MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bordetella bronchiseptica 253

Total Repeats: 138120

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4122	NC_019382	GCCG	2	8	180657	180664	0 %	0 %	50 %	50 %	412337511
4123	NC_019382	TGC	2	6	180677	180682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337511
4124	NC_019382	CCG	2	6	180683	180688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337511
4125	NC_019382	GCC	2	6	180799	180804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337511
4126	NC_019382	GAA	2	6	180810	180815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	412337511
4127	NC_019382	CGA	2	6	180858	180863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337511
4128	NC_019382	CGTG	2	8	180926	180933	0 %	25 %	50 %	25 %	412337511
4129	NC_019382	ACG	2	6	180968	180973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337511
4130	NC_019382	TCG	2	6	180977	180982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337511
4131	NC_019382	CGGGC	2	10	181017	181026	0 %	0 %	60 %	40 %	412337511
4132	NC_019382	CGA	2	6	181029	181034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337511
4133	NC_019382	GGC	2	6	181114	181119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337511
4134	NC_019382	GTG	2	6	181123	181128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412337511
4135	NC_019382	CGG	2	6	181138	181143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337511
4136	NC_019382	GGGC	2	8	181146	181153	0 %	0 %	75 %	25 %	412337511
4137	NC_019382	TTC	2	6	181156	181161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	412337511
4138	NC_019382	CCT	2	6	181184	181189	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	412337511
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4140	NC_019382	CGA	2	6	181254	181259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337511
4141	NC_019382	GCT	2	6	181270	181275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337511
4142	NC_019382	GCC	2	6	181342	181347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337511
4143	NC_019382	TGG	2	6	181367	181372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412337511
4144	NC_019382	GGC	2	6	181447	181452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337511
4145	NC_019382	CGGCA	2	10	181453	181462	20 %	0 %	40 %	40 %	412337511
4146	NC_019382	CGA	2	6	181464	181469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337511
4147	NC_019382	GCG	2	6	181522	181527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337512
4148	NC_019382	GCA	2	6	181549	181554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337512
4149	NC_019382	GCG	2	6	181671	181676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337512
4150	NC_019382	GC	4	8	181680	181687	0 %	0 %	50 %	50 %	412337512
4151	NC_019382	GCA	2	6	181699	181704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337512
4152	NC_019382	G	6	6	181766	181771	0 %	0 %	100 %	0 %	412337512
4153	NC_019382	TCG	2	6	181803	181808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337512
4154	NC_019382	CG	3	6	181848	181853	0 %	0 %	50 %	50 %	412337512
4155	NC_019382	GC	4	8	182044	182051	0 %	0 %	50 %	50 %	412337512
4156	NC_019382	GC	4	8	182077	182084	0 %	0 %	50 %	50 %	412337512
4157	NC_019382	CAG	2	6	182108	182113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337512
4158	NC_019382	ACGG	2	8	182160	182167	25 %	0 %	50 %	25 %	412337512
4159	NC_019382	GCGG	2	8	182179	182186	0 %	0 %	75 %	25 %	412337512
4160	NC_019382	CAG	2	6	182210	182215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337512
4161	NC_019382	GCG	2	6	182216	182221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337512
4162	NC_019382	GC	3	6	182268	182273	0 %	0 %	50 %	50 %	412337512
4163	NC_019382	GCA	3	9	182278	182286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337512
4164	NC_019382	GC	3	6	182312	182317	0 %	0 %	50 %	50 %	412337512
4165	NC_019382	GGCT	2	8	182337	182344	0 %	25 %	50 %	25 %	412337512
4166	NC_019382	CGG	2	6	182359	182364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337512
4167	NC_019382	GCTC	2	8	182380	182387	0 %	25 %	25 %	50 %	412337512
4168	NC_019382	CAG	2	6	182396	182401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337512
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4177	NC_019382	GGC	2	6	182822	182827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337513
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4179	NC_019382	CGC	2	6	182840	182845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337513
4180	NC_019382	CGG	2	6	182871	182876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337513
4181	NC_019382	CGT	2	6	182992	182997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337513
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4184	NC_019382	GGC	2	6	183107	183112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337513
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4188	NC_019382	CCG	2	6	183181	183186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337513
4189	NC_019382	CGA	2	6	183211	183216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337513
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4191	NC_019382	GGC	2	6	183235	183240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337513
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4193	NC_019382	CGC	2	6	183308	183313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337513
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4195	NC_019382	TCG	2	6	183399	183404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337513
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4197	NC_019382	CGA	2	6	183451	183456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337513
4198	NC_019382	GCCA	2	8	183495	183502	25 %	0 %	25 %	50 %	412337513
4199	NC_019382	GGC	2	6	183525	183530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337513
4200	NC_019382	ACA	2	6	183773	183778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	412337514
4201	NC_019382	CTG	2	6	183789	183794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337514
4202	NC_019382	GCCTG	2	10	183799	183808	0 %	20 %	40 %	40 %	412337514
4203	NC_019382	TGC	2	6	183814	183819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337514
4204	NC_019382	CGG	2	6	183832	183837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337514
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4206	NC_019382	CGG	2	6	183893	183898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337514
