MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia afzelii HLJ01 chromosome

Total Repeats: 23083

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
23001	NC_018887	ATTT	2	8	901645	901652	25 %	75 %	0 %	0 %	410679638
23002	NC_018887	ATT	2	6	901698	901703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410679638
23003	NC_018887	ATA	2	6	901722	901727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410679638
23004	NC_018887	TCT	2	6	901781	901786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410679638
23005	NC_018887	TGA	2	6	901789	901794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410679638
23006	NC_018887	TAT	2	6	901819	901824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410679638
23007	NC_018887	TTTA	2	8	901843	901850	25 %	75 %	0 %	0 %	410679638
23008	NC_018887	AATA	2	8	901888	901895	75 %	25 %	0 %	0 %	410679638
23009	NC_018887	AG	3	6	901919	901924	50 %	0 %	50 %	0 %	410679638
23010	NC_018887	ATC	2	6	901953	901958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410679638
23011	NC_018887	CTT	2	6	902007	902012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410679638
23012	NC_018887	A	6	6	902161	902166	100 %	0 %	0 %	0 %	410679638
23013	NC_018887	TGA	2	6	902236	902241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410679638
23014	NC_018887	A	6	6	902300	902305	100 %	0 %	0 %	0 %	410679638
23015	NC_018887	ATA	2	6	902360	902365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410679638
23016	NC_018887	ATG	2	6	902412	902417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410679638
23017	NC_018887	AAT	2	6	902449	902454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410679638
23018	NC_018887	TAA	2	6	902479	902484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410679638
23019	NC_018887	GAA	2	6	902492	902497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410679638
23020	NC_018887	TAA	2	6	902577	902582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410679638
23021	NC_018887	TTA	2	6	902655	902660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410679639
23022	NC_018887	GATT	2	8	902740	902747	25 %	50 %	25 %	0 %	410679639
23023	NC_018887	A	7	7	902749	902755	100 %	0 %	0 %	0 %	410679639
23024	NC_018887	CAA	2	6	902826	902831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410679639
23025	NC_018887	GCA	2	6	902855	902860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410679639
23026	NC_018887	ATG	2	6	902961	902966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410679639
23027	NC_018887	ATT	2	6	903015	903020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410679639
23028	NC_018887	ACCCA	2	10	903060	903069	40 %	0 %	0 %	60 %	410679639
23029	NC_018887	TGA	2	6	903084	903089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410679639
23030	NC_018887	TAT	2	6	903187	903192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410679639
23031	NC_018887	AATTAC	2	12	903289	903300	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	410679639
23032	NC_018887	AGG	2	6	903312	903317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410679639
23033	NC_018887	TGT	2	6	903334	903339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410679639
23034	NC_018887	TG	3	6	903349	903354	0 %	50 %	50 %	0 %	410679639
23035	NC_018887	GAG	2	6	903368	903373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410679639
23036	NC_018887	TCT	2	6	903397	903402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410679639
23037	NC_018887	GAT	2	6	903446	903451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410679639
23038	NC_018887	TGGT	2	8	903498	903505	0 %	50 %	50 %	0 %	410679639
23039	NC_018887	AGA	2	6	903550	903555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410679639
23040	NC_018887	GTT	2	6	903578	903583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410679639
23041	NC_018887	ATA	2	6	903643	903648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410679639
23042	NC_018887	AGT	2	6	903711	903716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410679640
23043	NC_018887	AAT	2	6	903722	903727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410679640
23044	NC_018887	TGTT	2	8	903742	903749	0 %	75 %	25 %	0 %	410679640
23045	NC_018887	CTG	2	6	903772	903777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410679640
23046	NC_018887	TAT	2	6	903887	903892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410679640
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23048	NC_018887	TTG	2	6	903958	903963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410679640
23049	NC_018887	ATT	2	6	903978	903983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410679640
23050	NC_018887	AAG	2	6	904026	904031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410679640
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23052	NC_018887	TGG	2	6	904085	904090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410679640
23053	NC_018887	TGT	2	6	904172	904177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410679640
23054	NC_018887	TAT	2	6	904187	904192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410679640
23055	NC_018887	GGAT	2	8	904283	904290	25 %	25 %	50 %	0 %	410679640
23056	NC_018887	TTTAT	2	10	904309	904318	20 %	80 %	0 %	0 %	410679640
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23058	NC_018887	A	6	6	904430	904435	100 %	0 %	0 %	0 %	410679640
23059	NC_018887	AGA	2	6	904448	904453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410679640
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23061	NC_018887	TTGG	2	8	904552	904559	0 %	50 %	50 %	0 %	410679640
23062	NC_018887	TAT	2	6	904598	904603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410679640
23063	NC_018887	TAGAT	2	10	904619	904628	40 %	40 %	20 %	0 %	410679640
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23066	NC_018887	TGA	2	6	904724	904729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410679640
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23068	NC_018887	CTA	2	6	904762	904767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410679640
23069	NC_018887	T	6	6	904769	904774	0 %	100 %	0 %	0 %	410679640
23070	NC_018887	T	6	6	904793	904798	0 %	100 %	0 %	0 %	410679640
23071	NC_018887	CAT	2	6	904799	904804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410679640
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23073	NC_018887	ATT	2	6	904815	904820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410679640
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23080	NC_018887	GTTT	2	8	905039	905046	0 %	75 %	25 %	0 %	410679640
23081	NC_018887	TTTA	2	8	905051	905058	25 %	75 %	0 %	0 %	410679640
23082	NC_018887	TTA	2	6	905086	905091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410679640
23083	NC_018887	AGC	2	6	905116	905121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410679640

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.