MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bordetella bronchiseptica 253

Total Repeats: 138120

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_019382	GTT	2	6	56804	56809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	412337411
1003	NC_019382	CAG	2	6	56846	56851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337411
1004	NC_019382	GC	3	6	57322	57327	0 %	0 %	50 %	50 %	412337412
1005	NC_019382	GCTG	2	8	57335	57342	0 %	25 %	50 %	25 %	412337412
1006	NC_019382	CGC	2	6	57346	57351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337412
1007	NC_019382	GCC	2	6	57396	57401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337412
1008	NC_019382	CAG	2	6	57447	57452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337412
1009	NC_019382	CGT	2	6	57454	57459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337412
1010	NC_019382	GGC	2	6	57563	57568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337412
1011	NC_019382	GC	3	6	57618	57623	0 %	0 %	50 %	50 %	412337412
1012	NC_019382	GCA	2	6	57632	57637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337412
1013	NC_019382	CGC	2	6	57656	57661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337412
1014	NC_019382	GC	3	6	57660	57665	0 %	0 %	50 %	50 %	412337412
1015	NC_019382	GC	3	6	57667	57672	0 %	0 %	50 %	50 %	412337412
1016	NC_019382	TGC	3	9	57703	57711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337412
1017	NC_019382	ACG	2	6	57766	57771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337412
1018	NC_019382	GC	3	6	57786	57791	0 %	0 %	50 %	50 %	412337412
1019	NC_019382	AC	3	6	57826	57831	50 %	0 %	0 %	50 %	412337412
1020	NC_019382	TGGC	2	8	57878	57885	0 %	25 %	50 %	25 %	412337412
1021	NC_019382	GGC	2	6	57898	57903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337412
1022	NC_019382	CG	3	6	57931	57936	0 %	0 %	50 %	50 %	412337412
1023	NC_019382	CAT	2	6	57956	57961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	412337412
1024	NC_019382	CGG	2	6	58016	58021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337412
1025	NC_019382	CGA	2	6	58058	58063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337412
1026	NC_019382	GCTGGG	2	12	58085	58096	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	412337412
1027	NC_019382	ACG	3	9	58102	58110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337412
1028	NC_019382	AT	3	6	58111	58116	50 %	50 %	0 %	0 %	412337412
1029	NC_019382	TCG	2	6	58180	58185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337412
1030	NC_019382	CGCAGG	2	12	58189	58200	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	412337412
1031	NC_019382	GCA	2	6	58213	58218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337412
1032	NC_019382	GGGC	2	8	58236	58243	0 %	0 %	75 %	25 %	412337412
1033	NC_019382	GC	3	6	58250	58255	0 %	0 %	50 %	50 %	412337412
1034	NC_019382	CGG	2	6	58277	58282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337412
1035	NC_019382	ACG	2	6	58333	58338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337412
1036	NC_019382	CGG	2	6	58352	58357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337412
1037	NC_019382	CGGCG	2	10	58406	58415	0 %	0 %	60 %	40 %	412337412
1038	NC_019382	GC	3	6	58520	58525	0 %	0 %	50 %	50 %	412337412
1039	NC_019382	T	6	6	58609	58614	0 %	100 %	0 %	0 %	412337413
1040	NC_019382	TGG	2	6	58632	58637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412337413
1041	NC_019382	GC	3	6	58656	58661	0 %	0 %	50 %	50 %	412337413
1042	NC_019382	TGC	2	6	58737	58742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337413
1043	NC_019382	GC	3	6	58746	58751	0 %	0 %	50 %	50 %	412337413
1044	NC_019382	CTG	2	6	58781	58786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337413
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1046	NC_019382	TGA	2	6	58812	58817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	412337413
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1052	NC_019382	GATC	2	8	59124	59131	25 %	25 %	25 %	25 %	412337414
1053	NC_019382	TTC	2	6	59170	59175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	412337414
1054	NC_019382	CTG	2	6	59212	59217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337414
1055	NC_019382	CGA	2	6	59229	59234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337414
1056	NC_019382	GCC	2	6	59238	59243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337414
1057	NC_019382	CGT	2	6	59556	59561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337415
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1059	NC_019382	GCGG	2	8	59608	59615	0 %	0 %	75 %	25 %	412337415
1060	NC_019382	CGA	2	6	59726	59731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337415
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1063	NC_019382	CCCG	2	8	59907	59914	0 %	0 %	25 %	75 %	412337416
1064	NC_019382	GGC	3	9	59978	59986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337416
1065	NC_019382	GC	3	6	59985	59990	0 %	0 %	50 %	50 %	412337416
1066	NC_019382	CTG	2	6	60045	60050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337416
