MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bordetella bronchiseptica 253

Total Repeats: 138120

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_019382	GCT	2	6	26406	26411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337376
502	NC_019382	GTC	2	6	26493	26498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337376
503	NC_019382	GCC	2	6	26501	26506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337376
504	NC_019382	AGGC	2	8	26519	26526	25 %	0 %	50 %	25 %	412337376
505	NC_019382	CCG	3	9	26551	26559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337376
506	NC_019382	GCC	2	6	26576	26581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337376
507	NC_019382	GC	3	6	26700	26705	0 %	0 %	50 %	50 %	412337376
508	NC_019382	CGG	2	6	26765	26770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337376
509	NC_019382	CGAA	2	8	26871	26878	50 %	0 %	25 %	25 %	412337376
510	NC_019382	CGG	2	6	26944	26949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337376
511	NC_019382	ACG	2	6	27149	27154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337377
512	NC_019382	TGA	2	6	27279	27284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	412337377
513	NC_019382	CG	3	6	27288	27293	0 %	0 %	50 %	50 %	412337377
514	NC_019382	GCC	2	6	27310	27315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337377
515	NC_019382	CAG	2	6	27322	27327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337377
516	NC_019382	TCG	2	6	28131	28136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337378
517	NC_019382	GAT	2	6	28142	28147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	412337378
518	NC_019382	GC	3	6	28164	28169	0 %	0 %	50 %	50 %	412337378
519	NC_019382	TCC	2	6	28176	28181	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	412337378
520	NC_019382	ACG	2	6	28191	28196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337378
521	NC_019382	GAT	2	6	28235	28240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	412337378
522	NC_019382	CCTC	2	8	28799	28806	0 %	25 %	0 %	75 %	412337379
523	NC_019382	GCT	2	6	28824	28829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337379
524	NC_019382	TGA	2	6	29001	29006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	412337379
525	NC_019382	CG	3	6	29010	29015	0 %	0 %	50 %	50 %	412337379
526	NC_019382	GCC	2	6	29032	29037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337379
527	NC_019382	CAG	2	6	29044	29049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337379
528	NC_019382	CGG	2	6	30066	30071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337380
529	NC_019382	GC	3	6	30107	30112	0 %	0 %	50 %	50 %	412337380
530	NC_019382	GC	3	6	30166	30171	0 %	0 %	50 %	50 %	412337380
531	NC_019382	AGC	3	9	30188	30196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337380
532	NC_019382	CG	3	6	30396	30401	0 %	0 %	50 %	50 %	412337381
533	NC_019382	CTTG	2	8	30430	30437	0 %	50 %	25 %	25 %	412337381
534	NC_019382	CG	3	6	30452	30457	0 %	0 %	50 %	50 %	412337381
535	NC_019382	GCA	2	6	30501	30506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337381
536	NC_019382	CAG	2	6	30510	30515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337381
537	NC_019382	GCT	2	6	30534	30539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337381
538	NC_019382	GCG	2	6	30545	30550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337381
539	NC_019382	CGC	2	6	30551	30556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337381
540	NC_019382	GAA	2	6	30658	30663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	412337381
541	NC_019382	TCC	2	6	31857	31862	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	412337382
542	NC_019382	TCG	2	6	31994	31999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337382
543	NC_019382	CTG	2	6	32015	32020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337382
544	NC_019382	CTGC	2	8	32029	32036	0 %	25 %	25 %	50 %	412337382
545	NC_019382	G	6	6	32037	32042	0 %	0 %	100 %	0 %	412337382
546	NC_019382	CAT	2	6	32146	32151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	412337382
547	NC_019382	T	6	6	32180	32185	0 %	100 %	0 %	0 %	412337383
548	NC_019382	TAC	2	6	32212	32217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	412337383
549	NC_019382	CCA	2	6	32252	32257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	412337383
550	NC_019382	TCCG	2	8	32351	32358	0 %	25 %	25 %	50 %	412337383
551	NC_019382	GTG	2	6	32419	32424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412337383
552	NC_019382	CAG	2	6	32440	32445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337383
553	NC_019382	GGC	2	6	32511	32516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337383
554	NC_019382	CAG	2	6	32593	32598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337383
555	NC_019382	GT	3	6	32691	32696	0 %	50 %	50 %	0 %	412337383
556	NC_019382	GAC	2	6	32707	32712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337383
557	NC_019382	GCAT	2	8	32768	32775	25 %	25 %	25 %	25 %	412337383
558	NC_019382	CAC	2	6	32788	32793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	412337383
559	NC_019382	A	6	6	32797	32802	100 %	0 %	0 %	0 %	412337383
560	NC_019382	GCC	2	6	32820	32825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337383
561	NC_019382	TCG	2	6	32858	32863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337383
562	NC_019382	CAA	2	6	32895	32900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	412337383
563	NC_019382	GC	3	6	32910	32915	0 %	0 %	50 %	50 %	412337383
564	NC_019382	GAC	2	6	32950	32955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337383
565	NC_019382	TGC	2	6	32986	32991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337383
