MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bordetella bronchiseptica 253

Total Repeats: 138120

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_019382	TCG	3	9	132583	132591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337475
3003	NC_019382	GCT	2	6	132647	132652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337475
3004	NC_019382	GCC	2	6	132657	132662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337475
3005	NC_019382	GGCG	2	8	132719	132726	0 %	0 %	75 %	25 %	412337475
3006	NC_019382	CGG	2	6	132742	132747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337475
3007	NC_019382	CAA	2	6	132761	132766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	412337475
3008	NC_019382	CG	3	6	132780	132785	0 %	0 %	50 %	50 %	412337475
3009	NC_019382	GCG	2	6	132838	132843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337475
3010	NC_019382	TCCGGC	2	12	132930	132941	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	412337475
3011	NC_019382	CGG	2	6	132976	132981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337475
3012	NC_019382	GC	3	6	133029	133034	0 %	0 %	50 %	50 %	412337475
3013	NC_019382	TCT	2	6	133052	133057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	412337475
3014	NC_019382	GGCG	2	8	133076	133083	0 %	0 %	75 %	25 %	412337475
3015	NC_019382	CGG	2	6	133097	133102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337475
3016	NC_019382	TCGG	2	8	133115	133122	0 %	25 %	50 %	25 %	412337475
3017	NC_019382	CTG	2	6	133296	133301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337475
3018	NC_019382	GAA	2	6	133370	133375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	412337475
3019	NC_019382	CGC	2	6	133414	133419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337475
3020	NC_019382	AAG	2	6	133500	133505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	412337475
3021	NC_019382	GAAGGC	2	12	133523	133534	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	412337475
3022	NC_019382	GGC	2	6	133617	133622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337475
3023	NC_019382	AGG	2	6	133639	133644	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	412337475
3024	NC_019382	CAT	2	6	133652	133657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	412337475
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3026	NC_019382	GC	4	8	133844	133851	0 %	0 %	50 %	50 %	412337475
3027	NC_019382	GCGCG	2	10	133901	133910	0 %	0 %	60 %	40 %	412337475
3028	NC_019382	GCC	2	6	133947	133952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337475
3029	NC_019382	CGC	2	6	134000	134005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337475
3030	NC_019382	CGGC	2	8	134015	134022	0 %	0 %	50 %	50 %	412337475
3031	NC_019382	GGC	2	6	134064	134069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337475
3032	NC_019382	CGA	2	6	134117	134122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337475
3033	NC_019382	GCTG	2	8	134126	134133	0 %	25 %	50 %	25 %	412337475
3034	NC_019382	GGC	2	6	134171	134176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337475
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3037	NC_019382	CAGGC	2	10	134223	134232	20 %	0 %	40 %	40 %	412337475
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3040	NC_019382	GGC	2	6	134390	134395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337475
3041	NC_019382	GGCGG	2	10	134403	134412	0 %	0 %	80 %	20 %	412337475
3042	NC_019382	CGC	2	6	134422	134427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337475
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3045	NC_019382	GGCG	2	8	134552	134559	0 %	0 %	75 %	25 %	412337475
3046	NC_019382	GCG	2	6	134597	134602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337475
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3050	NC_019382	GGTG	2	8	134705	134712	0 %	25 %	75 %	0 %	412337475
3051	NC_019382	GCA	2	6	134726	134731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337475
3052	NC_019382	CGG	3	9	134855	134863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337475
3053	NC_019382	CGG	2	6	134879	134884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337475
3054	NC_019382	TGG	2	6	134983	134988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412337475
3055	NC_019382	CGA	2	6	135023	135028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337475
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3060	NC_019382	GGC	2	6	135189	135194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337475
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3069	NC_019382	GGAA	2	8	135431	135438	50 %	0 %	50 %	0 %	412337475
3070	NC_019382	GC	3	6	135501	135506	0 %	0 %	50 %	50 %	412337475
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3076	NC_019382	GAGCA	2	10	135708	135717	40 %	0 %	40 %	20 %	412337475
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3106	NC_019382	GGCAG	2	10	136822	136831	20 %	0 %	60 %	20 %	412337475
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3123	NC_019382	GAC	2	6	137390	137395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337476
3124	NC_019382	ATC	2	6	137411	137416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	412337476
3125	NC_019382	GTG	2	6	137501	137506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412337476
3126	NC_019382	GCG	2	6	137513	137518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337476
