MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bordetella bronchiseptica 253

Total Repeats: 138120

< Previous12...265266267268269270271272273274275276277Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
138001	NC_019382	GC	3	6	5220948	5220953	0 %	0 %	50 %	50 %	412342110
138002	NC_019382	GAA	2	6	5221072	5221077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	412342110
138003	NC_019382	GGC	2	6	5221128	5221133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412342110
138004	NC_019382	CGGC	2	8	5221167	5221174	0 %	0 %	50 %	50 %	412342110
138005	NC_019382	GCG	2	6	5221175	5221180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412342110
138006	NC_019382	CAC	2	6	5221206	5221211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	412342110
138007	NC_019382	CGA	2	6	5221425	5221430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412342110
138008	NC_019382	GCC	2	6	5221456	5221461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412342110
138009	NC_019382	TCG	2	6	5230472	5230477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412342111
138010	NC_019382	CGG	2	6	5230481	5230486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412342111
138011	NC_019382	GC	3	6	5230548	5230553	0 %	0 %	50 %	50 %	412342111
138012	NC_019382	CACGG	2	10	5230615	5230624	20 %	0 %	40 %	40 %	412342111
138013	NC_019382	GCT	2	6	5230663	5230668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412342111
138014	NC_019382	GGCT	2	8	5230685	5230692	0 %	25 %	50 %	25 %	412342111
138015	NC_019382	CAC	2	6	5230738	5230743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	412342111
138016	NC_019382	ACG	2	6	5230790	5230795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412342111
138017	NC_019382	CG	4	8	5230848	5230855	0 %	0 %	50 %	50 %	412342111
138018	NC_019382	TGC	2	6	5230877	5230882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412342111
138019	NC_019382	A	6	6	5230904	5230909	100 %	0 %	0 %	0 %	412342111
138020	NC_019382	CAA	2	6	5230950	5230955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	412342111
138021	NC_019382	GGC	2	6	5230957	5230962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412342111
138022	NC_019382	GCGTCG	2	12	5250673	5250684	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	412342112
138023	NC_019382	CTT	2	6	5250768	5250773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	412342112
138024	NC_019382	GCCCAC	2	12	5250780	5250791	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	412342112
138025	NC_019382	CAGGCG	2	12	5250798	5250809	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	412342112
138026	NC_019382	AGGA	2	8	5250940	5250947	50 %	0 %	50 %	0 %	412342112
138027	NC_019382	GC	3	6	5250952	5250957	0 %	0 %	50 %	50 %	412342112
138028	NC_019382	GC	3	6	5250985	5250990	0 %	0 %	50 %	50 %	412342112
138029	NC_019382	CG	3	6	5251139	5251144	0 %	0 %	50 %	50 %	412342112
138030	NC_019382	TCCC	2	8	5251358	5251365	0 %	25 %	0 %	75 %	412342113
138031	NC_019382	TTC	2	6	5251380	5251385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	412342113
138032	NC_019382	GCA	2	6	5251388	5251393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412342113
138033	NC_019382	TCG	2	6	5251422	5251427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412342113
138034	NC_019382	GC	3	6	5251464	5251469	0 %	0 %	50 %	50 %	412342113
138035	NC_019382	TTG	2	6	5251479	5251484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	412342113
138036	NC_019382	CGA	2	6	5251516	5251521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412342113
138037	NC_019382	TGG	2	6	5251549	5251554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412342113
138038	NC_019382	T	6	6	5251577	5251582	0 %	100 %	0 %	0 %	412342113
138039	NC_019382	ATGC	2	8	5251604	5251611	25 %	25 %	25 %	25 %	412342113
138040	NC_019382	GTC	2	6	5251667	5251672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412342113
138041	NC_019382	CA	3	6	5251682	5251687	50 %	0 %	0 %	50 %	412342113
138042	NC_019382	CTG	2	6	5251781	5251786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412342113
138043	NC_019382	GCC	2	6	5251863	5251868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412342113
138044	NC_019382	CTG	2	6	5251934	5251939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412342113
138045	NC_019382	CAC	2	6	5251955	5251960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	412342113
138046	NC_019382	CGGA	2	8	5252021	5252028	25 %	0 %	50 %	25 %	412342113
138047	NC_019382	GGT	2	6	5252120	5252125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412342113
138048	NC_019382	GTA	2	6	5252162	5252167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	412342113
138049	NC_019382	A	6	6	5252194	5252199	100 %	0 %	0 %	0 %	412342113
138050	NC_019382	CGCT	2	8	5260857	5260864	0 %	25 %	25 %	50 %	412342114
138051	NC_019382	ACA	2	6	5260899	5260904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	412342114
138052	NC_019382	GTC	2	6	5260907	5260912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412342114
138053	NC_019382	CGA	2	6	5260939	5260944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412342114
138054	NC_019382	GC	4	8	5260950	5260957	0 %	0 %	50 %	50 %	412342114
138055	NC_019382	CAT	2	6	5261005	5261010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	412342114
138056	NC_019382	GCAA	2	8	5261012	5261019	50 %	0 %	25 %	25 %	412342114
138057	NC_019382	GCT	2	6	5261049	5261054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412342114
138058	NC_019382	GC	3	6	5261075	5261080	0 %	0 %	50 %	50 %	412342114
138059	NC_019382	TGA	2	6	5261118	5261123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	412342114
138060	NC_019382	GCA	2	6	5261380	5261385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412342114
