MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum AS43.3 chromosome

Total Repeats: 73099

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_019842	AAAATC	2	12	284182	284193	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	429503796
4502	NC_019842	CAG	2	6	284289	284294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429503796
4503	NC_019842	GCT	2	6	284318	284323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503796
4504	NC_019842	ATG	2	6	284382	284387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503796
4505	NC_019842	ACA	2	6	284391	284396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429503796
4506	NC_019842	A	6	6	284566	284571	100 %	0 %	0 %	0 %	429503796
4507	NC_019842	ACA	2	6	284644	284649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429503796
4508	NC_019842	ACT	2	6	284653	284658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429503796
4509	NC_019842	CTT	2	6	284725	284730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429503796
4510	NC_019842	GAA	2	6	284733	284738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503796
4511	NC_019842	CGGC	2	8	284743	284750	0 %	0 %	50 %	50 %	429503796
4512	NC_019842	CCT	2	6	284873	284878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429503796
4513	NC_019842	CAT	2	6	284954	284959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429503796
4514	NC_019842	GAGC	2	8	285005	285012	25 %	0 %	50 %	25 %	429503796
4515	NC_019842	CCG	2	6	285017	285022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429503796
4516	NC_019842	GAAAC	2	10	285159	285168	60 %	0 %	20 %	20 %	429503796
4517	NC_019842	GAA	2	6	285174	285179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503796
4518	NC_019842	AGA	2	6	285197	285202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503796
4519	NC_019842	ATA	2	6	285232	285237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429503796
4520	NC_019842	AC	3	6	285263	285268	50 %	0 %	0 %	50 %	429503796
4521	NC_019842	AACA	2	8	285378	285385	75 %	0 %	0 %	25 %	429503797
4522	NC_019842	GCTG	2	8	285430	285437	0 %	25 %	50 %	25 %	429503797
4523	NC_019842	GATG	2	8	285446	285453	25 %	25 %	50 %	0 %	429503797
4524	NC_019842	TAT	2	6	285470	285475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429503797
4525	NC_019842	CGC	2	6	285476	285481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429503797
4526	NC_019842	AAATG	2	10	285514	285523	60 %	20 %	20 %	0 %	429503797
4527	NC_019842	A	6	6	285600	285605	100 %	0 %	0 %	0 %	429503797
4528	NC_019842	ATC	2	6	285780	285785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429503797
4529	NC_019842	TGC	2	6	285787	285792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503797
4530	NC_019842	CTT	2	6	285819	285824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429503797
4531	NC_019842	GCG	2	6	285825	285830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429503797
4532	NC_019842	GCT	2	6	285875	285880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503797
4533	NC_019842	A	7	7	285963	285969	100 %	0 %	0 %	0 %	429503797
4534	NC_019842	TGC	2	6	286024	286029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503797
4535	NC_019842	TGTC	2	8	286030	286037	0 %	50 %	25 %	25 %	429503797
4536	NC_019842	CGT	2	6	286049	286054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503797
4537	NC_019842	TGA	2	6	286099	286104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503797
4538	NC_019842	TGA	2	6	286144	286149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503797
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4540	NC_019842	CGG	2	6	286240	286245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429503797
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4542	NC_019842	TGC	2	6	286285	286290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503797
4543	NC_019842	TGC	2	6	286303	286308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503797
4544	NC_019842	CTT	2	6	286313	286318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429503797
4545	NC_019842	GCG	2	6	286371	286376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429503797
4546	NC_019842	CGG	2	6	286402	286407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429503797
4547	NC_019842	CGG	2	6	286421	286426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429503797
4548	NC_019842	TCG	2	6	286444	286449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503797
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4550	NC_019842	TCA	2	6	286522	286527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429503797
4551	NC_019842	ATT	3	9	286530	286538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429503797
4552	NC_019842	GAAAC	2	10	286548	286557	60 %	0 %	20 %	20 %	429503797
4553	NC_019842	A	7	7	287029	287035	100 %	0 %	0 %	0 %	429503798
4554	NC_019842	A	6	6	287059	287064	100 %	0 %	0 %	0 %	429503798
4555	NC_019842	A	6	6	287066	287071	100 %	0 %	0 %	0 %	429503798
4556	NC_019842	TCAA	2	8	287106	287113	50 %	25 %	0 %	25 %	429503798
4557	NC_019842	ATG	2	6	287130	287135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503798
4558	NC_019842	TCA	2	6	287148	287153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429503798
4559	NC_019842	A	7	7	287291	287297	100 %	0 %	0 %	0 %	429503798
4560	NC_019842	A	6	6	287387	287392	100 %	0 %	0 %	0 %	429503798
4561	NC_019842	TCAGC	2	10	287464	287473	20 %	20 %	20 %	40 %	429503798
4562	NC_019842	GGA	2	6	287474	287479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429503798