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1068	NC_019382	GT	3	6	60230	60235	0 %	50 %	50 %	0 %	412337416
1069	NC_019382	ATT	2	6	60294	60299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	412337416
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1071	NC_019382	CAG	2	6	60363	60368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337416
1072	NC_019382	TCA	2	6	60793	60798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	412337417
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1078	NC_019382	GAT	2	6	61246	61251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	412337418
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1080	NC_019382	GCC	2	6	61357	61362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337418
1081	NC_019382	CGA	2	6	61512	61517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337418
1082	NC_019382	CAGC	2	8	61543	61550	25 %	0 %	25 %	50 %	412337418
1083	NC_019382	GGATG	2	10	61596	61605	20 %	20 %	60 %	0 %	412337418
1084	NC_019382	ACG	2	6	61995	62000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337419
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1094	NC_019382	GATG	2	8	62680	62687	25 %	25 %	50 %	0 %	412337419
1095	NC_019382	CGC	2	6	62755	62760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337419
1096	NC_019382	AGC	2	6	62778	62783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337419
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1098	NC_019382	GCCG	2	8	62815	62822	0 %	0 %	50 %	50 %	412337419
1099	NC_019382	GCT	2	6	62863	62868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337419
1100	NC_019382	GC	5	10	62920	62929	0 %	0 %	50 %	50 %	412337419
1101	NC_019382	GAG	2	6	62933	62938	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	412337419
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1103	NC_019382	CTA	2	6	62977	62982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	412337419
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1107	NC_019382	ACA	2	6	63293	63298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	412337420
1108	NC_019382	CGG	2	6	63381	63386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337420
1109	NC_019382	TCA	2	6	63428	63433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	412337420
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1111	NC_019382	CTG	2	6	63487	63492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337420
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1113	NC_019382	GAA	2	6	63501	63506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	412337420
1114	NC_019382	CAT	2	6	63537	63542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	412337420
1115	NC_019382	GCG	2	6	63560	63565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337420
1116	NC_019382	ATCCAG	2	12	63586	63597	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	412337420
1117	NC_019382	GC	3	6	63598	63603	0 %	0 %	50 %	50 %	412337420
1118	NC_019382	CCG	2	6	63707	63712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337420
1119	NC_019382	TGG	2	6	63734	63739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412337420
1120	NC_019382	CG	3	6	63757	63762	0 %	0 %	50 %	50 %	412337420
1121	NC_019382	A	7	7	63883	63889	100 %	0 %	0 %	0 %	412337421
1122	NC_019382	TGC	2	6	63910	63915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337421
1123	NC_019382	CAA	2	6	63929	63934	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	412337421
1124	NC_019382	TGA	2	6	63986	63991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	412337421
1125	NC_019382	CAT	2	6	64013	64018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	412337421
1126	NC_019382	CG	4	8	64040	64047	0 %	0 %	50 %	50 %	412337421
1127	NC_019382	TGGCGG	2	12	64138	64149	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	412337421
1128	NC_019382	CGA	2	6	64193	64198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337421
1129	NC_019382	CAT	2	6	64220	64225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	412337421
1130	NC_019382	GCT	2	6	64256	64261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337421
1131	NC_019382	GC	3	6	64275	64280	0 %	0 %	50 %	50 %	412337421
1132	NC_019382	CAT	2	6	64358	64363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	412337421
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1134	NC_019382	CAT	2	6	64415	64420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	412337421
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1155	NC_019382	CAT	2	6	65524	65529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	412337422
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1159	NC_019382	GCGCC	2	10	65767	65776	0 %	0 %	40 %	60 %	412337422
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1236	NC_019382	CCG	2	6	68604	68609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337423
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1251	NC_019382	GCC	2	6	69411	69416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337424
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