3127	NC_019382	GGT	2	6	137560	137565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412337476
3128	NC_019382	GCCT	2	8	137568	137575	0 %	25 %	25 %	50 %	412337476
3129	NC_019382	TCT	2	6	137592	137597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	412337476
3130	NC_019382	CG	3	6	137613	137618	0 %	0 %	50 %	50 %	412337476
3131	NC_019382	TGC	2	6	137637	137642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337476
3132	NC_019382	AGC	2	6	137661	137666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337476
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3134	NC_019382	CGG	2	6	137740	137745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337476
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3139	NC_019382	CTG	2	6	137870	137875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337476
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3142	NC_019382	TGG	2	6	137988	137993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412337476
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3198	NC_019382	GCGCG	2	10	140269	140278	0 %	0 %	60 %	40 %	412337478
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3205	NC_019382	TGG	2	6	140400	140405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412337478
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3214	NC_019382	CTG	2	6	140929	140934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337479
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3230	NC_019382	CAG	2	6	141397	141402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337479
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3232	NC_019382	AGC	2	6	141470	141475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337479
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3236	NC_019382	GC	4	8	141632	141639	0 %	0 %	50 %	50 %	412337479
3237	NC_019382	GCC	2	6	141655	141660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337479
3238	NC_019382	CAG	2	6	141676	141681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337479
3239	NC_019382	CGGG	2	8	141688	141695	0 %	0 %	75 %	25 %	412337479
3240	NC_019382	AGGGC	2	10	141735	141744	20 %	0 %	60 %	20 %	412337479
3241	NC_019382	GCTC	2	8	142007	142014	0 %	25 %	25 %	50 %	412337480
3242	NC_019382	GGC	2	6	142052	142057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337480
3243	NC_019382	GC	3	6	142056	142061	0 %	0 %	50 %	50 %	412337480
3244	NC_019382	CGCGG	2	10	142067	142076	0 %	0 %	60 %	40 %	412337480
3245	NC_019382	GGCG	2	8	142091	142098	0 %	0 %	75 %	25 %	412337480
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3352	NC_019382	CG	4	8	145810	145817	0 %	0 %	50 %	50 %	412337484
3353	NC_019382	GC	4	8	145823	145830	0 %	0 %	50 %	50 %	412337484
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3365	NC_019382	GCA	2	6	146320	146325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337485
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3367	NC_019382	GC	3	6	146471	146476	0 %	0 %	50 %	50 %	412337485
3368	NC_019382	GC	4	8	146522	146529	0 %	0 %	50 %	50 %	412337485
3369	NC_019382	GC	4	8	146541	146548	0 %	0 %	50 %	50 %	412337485
3370	NC_019382	GC	3	6	146551	146556	0 %	0 %	50 %	50 %	412337485
3371	NC_019382	GC	3	6	146558	146563	0 %	0 %	50 %	50 %	412337485
3372	NC_019382	GGCC	2	8	146570	146577	0 %	0 %	50 %	50 %	412337485
3373	NC_019382	CCGGG	2	10	146585	146594	0 %	0 %	60 %	40 %	412337485
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3376	NC_019382	GC	5	10	146679	146688	0 %	0 %	50 %	50 %	412337485
3377	NC_019382	GC	3	6	146701	146706	0 %	0 %	50 %	50 %	412337485
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3380	NC_019382	CGT	2	6	146803	146808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337485
3381	NC_019382	TGC	2	6	146860	146865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337485
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3383	NC_019382	CTGGC	2	10	146889	146898	0 %	20 %	40 %	40 %	412337485
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3401	NC_019382	GCA	2	6	149870	149875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337486
3402	NC_019382	CG	3	6	149885	149890	0 %	0 %	50 %	50 %	412337486
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3480	NC_019382	CGT	2	6	153386	153391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337488
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3489	NC_019382	CGA	2	6	153541	153546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337488
3490	NC_019382	GAGT	2	8	153555	153562	25 %	25 %	50 %	0 %	412337488
3491	NC_019382	CCGC	2	8	154166	154173	0 %	0 %	25 %	75 %	412337489
3492	NC_019382	CGG	2	6	154188	154193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337489
3493	NC_019382	GC	3	6	154199	154204	0 %	0 %	50 %	50 %	412337489
3494	NC_019382	CGT	2	6	154218	154223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337489
3495	NC_019382	CGG	2	6	154296	154301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337489
3496	NC_019382	CTTGG	2	10	154318	154327	0 %	40 %	40 %	20 %	412337489
3497	NC_019382	GC	4	8	154345	154352	0 %	0 %	50 %	50 %	412337489
3498	NC_019382	GGGC	2	8	154397	154404	0 %	0 %	75 %	25 %	412337489
3499	NC_019382	GCT	2	6	154414	154419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337489
3500	NC_019382	GCC	2	6	154438	154443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337489

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