566	NC_019382	GAA	2	6	32994	32999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	412337383
567	NC_019382	GGGA	2	8	33014	33021	25 %	0 %	75 %	0 %	412337383
568	NC_019382	GC	3	6	33234	33239	0 %	0 %	50 %	50 %	412337384
569	NC_019382	CGC	2	6	33385	33390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337384
570	NC_019382	GC	3	6	33389	33394	0 %	0 %	50 %	50 %	412337384
571	NC_019382	GCTG	2	8	33415	33422	0 %	25 %	50 %	25 %	412337384
572	NC_019382	TTCC	2	8	33431	33438	0 %	50 %	0 %	50 %	412337384
573	NC_019382	CGCCTG	2	12	33570	33581	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	412337384
574	NC_019382	AAG	2	6	33606	33611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	412337384
575	NC_019382	ACG	2	6	33694	33699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337384
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577	NC_019382	GTT	2	6	33853	33858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	412337385
578	NC_019382	AAGTG	2	10	33891	33900	40 %	20 %	40 %	0 %	412337385
579	NC_019382	GAT	2	6	34048	34053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	412337386
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581	NC_019382	GC	3	6	34252	34257	0 %	0 %	50 %	50 %	412337387
582	NC_019382	GAA	2	6	34260	34265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	412337387
583	NC_019382	CGA	2	6	34347	34352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337387
584	NC_019382	GC	3	6	34422	34427	0 %	0 %	50 %	50 %	412337387
585	NC_019382	CCG	2	6	34428	34433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337387
586	NC_019382	CGC	2	6	34481	34486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337387
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588	NC_019382	CGA	2	6	34604	34609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337387
589	NC_019382	GCGG	2	8	34645	34652	0 %	0 %	75 %	25 %	412337387
590	NC_019382	GC	3	6	34687	34692	0 %	0 %	50 %	50 %	412337387
591	NC_019382	GC	3	6	34697	34702	0 %	0 %	50 %	50 %	412337387
592	NC_019382	CGCC	2	8	34719	34726	0 %	0 %	25 %	75 %	412337387
593	NC_019382	GCG	2	6	34950	34955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337388
594	NC_019382	G	6	6	34955	34960	0 %	0 %	100 %	0 %	412337388
595	NC_019382	GACC	2	8	34967	34974	25 %	0 %	25 %	50 %	412337388
596	NC_019382	GTT	2	6	35012	35017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	412337388
597	NC_019382	CGG	2	6	35123	35128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337388
598	NC_019382	GGCC	2	8	35144	35151	0 %	0 %	50 %	50 %	412337388
599	NC_019382	AGC	2	6	35224	35229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337388
600	NC_019382	GAACC	2	10	35261	35270	40 %	0 %	20 %	40 %	412337388
601	NC_019382	CG	3	6	35290	35295	0 %	0 %	50 %	50 %	412337388
602	NC_019382	TGA	2	6	35299	35304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	412337388
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605	NC_019382	CTT	2	6	35348	35353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	412337388
606	NC_019382	ATG	2	6	35421	35426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	412337388
607	NC_019382	CGG	2	6	35438	35443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337388
608	NC_019382	GTG	2	6	35499	35504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412337388
609	NC_019382	TGG	2	6	35507	35512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412337388
610	NC_019382	TAC	2	6	35613	35618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	412337388
611	NC_019382	GAC	2	6	35709	35714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337388
612	NC_019382	GC	3	6	35757	35762	0 %	0 %	50 %	50 %	412337388
613	NC_019382	GC	3	6	35814	35819	0 %	0 %	50 %	50 %	412337388
614	NC_019382	CTCG	2	8	35841	35848	0 %	25 %	25 %	50 %	412337388
615	NC_019382	TGG	2	6	35859	35864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412337388
616	NC_019382	CGA	2	6	35867	35872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337388
617	NC_019382	TGCGC	2	10	35936	35945	0 %	20 %	40 %	40 %	412337388
618	NC_019382	AGC	2	6	36016	36021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337388
619	NC_019382	GTC	2	6	36024	36029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337388
620	NC_019382	CG	3	6	36050	36055	0 %	0 %	50 %	50 %	412337388
621	NC_019382	TGG	2	6	36108	36113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412337388
622	NC_019382	CGACC	2	10	36131	36140	20 %	0 %	20 %	60 %	412337388
623	NC_019382	AAC	2	6	36141	36146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	412337388
624	NC_019382	GCT	2	6	36176	36181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337388
625	NC_019382	CAT	2	6	36248	36253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	412337388
626	NC_019382	GC	3	6	36320	36325	0 %	0 %	50 %	50 %	412337388
627	NC_019382	GC	3	6	36348	36353	0 %	0 %	50 %	50 %	412337388
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629	NC_019382	CAC	2	6	36559	36564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	412337389
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883	NC_019382	GTT	2	6	51235	51240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	412337402
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995	NC_019382	CGGG	2	8	56120	56127	0 %	0 %	75 %	25 %	412337410
996	NC_019382	TGT	2	6	56129	56134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	412337410
997	NC_019382	CGT	2	6	56150	56155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337410
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1000	NC_019382	GCG	2	6	56655	56660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337411

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