138061	NC_019382	CGG	2	6	5261489	5261494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412342115
138062	NC_019382	AGC	2	6	5261506	5261511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412342115
138063	NC_019382	GCG	2	6	5261543	5261548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412342115
138064	NC_019382	CG	4	8	5261547	5261554	0 %	0 %	50 %	50 %	412342115
138065	NC_019382	CGA	2	6	5261573	5261578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412342115
138066	NC_019382	GCG	2	6	5261710	5261715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412342116
138067	NC_019382	TGG	2	6	5261745	5261750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412342116
138068	NC_019382	TGCG	2	8	5261759	5261766	0 %	25 %	50 %	25 %	412342116
138069	NC_019382	GCG	2	6	5261840	5261845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412342116
138070	NC_019382	GCT	2	6	5261851	5261856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412342116
138071	NC_019382	GC	3	6	5261870	5261875	0 %	0 %	50 %	50 %	412342116
138072	NC_019382	GTCG	2	8	5261890	5261897	0 %	25 %	50 %	25 %	412342116
138073	NC_019382	CTG	2	6	5261939	5261944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412342116
138074	NC_019382	GCC	3	9	5262005	5262013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412342117
138075	NC_019382	GC	3	6	5262027	5262032	0 %	0 %	50 %	50 %	412342117
138076	NC_019382	GACCTG	2	12	5262043	5262054	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	412342117
138077	NC_019382	CGC	2	6	5262063	5262068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412342117
138078	NC_019382	CGC	2	6	5262075	5262080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412342117
138079	NC_019382	CGC	2	6	5262168	5262173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412342117
138080	NC_019382	AAC	2	6	5262190	5262195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	412342118
138081	NC_019382	TCA	2	6	5262203	5262208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	412342118
138082	NC_019382	GAAG	2	8	5262276	5262283	50 %	0 %	50 %	0 %	412342118
138083	NC_019382	TGC	2	6	5262302	5262307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412342118
138084	NC_019382	CG	3	6	5262431	5262436	0 %	0 %	50 %	50 %	412342118
138085	NC_019382	CCG	2	6	5262533	5262538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412342118
138086	NC_019382	CACG	2	8	5262573	5262580	25 %	0 %	25 %	50 %	412342118
138087	NC_019382	ATC	2	6	5262613	5262618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	412342118
138088	NC_019382	TGG	2	6	5262629	5262634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412342118
138089	NC_019382	CCG	2	6	5262641	5262646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412342118
138090	NC_019382	GTC	2	6	5262729	5262734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412342118
138091	NC_019382	GGT	2	6	5262774	5262779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412342118
138092	NC_019382	GC	3	6	5262783	5262788	0 %	0 %	50 %	50 %	412342118
138093	NC_019382	GAA	2	6	5262804	5262809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	412342118
138094	NC_019382	CCA	2	6	5262831	5262836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	412342118
138095	NC_019382	CGG	2	6	5262849	5262854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412342118
138096	NC_019382	CCA	2	6	5262866	5262871	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	412342118
138097	NC_019382	GC	3	6	5262878	5262883	0 %	0 %	50 %	50 %	412342118
138098	NC_019382	CTG	2	6	5262898	5262903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412342118
138099	NC_019382	GCC	3	9	5262940	5262948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412342118
138100	NC_019382	GC	3	6	5262984	5262989	0 %	0 %	50 %	50 %	412342118
138101	NC_019382	GGC	2	6	5263032	5263037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412342118
138102	NC_019382	TGC	2	6	5263049	5263054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412342118
138103	NC_019382	GCG	2	6	5263055	5263060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412342118
138104	NC_019382	CGA	2	6	5263104	5263109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412342118
138105	NC_019382	GCC	2	6	5263110	5263115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412342118
138106	NC_019382	CGA	2	6	5263128	5263133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412342118
138107	NC_019382	AGG	2	6	5263155	5263160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	412342118
138108	NC_019382	C	6	6	5263189	5263194	0 %	0 %	0 %	100 %	412342119
138109	NC_019382	GGCT	2	8	5263212	5263219	0 %	25 %	50 %	25 %	412342119
138110	NC_019382	CG	3	6	5263249	5263254	0 %	0 %	50 %	50 %	412342119
138111	NC_019382	CCG	2	6	5263255	5263260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412342119
138112	NC_019382	AAG	2	6	5263281	5263286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	412342119
138113	NC_019382	GC	3	6	5263301	5263306	0 %	0 %	50 %	50 %	412342119
138114	NC_019382	GAA	2	6	5263425	5263430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	412342119
138115	NC_019382	GGC	2	6	5263481	5263486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412342119
138116	NC_019382	CGGC	2	8	5263520	5263527	0 %	0 %	50 %	50 %	412342119
138117	NC_019382	GCG	2	6	5263528	5263533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412342119
138118	NC_019382	CAC	2	6	5263559	5263564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	412342119
138119	NC_019382	CGA	2	6	5263778	5263783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412342119
138120	NC_019382	GCC	2	6	5263809	5263814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412342119

< Previous12...265266267268269270271272273274275276277Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.