
4070	NC_019842	CA	3	6	259769	259774	50 %	0 %	0 %	50 %	429503775
4071	NC_019842	GCT	2	6	259789	259794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503775
4072	NC_019842	GAA	2	6	259875	259880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503775
4073	NC_019842	GAA	2	6	259941	259946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503775
4074	NC_019842	GCT	2	6	259971	259976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503775
4075	NC_019842	CGT	2	6	259985	259990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503775
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4077	NC_019842	TG	3	6	260169	260174	0 %	50 %	50 %	0 %	429503775
4078	NC_019842	AAG	2	6	260238	260243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503775
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4080	NC_019842	ATCA	2	8	260269	260276	50 %	25 %	0 %	25 %	429503775
4081	NC_019842	GGT	2	6	260422	260427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429503775
4082	NC_019842	GCA	2	6	260432	260437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429503775
4083	NC_019842	CGGA	2	8	260476	260483	25 %	0 %	50 %	25 %	429503775
4084	NC_019842	AT	3	6	260523	260528	50 %	50 %	0 %	0 %	429503775
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4087	NC_019842	GCC	2	6	260651	260656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429503775
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4089	NC_019842	ATC	2	6	260763	260768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429503775
4090	NC_019842	GAT	2	6	260799	260804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503775
4091	NC_019842	TGA	2	6	260819	260824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503775
4092	NC_019842	GC	3	6	260835	260840	0 %	0 %	50 %	50 %	429503775
4093	NC_019842	TA	3	6	260843	260848	50 %	50 %	0 %	0 %	429503775
4094	NC_019842	A	7	7	260848	260854	100 %	0 %	0 %	0 %	429503775
4095	NC_019842	AAAG	2	8	260915	260922	75 %	0 %	25 %	0 %	429503776
4096	NC_019842	ATC	2	6	260949	260954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429503776
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4098	NC_019842	ATG	2	6	261060	261065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503776
4099	NC_019842	CTG	2	6	261101	261106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503776
4100	NC_019842	TCCG	2	8	261128	261135	0 %	25 %	25 %	50 %	429503776
4101	NC_019842	CGG	2	6	261146	261151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429503776
4102	NC_019842	CGTT	2	8	261166	261173	0 %	50 %	25 %	25 %	429503776
4103	NC_019842	CAT	2	6	261182	261187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429503776
4104	NC_019842	ATC	2	6	261204	261209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429503776
4105	NC_019842	TG	3	6	261215	261220	0 %	50 %	50 %	0 %	429503776
4106	NC_019842	ACG	2	6	261225	261230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429503776
4107	NC_019842	CGG	2	6	261280	261285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429503776
4108	NC_019842	TGA	2	6	261289	261294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503776
4109	NC_019842	GCA	2	6	261385	261390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429503776
4110	NC_019842	TTG	2	6	261457	261462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	429503776
4111	NC_019842	CAT	2	6	261473	261478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429503776
4112	NC_019842	AACA	2	8	261506	261513	75 %	0 %	0 %	25 %	429503776
4113	NC_019842	GC	3	6	261528	261533	0 %	0 %	50 %	50 %	429503776
4114	NC_019842	TCA	2	6	261538	261543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429503776
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4118	NC_019842	ATG	2	6	261876	261881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503776
4119	NC_019842	CGC	2	6	261902	261907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429503776
4120	NC_019842	GCG	2	6	261919	261924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429503776
4121	NC_019842	GCA	3	9	261958	261966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429503776
4122	NC_019842	GCC	2	6	261996	262001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429503776
4123	NC_019842	TCG	2	6	262084	262089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503776
4124	NC_019842	CGT	2	6	262151	262156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503776
4125	NC_019842	TCA	2	6	262195	262200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429503776
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4136	NC_019842	TCATT	2	10	262744	262753	20 %	60 %	0 %	20 %	429503777
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4142	NC_019842	GCTCT	2	10	263144	263153	0 %	40 %	20 %	40 %	429503778
4143	NC_019842	CGGC	2	8	263160	263167	0 %	0 %	50 %	50 %	429503778
4144	NC_019842	GAAA	2	8	263188	263195	75 %	0 %	25 %	0 %	429503778
4145	NC_019842	GCAGCC	2	12	263210	263221	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	429503778
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4237	NC_019842	CATCA	2	10	267884	267893	40 %	20 %	0 %	40 %	429503782
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4479	NC_019842	CTGA	2	8	281769	281776	25 %	25 %	25 %	25 %	429503795
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4487	NC_019842	GC	3	6	281992	281997	0 %	0 %	50 %	50 %	429503795
4488	NC_019842	TGGCT	2	10	282004	282013	0 %	40 %	40 %	20 %	429503795
4489	NC_019842	TGA	2	6	282044	282049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503795
4490	NC_019842	GAA	2	6	282065	282070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503795
4491	NC_019842	ATGG	2	8	282077	282084	25 %	25 %	50 %	0 %	429503795
4492	NC_019842	CGG	2	6	282206	282211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429503795
4493	NC_019842	ATG	2	6	282228	282233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503795
4494	NC_019842	GGC	2	6	282329	282334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429503795
4495	NC_019842	GTG	2	6	282363	282368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429503795
4496	NC_019842	TTC	2	6	282369	282374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429503795
4497	NC_019842	ATC	3	9	282378	282386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429503795
4498	NC_019842	TAT	2	6	282407	282412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429503795
4499	NC_019842	CAA	2	6	282422	282427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429503795
4500	NC_019842	AGA	2	6	282464	282469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503795

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