4207	NC_019382	CAC	2	6	183899	183904	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	412337514
4208	NC_019382	GC	4	8	183915	183922	0 %	0 %	50 %	50 %	412337514
4209	NC_019382	CCA	2	6	183928	183933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	412337514
4210	NC_019382	GTG	2	6	183963	183968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412337514
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4212	NC_019382	TCG	2	6	184009	184014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337514
4213	NC_019382	GCT	3	9	184040	184048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337514
4214	NC_019382	CGG	2	6	184054	184059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337514
4215	NC_019382	CG	3	6	184111	184116	0 %	0 %	50 %	50 %	412337514
4216	NC_019382	GCTGGT	2	12	184151	184162	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	412337514
4217	NC_019382	CCT	2	6	184165	184170	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	412337514
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4220	NC_019382	GCC	2	6	184275	184280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337514
4221	NC_019382	CACG	2	8	184313	184320	25 %	0 %	25 %	50 %	412337514
4222	NC_019382	GGC	2	6	184352	184357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337514
4223	NC_019382	GGCG	2	8	184361	184368	0 %	0 %	75 %	25 %	412337514
4224	NC_019382	TTCACC	2	12	184377	184388	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	412337514
4225	NC_019382	CGG	2	6	184396	184401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337514
4226	NC_019382	GC	3	6	184430	184435	0 %	0 %	50 %	50 %	412337514
4227	NC_019382	AGCGC	2	10	184456	184465	20 %	0 %	40 %	40 %	412337514
4228	NC_019382	CTGGA	2	10	184524	184533	20 %	20 %	40 %	20 %	412337514
4229	NC_019382	TCA	2	6	184537	184542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	412337514
4230	NC_019382	GCC	2	6	184547	184552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337514
4231	NC_019382	CGT	2	6	184568	184573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337514
4232	NC_019382	GC	3	6	184622	184627	0 %	0 %	50 %	50 %	412337514
4233	NC_019382	CAG	2	6	184638	184643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337514
4234	NC_019382	TCA	2	6	184720	184725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	412337514
4235	NC_019382	CTG	2	6	184938	184943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337515
4236	NC_019382	GC	3	6	185023	185028	0 %	0 %	50 %	50 %	412337515
4237	NC_019382	GGGC	2	8	185069	185076	0 %	0 %	75 %	25 %	412337515
4238	NC_019382	GGC	2	6	185078	185083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337515
4239	NC_019382	CTG	3	9	185142	185150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337515
4240	NC_019382	GGCG	2	8	185153	185160	0 %	0 %	75 %	25 %	412337515
4241	NC_019382	GGGC	2	8	185191	185198	0 %	0 %	75 %	25 %	412337515
4242	NC_019382	TGC	3	9	185212	185220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337515
4243	NC_019382	CCG	2	6	185230	185235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337515
4244	NC_019382	CGG	2	6	185273	185278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337515
4245	NC_019382	CGG	4	12	185335	185346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337515
4246	NC_019382	GC	3	6	185377	185382	0 %	0 %	50 %	50 %	412337515
4247	NC_019382	TGG	2	6	185383	185388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412337515
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4249	NC_019382	GACC	2	8	185408	185415	25 %	0 %	25 %	50 %	412337515
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4355	NC_019382	GC	3	6	189126	189131	0 %	0 %	50 %	50 %	412337518
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4360	NC_019382	GGCG	2	8	189244	189251	0 %	0 %	75 %	25 %	412337518
4361	NC_019382	GTCGGG	2	12	189256	189267	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	412337518
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4366	NC_019382	GCG	2	6	189408	189413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337518
4367	NC_019382	CG	3	6	189412	189417	0 %	0 %	50 %	50 %	412337518
4368	NC_019382	GGC	2	6	189418	189423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337518
4369	NC_019382	GCA	2	6	189450	189455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337518
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4371	NC_019382	GGC	2	6	189495	189500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337518
4372	NC_019382	GCCC	2	8	189614	189621	0 %	0 %	25 %	75 %	412337519
4373	NC_019382	CAT	2	6	189656	189661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	412337519
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4375	NC_019382	ACC	2	6	189718	189723	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	412337519
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4399	NC_019382	GTT	2	6	190625	190630	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	412337520
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4485	NC_019382	CCCA	2	8	193808	193815	25 %	0 %	0 %	75 %	412337523
4486	NC_019382	CCGA	2	8	193829	193836	25 %	0 %	25 %	50 %	412337523
4487	NC_019382	CAA	2	6	193846	193851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	412337523
4488	NC_019382	CGG	2	6	193944	193949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337523
4489	NC_019382	CG	3	6	193959	193964	0 %	0 %	50 %	50 %	412337523
4490	NC_019382	GCA	2	6	193984	193989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337523
4491	NC_019382	GCT	2	6	193990	193995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337523
4492	NC_019382	TGGCG	2	10	194053	194062	0 %	20 %	60 %	20 %	412337523
4493	NC_019382	ATGT	2	8	194075	194082	25 %	50 %	25 %	0 %	412337523
4494	NC_019382	CG	3	6	194155	194160	0 %	0 %	50 %	50 %	412337523
4495	NC_019382	GC	4	8	194207	194214	0 %	0 %	50 %	50 %	412337523
4496	NC_019382	ACCG	2	8	194219	194226	25 %	0 %	25 %	50 %	412337523
4497	NC_019382	GC	4	8	194260	194267	0 %	0 %	50 %	50 %	412337523
4498	NC_019382	GAG	2	6	194273	194278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	412337523
4499	NC_019382	ACG	2	6	194376	194381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337523
4500	NC_019382	CGG	2	6	194392	194397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337523

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