4563	NC_019842	GCA	2	6	287482	287487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429503798
4564	NC_019842	TTC	2	6	287529	287534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429503798
4565	NC_019842	GATG	2	8	287536	287543	25 %	25 %	50 %	0 %	429503798
4566	NC_019842	ATC	2	6	287627	287632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429503798
4567	NC_019842	TCA	2	6	287634	287639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429503798
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4569	NC_019842	TGA	2	6	287685	287690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503798
4570	NC_019842	GAA	2	6	287723	287728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503798
4571	NC_019842	TGA	2	6	287733	287738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503798
4572	NC_019842	CAT	2	6	287809	287814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429503798
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4579	NC_019842	GC	3	6	288132	288137	0 %	0 %	50 %	50 %	429503798
4580	NC_019842	TA	3	6	288155	288160	50 %	50 %	0 %	0 %	429503798
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4589	NC_019842	AGAA	2	8	288567	288574	75 %	0 %	25 %	0 %	429503799
4590	NC_019842	CCG	2	6	288580	288585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429503799
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4592	NC_019842	TCT	2	6	288654	288659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429503799
4593	NC_019842	CGT	2	6	288682	288687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503799
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4597	NC_019842	GCTT	2	8	288871	288878	0 %	50 %	25 %	25 %	429503799
4598	NC_019842	GAA	3	9	289039	289047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503799
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4600	NC_019842	CGCTG	2	10	289098	289107	0 %	20 %	40 %	40 %	429503800
4601	NC_019842	CTTT	2	8	289111	289118	0 %	75 %	0 %	25 %	429503800
4602	NC_019842	CTGC	2	8	289121	289128	0 %	25 %	25 %	50 %	429503800
4603	NC_019842	GTC	2	6	289261	289266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503800
4604	NC_019842	TGC	2	6	289278	289283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503800
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4606	NC_019842	ATC	2	6	289327	289332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429503800
4607	NC_019842	CGC	2	6	289346	289351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429503800
4608	NC_019842	TGA	2	6	289386	289391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503800
4609	NC_019842	A	7	7	289396	289402	100 %	0 %	0 %	0 %	429503800
4610	NC_019842	A	6	6	289576	289581	100 %	0 %	0 %	0 %	429503800
4611	NC_019842	TCAAT	2	10	289919	289928	40 %	40 %	0 %	20 %	429503800
4612	NC_019842	GAA	2	6	289938	289943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503800
4613	NC_019842	T	7	7	289977	289983	0 %	100 %	0 %	0 %	429503801
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4621	NC_019842	GCCT	2	8	290426	290433	0 %	25 %	25 %	50 %	429503801
4622	NC_019842	ATGA	2	8	290477	290484	50 %	25 %	25 %	0 %	429503801
4623	NC_019842	GCG	2	6	290508	290513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429503801
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4642	NC_019842	T	7	7	291499	291505	0 %	100 %	0 %	0 %	429503802
4643	NC_019842	GGC	2	6	291519	291524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429503802
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4653	NC_019842	CTG	2	6	291945	291950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503802
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4866	NC_019842	GCT	2	6	304452	304457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503814
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4870	NC_019842	T	6	6	304915	304920	0 %	100 %	0 %	0 %	429503815
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4873	NC_019842	CCAT	2	8	304969	304976	25 %	25 %	0 %	50 %	429503815
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4986	NC_019842	CAA	2	6	311209	311214	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429503820
4987	NC_019842	GCGG	2	8	311384	311391	0 %	0 %	75 %	25 %	429503820
4988	NC_019842	ATT	2	6	311397	311402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429503820
4989	NC_019842	ATT	2	6	311541	311546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429503821
4990	NC_019842	GACG	2	8	311599	311606	25 %	0 %	50 %	25 %	429503821
4991	NC_019842	G	7	7	311630	311636	0 %	0 %	100 %	0 %	429503821
4992	NC_019842	GCG	2	6	311676	311681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429503821
4993	NC_019842	GCG	2	6	311740	311745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429503821
4994	NC_019842	ATC	2	6	311942	311947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429503821
4995	NC_019842	CGT	2	6	312026	312031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503821
4996	NC_019842	GGAC	2	8	312073	312080	25 %	0 %	50 %	25 %	429503821
4997	NC_019842	GGC	2	6	312147	312152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429503821
4998	NC_019842	TCCGT	2	10	312175	312184	0 %	40 %	20 %	40 %	429503821
4999	NC_019842	GAC	2	6	312215	312220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429503821
5000	NC_019842	ATT	2	6	312231	312236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429503821

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